D***e 发帖数: 44 | 1 手头的KO小鼠一直没做出来任何预设的结果。现在考虑把WT和KO去进行一下在做组织的
蛋白/基因表达分析,想看看可能的pathways和相关的蛋白表达是否有变化(如一些比
较关心的蛋白家族)。懂行的人说说这个思路靠谱不?靠谱的话,该用Microarray,
RNA-Seq还是DGE?已海归在国内,问了些公司,他们的销售都讲不清楚,有推荐
Microarray的,也有大力鼓吹RNA-Seq的。我以前没接触过这一块。其实我的诉求很简
单,就是做不下去了不想浪费,想扩大范围撞撞运气,但这个范围还是在我划定的一块
里面,而上述的测序之类看起来很庞杂的样子,不确定是否为我想要的。而且后期的数
据我不确定公司是否会分析到位。
如果有感兴趣的高手帮助我一起进行分析,可以给劳务费,也可以选择合作文章挂名。 |
k*****2 发帖数: 135 | 2 不太了解DGE,但是RNA-seq比microarray要好。RNA-seq做起来也简单。 |
b******c 发帖数: 27 | 3 Microarray 基本被淘汰了。如果要看的基因不是非常特殊,需要特殊探针才能检测的
话。全都用RNAseq。 |
g*********3 发帖数: 177 | |
D***e 发帖数: 44 | 5 谢谢楼上2位的解答,那就打算用RNA-seq了
【在 b******c 的大作中提到】 : Microarray 基本被淘汰了。如果要看的基因不是非常特殊,需要特殊探针才能检测的 : 话。全都用RNAseq。
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i*********0 发帖数: 915 | 6 Rna-Seq, 不但可以看DEG, 还可以看AS, 这个现在还在浪头上呀, |