s****e
发帖数: 1180 | 1 找了一段时间工作，发现用perl的还不少，尤其是biotech的公司。那么perl的主要用
途是manipulate data（好像python的主要用途是这个），还是把算法翻译成程序，它
在biotech的公司里主要是干什么的？为什么bioinformatics据说用perl比较多，都用
perl干什么了？perl在bioinformatics上有什么优势吗？懂的人讲讲吧。谢谢。 |
p**5
发帖数: 2544 | 2 I am now reading a book "beginning perl for bioinformatic", very nice book
to learn perl
【在 s****e 的大作中提到】
: 找了一段时间工作，发现用perl的还不少，尤其是biotech的公司。那么perl的主要用
: 途是manipulate data（好像python的主要用途是这个），还是把算法翻译成程序，它
: 在biotech的公司里主要是干什么的？为什么bioinformatics据说用perl比较多，都用
: perl干什么了？perl在bioinformatics上有什么优势吗？懂的人讲讲吧。谢谢。
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D******n
发帖数: 2836 | 3 text parsing, pattern matching with regular expression.
【在 s****e 的大作中提到】
: 找了一段时间工作，发现用perl的还不少，尤其是biotech的公司。那么perl的主要用
: 途是manipulate data（好像python的主要用途是这个），还是把算法翻译成程序，它
: 在biotech的公司里主要是干什么的？为什么bioinformatics据说用perl比较多，都用
: perl干什么了？perl在bioinformatics上有什么优势吗？懂的人讲讲吧。谢谢。
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B******5
发帖数: 4676 | 4 perl就是regular expression matching很强大吧，
python的re也可以做，似乎perl还是这方面现在最强大的 |
g**********t
发帖数: 475 | 5 perl最主要的用途还是mainpulate data。算法一般都是用C/C++/java开发的。perl在
bioinformatics中之所以流行，一是perl比较适合处理文本数据，二是由于历史原因，
perl中有大量的bioinformatics modules可以中。最常用的是bioperl，几乎提供了所
有bioinformatics中常用的文件分析和数据处理功能。据本人实践，用bioperl比自己
从头开发速度往往要快一个数量级。除此之外，很多bioinformatics的databases会提
供perl的API，最常用的是Ensembl的API，也可以极大提高工作效率。
【在 s****e 的大作中提到】
: 找了一段时间工作，发现用perl的还不少，尤其是biotech的公司。那么perl的主要用
: 途是manipulate data（好像python的主要用途是这个），还是把算法翻译成程序，它
: 在biotech的公司里主要是干什么的？为什么bioinformatics据说用perl比较多，都用
: perl干什么了？perl在bioinformatics上有什么优势吗？懂的人讲讲吧。谢谢。
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