那位老大过来指点一下 exon/intron splicing - Biology版

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Biology版 - 那位老大过来指点一下 exon/intron splicing

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相关话题的讨论汇总
话题: splicing话题: variants话题: ensembl话题: microexon话题: intron

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C*********m
发帖数: 213

问题是这样的，我有个基因有19个exons，然后老鼠同源蛋白有两个splicing variants
中间差一段编码的肽段，很短，很可能是microexon引起的，在不同组织里表达不一样
；然后我就想看看人里面的是不是也会有类似的splicing variants，也想找一下
microexon的可能。那就想看序列，看splicing位点，编码序列的比对，可貌似ensembl
.org查起来不太方便。
想问:怎么查找人源蛋白里是否存在类似的splicing variants?

l*******t
发帖数: 1016

ensembl用习惯就方便了

variants
ensembl

【在 C*********m 的大作中提到】

: 问题是这样的，我有个基因有19个exons，然后老鼠同源蛋白有两个splicing variants
: 中间差一段编码的肽段，很短，很可能是microexon引起的，在不同组织里表达不一样
: ；然后我就想看看人里面的是不是也会有类似的splicing variants，也想找一下
: microexon的可能。那就想看序列，看splicing位点，编码序列的比对，可貌似ensembl
: .org查起来不太方便。
: 想问:怎么查找人源蛋白里是否存在类似的splicing variants?

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相关主题
● 发现了alternative splicing form 但是没有蛋白表达，有必要继	● 碰到个狗血问题，请蛋白降解方面的大牛多指教
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● 请教高手们一个knockin的问题，用cDNA和fulllength genomic DNA 有那些考究	● PostDoc position available
● What is advantage and disadvantage of intronless genes	● splice acceptor sequence问题求助
● 问问关于 variant transcripts 研究方法	● 请问：基因5’UTR 长度一定会大于25bp吗？（设计Mopholino antisense oligomer）
● Re: A question on PCR efficiency	● exons for a gene 有包子奖励
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