HELP: a weird thing about genotyping - Biology版

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Biology版 - HELP: a weird thing about genotyping

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话题: genotyping话题: pcr话题: weird话题: dna话题: cdna

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M*****n
发帖数: 16729

最近碰到一个怪事，请版上的大牛小牛们帮俺看看，提点建议。
俺的postdoc用genomic DNA作PCR，是为了genotyping mutant，结果有一个animal 的
genomic DNA 给出的一个PCR 条带，我们sequence 以后发现居然是这个gene 的
partial
cDNA， genotyping primers 其实是跨了几个intron的，但是这个PCR 产物居然是不含任
何intron.我们从来没有克隆这个基因的cDNA，所以不可能是环境中的交叉污染。俺实
在是不得其解。怎么从genomic DNA直接就能扩出cDNA呢？而且做了几十个sample，只
有一个有这样的PCR 产物。颠覆中心法则阿。

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● 请教高手们一个knockin的问题，用cDNA和fulllength genomic DNA 有那些考究	● 验证sgRNA用什么样的细胞系合适
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