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全部话题 - 话题: 基因组
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t*******a
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四万年前北京人DNA成功提取测序:第一个中国古人类基因组
澎湃新闻记者 吴跃伟
2017-10-13 08:08 来源:澎湃新闻
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田园洞遗址外观图 受访者供图
零落成泥碾作尘,只有香如故。
数万年前古人类的基因组也可以从化石中提取出来,也可以测序?
国际上最新的古DNA技术,让数万年甚至几十万年前古人类的DNA从人类化石甚至土壤中
获得,成为一种可能。
北京房山的田园洞曾出土一具四万年前男性的骨骼化石。中国科学院古脊椎动物与古人
类研究所的研究人员从其富含细菌和真菌DNA污染的化石样品中,通过他们和德国合作
团队一同开发的一种特殊的捕获技术,将混杂在大量微生物DNA中极其微量的古人类的
DNA筛选出来,并进行了测序。
由此,中国地区古人类的第一个基因组、整个东亚地区最古老的人类基因组诞生。
科学家们对这一难得的基因组数据进行了充分研究,他们将其与世界范围内各种人群的
基因组数据等进行了比对。研究最终证实,田园洞人属于古东亚人,但他并非现代东亚
人的直接祖先。也就是说,田园洞人这一支系的东亚人没能繁衍至今。
科学家惊讶地发现,四万年前,虽然田园洞人居住在中国北京房山地区,他们却跟来... 阅读全帖
n********y
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2
“公私同行”的疑问:基因组所和华大基因公司 精选
已有 14427 次阅读 2012-11-1 09:39 |个人分类:社会|系统分类:观点评述|关键词:杨
焕明 华大基因
2003年至2007年,杨焕明同时任中国科学院基因组研究所所长和华大基因公司董事长。
中国科学院的研究所是国家事业拨款单位,其所长不仅是国家正规行政体系的厅局级,
而且是法人。华大基因是盈利性私人企业,杨焕明也是其法人。
公私两个机构做同一件事情:基因测序。
对“公私同行”现象有所评论可能不是多余。总结经验教训对后来者有借鉴意义。如果
是好事,应该树立为榜样;如果可行,会有更多的人争相仿;如果有问题,要避免后来
者重复,而且国家需要建立规范。如果发现正反两方面的经验,可以去其糟粕、取其精
华。
本文主要在于科研人员与公司的关系。这并非一个公司的问题,而是高科技企业中有一
定普遍性的问题,不过杨焕明和华大基因较为引人注目而成为了近年生物医药方面的范
例。国外已有公私分离的规范,国内有必要亡羊补牢。
“公私同行”是顺应改革、还是逆改革而动?
我国有过从国立机构转为私营的企业,因为这些国立机构是1950到1970年代计... 阅读全帖
w*********g
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3
中国首次完成人类单个卵细胞高精度基因组测序
字号:小中大2013-12-21 21:11:27
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169
关键字 >> 基因基因测序卵细胞基因测序全基因组测序单细胞基因测序北京大学试管婴
儿中国基础研究头条观察者头条
世界生命科学领域的权威学术杂志《细胞》20日对外发布,来自中国北京大学的科研团
队,在国际上首次完成了人类单个卵细胞高精度基因组测序。这项技术可帮助医生检测
出遗传过程中来自母亲的遗传病,并有可能将试管婴儿的活产成功率从目前的30%提高
到60%。
中国科学家全球首次完成人类单个卵细胞高精度基因组测序
中国科学家全球首次完成人类单个卵细胞高精度基因组测序
巧妙实现卵细胞基因测序
据《细胞》杂志披露,近日,北京大学的科学家们完成了对单个卵细胞的高精度全基因
组测序,这是一项里程碑式的工作。该项研究由北京大学第三医院乔杰教授、生物动态
光学成像中心汤富酬教授和谢晓亮教授所领导的三个研究小组共同完成,谢晓亮同时也
是哈佛大学教授。
人类的遗传信息存在于每个细胞的DNA中,DNA是由四种不同的核苷酸组成的长链。这些
核苷酸的组合和序列组成了遗传的基本功能单位——基因。无论在基... 阅读全帖
E**y
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4
新华网华盛顿7月27日电(记者毛磊)河豚是已知的基因组最小的脊椎动物,对它进行
基因测序,有望为研究人类基因组提供重要线索。一个国际研究小组通过分析比较河豚与
人类的基因组草图,已初步从理论上识别出近1000个新的人类基因。
新加坡、英国和美国研究人员近日在美国《科学》杂志网站上发表论文宣布,他们已
采用全基因组鸟枪测序法绘出河豚的基因组草图,并对草图进行了详细的分析。该草图覆

了河豚基因组的95%。研究人员还介绍说,这是继人类基因组草图之后,第一幅由公共经
费资助完成的脊椎动物基因组草图,有关的基因组序列数据已经在因特网上公开。
河豚在基因测序上的研究价值,在于其基因组规模非常小,仅相当于人类基因组的约
十分之一。河豚与人类基因数目相差不多,但其基因组结构却比人类远为紧凑。因此,研
究河豚基因组,有助于更好地寻找人类基因组中被大量重复DNA(脱氧核糖核酸)片段所遮
蔽的人类基因。重复DNA在人类基因组序列中所占的比重高达97%,但这些所谓“垃圾”DN
A在河豚基因组中却相对稀少。
新加坡等国研究人员将河豚基因组与人类基因组进行对比后发现,两个基因组有同也
有异。一方面,四分之三的
p*******1
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http://www.genetics.ac.cn/xwzx/zhxw/201609/t20160928_4670649.html
中国科协第114期新观点新学说学术沙龙在江苏常州召开
2016年9月27-28日,“中国科协第114期新观点新学说学术沙龙”在江苏省常州市召
开。此次沙龙活动由中国科学技术协会主办,中国遗传学会、中国科学院老科技工作者
协会承办,中国科学院遗传与发育生物学研究所、江苏省常州国家高新区管委会协办。
本次沙龙活动的主题是“基因组编辑新技术的兴起将带来的冲击”。
沙龙主持人中国科学院遗传与发育生物学研究所高彩霞研究员和北京大学许智宏院
士、华大基因杨焕明院士、昆明理工大学季维智研究员及来自中国科学院遗传与发育生
物学研究所、中国科学院动物研究所、北京大学、复旦大学、中山大学、华南农业大学
等单位的近30位基因组编辑专家和10余位来自浙江中医中药大学、苏州大学、农业部食
品与医药研究所等相关领域的专家、学者以及媒体、公众代表出席了沙龙。
中国科协第114期新观点新学说学术沙龙现场
高彩霞研究员欢迎大家在沙龙平台上充分交流学术思想,许智宏院士做了特邀开
场发言,大家... 阅读全帖
m****s
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6
【 以下文字转载自 Returnee 讨论区 】
发信人: poaceae (sorghum), 信区: Returnee
标 题: 中国农业科学院深圳基因组研究所招聘

发信站: BBS 未名空间站 (Mon Sep 29 17:14:49 2014, 美东)
中国农业科学院深圳基因组研究所群体遗传、进化、统计基因组学创新团队招聘

