x****6
发帖数: 4339 | 1 基因组序列及注释在此：
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MN908947.2
这个病毒算很大的，有近3万个碱基对，是艾滋病毒的30几倍那么大。
我从来没见过病毒携带如此举行的 多肽 |
O*******n
发帖数: 22 | |
x****6
发帖数: 4339 | 3 我研究过 噬菌体、艾滋病毒等常见病毒，7000 aas的single polypeptide还是第一次见
【在 O*******n 的大作中提到】
: 我擦，你需要从virology101开始补课
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S*******l
发帖数: 4637 | |
x****6
发帖数: 4339 | 5 一个蛋白的平均长度是330 AAs, 7000AAs 要切成21个蛋白。有点多啊。
比如艾滋病毒里 一切三：RNA聚合酶、coast protein 还有一个Integrase
【在 S*******l 的大作中提到】
: 切成功能蛋白
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S*******l
发帖数: 4637 | 6 SARS是pick up了一个人类蛋白基因又duplicate 加变异形成spike protein for entry
. |
S*******l
发帖数: 4637 | 7 SARS是pick up了一个人类蛋白基因又duplicate 加变异形成spike protein for entry
. 光这家伙就1100多 aas |
S*******l
发帖数: 4637 | 8 The genome of SARS-CoV consists of a single, positive-strand RNA that is
approximately 29,700 nucleotides long. The overall genome organization of
SARS-CoV is similar to that of other coronaviruses. The reference genome
includes 13 genes, which encode at least 14 proteins. Two large overlapping
reading frames (ORFs) encompass 71% of the genome. The remainder has 12
potential ORFs, including genes for structural proteins S (spike), E (small
envelope), M (membrane), and N (nucleocapsid). Other potential ORFs code for
unique putative SARS-CoV-specific polypeptides that lack obvious sequence
similarity to known proteins. |
x****6
发帖数: 4339 | 9 谢谢～～
这玩意是通过RNA变成RNA来繁殖的，比HIV还牛，后者至少要经过DNA。所以突变率应该
比HIV还高。
http://en.wikipedia.org/wiki/Coronavirus#/media/File:Coronavirus_
replication.png
overlapping
small
for
【在 S*******l 的大作中提到】
: The genome of SARS-CoV consists of a single, positive-strand RNA that is
: approximately 29,700 nucleotides long. The overall genome organization of
: SARS-CoV is similar to that of other coronaviruses. The reference genome
: includes 13 genes, which encode at least 14 proteins. Two large overlapping
: reading frames (ORFs) encompass 71% of the genome. The remainder has 12
: potential ORFs, including genes for structural proteins S (spike), E (small
: envelope), M (membrane), and N (nucleocapsid). Other potential ORFs code for
: unique putative SARS-CoV-specific polypeptides that lack obvious sequence
: similarity to known proteins.
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p*******n
发帖数: 1 | |
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x****6
发帖数: 4339 | 11 “. Two different proteins, 3CLpro and PL2pro, cleave the large polyproteins
into 16 smaller subunits.”
的确是翻译出一个大多肽，然后剪成16个小蛋白
https://en.wikipedia.org/wiki/Severe_acute_respiratory_syndrome-related_
coronavirus
【在 p*******n 的大作中提到】
: 应该不是翻译成7000AA的多肽。
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E******k
发帖数: 1 | |
p*******n
发帖数: 1 | 13 7000aa的蛋白翻译效率应该极低。
polyproteins
【在 x****6 的大作中提到】
: “. Two different proteins, 3CLpro and PL2pro, cleave the large polyproteins
: into 16 smaller subunits.”
