H****g
发帖数: 2273 | 1 我在医学院做统计，有个数据库看来不错，几个million的EHR。
可是仔细一看，EHR里都是diagnosis，有一些med，没有预后之类的。不知道版上的大
牛们，拿EHR做research的话，一般都是做什么方向啊？
EHR有没有预后信息啊？我怎么觉得现在做个cause of death或者maternity morality
都不能做呢？是在“note”部分里吗？还是完全没有，要继续发掘数据呢？
谢谢指点！！！bow！ |
b******1
发帖数: 466 | 2 ehr预设的信息很多，可是要烦忙的医生一一填写是不现实的，只能有什么做什么。我
以前也遇到类似问题。
您做的是research, 而他们做的是production.
morality
【在 H****g 的大作中提到】
: 我在医学院做统计，有个数据库看来不错，几个million的EHR。
: 可是仔细一看，EHR里都是diagnosis，有一些med，没有预后之类的。不知道版上的大
: 牛们，拿EHR做research的话，一般都是做什么方向啊？
: EHR有没有预后信息啊？我怎么觉得现在做个cause of death或者maternity morality
: 都不能做呢？是在“note”部分里吗？还是完全没有，要继续发掘数据呢？
: 谢谢指点！！！bow！
|
m******h
发帖数: 297 | 3 三种可能，1.数据库设计太烂没有相关的文件和专栏，2.数据库已存在相关文件和专栏
，3.数据库没有专栏但是可以parsing出数据。
针对以上，三种结果，
1. 加入文件和专栏要改变整个EHR的设计，不在你能控制的范围内，安了吧。
2. 睁大眼睛继续寻找。一般来说，数据库内不可能只有一个文件，商业数据库会有上
千的文件，且每一个数据文件都可能有几十甚至上百或好几百的栏。
3. 就看你怎么设parsing的条件了。
现在商业EHR系统功能都非常强悍，你说的这些数据都有，都可以做。如果你的数据库
是内部开发或那种小公司给做的，很烂的可能性太大。
如果你手上的数据库只包括一部分文件，你需要去找全有关EHR的全部文件。如果你的
EHR数据是一个data dump形成的flat file，那么你还是得去找源数据文件。
如果我这个回帖里的术语你都没看懂，请先找书学习一下数据结构，数据库设计。
如果你觉得我的回答有用，请把包子转给版主garland，算是带我对他这一年来的工作
表示感谢。
morality
【在 H****g 的大作中提到】
: 我在医学院做统计，有个数据库看来不错，几个million的EHR。
: 可是仔细一看，EHR里都是diagnosis，有一些med，没有预后之类的。不知道版上的大
: 牛们，拿EHR做research的话，一般都是做什么方向啊？
: EHR有没有预后信息啊？我怎么觉得现在做个cause of death或者maternity morality
: 都不能做呢？是在“note”部分里吗？还是完全没有，要继续发掘数据呢？
: 谢谢指点！！！bow！
|
f****b
发帖数: 2410 | 4 震惊了。懂计算机开发到这个程度的医生，除了本人，现实中还真的没遇到过。
【在 m******h 的大作中提到】
: 三种可能，1.数据库设计太烂没有相关的文件和专栏，2.数据库已存在相关文件和专栏
: ，3.数据库没有专栏但是可以parsing出数据。
: 针对以上，三种结果，
: 1. 加入文件和专栏要改变整个EHR的设计，不在你能控制的范围内，安了吧。
: 2. 睁大眼睛继续寻找。一般来说，数据库内不可能只有一个文件，商业数据库会有上
: 千的文件，且每一个数据文件都可能有几十甚至上百或好几百的栏。
: 3. 就看你怎么设parsing的条件了。
: 现在商业EHR系统功能都非常强悍，你说的这些数据都有，都可以做。如果你的数据库
: 是内部开发或那种小公司给做的，很烂的可能性太大。
: 如果你手上的数据库只包括一部分文件，你需要去找全有关EHR的全部文件。如果你的