基因组研究所是由中国农业科学院和深圳市政府合作共建,是目前国内唯一专门从事农
业基因组学基础及应用研究的国家级公益性研究所。基因组所位于深圳市大鹏新区,该
区将建设成国际级旅游度假胜地。基因组所将在新区力争用10年左右时间,打造国际生
物育种创新“高地”,目前基因组研究所已引进十余支创新团队 。预计到2016年,基
因组研究所将形成一支由200人以上组成的科研队伍。
基因组所的群体遗传、进化、统计基因组学创新团队拟招聘下列人员,在团队首席的领
导下进行创新性研究工作:
研究员 1名

、副研究员1名、助理研究员2名、博士后2名、研究助理1名。
研究员1名;背景要求: 分子生物学或生物信息学或相应专业博士;... 阅读全帖
p*****e
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中国农业科学院深圳基因组研究所群体遗传、进化、统计基因组学创新团队招聘

基因组研究所是由中国农业科学院和深圳市政府合作共建,是目前国内唯一专门从事农
业基因组学基础及应用研究的国家级公益性研究所。基因组所位于深圳市大鹏新区,该
区将建设成国际级旅游度假胜地。基因组所将在新区力争用10年左右时间,打造国际生
物育种创新“高地”,目前基因组研究所已引进十余支创新团队 。预计到2016年,基
因组研究所将形成一支由200人以上组成的科研队伍。
基因组所的群体遗传、进化、统计基因组学创新团队拟招聘下列人员,在团队首席的领
导下进行创新性研究工作:
研究员 1名

、副研究员1名、助理研究员2名、博士后2名、研究助理1名。
研究员1名;背景要求: 分子生物学或生物信息学或相应专业博士;国外申请者应有助
教授(或相当于)以上工作经历;国内申请者应取得副教授或教授职称;有不少于3篇
二区以上的文章,其中最少1篇高影响因子一区文章 ;有深厚的中英文写作和项目申请
经验;有能力带领团队成员在首席的指导下进行探索性创新性研究。
副研究员1名;背景要求: 生物信息学或相... 阅读全帖
m****g
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8
来自主题: _Harvard_Medical_School版 - 我国科学家首提“人类泛基因组”
经过不懈研究和攻关,我国科研人员在人类基因组研究中获得新的重大进展――发现人
类基因组中存在着种群特异甚至个
体独有的DNA序列和功能基因。科研人员还首次提出了“人类泛基因组”的概念。
由深圳华大基因研究院领衔,华南理工大学参与的研究论文《构建人类泛基因组序列图
谱》12月7日在国际著名科学期刊
《自然—生物技术》(Nature Biotechnology)上发表。
在研究中,科研人员运用第二代测序技术和自主研发的基因组组装工具,对“炎黄一号
”基因组――首个亚洲人个人基因组进
行了进一步的深度测序和拼接,发现人类基因组中除原先公认的单核甘酸多态性、插入
删除多态性和结构性变异以外,还
存在着种群特异甚至个体独有的DNA序列和功能基因,例如主要在亚洲人群内特有的基
因序列。
科研人员同时对近两年发表的非洲人基因组和韩国人基因组进行了重新组装,也得到类
似结论。科研人员还首次提出了“人
类泛基因组”的概念,即人类群体基因序列的总和。
国际人类基因计划基于欧洲人DNA完成的参考基因组序列,是目前绝大多数人类基因组
学研究的数据基础。多年来,大多
数科学研究都认为每个个体的基因组均与这一参考
p*****e
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中国农业科学院深圳基因组研究所群体遗传、进化、统计基因组学创新团队招聘

基因组研究所是由中国农业科学院和深圳市政府合作共建,是目前国内唯一专门从事农
业基因组学基础及应用研究的国家级公益性研究所。基因组所位于深圳市大鹏新区,该
区将建设成国际级旅游度假胜地。基因组所将在新区力争用10年左右时间,打造国际生
物育种创新“高地”,目前基因组研究所已引进十余支创新团队 。预计到2016年,基
因组研究所将形成一支由200人以上组成的科研队伍。
基因组所的群体遗传、进化、统计基因组学创新团队拟招聘下列人员,在团队首席的领
导下进行创新性研究工作:
研究员 1名

、副研究员1名、助理研究员2名、博士后2名、研究助理1名。
研究员1名;背景要求: 分子生物学或生物信息学或相应专业博士;国外申请者应有助
教授(或相当于)以上工作经历;国内申请者应取得副教授或教授职称;有不少于3篇
二区以上的文章,其中最少1篇高影响因子一区文章 ;有深厚的中英文写作和项目申请
经验;有能力带领团队成员在首席的指导下进行探索性创新性研究。
副研究员1名;背景要求: 生物信息学或相... 阅读全帖
d******i
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专家:虎与人基因组大小相似
2010年02月13日21:45:17 [科技新闻]

编者按:虎年即将到来,人人谈虎,但您知道虎的基因组是怎样的吗?虎与人的基因组
有什麽区别?笔者昨日获悉,继2009年启动「三极动物计划」和顺利完成「国际大熊猫
基因组计划」之后,深圳华大基因研究院今日将正式启动「狮虎豹基因组计划」。
近期目标是在一年内完成狮虎豹基因组的序列框架图。此次「狮虎豹基因组计划」是由
深圳华大基因研究院、北京大学、黑龙江虎林园、中科院昆明动物所、美国圣.迭亚哥
动物保护研究所以及其他中外科学家共同发起并承担。
虎和人的基因组大小相似
2010 年是虎年,在中国,虎一直受到中华民族的崇拜,是正义、勇勐、威严的象徵。
对虎文化的崇尚意识,已经成为中华民族共同的文化观念。但与虎的重要意义相比,其
基因组学研究却近乎空白。华大基因相关负责人表示,中国人虎年「测」虎,对中国文
化的发展和继承有着重要意义,还将推动全社会对虎等大型猫科动物的重视和保护,因
此该院将虎选为「狮虎豹基因组计划」的先行物种。
据华大基因专家介绍,虎的基因组与人的基因组大小相似,约为3G。虎基因组信息将会
g*********d
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11
科学家呼吁关注全球基因组数据库污染
样品处理有可能是导致DNA数据库广泛污染的最主要原因
2月16日发表在《公共科学图书馆·综合》(PLoS ONE)期刊上的一份研究报告称康涅
狄格大学的遗
传学家Mark Longo及同事发现由顶级公共测序机构提供的测序结果构建的基因组数据库
中的大约
1/5的细菌、植物和非灵长类动物基因组数据受到了人类DNA的污染,样品处理有可能是
导致DNA数据
库广泛污染的最主要原因。这一研究报告引起了生物研究人员及各大权威媒体的高度关
注,《科学
家》(The Scientist)杂志以及《自然》(Nature)杂志均在其官方网络上第一时间
对这一事件
进行了报道。
Mark Longo等在报告中呼吁科学家们需更加努力以确保测序获得的基因组不受到污染,
并应对来自
公共基因组数据库的基因组进行潜在污染检测。
“基因组污染是一个大问题,但却不是一个新问题,”加州大学进化生物学家、美国能
源部联合基因组
研究所系统发育基因组学计划负责人Jonathan Eisen说:“这篇论文或可帮助提醒人们
注意这一问
题。”
污染有可能在测序的任何一个阶段导入到基因组序列中... 阅读全帖
u****g
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帮朋友发的,大家具体看连接,不要给我发站内信哦~我不清楚细节~
中科院北京基因组研究所曾长青课题组主要从事基因组测序、SNP多态性分型和生物信
息学相关研究,现因工作需要拟招聘如下岗位。
一、招聘岗位
