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Biology版 - deep seq 对生物学有多少现实意义
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回国创业_分子诊断Bioinformatics Position in a Genomics Center in a University in the Southern California
chip-Seq大家都在哪个公司做啊?active motif太贵了求助 RNA in vitro transcription
借人气问一个半年搞不定的专业问题?【包子求助】call SNPs 有哪些工具??
请教一个测序的问题华大必死
请问DNA methylation 测量有什么特别的问题吗?想做CHIP-seq,先做什么预实验?
Bioinformatics Position in a Genomics Center in a University in the Southern California几家测序仪公司的发展
Bioinformatics Position in a Genomics Center in a University in the Southern California包子请教23andme问题
相关话题的讨论汇总
话题: seq话题: 测序话题: ngs话题: 现实意义话题: 生物学
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G********e
发帖数: 528
1
DNA-seq 大家都知道,测序完了不知道做什么
chip-seq,bisulfite-seq 无非就是发现转录因子的一些结合位点,或者不同条件下不
同结合位点,其实说到底也没啥奇怪的,而且太多的secondary效果,经常说不出所以
然。
RNA-seq 用处稍大点,可能能找出来东西
还有啥?
胚胎测序是我见过最有用的了
s*********y
发帖数: 292
2
所有的组学都有这问题
看着一坨坨的大数据,不知道该干什么

【在 G********e 的大作中提到】
: DNA-seq 大家都知道,测序完了不知道做什么
: chip-seq,bisulfite-seq 无非就是发现转录因子的一些结合位点,或者不同条件下不
: 同结合位点,其实说到底也没啥奇怪的,而且太多的secondary效果,经常说不出所以
: 然。
: RNA-seq 用处稍大点,可能能找出来东西
: 还有啥?
: 胚胎测序是我见过最有用的了

l********8
发帖数: 197
3
大家都是混口饭吃,何必那么直接了?以后这些data会被智慧的人类发现更多用处的。
e*******n
发帖数: 2178
4
这个问题挺难回答了。也许没什么意义。也许意义重大,就像第谷在等待开普勒。
s******s
发帖数: 13035
5
大医院所有癌症病人,有条件的都开始测序了。这玩意儿已经从实验室进入临床了,你
还在这里问对生物学有多少现实意义, 我服了

【在 G********e 的大作中提到】
: DNA-seq 大家都知道,测序完了不知道做什么
: chip-seq,bisulfite-seq 无非就是发现转录因子的一些结合位点,或者不同条件下不
: 同结合位点,其实说到底也没啥奇怪的,而且太多的secondary效果,经常说不出所以
: 然。
: RNA-seq 用处稍大点,可能能找出来东西
: 还有啥?
: 胚胎测序是我见过最有用的了

c*****u
发帖数: 439
6
好发文章,就是对薄后和pi 的 最大意义。
j****n
发帖数: 3370
7
这玩意最大好处就是不管得到啥结果
都能分析出点东西 可以灌水
当然也有高手能整出大paper的

★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.7

【在 G********e 的大作中提到】
: DNA-seq 大家都知道,测序完了不知道做什么
: chip-seq,bisulfite-seq 无非就是发现转录因子的一些结合位点,或者不同条件下不
: 同结合位点,其实说到底也没啥奇怪的,而且太多的secondary效果,经常说不出所以
: 然。
: RNA-seq 用处稍大点,可能能找出来东西
: 还有啥?
: 胚胎测序是我见过最有用的了

m***T
发帖数: 11058
8
有空读读这几篇文章,或许对你了解现实意义会有所帮助。ngs还没有成为临床检验的
标准,要做到这一点可能还要经历一段时日(不管是技术上、成本上还是临床对其的认
可程度等),但目前看这是趋势。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23788249
http://www.esmo.org/Policy/Position-Statements-Recommendations/
http://www.nature.com/gim/journal/v15/n9/full/gim201392a.html
http://www.americanscientist.org/issues/id.16205,y.0,no.,conten
w**k
发帖数: 6722
9
每年两百亿美刀的市场,被你们说成了:没什么意义,有可能发好文章。
口气还能再大一点么?
n******7
发帖数: 12463
10
我也服了
满口大话的真多

【在 s******s 的大作中提到】
: 大医院所有癌症病人,有条件的都开始测序了。这玩意儿已经从实验室进入临床了,你
: 还在这里问对生物学有多少现实意义, 我服了

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请问DNA methylation 测量有什么特别的问题吗?Bioinformatics Position in a Genomics Center in a University in the Southern California
Bioinformatics Position in a Genomics Center in a University in the Southern CaliforniaBioinformatics Position in a Genomics Center in a University in the Southern California
Bioinformatics Position in a Genomics Center in a University in the Southern California求助 RNA in vitro transcription
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c**o
发帖数: 56
11
我们group有病人,分析家族数据,找到致病的位点。已经作了好多个病人了。有个人
专门和病人联系,打电话,跟他们讲分析的结果。不过一般都是whole exon seq

