O*T
发帖数: 7 | |
s******s
发帖数: 13035 | 2 这玩意儿有人用么？出来之前宣传的太牛X，出来以后我听到过用的人，没说过这个的
好话
【在 O*T 的大作中提到】
: Applications Bioinformatician
: https://nanoporetech.com/careers/career-opportunities/view/247
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t*****z
发帖数: 1598 | 3 最近有篇Genome Research的paper讲ONT+MiSeq的pipeline，号称可以大幅降低error
rate，不知ONT官方有何评价？
【在 s******s 的大作中提到】
: 这玩意儿有人用么？出来之前宣传的太牛X，出来以后我听到过用的人，没说过这个的
: 好话
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n******7
发帖数: 12463 | 4 link plz？
前几年pacbio要死的时候，也是这种hybrid 策略救了一命
目前ONT的error rate比pacbio还高一个数量级
不知道还有救没有
ONT的直接竞争者应该就是pacbio
【在 t*****z 的大作中提到】
: 最近有篇Genome Research的paper讲ONT+MiSeq的pipeline，号称可以大幅降低error
: rate，不知ONT官方有何评价？
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s******r
发帖数: 1245 | 5 用这种hybrid就是彻底承认自己不行了，饮鸠止渴来续命
对投资者来说打击巨大，对使用者来说，反正也没多少人正在用或者将要用
【在 n******7 的大作中提到】
: link plz？
: 前几年pacbio要死的时候，也是这种hybrid 策略救了一命
: 目前ONT的error rate比pacbio还高一个数量级
: 不知道还有救没有
: ONT的直接竞争者应该就是pacbio
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n******7
发帖数: 12463 | 6 nanopore和pacbio的特点是long reads
在splicing，genome sv， de novo assembly等领域还是很有用的
【在 s******r 的大作中提到】
: 用这种hybrid就是彻底承认自己不行了，饮鸠止渴来续命
: 对投资者来说打击巨大，对使用者来说，反正也没多少人正在用或者将要用
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h*********9
发帖数: 35 | 7 只要coverage 够高，那点error rate算啥，校正一下就行。这种数据，statistician
的最爱。
【在 n******7 的大作中提到】
: nanopore和pacbio的特点是long reads
: 在splicing，genome sv， de novo assembly等领域还是很有用的
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t*****z
发帖数: 1598 | 8 链接在这：
http://genome.cshlp.org/content/early/2015/10/07/gr.191395.115.abstract
这种策略对de novo assembly确实很有帮助。
PacBio已经出了牛逼的Sequel，ONT更加没希望了。
【在 n******7 的大作中提到】
: link plz？
: 前几年pacbio要死的时候，也是这种hybrid 策略救了一命
: 目前ONT的error rate比pacbio还高一个数量级
: 不知道还有救没有
: ONT的直接竞争者应该就是pacbio
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