(一)助理研究员/副研究员
招聘人数:1名,工作地点:北京
1、任职条件
1)获得生物信息学、群体遗传学、基因组学、计算机科学、遗传学等相关专业博士学
位;
2)精通统计学原理,方法和应用,熟练Matlab,R等相关软件的使用,对基因组测序、
RNA-seq、SNP分型等组学数据具有较好的分析能力。熟悉 UNIX系统,熟练掌握C、Perl
或其它生物信息学分析中常用的编程语言;
3)至少有一篇以上的第一作者SCI文章;
4)有大规模测序数据分析相关科研工作经历者优先;
5)能独立从事科研,并协助制定课题计划及撰写研究论文;
6)具有良好的英语阅读、写作和交流能力;
7)身体健康,工作认真负责,热爱科研, 具有扎实的专业基础、良好的团队精神、较
好的学习能力及沟通能力;
2、岗位职责
1)利用计算生物学方法和知识,对海量测序数据进行深入挖掘。包括全基因组测序、
RNA-seq、ChIP-s... 阅读全帖
m****g
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来自主题: _Harvard_Medical_School版 - 首个用化学方法合成的细菌基因组
据5月21日的《科学》杂志报道说,科学家们已经开发出了第一个由一个合成的基因组
所控制的细胞。 他们现在希望用这
种方法来更好地了解驱动所有生命的基础机制,并用遗传工程的方法来制造有专门配置
的可生产如燃油或能消解毒性废物的
细菌。 该研究团队已经用化学的方法合成了一个细菌的基因组,他们将某种细菌的基
因组移植到了另外一个细菌的基因组
中。 在这个例子中,合成的基因组是一份现存基因组的拷贝,尽管它带有添加的DNA序
列使其成为区别于自然基因组的“水
印”。 将来,科学家们希望设计出更新颖的基因组,使得含有这些基因组的细菌能够
完成特别的任务以帮助解决能源、环保
或其它的问题。 该研究团队首先合成了丝状支原体(Mycoplasma mycoides)的基因组
,接着将其移植到山羊支原体
(Mycoplasm capricolum)中。 该新的基因组会“启动”接受方的细胞。 文章的作者
报告说,尽管在移植的细菌中有14个
基因被删除或遭到中断,但它们看上去仍然像是正常的丝状支原体细菌,并只能产生丝
状支原体的蛋白质。他们写道:“如
果在此描述的方法可被普遍化的话,那么设计、合成、装配及移植
b****r
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14
今天从这个中国公司收到的广告邮件。不知道效果到底如何,这个看起来不比nanopore
差啊,而且都已经在商业公司卖了。。。
http://www.bio-star.cn/contents/239/225.html#ly
Irys单分子基因组结构成像系统
剥茧抽丝,让让基因组纤毫毕现
Irys系统特征
长链DNA分子
DNA分子可长达几百kb,完全可以跨越重复单元和可变区。
高质量的数据
单分子DNA通过纳米通道被拉直,平行排列,生成高质量的图像,基因组结构展现无遗
应用灵活
Irys系统可以作为一个开放的平台为研究人员提供多种形式的遗传分析
让我们组织,而不是堆砌数据
在过去的几年里,二代测序的高通量一直主导着基因组研究的发展。
但是二代测序技术可以廉价的获得大量的测序数据,但是受制于较短的读长,这使得科
学家们无法简单而直观地看到整个基因组范围的结构变化。现在,针对更长片段的分析
方法对于基因组结构研究显得越来越重要。另外,由于基因组的复杂性,诸如重复序列
和结构变异,限制了基因组的重构和对功能元件的理解。Irys系统克服了这些困难,利
用一种新的方法去获取单分子,尤其是长链DNA分... 阅读全帖
p*****c
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2013年09月20日21:07 中国新闻网 我有话说(27人参与)
中新社深圳9月20日电 (记者 郑小红)韩国个人基因组学研究所、深圳华大基因研
究院等单位的科研人员,近期成功破译了全球首个东北虎基因组。
华大基因20日向此间媒体公布,经与狮子、雪豹等多种大型猫科动物的基因组对比
后,发现了一批东北虎与猫科动物进化及生活习性相关的特异性突变,为东北虎及其它
大型猫科动物的种质资源保护奠定了重要的遗传学基础。该最新研究成果17日在《自然
·通讯》杂志上发表。
在本研究中,科研人员对一只来自韩国的9岁雄性东北虎进行了全基因组测序及分
析,并对东北虎基因组中的20226个蛋白编码基因和2935个非编码RNA进行了预测,发现
在东北虎基因组中与嗅觉受体敏感性、氨基酸转运及新陈代谢等相关的基因出现了富集
。他们推测氨基酸等新陈代谢相关基因的富集可能与老虎的极度食肉的饮食习惯相关,
同时,嗅觉以及一系列信号通路基因则与老虎的捕食、领土占有和交配行为有关。
为了对大型猫科动物进行系统比较及分析,科研人员还对一只白色孟加拉虎、一只
非洲狮、一只白色非洲狮和一只雪豹进行了基因组测序。
在老虎和其他... 阅读全帖
t*******a
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世界反兴奋剂机构把基因组编辑技术列入“黑名单”
据日本共同社5日报道,世界反兴奋剂机构(WADA)汇总的关于2018年禁止药物名
单中,新加入了使用可自由改变遗传基因的基因组编辑技术的基因兴奋剂。该名单将从
明年1月1日起生效。
基因组编辑可有效改良目标基因,是在治疗疾病和改良食物品种应用上备受期待的
新技术。该技术被评价为生命科学研究领域的“诺贝尔奖级别”,正迅速推广。虽然尚
无报告例子,但由于该技术被视为也可用于增强肌肉力量等提升运动能力,存在以兴奋
剂为目的使用的担忧。迎接2020年东京奥运会和残奥会,开发检查方法等或成为课题。
WADA把来自外部的DNA和改变基因的细胞注入人体旨在提升运动能力的行为视为“
基因兴奋剂”,一直以来予以禁止。若使用基因组编辑,或能够更简单巧妙地起到兴奋
剂的作用,因此决定在名单中明文禁止。
通过使用可导致基因组编辑的药物等有可能能够增强肌肉力量和耐力。如果在受精
卵阶段进行基因组编辑,生出天生就具备较高运动能力的“人造宝宝”也并非不可能。
由于与自然产生的突变难以分辨,也有意见指出检查中难以辨别,导致“总有被... 阅读全帖
w*****x
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中国人类基因组测序工作的缺憾
老刘
最近几天,国内的许多媒体报道了我国人类基因组测序工作的进展情
况。昨晚我从电视上看到,我国的人类基因组测序工作的主要领衔科
学家杨焕明博士,接受中央电视台的采访的节目。由此,又勾起了我
的一些看法和想法。
我第一次直接从杨焕明博士那里听到关于中国人类基因组测序工作的
情况介绍,是在去年的全国遗传学大会的最后一天的学术报告会上。
当时杨焕明博士在介绍了我国的人类基因组测序工作情况之后,还顺
便介绍了我国的人类基因组测序仪器设备方面的情况。他当时的介绍
,给我的印象是:中国的人类基因组测序的主要仪器设备,中国自己
生产不出来,而要从国外进口。中国的人类基因组测序的效率和水平
如何,在很大程度上,取决于用高价从国外购进的基因测序的仪器设
备的档次和数量。杨焕明博士当时在大会主席台上,还因为基因测序
的仪器设备的事情,冲着国外某公司的代表,强烈谴责该公司的某一
不地道的行为。在我的印象中,杨焕明博士当时好像是谴责该公司没
有将较好的基因测序仪器设备卖给中国,该公司从中国赚走了一笔昧
心钱。当时杨焕明博士的严厉谴责,搞得大会的气氛突然有点激烈。
大会的主持人赵
b***n
