o******n
发帖数: 511 | 1 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: ostrakon (ostrakon), 信区: Biology
标 题: 请问有做quantitative genetics的人吗？问个kinship和mixed model的问题。
关键字: quantitative genetics,mixed model
发信站: BBS 未名空间站 (Mon May 5 12:50:52 2014, 美东)
我们想把kinship matrix加到我们的model里，分析一些植物的genotype和它们的trait
的关系。
采样的时候，我们每个植物的genotype取了三个样，有27种植物的genotype，所以有81
个样品。
在把kinship放到模型里的R packages里，要求trait data matrix和kinship matrix要
有一样的size，请问我们这种81*n trait的trait data matrix和27*27的kinship
matrix怎么才能对应起来呢？取平均值肯定不是最优的办法。
谢谢！ | a**********w
发帖数: 150 | 2 你的genotype matrix应该是27×3， phenotype matrix 应该是27*n(number of
traits)
题。
trait
81
【在 o******n 的大作中提到】
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: 发信人: ostrakon (ostrakon), 信区: Biology
: 标 题: 请问有做quantitative genetics的人吗？问个kinship和mixed model的问题。
: 关键字: quantitative genetics,mixed model
: 发信站: BBS 未名空间站 (Mon May 5 12:50:52 2014, 美东)
: 我们想把kinship matrix加到我们的model里，分析一些植物的genotype和它们的trait
: 的关系。
: 采样的时候，我们每个植物的genotype取了三个样，有27种植物的genotype，所以有81
: 个样品。
: 在把kinship放到模型里的R packages里，要求trait data matrix和kinship matrix要
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