: 的确是翻译出一个大多肽，然后剪成16个小蛋白
: https://en.wikipedia.org/wiki/Severe_acute_respiratory_syndrome-related_
: coronavirus
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O*******n
发帖数: 22 | 14 zika也是
次见
【在 x****6 的大作中提到】
: 我研究过 噬菌体、艾滋病毒等常见病毒，7000 aas的single polypeptide还是第一次见
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O*******n
发帖数: 22 | 15 RNA病毒分正链和逆转录病毒
次见
【在 x****6 的大作中提到】
: 我研究过 噬菌体、艾滋病毒等常见病毒，7000 aas的single polypeptide还是第一次见
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x****6
发帖数: 4339 | 16 我看到数据的第一感觉也是这个。
但是 病毒是一种奇特的存在，很多现象反常识。
【在 p*******n 的大作中提到】
: 7000aa的蛋白翻译效率应该极低。
:
: polyproteins
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x****6
发帖数: 4339 | 17 这些常识我知道
但是1切16这种操作，的确第一次遇到。
【在 O*******n 的大作中提到】
: RNA病毒分正链和逆转录病毒
:
: 次见
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f********g
发帖数: 32 | 18 Re
【在 E******k 的大作中提到】
: 生化武器，只要是锁定特定种族基因靶标。
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V*****2
发帖数: 7930 | 19 大多数突变，对病毒是有害的，随即就被淘汰，消失了。真的能提高病毒感染能力，
避过现有的抗体的突变，少之又少。所以，实际有效突变率，还是非常非常低的。
【在 x****6 的大作中提到】
: 谢谢～～
: 这玩意是通过RNA变成RNA来繁殖的，比HIV还牛，后者至少要经过DNA。所以突变率应该
: 比HIV还高。
: http://en.wikipedia.org/wiki/Coronavirus#/media/File:Coronavirus_
: replication.png
:
: overlapping
: small
: for
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x****6
发帖数: 4339 | 20 看了你另一个贴的发言，你不是千老。
绝大多数突变有害也架不住 病毒在人体内种群的规模。这个规模在米林到比林级别。
你拿一个小数（有益突变率）乘以一个大数（种群规模）是能够乘出一个大数的。
【在 V*****2 的大作中提到】
: 大多数突变，对病毒是有害的，随即就被淘汰，消失了。真的能提高病毒感染能力，
: 避过现有的抗体的突变，少之又少。所以，实际有效突变率，还是非常非常低的。
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V*****2
发帖数: 7930 | 21 所以，你只是千老。如果病毒真的如你所说的突变率那么高，这病毒也就不再是冠状病
毒了，病毒完全会变得不可捉摸。只是你看到的冠状病毒，还保持这冠状病毒的基本特
征，主要的序列并没有发生根本变化，为什么？
就好比人，每个人千差万别，但是绝大多数基因还是相同的。发生突变的大多数都生病
死掉了，到目前为止，并没有出现超人，为什么？
【在 x****6 的大作中提到】
: 看了你另一个贴的发言，你不是千老。
: 绝大多数突变有害也架不住 病毒在人体内种群的规模。这个规模在米林到比林级别。
: 你拿一个小数（有益突变率）乘以一个大数（种群规模）是能够乘出一个大数的。
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r********n
发帖数: 7441 | |
x****6
发帖数: 4339 | 23 你懂个屁，
不同种类的病毒 完全不一样
为什么流感可以有疫苗，但是艾滋病毒研究几十年也没有有效的?
就是因为流感病毒是DNA病毒，艾滋病是RNA反转录病毒，后者突变率高得多：变太快，
根本没法上疫苗。
【在 V*****2 的大作中提到】
: 所以，你只是千老。如果病毒真的如你所说的突变率那么高，这病毒也就不再是冠状病
: 毒了，病毒完全会变得不可捉摸。只是你看到的冠状病毒，还保持这冠状病毒的基本特
: 征，主要的序列并没有发生根本变化，为什么？
: 就好比人，每个人千差万别，但是绝大多数基因还是相同的。发生突变的大多数都生病
: 死掉了，到目前为止，并没有出现超人，为什么？
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V*****2
发帖数: 7930 | 24 HIV病毒变化快，你去看看GILD公司开发的那么多种HIV的药吧，HIV基本已经被控制住
了。GILD公司甚至开始讨论有没有必要继续研发HIV的新药了。
【在 x****6 的大作中提到】
: 你懂个屁，
: 不同种类的病毒 完全不一样
: 为什么流感可以有疫苗，但是艾滋病毒研究几十年也没有有效的?