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中国遗传学会功能基因组学研讨会在我校成功举行
作者: 生命 / 来源:生命学院 / 时间:2006-10-19 / 点击: 426 / 评论: 0 / 关键字:
功能基因组学
“中国遗传学会功能基因组学研讨会”于2006年10月14日—18日在我校召开。
我校副校长聂在平、四川省科协副主席黄竟跃、中国遗传学会安锡培副秘书长、特邀嘉
宾、100多名会议代表以及我校生命学院400多名师生出席了开幕式,会议邀请了中国科
学院院士贺 林教授、中国科学院北京基因组研究所所长杨焕明教授、美国洛克菲勒大
学Jurg Ott教授和美国冷泉港生物信息学实验室Michael Q. Zhang教授等国内外知名专
家作专题学术报告。
聂在平对各位嘉宾、代表的到来表示热烈欢迎。他介绍了我校生命学科发展情况,同时
表示学校将加强生物信息领域队伍建设、科学研究,加强合作交流,相信此次会议对我
校基因组学研究能起到推动作用。
上海交通大学贺林院士致开幕词,他说,目前人类对基因的研究正处于后基因组时代,
功能基因组学研究正是破译基因的功能,借以控制、改造基因,为人类健康服务,本次
研讨会的目的是展示近两年基因组学研究的
s******o
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【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: someinfo (someinfo), 信区: Biology
标 题: <退化论---基因熵与基因组的奥秘>康奈尔大学教授 基因枪发明者所写
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Apr 21 19:48:03 2011, 美东)
使者出版社在2010年底特别推荐一本书: 退化论---基因熵与基因组的奥秘, 由康奈
尔大学的教授, John Sanford, 基因枪发明者所写。
退化论---基因熵与基因组的奥秘 约翰. 圣弗德 182頁
Genetic Entropy & the Mystery of the Genome, John Sanford
本书以有力的证据显示了我们的基因在退化,而且人类也必随着时间的推移而慢慢退化
。是什么导致这种退化呢?康奈尔大学的教授圣弗德在书中向你揭示了这一奥秘。
使者出版社有售:http://afcinc.org/Default.aspx?tabid=2762&language=zh-CN, 简体字书籍目录:中文 (pdf) , 编号:C2-50, 价格:$4... 阅读全帖
s*********e
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20
这个太胡闹了。
http://www.big.cas.cn/gkjj/skjj/
基因组所成立于2003年。 华大成立于1999年。
所谓同时担任基因组所和华大的法人这个说法,纯粹是混淆视听。
实际情况是,华大于99年成立,也确实如饶毅所说,自行宣布代表中国参加了1%计划。
而实际上此计划,最开始阶段,完全没有国家投资。 完全是几个创始人和最早一批员
工自行筹集资本。杨老师最后还从温州(家乡)筹集到一定资本维持项目运转。 最终
到00年左右,克林顿宣布中国是6个国家之一,中央政府才开始重视,进行投资。
不否认没有中央的支持,华大不可能完成1%的项目。而实际上,中央同时建立了南方基
因组和北方基因组中心,连同华大在内, 一共3家单位都进行。 南方和北方中心都是
国家直接投资的,只有华大一个怪胎,算是私人的。 既然是国家投资,那么资金分配
的角度,华大肯定占不到便宜。 但是最终的成果,华大所测序列占中国完成部分的90%
以上。我有一个猜测,如果没有华大的出现,中国非常可能不是6个国家之一,或者国
家需要投更多的资源,才能挤入6强。
至于中国是否应该加入人类基因组计划,这个仁者见仁。 这件事... 阅读全帖
s******o
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【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: someinfo (someinfo), 信区: Biology
标 题: <退化论---基因熵与基因组的奥秘>康奈尔大学教授 基因枪发明者所写
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Apr 21 19:48:03 2011, 美东)
使者出版社在2010年底特别推荐一本书: 退化论---基因熵与基因组的奥秘, 由康奈
尔大学的教授, John Sanford, 基因枪发明者所写。
退化论---基因熵与基因组的奥秘 约翰. 圣弗德 182頁
Genetic Entropy & the Mystery of the Genome, John Sanford
本书以有力的证据显示了我们的基因在退化,而且人类也必随着时间的推移而慢慢退化
。是什么导致这种退化呢?康奈尔大学的教授圣弗德在书中向你揭示了这一奥秘。
使者出版社有售:http://afcinc.org/Default.aspx?tabid=2762&language=zh-CN, 简体字书籍目录:中文 (pdf) , 编号:C2-50, 价格:$4... 阅读全帖
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发信人: someinfo (someinfo), 信区: Biology
标 题: <退化论---基因熵与基因组的奥秘>康奈尔大学教授 基因枪发明者所写
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Apr 21 19:48:03 2011, 美东)
使者出版社在2010年底特别推荐一本书: 退化论---基因熵与基因组的奥秘, 由康奈
尔大学的教授, John Sanford, 基因枪发明者所写。
退化论---基因熵与基因组的奥秘 约翰. 圣弗德 182頁
Genetic Entropy & the Mystery of the Genome, John Sanford
本书以有力的证据显示了我们的基因在退化,而且人类也必随着时间的推移而慢慢退化
。是什么导致这种退化呢?康奈尔大学的教授圣弗德在书中向你揭示了这一奥秘。
使者出版社有售:http://afcinc.org/Default.aspx?tabid=2762&language=zh-CN, 简体字书籍目录:中文 (pdf) , 编号:C2-50, 价格:$4... 阅读全帖
s******o
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标 题: <退化论---基因熵与基因组的奥秘>康奈尔大学教授 基因枪发明者所写
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Apr 21 19:48:03 2011, 美东)
使者出版社在2010年底特别推荐一本书: 退化论---基因熵与基因组的奥秘, 由康奈
尔大学的教授, John Sanford, 基因枪发明者所写。
退化论---基因熵与基因组的奥秘 约翰. 圣弗德 182頁
Genetic Entropy & the Mystery of the Genome, John Sanford
本书以有力的证据显示了我们的基因在退化,而且人类也必随着时间的推移而慢慢退化
。是什么导致这种退化呢?康奈尔大学的教授圣弗德在书中向你揭示了这一奥秘。
