w*******d 发帖数: 396 | 1 请教一个关于student's t test的基本问题。
实验目的:
测试维生素D是否影响钙的吸收
实验方法:
20个接收测试的人分为两组。
第一天, 第一组的人食用含有同位素钙42且不含维生素D的食物, 第二组的人食
用含有同位素钙44且含维生素D的食物。
第二天, 第二天,进行食物互换,即,第一组的人食用含有同位素钙44且含维生素
D的食物,第二组的人食用含有同位素钙42且不含维生素D的食物。
两周之后,测量血液中钙42和钙44的含量。
实验结果:
Subject 42Ca 44Ca w Vitamin D
1 a1 b1
2 a2 b2
3 a3 b3
4 a4 b4
5 a5 b5
6 a6 b6
7 a7 b7
8 a8 b8
9 a9 b9
10 a10 b10
11 a11 b11
12 a12 b12
13 a13 b13
14 a14 b14
15 a15 b15
16 a16 b16
17 a17 b17
18 a18 b18
19 a19 b19
20 a20 b20
我的问题是:
(1) 从数值上看,ai 和 bi 存在对应关系(correlation)。 如果使用Student
’s t test分析的话,样本是independent samples 还是
paired samples?
(2) 是否可以用ANOVA and Tukey’s test?
谢谢。 |
C******y 发帖数: 2007 | 2 如果我没理解错的话,你这个实验设计无法达到测试你提出的假设的目的。
【在 w*******d 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 请教一个关于student's t test的基本问题。 : 实验目的: : 测试维生素D是否影响钙的吸收 : 实验方法: : 20个接收测试的人分为两组。 : 第一天, 第一组的人食用含有同位素钙42且不含维生素D的食物, 第二组的人食 : 用含有同位素钙44且含维生素D的食物。 : 第二天, 第二天,进行食物互换,即,第一组的人食用含有同位素钙44且含维生素 : D的食物,第二组的人食用含有同位素钙42且不含维生素D的食物。 : 两周之后,测量血液中钙42和钙44的含量。
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w*******d 发帖数: 396 | 3 实验方法也可以这样表达。
食物A:含有同位素钙42,不含维生素D。
食物B:含有同位素钙44,含维生素D。
食物A和B 中含有同位素钙的数量相同,并且除维生素D之外,其他营养成分都相同。
1-10人:第一天吃食物A,第二天吃食物B。
11-20人:第一天吃食物B,第二天吃食物A。
两周之后,测量所有人血液中钙42和钙44的含量。
简单说就是,钙44和维生素D同时进食,钙42没有和维生素D同时进食。
体内留有的钙44和钙42量可以反映维生素D对钙吸收的影响。
我的问题是:
(1) 如果使用Student’s t test分析的话,样本是independent samples 还是 paired
samples?
(2) 是否可以用ANOVA and Tukey’s test?
【在 C******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 如果我没理解错的话,你这个实验设计无法达到测试你提出的假设的目的。
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Y******Y 发帖数: 8753 | 4 这是crossover design. 如果你假设没有carry-over effects和interaction effects
(between groups, subjects and periods), 那么你可以用either paired t test or
two sample t test. 如果你进一步假设没有period effects,那就可以用paired t
test.
不过我倒是对你的实验设计有问题,为什么没有足够长的washout period? 同一个人前
后两天就吃两种食物,你肯定先吃食物B的那群人当中,食物B中的VD不会对第二天吃的
食物A中的钙42吸收产生影响么? 我猜ColdBody的回答也是这个意思。 |
t*****w 发帖数: 254 | 5 我不懂crossover design的好处。请教一下。
我猜anova和tukey's test用不着。 估计anova的结果和t test一样或相似。tukey's
test 应该用在三个或以上样品组。
effects
or
【在 Y******Y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 这是crossover design. 如果你假设没有carry-over effects和interaction effects : (between groups, subjects and periods), 那么你可以用either paired t test or : two sample t test. 如果你进一步假设没有period effects,那就可以用paired t : test. : 不过我倒是对你的实验设计有问题,为什么没有足够长的washout period? 同一个人前 : 后两天就吃两种食物,你肯定先吃食物B的那群人当中,食物B中的VD不会对第二天吃的 : 食物A中的钙42吸收产生影响么? 我猜ColdBody的回答也是这个意思。
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t*****w 发帖数: 254 | 6 我想可以忽略carry-over effect and period effect.
if there is a correlation between Ca44 and Ca42, simple linear regression
model Ca44=ca42+group will make sense.