【在 G********e 的大作中提到】
: DNA-seq 大家都知道,测序完了不知道做什么
: chip-seq,bisulfite-seq 无非就是发现转录因子的一些结合位点,或者不同条件下不
: 同结合位点,其实说到底也没啥奇怪的,而且太多的secondary效果,经常说不出所以
: 然。
: RNA-seq 用处稍大点,可能能找出来东西
: 还有啥?
: 胚胎测序是我见过最有用的了

s******s
发帖数: 13035
12
现实就是这样, 你不服也没用.
这玩意儿发展太快,前两年还都几百几百的测,现在的program都是成千上万的测了。
现在30x全基因组最低成本已经$1000了,更别说医院一般都是做exon。现在支持医
院里面NGS的funding/contract/trial多如牛毛, 你看看几家大的癌症中心吧。现在就
差最后一脚lobby让insurance公司进入了。

【在 n******7 的大作中提到】
: 我也服了
: 满口大话的真多

G********e
发帖数: 528
13
我是外行
所以有些搞不明白
我觉得基因组数据基本上就是表型基因型的问题
可能可以调出来一些特殊遗传病
只是真正的普遍的生物学医学问题都相当复杂,衰老,再生,糖尿病,癌症等等
测序都不能很好解决
个体化治疗成功也不是很普遍吧

【在 s******s 的大作中提到】
: 现实就是这样, 你不服也没用.
: 这玩意儿发展太快,前两年还都几百几百的测,现在的program都是成千上万的测了。
: 现在30x全基因组最低成本已经$1000了,更别说医院一般都是做exon。现在支持医
: 院里面NGS的funding/contract/trial多如牛毛, 你看看几家大的癌症中心吧。现在就
: 差最后一脚lobby让insurance公司进入了。

w**k
发帖数: 6722
14
要是医疗保险能保测序的话,哇,那ILMN股票第二天就会翻番

【在 s******s 的大作中提到】
: 现实就是这样, 你不服也没用.
: 这玩意儿发展太快,前两年还都几百几百的测,现在的program都是成千上万的测了。
: 现在30x全基因组最低成本已经$1000了,更别说医院一般都是做exon。现在支持医
: 院里面NGS的funding/contract/trial多如牛毛, 你看看几家大的癌症中心吧。现在就
: 差最后一脚lobby让insurance公司进入了。

n******7
发帖数: 12463
15
靠,我说lz
我就做这个的,我当然知道

【在 s******s 的大作中提到】
: 现实就是这样, 你不服也没用.
: 这玩意儿发展太快,前两年还都几百几百的测,现在的program都是成千上万的测了。
: 现在30x全基因组最低成本已经$1000了,更别说医院一般都是做exon。现在支持医
: 院里面NGS的funding/contract/trial多如牛毛, 你看看几家大的癌症中心吧。现在就
: 差最后一脚lobby让insurance公司进入了。

n******7
发帖数: 12463
16
这一年参加了几次会议
怎么把测序整到保险里面去是个专门session

【在 w**k 的大作中提到】
: 要是医疗保险能保测序的话,哇,那ILMN股票第二天就会翻番
n******7
发帖数: 12463
17
癌症的个性化医疗目前主要是根据一些关键mutation选择治疗方案以及检测癌症复发

【在 G********e 的大作中提到】
: 我是外行
: 所以有些搞不明白
: 我觉得基因组数据基本上就是表型基因型的问题
: 可能可以调出来一些特殊遗传病
: 只是真正的普遍的生物学医学问题都相当复杂,衰老,再生,糖尿病,癌症等等
: 测序都不能很好解决
: 个体化治疗成功也不是很普遍吧