使者出版社有售:http://afcinc.org/Default.aspx?tabid=2762&language=zh-CN, 简体字书籍目录:中文 (pdf) , 编号:C2-50, 价格:$4... 阅读全帖
l*****a
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标 题: 特别推荐< 退化论---基因熵与基因组的奥秘>康奈尔大教授基因枪发明者所写
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Apr 21 19:36:45 2011, 美东)
使者出版社(Ambassador for Christ) 在2010年底特别推荐一本书: 退化论---基因熵
与基因组的奥秘, 有康奈尔大学的教授, John Sanford, 基因枪发明者所写。
退化论---基因熵与基因组的奥秘 约翰. 圣弗德 182頁
Genetic Entropy & the Mystery of the Genome, John Sanford
本书以有力的证据显示了我们的基因在退化,而且人类也必随着时间的推移而慢慢退化
。是什么导致这种退化呢?康奈尔大学的教授圣弗德在书中向你揭示了这一奥秘。
使者出版社有售:http://afcinc.org/Default.aspx?tabid=2762&language=zh-C... 阅读全帖
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标 题: 特别推荐: 退化论---基因熵与基因组的奥秘,有康奈尔大学的教授, John Sanford, 基因枪发明者所写。
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Apr 22 19:48:43 2011, 美东)
使者出版社在2010年底特别推荐一本书: 退化论---基因熵与基因组的奥秘, 有康奈
尔大学的教授, John Sanford, 基因枪发明者所写。
退化论---基因熵与基因组的奥秘 约翰. 圣弗德 182頁
Genetic Entropy & the Mystery of the Genome, John Sanford
本书以有力的证据显示了我们的基因在退化,而且人类也必随着时间的推移而慢慢退化
。是什么导致这种退化呢?康奈尔大学的教授圣弗德在书中向你揭示了这一奥秘。
使者出版社afcinc 简体字书籍目录:中文 (pdf) , 编号:C2-50
大陆 也有出版: 山东友谊出版社; 第1版 (2010年6月1日),译者:流萤... 阅读全帖
c****y
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http://www.genomeweb.com/print/1446176
世界首例经MALBAC基因组扩增高通量测序进行单基因遗传病筛查的试管婴儿2014年9月
19日在北京大学第三医院出生,标志我国胚胎植入前遗传诊断技术已处于世界领先水平。
本例夫妻,男方为单基因显性遗传病患者,经历了多次手术治疗,非常痛苦。该疾病主
要是因为基因序列上发生了单个碱基的缺失,后代中无论男孩女孩都有二分之一概率患
同样的疾病。夫妻在北医三院生殖中心就诊,期望通过胚胎基因诊断帮他们挑选正常胚
胎,避免让自己的孩子患上同样疾病。
他们通过辅助生殖技术共获得18枚囊胚,医务人员利用显微操作技术获得极少量的细胞
,采用本研究组研发的单细胞基因组MALBAC扩增技术,将这些极少量胚胎细胞中的DNA
均匀扩增上百万倍以满足基因分析的需求,结合PCR技术与高通量测序技术,经过低深
度的测序(平均0.1X),可同时观察到全部染色体数目及结构是否异常,并能实现准确
的、单位点的关键基因检测。研究者从18枚胚胎中挑选出3枚既不包含致病位点又不包
含新发现的突变位点,同时染色体正常的胚胎,选择其中一枚移植到女方子宫内,胚... 阅读全帖
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使者出版社(Ambassador for Christ) 在2010年底特别推荐一本书: 退化论---基因熵
与基因组的奥秘, 有康奈尔大学的教授, John Sanford, 基因枪发明者所写。
退化论---基因熵与基因组的奥秘 约翰. 圣弗德 182頁
Genetic Entropy & the Mystery of the Genome, John Sanford
本书以有力的证据显示了我们的基因在退化,而且人类也必随着时间的推移而慢慢退化
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大陆 也有出版:价格: 人民币17.00, 山东友谊出版社; 第1版 (2010年6月1日),译者
:流萤
http://www.amazon.cn/%E9%80%80%E5%8C%96%E8%AE%BA-%E5%9C%A3%E5%B
《退... 阅读全帖
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使者出版社在2010年底特别推荐一本书: 退化论---基因熵与基因组的奥秘, 由康奈
尔大学的教授, John Sanford, 基因枪发明者所写。
退化论---基因熵与基因组的奥秘 约翰. 圣弗德 182頁
Genetic Entropy & the Mystery of the Genome, John Sanford
本书以有力的证据显示了我们的基因在退化,而且人类也必随着时间的推移而慢慢退化
。是什么导致这种退化呢?康奈尔大学的教授圣弗德在书中向你揭示了这一奥秘。
使者出版社有售:http://afcinc.org/Default.aspx?tabid=2762&language=zh-CN, 简体字书籍目录:中文 (pdf) , 编号:C2-50, 价格:$4.00。
大陆 也有出版:价格: 人民币17.00, 山东友谊出版社; 第1版 (2010年6月1日),译者
:流萤
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《退化论 基因熵和基因组的奥秘》精辟地解析了基本公理... 阅读全帖
m****g
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来自主题: _Harvard_Medical_School版 - 人类基因组中发现非逆转录RNA病毒
日本和美国科学家最近发现,人类基因组的8%是来自与病毒。这项研究是由Cédric
Feschotte完成的,发表在《Nature》
杂志上。该研究表明,人类和其他哺乳动物的一部分DNA最早来自于一种RNA病毒——博
尔纳病毒(bornaviruses)。据
Feschotte介绍,这种来源于病毒的DNA可能是引起基因突变的原因之一,也可能导致如
精神分裂症之类的精神疾病。
病毒序列同化到宿主细胞基因组中的过程称为内生化(endogenization)。当这种病毒的
DNA整合到生殖细胞的染色体,将
会随生殖细胞传递到子代个体中。到目前为止,逆转录病毒是唯一已知可在脊椎动物中
内生化的病毒。但据最新的这项研
究发现,非逆转录病毒博尔纳病毒也可在进化过程中内生化到哺乳动物基因组中。
博尔纳病毒(BDV)可感染禽类和哺乳动物。这种病毒只侵染宿主的神经元细胞核。据
Feschotte称,这是研究人员首次将
BDV与细胞核建立联系。研究人员对234种真核生物的基因组序列进行搜索,以寻找与
BDV基因组相似的部分。结果发现在
多种哺乳动物基因组中存在大量的博尔纳病毒类似的基因组。(高芳)