: 就是因为流感病毒是DNA病毒，艾滋病是RNA反转录病毒，后者突变率高得多：变太快，
: 根本没法上疫苗。
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x****6
发帖数: 4339 | 25 HIV的药是鸡尾酒疗法，就是三+个药一起上，作用与艾滋病毒的不同位置，才治得了它
。为什么？ 单个靶点，一下子就突变掉了，对药耐受。只有多个一起来，三个靶点同
时独立突变到特定基因型的概率要小很多。
但是 丙肝病毒的药就不是鸡尾酒疗法，靶向单个位点即可治愈
【在 V*****2 的大作中提到】
: HIV病毒变化快，你去看看GILD公司开发的那么多种HIV的药吧，HIV基本已经被控制住
: 了。GILD公司甚至开始讨论有没有必要继续研发HIV的新药了。
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V*****2
发帖数: 7930 | 26 我另外一个帖子里，一样强调是复合疫苗啊，并没有说只是纯化出一种蛋白，就可以作
为疫苗。你没有好好读我的另外一个帖子。
HCV的药，不是鸡尾酒疗法？你去看看GILD公司里的药，里面有多少种成分，就知道是
不是鸡尾酒疗法。LOL
我不和你争了，没时间给你上课。希望你在美国学习愉快！真的能学到美国科学的精髓
，否则这个样子，哪天回国，啥都不懂，误己害人。
【在 x****6 的大作中提到】
: HIV的药是鸡尾酒疗法，就是三+个药一起上，作用与艾滋病毒的不同位置，才治得了它
: 。为什么？ 单个靶点，一下子就突变掉了，对药耐受。只有多个一起来，三个靶点同
: 时独立突变到特定基因型的概率要小很多。
: 但是 丙肝病毒的药就不是鸡尾酒疗法，靶向单个位点即可治愈
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l*****d
发帖数: 176 | 27 HIV 能够被现有药物控制了，但是还没有能够被治愈，也没有疫苗。三藩因为是HIV发
源地而产生了一批相关专家，看看武汉能不能在病毒方面拿出点儿东西
: HIV病毒变化快，你去看看GILD公司开发的那么多种HIV的药吧，HIV基本已经被
控制住
: 了。GILD公司甚至开始讨论有没有必要继续研发HIV的新药了。
【在 V*****2 的大作中提到】
: 我另外一个帖子里，一样强调是复合疫苗啊，并没有说只是纯化出一种蛋白，就可以作
: 为疫苗。你没有好好读我的另外一个帖子。
: HCV的药，不是鸡尾酒疗法？你去看看GILD公司里的药，里面有多少种成分，就知道是
: 不是鸡尾酒疗法。LOL
: 我不和你争了，没时间给你上课。希望你在美国学习愉快！真的能学到美国科学的精髓
: ，否则这个样子，哪天回国，啥都不懂，误己害人。
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V*****2
发帖数: 7930 | 28 某种程度上来说，GILD公司并不想真的开发出能治愈HIV的药，因为如果真的治愈了，
它的药就卖不出去了。已经有很多文章说HCV的药，治愈了HCV，断了自己的财路。
HIV的疫苗，不是完全没有。任何一个在美国拿了绿卡的，都知道拿绿卡的时候，被要
求打HIV的疫苗了。有多少效果，就不清楚了。我们开发疫苗，只是希望能达到一定的
抑制作用。真的要治愈，确实很难。
【在 l*****d 的大作中提到】
: HIV 能够被现有药物控制了，但是还没有能够被治愈，也没有疫苗。三藩因为是HIV发
: 源地而产生了一批相关专家，看看武汉能不能在病毒方面拿出点儿东西
:
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: HIV病毒变化快，你去看看GILD公司开发的那么多种HIV的药吧，HIV基本已经被
: 控制住
:
: 了。GILD公司甚至开始讨论有没有必要继续研发HIV的新药了。
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z*****n
发帖数: 36 | 29 真是，买买提那么多申请绿卡的，没有一个跳出来说打过HIV疫苗的
【在 V*****2 的大作中提到】
: 某种程度上来说，GILD公司并不想真的开发出能治愈HIV的药，因为如果真的治愈了，
: 它的药就卖不出去了。已经有很多文章说HCV的药，治愈了HCV，断了自己的财路。
: HIV的疫苗，不是完全没有。任何一个在美国拿了绿卡的，都知道拿绿卡的时候，被要
: 求打HIV的疫苗了。有多少效果，就不清楚了。我们开发疫苗，只是希望能达到一定的
: 抑制作用。真的要治愈，确实很难。
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V*****2
发帖数: 7930 | 30 查了一下，现在绿卡确实不需要打HIV疫苗，可能我记错了，或者若干年前需要打那没
啥效果的HIV疫苗，后来取消了。
【在 z*****n 的大作中提到】
: 真是，买买提那么多申请绿卡的，没有一个跳出来说打过HIV疫苗的
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V*****2
发帖数: 7930 | 31 However, scientists are working to develop one. Building on the findings of
an earlier study that found for the first time, albeit modestly, that a
vaccine could prevent HIV infection in 2016, an NIH-supported clinical trial
was launched to test a modified HIV vaccine. This current vaccine trial,
called HVTN 702, is testing whether an experimental vaccine regimen safely
prevents HIV infection among South African adults. Learn more in this blog
post and in the video below.
以前确实是有HIV疫苗的，拿绿卡是要求被打的。这些年取消了，因为老疫苗对付不了
新HIV。
【在 z*****n 的大作中提到】
: 真是，买买提那么多申请绿卡的，没有一个跳出来说打过HIV疫苗的
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p*a
发帖数: 7676 | 32 几十年前就是被病毒基因忽悠得自己去报了生物专业。
不过运气不错，当年被忽悠的人太多了，竟然被调剂到其他专业去了。
否则我就是千老中的千老了。 |
x*********4
发帖数: 1 | 33
【在 p*a 的大作中提到】
: 几十年前就是被病毒基因忽悠得自己去报了生物专业。
: 不过运气不错，当年被忽悠的人太多了，竟然被调剂到其他专业去了。
: 否则我就是千老中的千老了。
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