由买买提看人间百态

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全部话题 - 话题: bioinfo
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l*******r
发帖数: 39279
1
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: Wardo (餐厅忙的时候客户端,否则服务端), 信区: Biology
标 题: Re: 我再给指个转行路吧
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Aug 31 10:22:20 2015, 美东)
这个绝对靠谱!
我之前做了好多年的wet lab,实在看不到前途,paper发的再多,方向不行,最后也还
是很难找到正经工作,如果自己一个人这样过着希望不大的生活也可以,关键是看着下
一代,看着innocent eyes一眨一眨的,我有动力去bring them a good life,
whatever it takes;我的第一个博士后实验室是一个sweat shop,博后门必须100%
follow老板的idea和设计,每天要汇报几次结果,而且老板从来没有一句好话,美其名
曰是for the good of you guys bright future. 吭哧吭哧的做了3年多,paper发完
以后,立马就找第二个薄厚实验室。。。我庆幸在被逼近墙角的时候没有走极端,有好
几次像放电影一样在脑子里想买把枪把老板干掉,然后同... 阅读全帖
d*********o
发帖数: 6388
2
http://realtime.zaobao.com/2010/10/101001_33.shtml
(新加坡讯)新明日报报道,40岁前南大副教授被控非礼女博士生,他必须赔偿5000
元给女生,并当庭向她公开道歉。
女博士生接受道歉,但她当庭请他以后不要再找她。
法官在双方同意和解后,撤销控状,判副教授无罪释放。
涉案的李金艳博士,原任南洋理工大学电脑工程学院副教授兼博士生导师。他被控
在09年9月11日下午,在大学一个办公室内,用手触摸22岁女博士生的臀部。
李博士今早在妻子的陪同下出庭,他聘有代表律师,而案中的女生长得清秀高佻,
也由男友陪同出庭。
这起非礼案今早提堂时,控方表示博士要求和女生庭外和解,已通过查案人员付
5000元给女生,并准备当庭向她道歉。女生列出条件,即李博士日后不能再找她。
李博士原籍中国,曾获“亚洲创新奖”金奖。
他的科研履历显赫,已经是本地永久居民的他,拥有澳洲墨尔本大学的博士学位,
之后在我国资讯通信研究院任职,从2008年起在南大执教。
他已在今年7月尾被大学开除。他的主要研究方向包括数据挖掘算法(Data Mining
)、生物信息学(Bioinfo
y**o
发帖数: 8897
3
来自主题: Military版 - 你们谁见过数学好的美女
也得学高数,线代肯定要通过,要不然过不了bioinfo.
u**c
发帖数: 17972
4
这应该算是stem吧.bioinfo好歹也是数学加计算机阿
z*****3
发帖数: 1793
5
现在搞生物的数学的确不行,反而一些搞交叉的可以。比如bioinfo,biomedic的这些
人,数学工具用的多。纯生物的人数学真心不行。
z****e
发帖数: 54598
6
你可以说计算机语言已死
或者说是一个夕阳产业了
就是人类已经发现了这个领域的最优解
就不再继续折腾了,你只需要学会人类定义好的规则就好了
计算机语言这个领域已经没有什么难题需要人类去解决了
java之前,人们之所以搞计算机语言
是因为觉得机器的对话方式,跟人类对话方式有比较大的差异
所以人类可能看不懂机器在执行什么,比如01001011110101010
给你这么一串,你滴不懂这个是啥意思
但是java之后,基本上人能看懂了
所以满足了这个目的之后,还在折腾计算机语言的
不是脑子有屎就是目光短浅,人家解决过的问题
你解决了干嘛?就犹如数学上的某个猜想,已经得到了证明
你再证明一遍?有用吗?你就算证明出来了,人家多半也会说你是抄的
所以计算机语言这个level,已经没有什么可以继续搞的了
剩下无非继续傻瓜化,做成脚本或者置标语言这些,区别不会太大
所以你应该转移到计算机语言以上的东西上去
比如用java来实现什么,vert.x就是一个最好的前进
vert.x之后肯定还有,但是基础类软件,到vert.x应该是一个终结了
vert.x连并发都搞定了,下面人类应该进入纯粹的数学抽象领域了
进入... 阅读全帖
N*****m
发帖数: 42603
7
来自主题: Military版 - 下一步是取代家庭医生
护士收集bioinfo就行了

