c****t 发帖数: 194 | 1 如何下载不同phylum的16s rRNA的序列,然后alignment?
是一组,不是某一个序列。直接从RDP下载都是20-60千的序列。
大家怎么弄的? |
A***u 发帖数: 3714 | 2 不同phylum ... Cool.. 好高大山。。
你知道自己在说个什么吗?我专门学习动物分类2年,所以phylum 对我是个敏感词。。
Xenopys, zebrafish , mouse, arobidopsis, human, drosophila, worm(c.elefant)
,etc... 都有各自的data base ...
还有几个model animal,?
你不用查书,跟我这样闭着眼睛,离开学术界6年后写出来。。
【在 c****t 的大作中提到】 : 如何下载不同phylum的16s rRNA的序列,然后alignment? : 是一组,不是某一个序列。直接从RDP下载都是20-60千的序列。 : 大家怎么弄的?
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c****t 发帖数: 194 | 3 bacteria only
PHYLA
Bacteria|Actinobacteria
Bacteria|Bacteroidetes
Bacteria|Cyanobacteria
Bacteria|Deferribacteres
Bacteria|Firmicutes
Bacteria|Fusobacteria
Bacteria|Gemmatimonadetes
Bacteria|Proteobacteria
Bacteria|Spirochaetes
Bacteria|TM7
Bacteria|Tenericutes
Bacteria|Thermi
Bacteria|Verrucomicrobia |
F*******n 发帖数: 813 | 4 intertsting......
我 还以为你要比较不同phylum...
微生物,要问Wendy...
【在 c****t 的大作中提到】 : bacteria only : PHYLA : Bacteria|Actinobacteria : Bacteria|Bacteroidetes : Bacteria|Cyanobacteria : Bacteria|Deferribacteres : Bacteria|Firmicutes : Bacteria|Fusobacteria : Bacteria|Gemmatimonadetes : Bacteria|Proteobacteria
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