Jour
H********g
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标 题: 淘汰劣等人基因 世界首批全基因组测序婴儿在中信湘雅诞生
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Dec 10 21:59:27 2013, 美东)
世界首批全基因组测序试管婴儿在中信湘雅诞生
健康中国health.china.com.cn 时间: 2013-11-06   来源: 新华网
近日,从中国湖南长沙中信湘雅生殖与遗传专科医院传来消息,世界首批经大规模
平行测序技术的胚胎植入前遗传学诊断 / 筛查试管婴儿(PGD/PGS)在该院诞生,首批15
对夫妇生育了17个健康孩子。最大的孩子于2012年8月24日出生,现在已有11个月。这
些孩子都非常健康。首批有33对夫妇因习惯性流产、高龄或自身为染色体异常的携带者
接受这项治疗,22对成功妊娠,妊娠率达到66.7%,抱婴率45.5%。目前第二批有52对夫
妇正在接受相同的PGD/PGS,正在等待胚胎移植中。
7月8日,在英国伦敦举行的有数千人参加的“欧洲生殖医学年会”上报道了这一成
果并得到国际的... 阅读全帖
t*****z
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31
我现在需要学做比较基因组学的研究,检测我们的某个已知序列的细菌基因组,曾经跟
别的哪些基因组有过水平基因转移(HGT)。
我查了些资料,发现现有的方法,一是检测某个基因组中有哪些部分是外来的,但是不
能告诉你它们是哪来的,比如IslandViewer、Mauve等程序。二是对已知的一组数据(
比如十个细菌的基因组)构建网状的进化树,检测它们之间发生过什么遗传材料的交换
,比如SplitTree、PhyloNet等程序。
但是它们都不完全符合我的要求,因为它们无法从单独一个基因组出发,找到别的遗传
材料的提供者。我想要做的是知道它们和谁发生过水平基因转移,最好还要知道是什么
时候发生的(用进化分析来估算时间)。
不知现在有没有好的解决方法呢?谢谢大家赐教!祝新学期愉快
w*********g
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世界首批全基因组测序试管婴儿在中信湘雅诞生
健康中国health.china.com.cn 时间: 2013-11-06   来源: 新华网
近日,从中国湖南长沙中信湘雅生殖与遗传专科医院传来消息,世界首批经大规模
平行测序技术的胚胎植入前遗传学诊断 / 筛查试管婴儿(PGD/PGS)在该院诞生,首批15
对夫妇生育了17个健康孩子。最大的孩子于2012年8月24日出生,现在已有11个月。这
些孩子都非常健康。首批有33对夫妇因习惯性流产、高龄或自身为染色体异常的携带者
接受这项治疗,22对成功妊娠,妊娠率达到66.7%,抱婴率45.5%。目前第二批有52对夫
妇正在接受相同的PGD/PGS,正在等待胚胎移植中。
7月8日,在英国伦敦举行的有数千人参加的“欧洲生殖医学年会”上报道了这一成
果并得到国际的认可。这批可爱的小朋友来到这个世界,意味着中国已成功将全基因组
测序技术应用于体外受精的胚胎进行遗传学诊断并走在世界的前列,标志着植入前遗传
学诊断(PGD)迈向植入前遗传学筛查(PGS)新时代,为接受试管婴儿治疗的人群提供新的
选择,为积极性优生开拓了一条新道路。
这项成果是中信湘... 阅读全帖
l***4
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33
测序技术团队负责人 (研究员、副研究员):
职责:领导生物能基因组中心的 DNA 测序部门,设计科学的实验方案,经济有效地
解决以基因组测序与分析为基础的各种生物信息学问题;
开展新型DNA测序技术的评价,开发,实施和运用;
执行DNA分子生物学实验室平台建设工作;建立,维护和优化现有技术规程负
责组建一个DNA 测序和质量监控的硬件和软件平台。直接向生物能源基因组中心主任负
责。
应聘条件:
 分子生物学、生物化学、遗传学及相关专业博士或硕士学位;
 具有遗传学/基因组学背景,深入了解DNA测序及其技术;
 有实验规程开发和软件程序开发与优化方面经验者优先,此外还有生物信
息学
方面的经验则更好。
计算生物学家/高级计算生物学家 (研究员、副研究员、高级研究助理)
职责:
设计、构建和组织运行高效率的计算工作流的工作,为高通量 DNA测序工作
和基因组研究环境奠定软件基础;
完成对现有数据流程的优化和故障检测,及测序质量的评价,同时能够收集
、分析、报告实验数据,向下游科研团队提供数据支
w*********g
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世界首批全基因组测序试管婴儿在中信湘雅诞生
健康中国health.china.com.cn 时间: 2013-11-06   来源: 新华网
近日,从中国湖南长沙中信湘雅生殖与遗传专科医院传来消息,世界首批经大规模
平行测序技术的胚胎植入前遗传学诊断 / 筛查试管婴儿(PGD/PGS)在该院诞生,首批15
对夫妇生育了17个健康孩子。最大的孩子于2012年8月24日出生,现在已有11个月。这
些孩子都非常健康。首批有33对夫妇因习惯性流产、高龄或自身为染色体异常的携带者
接受这项治疗,22对成功妊娠,妊娠率达到66.7%,抱婴率45.5%。目前第二批有52对夫
妇正在接受相同的PGD/PGS,正在等待胚胎移植中。
7月8日,在英国伦敦举行的有数千人参加的“欧洲生殖医学年会”上报道了这一成
果并得到国际的认可。这批可爱的小朋友来到这个世界,意味着中国已成功将全基因组
测序技术应用于体外受精的胚胎进行遗传学诊断并走在世界的前列,标志着植入前遗传
学诊断(PGD)迈向植入前遗传学筛查(PGS)新时代,为接受试管婴儿治疗的人群提供新的
选择,为积极性优生开拓了一条新道路。
这项成果是中信湘... 阅读全帖
z******3
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转帖 还是做bioinformatics比较爽啊!
我只是技术人员,科学创新思想什么的不咋地。不过好歹算是搞这行的,而且做数据分
析的,什么都得了解一点。
感觉生命科学可能是国内与国外差距最小的基础科学研究领域。在我们实验室,从来都
是看人家最前沿的东西,然后想我们在往前走一步可以做些什么。我们所的水平在中科
院大概只算中流而已,我相信中科院其它生物口的研究所的众实验室,水平不大可能低
于我们,很有可能比我们强。也就是说,大家都在国际前沿里面泡着。
华大基因是非常有趣的地方,他们有128台solid,测序通量世界第一。上半年和欧洲合
作测人的肠道微生物元基因组(欧洲人出钱,华大干活),一个人的样品的数据总量就
几乎超过以前世界上元基因组的数据总量之和。一共128个人的样品。
啊,对了,再加上七十多个中国人样品,他们后来自己搞的。
当然,华大也有些问题,比如据说留不住人,有些本事的就都又跑了。再比如分析力量
似乎不足,数据出来了,分析不能完全搞定(他们自己说的,不过我看不出来。他们反
正比我们所强。他们招了差不多一千人做生物信息,它喵的太壮观了)。
不过我感觉他们的人事机制很灵活,人员招... 阅读全帖
y***k
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36
先bless这位可敬的母亲,你可能没时间看那些书了,我根据我的知识提供一些看法。
1 全基因测序是不是有很多遗传病其实也测不出来,是不是和数据库有关?
