s****s
发帖数: 16 | 1 实验碰到难题了。最近从原代细胞里提取了genomic DNA，在agarose（ETBR）胶上可以
看到很清楚的band。然后用新购买的Qiagen的Epitech Bilsulte kit作bisulite
treatment。gDNA的input量是2 ug。 一切按照protocol做和DNA clean和column收集。
260／280 ratio 是2左右。但是到最后跑胶（200ng），什么都没有见到。做了几次，
都是这样。犹豫是否继续下一步的PCR。请有经验的大侠帮trouble shooting一下。不
胜感激。 |
g********6
发帖数: 86 | 2 直接pcr吧，一般conversion完了不用电泳看的。bisulfite conversion后大部分DNA降
解掉是正常的，尤其是qiagen kit.如果pcr做不出来可以试试zymo的kit,对DNA损伤小
一些。 |
k*****o
发帖数: 148 | 3 正常，继续。Bisulfite convert完了的DNA是单链DNA，用可以染单链DNA的dye才能看
到。
【在 s****s 的大作中提到】
: 实验碰到难题了。最近从原代细胞里提取了genomic DNA，在agarose（ETBR）胶上可以
: 看到很清楚的band。然后用新购买的Qiagen的Epitech Bilsulte kit作bisulite
: treatment。gDNA的input量是2 ug。 一切按照protocol做和DNA clean和column收集。
: 260／280 ratio 是2左右。但是到最后跑胶（200ng），什么都没有见到。做了几次，
: 都是这样。犹豫是否继续下一步的PCR。请有经验的大侠帮trouble shooting一下。不
: 胜感激。
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s****s
发帖数: 16 | 4 谢谢二位的解答。
【在 k*****o 的大作中提到】
: 正常，继续。Bisulfite convert完了的DNA是单链DNA，用可以染单链DNA的dye才能看
: 到。
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