s********m
发帖数: 748 | 1 最近准备用Ｑ-trap做ＭＲＭ，目前还不是很熟悉，有个问题还没搞清楚。
做ＭＲＭ之前，为了找transitions,我需要先做一个general的MS/MS identification.
但我现在还不知道样品里可能会有什么蛋白。我以前一直用LTQ做鉴定。我发现Q-trap
里好像需要设定具体的peptide mass(EPI),而不是像LTQ那样可以选most N abundant
peak for fragmentation,或者可以选但我不知道在哪里设定。
还有个问题就是，设定方法的时候，有个ＩＤＡ，first(second)level criterial, 这
个是什么意思啊？first 和second有什么区别？ 比如我ＭＳ选好一个方法，下面加了
一个ＩＤＡlevel criterial是不是对这个方法的一些条件限制和补充啊？
最近急用仪器， 哪位高手可以教教我啊，感激不尽。 | m*******h
发帖数: 896 | 2 QTRAP 里面当然也可以用 Most Nth . 就是一般的IDA, 不MRM.
first criteria可以是Intensity, second的可以是另外一个参数, 比如说Mass range,
charge state
identification.
trap
【在 s********m 的大作中提到】
: 最近准备用Ｑ-trap做ＭＲＭ，目前还不是很熟悉，有个问题还没搞清楚。
: 做ＭＲＭ之前，为了找transitions,我需要先做一个general的MS/MS identification.
: 但我现在还不知道样品里可能会有什么蛋白。我以前一直用LTQ做鉴定。我发现Q-trap
: 里好像需要设定具体的peptide mass(EPI),而不是像LTQ那样可以选most N abundant
: peak for fragmentation,或者可以选但我不知道在哪里设定。
: 还有个问题就是，设定方法的时候，有个ＩＤＡ，first(second)level criterial, 这
: 个是什么意思啊？first 和second有什么区别？ 比如我ＭＳ选好一个方法，下面加了
: 一个ＩＤＡlevel criterial是不是对这个方法的一些条件限制和补充啊？
: 最近急用仪器， 哪位高手可以教教我啊，感激不尽。
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