基因组测序做的是检测目标对象和参考基因组(reference genome)的变异。 目前的
基因组测序主要有全基因组测序(WGS)和全外显组(WES,也就是你做的)测序。外显
组测序只测编码蛋白的部分(最有可能发生导致遗传病的变异部分),覆盖率高,操作
得当的话对 应该可以检测大部分目标区域的简单变异(SNP),当然不可能是完全的,
而且作为医学报告,他们一般报告他们把握大的部分而容忍遗漏(high accuracy and
lost sensitivity ),具体数据前面有个网友提供了一些信息(不过25%太低了吧)。
WES对大的结构变异的检出能力很差。 全基因组测序理论上可以可以提供全面的信息
,不过因为覆盖率低平均检出率会低很多,成本也要高很多。所以你可以认为他们给出
的一般是真的,不过遗漏了很多。
目前的情况,如果有肯能,希望他们提供原始的测序数据,可以先对结果做个评估在
考虑下一步的遗传检测。另外代谢方面的检测可以提... 阅读全帖
f*******2
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37
我来解释这个文章
首先是背景知识
人类走出非洲好几次
最后一次走出非洲,遇到了以前走出非洲留下的后裔:
尼安德特人,丹尼索瓦人等
这两年的基因组数据表明,有少量通婚过程,使现在所有非非洲的现代人都有尼安德特
、丹尼索瓦少量血统。。。
这个文章是4万年前的,按照年代和地理估计,该是最后一次走出非洲的人的后代。那
么可以想到的问题是:
1,他是不是黑发黄面,是不是中国东亚祖先?还是亚欧人共同的祖先
2,他是不是有尼安德特人的少量血统?
3,他是不是有北京人,蓝田人等的血统,就像中国的老一辈考古人员喜欢持有的观点。
文章做了线粒体和单个染色体的测序
没有全基因组测序,因为技术能力所限
线粒体短,独立,所以偶然性大,只能做群体遗传学考察。对单个样本意义不大
染色体信息大,一个样本就能解答很多问题
那么我们来看图、不看正文文字,这样省时间。
图一线粒体的进化树。可以看到
本文骨头是b谱系的源头附近,跟谁都不接近
表一是基因组数据,从表一等作图,得出图二(作图时估计考虑了连锁权重等,所以比
数据更有力)
可见,基因组数据分为两支
一支是丹尼索瓦人,一支是其他
说明本文骨头是走出非洲的人,不像是本地... 阅读全帖
b********n
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38
华大基因与鬼子非法搜集基因测序对象占中国总人口的万分之一
还发现了中国人基因组中独特的病毒DNA分布!有了这些信息,不难搞出对中国人的
基因武器!
“报道内容是:中国研究人员领导的一个国际研究团队4日说,他们完成了迄今最大规
模的中国人基因组测序和分析,有助于揭示基因与生育的联系以及了解中国人口基因结
构。
这项发表在新一期美国《细胞》杂志上的研究显示,深圳华大基因研究院用“无创产前
基因检测”技术收集了超过14万名中国孕妇的部分基因组样本。“无创产前基因检测
”是对孕妇少量游离DNA进行测序以检测染色体异常的一种技术。
研究人员表示,这项研究的测序对象约占中国总人口的万分之一,除汉族外还覆盖了3
6个少数民族。研究确认了与身高和身体质量指数(BMI)等表型有关的新的遗传位
点,还发现了中国人基因组中独特的病毒DNA分布。测序结果还显示,中国人拥有一
些印度人、东南亚人和沿古丝绸之路上的欧洲人中常见的遗传变异。
研究发现,一个叫NRG1的基因变异情况与孕妇生双胞胎的概率有关。此外,有一个
基因的变异与孕妇血液中疱疹病毒6型浓度高有关,后者是导致婴儿出现“蔷薇疹”的
常见原因。
论文共同... 阅读全帖
H********g
发帖数: 43926
39
来自主题: Joke版 - 基因组的熵
一个物种的基因组一直受到各种外界的攻击。比如人的基因组里50%以上都是反转录因
子(ie 病毒)的残迹,甚至还有活的。还有系统性的把C变成T这样的慢慢的变化(导
致信息含量减少)。
换句话说,从可观测到的尺度看,我个人觉得一个物种的基因组一直是在熵增的。那么
问题是,为什么生命可以在地球上一直坚持到今天?也就是说,为什么地球上的物种的
基因组并没有都变成一堆乱码?
C**e
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40
【 以下文字转载自 THU 讨论区 】
【 原文由 oooh 所发表 】
十名美国著名教授在我国创立基因组研究所
清华要破译基因密码
本报记者田利平、牛金荣报道 继人类基因图谱完成后,科学家们利用这一图
谱开始的研究将最终让人们看到生命科学是如何不可思议地改变人类的生老病死。
由10位这一领域的国际著名学者创建的基因组研究所将在清华大学开始这一激动人
心的研究。
人类基因图谱的完成意味着科学家们已经知道每一条人类染色体上的碱基对是
如何排列的。但是这样的排列意味着什么,这正是科学家们接下来要做的研究。
“好比会场里的人,我们看见他们是如何排列坐着的,但每一个人是谁,做什么工
作的,我们还不知道。”美国普林斯顿大学教授钱卓曾这样对记者说。
清华基因组研究所是由美国各著名学府的一些著名学者创办的。所长傅新元现
为美国耶鲁大学医学院病理系教授,他在生物信号转导领域的重大发现曾被美国
《科学》杂志评为1993年重大科学发现之一。其他创立者都是具有国际声望的科学
家,都有论文发表在《科学》、《自然》、《细胞》等国际权威学术刊物上。
昨天清华基因组研究所成立仪式结束后,37岁时获得诺贝尔奖的美国生
a****n
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41
我国疾病基因组学研究的又一重大突破:
同济大学和国家人类基因组南方研究中心科学家
发现家族性心房颤动致病基因
经过不懈的努力,同济大学医学遗传研究所所长、附属同济医院心脏内科专家陈
义汉博士等和国家人类基因组南方研究中心徐世杰博士等以及其他科研单位的科研工
作者密切合作,最近找到了一个引起家族性心房颤动(房颤)的致病基因。这项研究
成果发表在2003年1月10日出版的国际权威学术刊物《科学》杂志上。这是迄今为止
发现的第一个引起家族性房颤的致病基因,是我国生物医学界在疾病基因组学研究中
取得的又一可喜成果。
房颤是一种常见的心律失常。根据统计,房颤发病率随着年龄的增长而急剧增高
,其发病率在40岁以下的成年人中接近1%,40岁以上的成年人中为2.3%,而在65岁以
上的老年人中则高达5%以上。房颤可以导致运动耐力降低、促发心力衰竭、产生快速
或缓慢性心律失常、引起中风等血栓和栓塞事件、增加基础心脏病的死亡率。房颤本
身还可以引起心脏扩大和心肌病变。老年人口中有三分之一的中风正是由于房颤引起
的。房颤严重地影响着人类的健康和生命,也给社会带来了相当大的经济负担,因此
受到普遍关注,但其发
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42
来自主题: Biology版 - 请教:有关基因组序列比对.