s******s
发帖数: 13035
18
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
现在全是往个体化治疗走了。新药难搞,太慢太贵,现在药厂都先搞mutation
specific
的药出来批了,然后再慢慢做trial看看其他population的效果,一点点扩大。FDA也支持
这么搞,推出的fast track,然这种要测marker的高效药快上。说实话,这玩意暂时不用
NGS,不过既然做了,不管是医院还是药厂都愿意搞ngs,反正一个marker也是测,还
不如都测了,反正便宜,以后做分析也方便。
另外,还有以前failed掉的药物candidate,现在也可以挖出来看看特定population里面
的效果,这都是宝啊。
唯一阻碍大爆发的就是保险了。现在测序还都是依靠NCI的funding/contract,还有
药厂/biotech给钱,也只要大的consortium /corporate group或者大医院能分到大
饼。其实上游illumina,下游各种数据分析的公司都准备好了,就等保险公司进入了。
w**k
发帖数: 6722
19
另外,还有以前failed掉的药物candidate,现在也可以挖出来看看特定population里
面的效果,这都是宝啊。
~~~~~~~~~~~~~~~~~~这个的确是宝。想想看,以前三期失败的但还是有点效果的药物,
很多都可以选定特定病人群来重新做三期。以前的一期二期可以不用做了,等于直接三
期然后新药。不过,目前好像研究还没有到位,没有这样的申请出来 --- 也许我错过
了。

支持
不用
里面

【在 s******s 的大作中提到】
: ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
: 现在全是往个体化治疗走了。新药难搞,太慢太贵,现在药厂都先搞mutation
: specific
: 的药出来批了,然后再慢慢做trial看看其他population的效果,一点点扩大。FDA也支持
: 这么搞,推出的fast track,然这种要测marker的高效药快上。说实话,这玩意暂时不用
: NGS,不过既然做了,不管是医院还是药厂都愿意搞ngs,反正一个marker也是测,还
: 不如都测了,反正便宜,以后做分析也方便。
: 另外,还有以前failed掉的药物candidate,现在也可以挖出来看看特定population里面
: 的效果,这都是宝啊。
: 唯一阻碍大爆发的就是保险了。现在测序还都是依靠NCI的funding/contract,还有

m******5
发帖数: 1383
20
ngs对生物医学所有方向的作用都是革命性的。
以前在molecular machanism上还需要strong hypothesis 来drive
现在又回归到descriptive的阶段了,很快会有大突破。
医学方面的作用就不说了
至于你说的 测序完不知道做什么
其实正是学科发展的体现
一是线性化的story telling再大量data面前已经不太管用了
二是没有广泛知识再难以以偏概全地说故事了
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【包子求助】call SNPs 有哪些工具??几家测序仪公司的发展
华大必死包子请教23andme问题
想做CHIP-seq,先做什么预实验?没人关注illumina股票狂跌25%?
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s****i
发帖数: 5469
21
用失败的老家伙直接三期然后出新药,这老家伙的专利怎么办?之前的一二期算上
,加上中间失败后的时间,再来个三期,超过20年都不奇怪。专利失效了药厂怕是没兴
趣继续弄了

【在 w**k 的大作中提到】
: 另外,还有以前failed掉的药物candidate,现在也可以挖出来看看特定population里
: 面的效果,这都是宝啊。
: ~~~~~~~~~~~~~~~~~~这个的确是宝。想想看,以前三期失败的但还是有点效果的药物,
: 很多都可以选定特定病人群来重新做三期。以前的一期二期可以不用做了,等于直接三
: 期然后新药。不过,目前好像研究还没有到位,没有这样的申请出来 --- 也许我错过
: 了。
:
: 支持
: 不用
: 里面

G********e
发帖数: 528
22
说的比较靠谱 ngs会是一个载入史册的技术
但是仍然解决不了很多问题
没有许多人吹的那么神奇
市场大并不等同科学意义
做市场并不是做科学
就是画圈圈的故事
信息量越大,圈也越大,圈外不懂的东西也越来越多
期待下个革命的到来

【在 m******5 的大作中提到】
: ngs对生物医学所有方向的作用都是革命性的。
: 以前在molecular machanism上还需要strong hypothesis 来drive
: 现在又回归到descriptive的阶段了,很快会有大突破。
: 医学方面的作用就不说了
: 至于你说的 测序完不知道做什么
: 其实正是学科发展的体现
: 一是线性化的story telling再大量data面前已经不太管用了
: 二是没有广泛知识再难以以偏概全地说故事了

w**k
发帖数: 6722
23
只能说这个世界上sb太多了

【在 G********e 的大作中提到】
: 说的比较靠谱 ngs会是一个载入史册的技术
: 但是仍然解决不了很多问题
: 没有许多人吹的那么神奇
: 市场大并不等同科学意义
: 做市场并不是做科学
: 就是画圈圈的故事
: 信息量越大,圈也越大,圈外不懂的东西也越来越多
: 期待下个革命的到来

s******s
发帖数: 13035
24
具体不知道。不过专利都是一层一层的,而且还可以开发衍生药物,药厂这么做总是
知道有好处的

【在 s****i 的大作中提到】
: 用失败的老家伙直接三期然后出新药,这老家伙的专利怎么办?之前的一二期算上
: ,加上中间失败后的时间,再来个三期,超过20年都不奇怪。专利失效了药厂怕是没兴
: 趣继续弄了

s******s
发帖数: 13035
25
不过illumina这技术实在是落伍,通量再高,分析结构变化还是
一塌糊涂。能一统江湖还是竞争对手不争气

【在 m******5 的大作中提到】
: ngs对生物医学所有方向的作用都是革命性的。
: 以前在molecular machanism上还需要strong hypothesis 来drive
: 现在又回归到descriptive的阶段了,很快会有大突破。
: 医学方面的作用就不说了
: 至于你说的 测序完不知道做什么
: 其实正是学科发展的体现
: 一是线性化的story telling再大量data面前已经不太管用了
: 二是没有广泛知识再难以以偏概全地说故事了

1 (共1页)
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包子请教23andme问题请教一个测序的问题
没人关注illumina股票狂跌25%?请问DNA methylation 测量有什么特别的问题吗?
咨询肿瘤样品测序的公司,先谢了。Bioinformatics Position in a Genomics Center in a University in the Southern California
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chip-Seq大家都在哪个公司做啊?active motif太贵了求助 RNA in vitro transcription
借人气问一个半年搞不定的专业问题?【包子求助】call SNPs 有哪些工具??
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话题: seq话题: 测序话题: ngs话题: 现实意义话题: 生物学