发帖数: 1
m**********e
发帖数: 12525
9
来自主题: Military版 - 50刀的代理费都舍不得花的索南
bioinfo的电子护照要本人去办,没法代理吧
你还生活在上个世纪?
g******t
发帖数: 11249
10
bioinfo主要是统计的
生千民工拿着别人的包炮炮生成分析报告交给PI
n******7
发帖数: 12463
11
恩,我做bioinfo的,做试验和做算法的基本相互鄙视。做实验的觉得做方法的太扯淡
,玩虚的,实际根本不work;做方法的觉得做实验的没点基本的量化分析能力,土包子
...
d*******g
发帖数: 26
12
来自主题: Faculty版 - 泼冷水,感觉faculty就是joke!
Bioinfo真这么恐怖啊?刚刚接受了一个Offer,bioinformatics就快赶上生物了,大坑
啊,真是明知山有虎,偏上虎山行啊
c*z
发帖数: 157
13
做计算的还是做分子的?
我的lab1办公桌和实验台在一个屋子两侧 外面没有kitchen(有也不会去的)
办公桌和实验台不相连
不做同位素的话 推荐这样的格局
lab2办公桌和实验台连在一起 外面有kitchen 偶尔有人拿可乐咖啡进来
缺点是喝水不方便(波士顿那干燥的天气很要命的)
lab3同lab2 上述三个都是作分子生物实验的
lab4现在是实验室和办公室分开,幸亏是大部分做bioinfo的 如果像以前那样做
western的话两头跑
会崩溃
c*******o
发帖数: 8869
14
hoho, 我是bioinfo的, 刚刚开始找,看到的位置都是2012 fall开始的。 如果是下
面这样写的, 是什么意思:
Please upload your letter of interest, curriculum vitae, a statement of
research plans and goals, a statement of teaching philosophy that includes
teaching experience and course preferences, and four letters of reference.
e*******e
发帖数: 1837
15
来自主题: Faculty版 - Missouri 一大学,9个月60k
挺低的,bioinfo/biostat postdoc/staff 都能拿6万多。

少?
l****i
发帖数: 394
16
来自主题: Faculty版 - Missouri 一大学,9个月60k
稍低一点。但是不离谱吧。看你是挂靠那个系了。生物系的和计算机系的肯定会不同。
我知道的一个明星AP老师,做bioinfo 在生物系,adjunct 到计算类的系,10个月才六
万多点。现在刚提前评了Associate Prof了不知长了多少。应该算中西部一流学校吧。学校很
大。Big10。
f*******d
发帖数: 637
17
来自主题: Faculty版 - Missouri 一大学,9个月60k
真的假的啊
bioinfo这么爽??
p**m
发帖数: 11571
18
☆─────────────────────────────────────☆
animalsex (ws无敌) 于 (Wed Oct 31 13:11:19 2012, 美东) 提到:
女主在天涯开贴呢
http://bbs.tianya.cn/post-funinfo-3735229-1.shtml
( 转载) 本人32岁,未婚,刚确定怀孕,肚子里孩子的生父是一位非常优秀的男人,但
他有妻子也有孩子,这次由于工作原因回国,顺道回来探望他父母,我作为他的高中同学,
做东请他吃饭,在气氛的渲染下,我们发生了关系,然后我怀孕了,现在他已经回到美国.
我当时不是故意要怀孕的,只是情之所至没有避孕,现在我在犹豫要不要生下这个孩
子.
肚子里孩子的生父曾经是我们省高考前十名,考入北京两所最高学府之一的学校,后
来转本硕连读,也就是6年就拿到硕士学位了,然后拿着全额奖学金去了美国一所世界名
校攻读博士,5年后博士毕业,现在是另一所世界名校的助理教授(在美国要取得终身教授
需做6年助理教授),目前已经做了三年助理教授,按他的情况肯定能够转终身教授.
他身高178,体型很好,人长得很谨慎,... 阅读全帖
L***s
发帖数: 9258
19
Bioinfo这个领域难道都要Nature才行了?
l***s
发帖数: 841
20
The range is pretty wide. Anywhere between $80k-130k for a starting AP for
12 months is reasonable. To be safe, you may choose a midpoint if not sure.
My impression is that a bioinfo position is 10-15% higher than biology, but
10-15% lower than CS.

