b**********8 发帖数: 349 | 1 又来请教各位大侠了,
我最近发现对一株细胞做某种处理后,一个基因(暂命名为A)的mRNA和protein都显著
下调,结果已经重复多次。现在推测这种处理因素可能会影响细胞株中A基因的转录,
于是构建了一系列逐渐缩短的启动子报告基因(基于pGL3-basic载体)和renilla载体
一起转染细胞。双荧光素酶报告基因分析发现从转录起始位点上游1000bp处开始,一直
到上游150bp,跟对照处理相比,处理组细胞的报告基因的活性一直都有显著下降。见
图A所示。但是当把所有组的报告基因活性都先被对照组pGL3-promoter的活性
normalise后,统计分析却显示到上游200bp时报告基因的活性就没有差异了。两张
figure都是在grapad prism里面用two way anova做的统计分析,结果却截然不同,这
关系到我接下来具体分析哪一个区域的问题,请大家帮我看看,到底哪一种统计方法更
合理?谢谢 |
C*********h 发帖数: 83 | 2 描述太混乱了。
【在 b**********8 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 又来请教各位大侠了, : 我最近发现对一株细胞做某种处理后,一个基因(暂命名为A)的mRNA和protein都显著 : 下调,结果已经重复多次。现在推测这种处理因素可能会影响细胞株中A基因的转录, : 于是构建了一系列逐渐缩短的启动子报告基因(基于pGL3-basic载体)和renilla载体 : 一起转染细胞。双荧光素酶报告基因分析发现从转录起始位点上游1000bp处开始,一直 : 到上游150bp,跟对照处理相比,处理组细胞的报告基因的活性一直都有显著下降。见 : 图A所示。但是当把所有组的报告基因活性都先被对照组pGL3-promoter的活性 : normalise后,统计分析却显示到上游200bp时报告基因的活性就没有差异了。两张 : figure都是在grapad prism里面用two way anova做的统计分析,结果却截然不同,这 : 关系到我接下来具体分析哪一个区域的问题,请大家帮我看看,到底哪一种统计方法更
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v*******e 发帖数: 11604 | 3 不是很了解你的领域,你得看看别人怎么做的,你那启动子报告基因的protocol怎么说
的。不太了解,只是觉得可能normalize之后的结果才是对的吧。 |
b**********8 发帖数: 349 | 4 不好意思,可能是我的表达能力不够,不过请大家耐心的看一下,然后参考我贴的示意
图,就能明白我的问题是什么了,谢谢! |
v*******e 发帖数: 11604 | 5
你那图,大部分人都看不了吧。改成jpg吧。
【在 b**********8 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 不好意思,可能是我的表达能力不够,不过请大家耐心的看一下,然后参考我贴的示意 : 图,就能明白我的问题是什么了,谢谢!
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m******5 发帖数: 1383 | 6 其实大多promoter reporter就是扯淡的
特别是proximal promoter.很多时候regulation明明在distal
enhancer上,还煞有介事地在proximal promoter上研究半天 |