x****s
发帖数: 29 | 1 没做过甲基化或者乙酰化的实验，想问一下这种epigenetic的修饰是不是transient的
实验无法检测。
比如说，我发现在稳定转染一个外源A基因的细胞株里，B基因的表达有上调，体外构建
了B基因promoter的报告基因，但是没有发现A对其有任何激活。不过，分析稳转细胞株
发现，B基因的启动子区域有乙酰化(对照株没有)，这样的结果能解释A对B的上调吗？
这能不能说明表观遗传的修饰需要相当的时间呢？谢谢。 |
L****T
发帖数: 169 | 2 首先回答你第一个问题，答案是不确定，因为我的经验里Epigenetic修饰的变化有时候
transient实验可以检测到，有时候不能。
具体而言，你描述的实验分别检测的是short term与long term的效应。稳定转染看的
是long term的效应（>1 week），而luciferase reporter assay一般是short term的
效应（24-72h）。short term和long term效应有可能会不一致的。正如你所说可能需
要更长的时间，也可能你的reporter压根不能很好模拟B基因的染色质结构。你检测到
稳转细胞株里B基因启动子区域有乙酰化（对照株没有），这个结果确实可以解释为A基
因编码的蛋白质通过表观遗传方式来调控B基因，
One question: 你试过transient over-expression A基因，是否可以检测到B基因表达
水平的变化以及启动子乙酰化的变化？ |
x****s
发帖数: 29 | 3 多谢详尽的解释，就是说表观遗传修饰是不好用transient的方法来检测的吧，至于你
说到reporter不能模拟实际B基因染色质结构，我觉得可以理解，不过想问一下有没有
相关文章可以参考一下，谢谢。
实际上这是别人文章的结果，自己以前也有类似的疑惑，所以就问了一下。至于你提到
的那个问题，我在文章里没有看到，所有数据都是来自稳转细胞株，或者是knockdown
结果，没有瞬时转染。其实这里面也有点小问题，如果乙酰化修饰导致的上调的话，应
该是个long term的结果，knockdown和overexpression都是看short term，把
knockdown结果放这里似乎跟机制有点矛盾。 |