各位朋友:
我用mauve软件做基因组序列比对,请问如何加入annotation呢?需要用什么格式的
基因组文件呢?我用genenious软件初步分析了不同基因组同类基因的序列,该保存为什
么格式,才能用mauve软件做基因组比较呢?多谢.
l********n
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43
美国科学家克雷格·文特尔协助破译了人类基因组,创建了第一个合成细胞,并在海洋
中遍寻新的基因组,可谓合成生命学研究先驱。有着“科学狂人”之称的他,现在又把
目光瞄准了火星。
据《新科学家》杂志网站报道,在日前于纽约举行的连线健康研讨会上,文特尔描述了
向火星派遣一个由机器人控制的基因组测序仪,以对火星上可能存在的外星生命进行基
因组测序的计划。他不是第一个提出这种想法的人,但这类任务成功的可能性有多大?
文特尔的计划将如何实施?
简单来说,他要将机器设备送往火星,这些设备可以自动翻检火星土壤,将任何可能找
到的微生物从中分离出来,为其进行DNA测序,然后将数字化的结果传回地球。利用这
些结果,科学家可以创造一种人工合成的来自火星的基因组版本,进而在地球上重塑火
星生命,轻而易举就解决了将样品带回地球的实际困难。
计划进展如何?
多年来,文特尔一直在尝试从海洋中搜寻DNA,并已经获得了一些有趣的结果。在此次
研讨会上,他表示,相关的技术正由他的研究团队在加利福尼亚州莫哈韦沙漠中选取的
一处与火星环境类似的地点进行测试,以此作为开启火星生命测序任务的前奏。美国国
家航空航天局(NASA)的... 阅读全帖
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44
来自主题: Biology版 - 小教程:从基因组数据到功能
对于非经典的模式生物或罕见物种(基因组go term未知),建议先把ID转为人或其它模
型生物。
lotkaeuler11 推荐的MADGENE值得一试
http://cardioserve.nantes.inserm.fr/madtools/madgene/batch.php
另外有时你也可以就用Gene Symbol(如果你的annotation给基因起名参照了人或小鼠
基因组), 然后告诉DAVID就用人基因组做分析。比如把Chinese Hamster基因的
Symbol用人基因组做分析,大多数基因都有match。
b********g
发帖数: 1
45
来自主题: ChinaNews2版 - 中科院基因组所的家庭主妇PI们
中科院北京基因组所王敦梅研究员2004年6月入选中科院“百人计划”,于2007年10月
回到美国,该入选者并没有提前完成原本的研究计划,也没有在美国找到研究职位,而
是做起了全职的家庭主妇。在2008年一年中回到基因组所的时间不超过一个月,也没有
担当起一个中科院博士生导师应有的责任(其实该入选者应该被撤销博士生导师资格)。
但是在中科院北京基因组研究所的研究生招生简章上这样的家庭主妇仍然在国内继续招
收研究生。
http://www.big.ac.cn/big/sceince/sciwzm.jsp
2009年4月王敦梅延期2年完成“百人计划”终期考核,她的终期考核评估表显示,在其
延期2年共5年的“百人计划”执行期间,只发表了一篇第一作者的文章(Oncogene,
2007)和2篇非第一、非通讯作者的文章(Methods, 2006; Human Mutation, 2008)。5年
时间没有承担过973、863等国家重大项目;主持过一项国家自然基金项目(18万元),参
加过一项国家自然基金项目(28万元);承担研究所项目100万元;承担各种横向课题研
究共267.7万元。经费使用情
e*********0
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基因组学/高通量测序项目经理
岗位职责:
1. 负责DNA或RNA样品高通量测序技术项目的开发,维护和发展海外客户关系;
2. 从事基因组学相关项目的研发及服务;,负责项目跟踪和技术支持;
3. 为海外客户提供优质高效的产品服务售前售后技术支持工作
4.. 做好项目的基础管理工作,保存各文件,记录,数据等资料;
5. 制定工作计划,定期进行工作总结. 完成公司规定的国际业务相关的各项工作任务;
职位要求:

1. 基因组学、生物信息学、微生物学、生物技术、医学检验等相关专业,硕士及以上
学历;
2. 熟悉新一代DNA/RNA测序、DNA/RNA合成、质谱分析和生物芯片技术者优先;
3. 具有较强的专业理论知识;
4. 英语六级水平以上,能够熟练进行英语交流和报告写作,能以英语作为工作语言与
国外客户进行无障碍交流,熟练掌握Office 2010办公软件;
5. 具有较强的责任感. 组织管理能力. 协调沟通能力. 分析和解决问题能力及创新和
团队协作精神;性格稳健. 认真踏实. 积极肯干。
安必奇生物科技有限公司是一家新兴的生物产品研发服务的公司,成立于2005年,总部
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e*********0
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基因组学/高通量测序项目经理
岗位职责:
1. 负责DNA或RNA样品高通量测序技术项目的开发,维护和发展海外客户关系;
2. 从事基因组学相关项目的研发及服务;,负责项目跟踪和技术支持;
3. 为海外客户提供优质高效的产品服务售前售后技术支持工作
4.. 做好项目的基础管理工作,保存各文件,记录,数据等资料;
5. 制定工作计划,定期进行工作总结. 完成公司规定的国际业务相关的各项工作任务;
职位要求:

1. 基因组学、生物信息学、微生物学、生物技术、医学检验等相关专业,硕士及以上
学历;
2. 熟悉新一代DNA/RNA测序、DNA/RNA合成、质谱分析和生物芯片技术者优先;
3. 具有较强的专业理论知识;
4. 英语六级水平以上,能够熟练进行英语交流和报告写作,能以英语作为工作语言与
国外客户进行无障碍交流,熟练掌握Office 2010办公软件;
5. 具有较强的责任感. 组织管理能力. 协调沟通能力. 分析和解决问题能力及创新和
团队协作精神;性格稳健. 认真踏实. 积极肯干。
安必奇生物科技有限公司是一家新兴的生物产品研发服务的公司,成立于2005年,总部
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d*******0
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求审稿机会-人类遗传学,基因组学,药物基因组学,全基因组关联研究,遗传流行病
学。
我可将个人简历发送到您邮箱。
请大家帮忙!
H********g
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来自主题: Joke版 - 基因组的熵
这个很不好估啊。我的意思是,我可以看到很多破坏基因组的因素,但是似乎理论上基
因组产生有用的东西就靠碰运气。这两个变化似乎很不平衡啊。
再说,你看人的基因组一共26000个蛋白质基因,似乎个个都有点用。要怎么样才能演
化出来新的功能基因呢?
一个可能的机制:
历史上(哺乳?)动物的老祖宗似乎有个变成四倍体又变回二倍体的事件,所以很多当
时被复制的基因变成新基因了。是不是说其实基因组基本稳定的物种,其实都是在消亡
的路上慢慢爬,而未来属于某个畸形儿童的后代呢?
b****r
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50
我也觉得中国的情况体挺适合做基因组的
当然,我没觉得华大有那么牛,关键是他在国内把钱给垄断了一大块
要是美国哪个institute有华大那个经济实力,我觉得多半产量质量恐怕会更高
毕竟全基因组测序方法还是非常成熟的,而且基本上是hypothesis free的project,无
非就是把没有测过的基因组拿来一测,软件一拼,就看谁快。我认为基本上属于工程,跟高铁有点像,非常适合山寨国大搞。
王俊本人还是很牛的,今年才34,很佩服
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