Re: 请教一个统计学问题，需要多少个SNPs去鉴定一个人 (转载) - Statistics版 - 未名存档

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Statistics版 - Re: 请教一个统计学问题，需要多少个SNPs去鉴定一个人 (转载)

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w**k 发帖数: 6722	1 转到统计老家来问问原帖在 http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31928741.html 【以下文字转载自 Biology 讨论区】发信人: wxwk (wxwk), 信区: Biology 标题: Re: 请教一个统计学问题，需要多少个SNPs去鉴定一个人发信站: BBS 未名空间站 (Wed Dec 10 16:07:15 2014, 美东) 如果测定某个点位，两套染色体上可以是n=10种组合（4 homo and 6 hetero）。也就是说，如果全世界的人都测定了这个位置，那么全世界的人可以分进这n组中某个组。具体到SNP，通常某个位置上有个主要的常见的，比如C/C，一个不常见的，比如T/T。常见的C/C也许是80%，T/T 20%，那就是64% CC，32% CT，4% TT的分布。我的问题其实是这样的。假定我有某个人（X）的DNA，我还有一个两百万大小DNA数据库。数据库里面有X的DNA。这两百万的样品都测定了某些SNPs，比如说20个吧。然后X 的DNA也测了这个SNP panel。我需要通过X的SNP panel结果来判定X和数据库里面的X是不是同一个人。需要考虑的是我的DNA样品有可能是X的，也有可能是X的父母亲的，或者兄弟姐妹的，或者邻居老王的，甚至不遗传相关的陌生人。我需要设计这么一个SNP panel，然后我测定X之后，可以在统计学意义上说，样品X和数据库里面的X是同一个人，其中的错误的可能性小到可以忽略。
h*******n 发帖数: 458	2 我怎么觉得这不是个统计问题。如果你问X是否是n组中某个组，那是个统计问题，问是否是样本中的某个，似乎不是统计问题。也可能是我没理解。
a*******7 发帖数: 772	3 这个取决于你的数量有多少了，现在NGS这么流行，估计是很大的数据。那就看你要多少精度了，首先你数据库里的有可能不是某个人的，而是population average的，那你要把X match上去的话估计会很难。。。我能想到的只能是用相关性了。。。

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