|
g*****d
发帖数: 991 | 5 你是我们的好同志啊。热泪盈眶中。
这个EHR里做Research，没有医生主导，什么也干不了，你都不知道自己看什么。EHR方
便医生做回顾性调查，以前都要到病案室一份份调病历。建议找个医生，他出Idea，你
出力。
【在 m******h 的大作中提到】
: 三种可能，1.数据库设计太烂没有相关的文件和专栏，2.数据库已存在相关文件和专栏
: ，3.数据库没有专栏但是可以parsing出数据。
: 针对以上，三种结果，
: 1. 加入文件和专栏要改变整个EHR的设计，不在你能控制的范围内，安了吧。
: 2. 睁大眼睛继续寻找。一般来说，数据库内不可能只有一个文件，商业数据库会有上
: 千的文件，且每一个数据文件都可能有几十甚至上百或好几百的栏。
: 3. 就看你怎么设parsing的条件了。
: 现在商业EHR系统功能都非常强悍，你说的这些数据都有，都可以做。如果你的数据库
: 是内部开发或那种小公司给做的，很烂的可能性太大。
: 如果你手上的数据库只包括一部分文件，你需要去找全有关EHR的全部文件。如果你的
|
H****g
发帖数: 2273 | 6 主要用的是EPIC的，还有cerner的，确定不是自己研发或小公司出品。麻烦问问有
预后的内容吗？如果是EPIC，一般在哪里啊？
确实，手头可以申请access的有两个数据库，一个是只包含EPIC家部分内容的flat
files，只有diagnosis, vitals, med, lab, procedure等几个files，简单的参数，比
如CPT codes，没有预后。
另一个数据库说是所有源文件，但是管理access的是纯搞数据库，我是纯做统计，数据
结构基本原理倒是学过皮毛，可是头次接触EHR，都不是很确定预后及相关应该在哪里
找啊。
听你的，包子发给斑竹了~谢谢！
【在 m******h 的大作中提到】
: 三种可能，1.数据库设计太烂没有相关的文件和专栏，2.数据库已存在相关文件和专栏
: ，3.数据库没有专栏但是可以parsing出数据。
: 针对以上，三种结果，
: 1. 加入文件和专栏要改变整个EHR的设计，不在你能控制的范围内，安了吧。
: 2. 睁大眼睛继续寻找。一般来说，数据库内不可能只有一个文件，商业数据库会有上
: 千的文件，且每一个数据文件都可能有几十甚至上百或好几百的栏。
: 3. 就看你怎么设parsing的条件了。
: 现在商业EHR系统功能都非常强悍，你说的这些数据都有，都可以做。如果你的数据库
: 是内部开发或那种小公司给做的，很烂的可能性太大。
: 如果你手上的数据库只包括一部分文件，你需要去找全有关EHR的全部文件。如果你的
|
H****g
发帖数: 2273 | 7 谢谢指点。我也是这么想的，找个医生合作。可是我想先有个大概的方向，免得一头雾
水遭医生鄙视啊，医生也都挺忙的~
简单但是比较clean的那个数据库是没有预后，只有diagnosis, vitals, med, lab,
procedures，这能做哪方面的研究呢？
比较comprehensive的那个数据库我倒是可以申请Access，但是管数据access的人非要
我先确定”Do you know if the data you are looking for is captured in cerner
or epic?“
于是我就凌乱了，上来问问大牛们~
【在 g*****d 的大作中提到】
: 你是我们的好同志啊。热泪盈眶中。
: 这个EHR里做Research，没有医生主导，什么也干不了，你都不知道自己看什么。EHR方
: 便医生做回顾性调查，以前都要到病案室一份份调病历。建议找个医生，他出Idea，你
: 出力。
|
m******h
发帖数: 297 | 8 没用过EPIC，现在用的系统里预后是在assessment plan里输入，你可以问一下医生在
EPIC里的哪个界面的哪一栏里输入预后，最好要一个实例，print screen，这样你去找