【在 t*****w 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 我不懂crossover design的好处。请教一下。 : 我猜anova和tukey's test用不着。 估计anova的结果和t test一样或相似。tukey's : test 应该用在三个或以上样品组。 : : effects : or
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w*******d 发帖数: 396 | 7 感谢几位的回复。
这个设计中已经考虑了足够长的washout period,食物B中的VD不会对第二天吃的食物A
中的钙42吸收产生影响。
我遇到的问题是这样的。
N=18 (Two outliers by Shapiro-Wilk W Test were excluded.)
paired t test:p=0.0202
two sample t test:p=0.1763 (equal variance)
Subject 42Ca 44Ca w VD
1 8.16 8.84
2 7.59 7.07
3 1.98 2.34
4 7.93 8.65
5 9.38 8.7
6 4.93 5.54
7 6.21 10.07
8 4.97 5.51
9 3.73 4.1
10 7.52 10.25
11 4.69 9.77
12 5.64 5.18
13 3.43 3.41
14 3.93 4.1
15 5.13 5.63
16 4.69 9.77
17 4.12 4.16
18 2.68 3.34
为什么paired t test 和 two sample t test 得出不同的结论? |
t*****w 发帖数: 254 | 8 paired t test:
H0: difference in means of paired ca42 and ca44 is not equal to 0
p=0.0202, reject that mean of paired ca42 and ca44 is zero;
two sample t test:
H0: difference of two means of ca42 or ca44 between two treatments is 0.
p=0.1763, accept two treatments make no difference.
物A
【在 w*******d 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 感谢几位的回复。 : 这个设计中已经考虑了足够长的washout period,食物B中的VD不会对第二天吃的食物A : 中的钙42吸收产生影响。 : 我遇到的问题是这样的。 : N=18 (Two outliers by Shapiro-Wilk W Test were excluded.) : paired t test:p=0.0202 : two sample t test:p=0.1763 (equal variance) : Subject 42Ca 44Ca w VD : 1 8.16 8.84 : 2 7.59 7.07
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t*****w 发帖数: 254 | 9 from paired t-test, it concludes that the radioactive mean difference from
paired ca42 and ca44 is not equal to zero. but the cause lead to this
difference is ambiguous. You cannot figure out whether ca44 or vitamin-D
results in the difference. As one responder said, this experiment design can
not reach your goal.If I were you, I will choose only one radioactive Ca.
Then one group is fed with Vitamin-D and the other group without Vitamin-D.
【在 t*****w 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : paired t test: : H0: difference in means of paired ca42 and ca44 is not equal to 0 : p=0.0202, reject that mean of paired ca42 and ca44 is zero; : two sample t test: : H0: difference of two means of ca42 or ca44 between two treatments is 0. : p=0.1763, accept two treatments make no difference. : : 物A
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w*******d 发帖数: 396 | 10 谢谢。
我这几天也查了些资料,大概的理解就是crossover design通常用paired t test或者
repeated measures ANOVA。
从各位的回复中我学习到很多东西。谢谢!
can
【在 t*****w 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : from paired t-test, it concludes that the radioactive mean difference from : paired ca42 and ca44 is not equal to zero. but the cause lead to this : difference is ambiguous. You cannot figure out whether ca44 or vitamin-D : results in the difference. As one responder said, this experiment design can : not reach your goal.If I were you, I will choose only one radioactive Ca. : Then one group is fed with Vitamin-D and the other group without Vitamin-D.
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