请教了解450k 甲基化芯片分析的朋友 - Biology版 - 未名存档

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Biology版 - 请教了解450k 甲基化芯片分析的朋友

相关主题
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相关话题的讨论汇总
话题: ncbi话题: 甲基化话题: 450k话题: illumina话题: 基因

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x*****e 发帖数: 309	1 Illumina HumanMethylation 450K BeadChip kit (Illumina, San Diego, CA, USA) 查到一篇文章里面有个我感兴趣的基因甲基化位点(CpG 位于基因的 5 UTR)，但是我按照文章给出的位置（Chromsome N,position XXXXX，）去NCBI找，对应的却不是我感兴趣的基因，相差200kb。我又找了另外几个文章中的甲基化位置，自己在NCBI上找了找，还是对不上，不知道什么原因。难道那篇文章参照不是NCBI的数据？还是NCBI 数据更新了？先谢了！
a**r 发帖数: 352	2 先确认genome的assembly version， ncbi好像已经全面升级到hg38(GRCh38)了, 我猜你的450K还是hg19的吧。
x*****e 发帖数: 309	3 的确如此，多谢多谢！【在 a**r 的大作中提到】 : 先确认genome的assembly version， ncbi好像已经全面升级到hg38(GRCh38)了, 我猜 : 你的450K还是hg19的吧。

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● 怎么区别甲基化的和没有convert的CpG位点？	● 大家有没有经历过这种情况？
● 关于DNA methylation的问题,请大师指点!	● 一个基因为什么需要多个transcript variant ？
● 求教高手：转基因小鼠的疑问？	● 提交sequence到NCBI database.
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