c****t
发帖数: 194 | 1 如何下载不同phylum的16s rRNA的序列，然后alignment?
是一组，不是某一个序列。直接从RDP下载都是20-60千的序列。
大家怎么弄的？ |
A***u
发帖数: 3714 | 2 不同phylum ... Cool.. 好高大山。。
你知道自己在说个什么吗？我专门学习动物分类2年，所以phylum 对我是个敏感词。。
Xenopys, zebrafish , mouse, arobidopsis, human, drosophila, worm(c.elefant)
，etc... 都有各自的data base ...
还有几个model animal,？
你不用查书，跟我这样闭着眼睛，离开学术界6年后写出来。。
【在 c****t 的大作中提到】
: 如何下载不同phylum的16s rRNA的序列，然后alignment?
: 是一组，不是某一个序列。直接从RDP下载都是20-60千的序列。
: 大家怎么弄的？
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c****t
发帖数: 194 | 3 bacteria only
PHYLA
Bacteria|Actinobacteria
Bacteria|Bacteroidetes
Bacteria|Cyanobacteria
Bacteria|Deferribacteres
Bacteria|Firmicutes
Bacteria|Fusobacteria
Bacteria|Gemmatimonadetes
Bacteria|Proteobacteria
Bacteria|Spirochaetes
Bacteria|TM7
Bacteria|Tenericutes
Bacteria|Thermi
Bacteria|Verrucomicrobia |
F*******n
发帖数: 813 | 4 intertsting......
我 还以为你要比较不同phylum...
微生物，要问Wendy...
【在 c****t 的大作中提到】
: bacteria only
: PHYLA
: Bacteria|Actinobacteria
: Bacteria|Bacteroidetes
: Bacteria|Cyanobacteria
: Bacteria|Deferribacteres
: Bacteria|Firmicutes
: Bacteria|Fusobacteria
: Bacteria|Gemmatimonadetes
: Bacteria|Proteobacteria
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