dba的时候，他们就可以告诉你是哪个文件的哪个column，如果dba没有source code不
知道对应的文件，他们可以通过那个实例去寻找那个数据的出处。
我不太清楚你为什么要主动做自己设计的全新project，工作里不都是上面头头给什么
项目就做什么项目吗？你是正在上学的学生？想拿手上的数据库练练手？原理上说，只
要是医生们keyin的数据，都可以被pull出来。最好的scenario是你要的数据存在于一
个或几个界面的不同栏目里，不同栏目意味着文件中有不同的column。最糟的是一个大
notes栏，你需要去字符串中提取部分字符（我不知道你自己能不能做，因为这个活儿
通常是dba或者developer才能做）。这个提取的条件可能非常之复杂，因为每个写
notes的人都可能有不同习惯，如果大家都遵循某一规律或者有关键词可以查询，那么
你的数据准确程度才能有保障，大数据和云计算现在干的就是这事儿－从无序的数据中
寻找有意义的数据。
【在 H****g 的大作中提到】
: 主要用的是EPIC的，还有cerner的，确定不是自己研发或小公司出品。麻烦问问有
: 预后的内容吗？如果是EPIC，一般在哪里啊？
: 确实，手头可以申请access的有两个数据库，一个是只包含EPIC家部分内容的flat
: files，只有diagnosis, vitals, med, lab, procedure等几个files，简单的参数，比
: 如CPT codes，没有预后。
: 另一个数据库说是所有源文件，但是管理access的是纯搞数据库，我是纯做统计，数据
: 结构基本原理倒是学过皮毛，可是头次接触EHR，都不是很确定预后及相关应该在哪里
: 找啊。
: 听你的，包子发给斑竹了~谢谢！
|
H****g
发帖数: 2273 | 9 上班用的数据是寄养儿童的心理学数据，很不稳定。想拓展一下，用用临床数据。
谢谢你的建议，很有操作性，我去问问。
方便问一下，你们的系统是自己开发的，还是哪家公司的呢？
[在 mtmoriah (moriah) 的大作中提到：]
：没用过EPIC，现在用的系统里预后是在assessment plan里输入，你可以问一下医生在
：EPIC里的哪个界面的哪一栏里输入预后，最好要一个实例，print screen，这样你去
找dba的时候，他们就可以告诉你是哪个文件的哪个column，如果dba没有source code不
：........... |
m******h
发帖数: 297 | 10 Soarian，西门子公司产品。
Good luck with your project. 感觉你这个项目里数据白噪音可能会很大很大。问问
有经验的做data modeling的人吧。你要是用临床数据，必须要有足够的医学知识才能
看到数据中的相关性。
【在 H****g 的大作中提到】
: 上班用的数据是寄养儿童的心理学数据，很不稳定。想拓展一下，用用临床数据。
: 谢谢你的建议，很有操作性，我去问问。
: 方便问一下，你们的系统是自己开发的，还是哪家公司的呢？
: [在 mtmoriah (moriah) 的大作中提到：]
: ：没用过EPIC，现在用的系统里预后是在assessment plan里输入，你可以问一下医生在
: ：EPIC里的哪个界面的哪一栏里输入预后，最好要一个实例，print screen，这样你去
: 找dba的时候，他们就可以告诉你是哪个文件的哪个column，如果dba没有source code不
: ：...........
|
H****g
发帖数: 2273 | 11 嘿，现在的数据噪声就够大的，免疫力倒是有。
一定会找个医生指点的，谢谢帮忙啦！
【在 m******h 的大作中提到】
: Soarian，西门子公司产品。
: Good luck with your project. 感觉你这个项目里数据白噪音可能会很大很大。问问
: 有经验的做data modeling的人吧。你要是用临床数据，必须要有足够的医学知识才能
: 看到数据中的相关性。
|
