x********e
发帖数: 35261 | 1 不要你们做108个基因组的phylogenetic tree，NCBI数据库里有11个美国病例的基因组。
Step1.根据location找到美国病例
Step2.点GenBank超链接获取基因组序列
Step3.选你喜欢的算法进行相似度分析
Step4.以时间为x轴画树
Step5.记录一下你的操作时间截图发菌版证明你的水平
数据库链接：
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/sars-cov-2-seqs/ |
k**********4
发帖数: 16092 | 2 你用的什么软件
组。
【在 x********e 的大作中提到】
: 不要你们做108个基因组的phylogenetic tree，NCBI数据库里有11个美国病例的基因组。
: Step1.根据location找到美国病例
: Step2.点GenBank超链接获取基因组序列
: Step3.选你喜欢的算法进行相似度分析
: Step4.以时间为x轴画树
: Step5.记录一下你的操作时间截图发菌版证明你的水平
: 数据库链接：
: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/sars-cov-2-seqs/
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r***i
发帖数: 1 | 3 麻痹的，千老好像很得意
组。
【在 x********e 的大作中提到】
: 不要你们做108个基因组的phylogenetic tree，NCBI数据库里有11个美国病例的基因组。
: Step1.根据location找到美国病例
: Step2.点GenBank超链接获取基因组序列
: Step3.选你喜欢的算法进行相似度分析
: Step4.以时间为x轴画树
: Step5.记录一下你的操作时间截图发菌版证明你的水平
: 数据库链接：
: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/sars-cov-2-seqs/
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C*********e
发帖数: 1 | |
f****1
发帖数: 1 | |
t********s
发帖数: 4503 | 6 证明习大大水平的时候到了，看他有没有水平LOL
组。
【在 x********e 的大作中提到】
: 不要你们做108个基因组的phylogenetic tree，NCBI数据库里有11个美国病例的基因组。
: Step1.根据location找到美国病例
: Step2.点GenBank超链接获取基因组序列
: Step3.选你喜欢的算法进行相似度分析
: Step4.以时间为x轴画树
: Step5.记录一下你的操作时间截图发菌版证明你的水平
: 数据库链接：
: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/sars-cov-2-seqs/
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x********e
发帖数: 35261 | 7 我没自己跑，是GISAID用Augur建树，然后用Auspice完成网页交互式数据presentation
【在 k**********4 的大作中提到】
: 你用的什么软件
:
: 组。
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d*******y
发帖数: 2710 | 8 大勺才不跟老酱一样沙比去反华反共。
应该是下室老酱把泡面撒了一地，然后又捡起来吃了
【在 C*********e 的大作中提到】
: 大勺们惊慌失措，把鱼香肉丝 掉到了地上
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k**********4
发帖数: 16092 | 9 那为什么要花很多时间
presentation
【在 x********e 的大作中提到】
: 我没自己跑，是GISAID用Augur建树，然后用Auspice完成网页交互式数据presentation
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x********e
发帖数: 35261 | 10 文盲老将夸口自己用R画5分钟就出来了。就算用augur现跑10个样品也不止5分钟。
GISAID是在已有phylogenetic tree的基础上不断加新数据，优化树。
【在 k**********4 的大作中提到】
: 那为什么要花很多时间
:
: presentation
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