faculties,
l***s
发帖数: 841
21
The range is pretty wide. Anywhere between $80k-130k for a starting AP for
12 months is reasonable. To be safe, you may choose a midpoint if not sure.
My impression is that a bioinfo position is 10-15% higher than biology, but
10-15% lower than CS.

faculties,
l**********1
发帖数: 5204
22
来自主题: Faculty版 - 今年第一个CAREER发出来了
http://chem.ucr.edu/faculty.html?id=44
本来就是忽悠, that Comp Chem Bioinfo , before 张 Yi Tang or similar
Mathmatician published new math tool which can replace/beyond Monte Carto
Markov chain
applied on Quantum Chem kinetics...
s*******2
发帖数: 598
23
发信人: redsilence (redsilence), 信区: biojailbreak
标 题: 【求助】转行大难题求建议
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Apr 12 04:02:07 2014, 美东)
求各位ex-, current-hellmates建议指路!
我的现状对于转行这个目的来说就像全身肿瘤转移,全是问题。但我深切地想转行cs、
bioinfo或biostat,而且最近偷偷跟了udacity的python课,真的很喜欢编程这种纯靠
逻辑、定义明确的东西。
地理位置:中国
个人:生物类美国PhD回国青教3年,发现自己不适合也不擅长以科研为生,只想要个平
凡稳定有技术性的工作做到退休
出国和未来找工都有身份问题:大龄<35,单身女,已有美国PHD(这三项不管申J1还是
F1签证都是赤裸裸的移民倾向);无卡、不够EB1A,唯一好点儿的是phd毕业后没申opt
就回去了,再上master的话应该还有opt
用博后做跳板希望渺茫:博士期间太没规划,基本的生物技术都没学、科研思维也很一
般,现在申请美加的博后没人理,即使有老板要我,能不能撑到j1 waiver也是... 阅读全帖
s******g
发帖数: 3841
24
里面很多是ECE或者Bioinfo的,挂靠在CS
Yizhao Hou是数学的,都算是CS?

发帖数: 1
25
来自主题: Faculty版 - Faculty本来是个很好的职业
Bill_Ma 发表于 2009-7-3 13:41:49 | 只看该作者 回帖奖励
Waterloo的theory组,做得很好的有两位老师,一位是华人老师李明老师,ACM Fellow
,他师从Cornell的Turing Award得主Juris Hartmanis,以前是专做Kolmogorov
complexity的,也成名于此,现在主要做bioinformatics。另一位做theory很好的是
Ian Munro,主要做数据结构。这里不得不提theory组的一个校友--Erik Demaine,此
人20岁从waterloo理论组phd毕业,就到了MIT CSAIL做Assi. Prof,4年拿下终身教职
升为副教授,插一句,此天才是前面提到的多大教授Stephen Cook的徒孙。. more
info on 1point3acres.com
Waterloo另一个非常强的组,就是Bioinformatics了,前面说了李明老师现在主要做这
块。另外,还有个华人老师--马斌老师,他10多年前是李老师的post-doc,现在是
Waterloo的副教授了,马老师本硕博都是在... 阅读全帖
h********y
发帖数: 43
26
请问能展开说下吗?我对bioinfo领域不是太懂。。。

发帖数: 1
27
cs系做生物信息的少,地位也不高。很多高校cs招聘广告中都是提了一大堆方向包括生
物信息,这种的做生物信息的去申基本没啥希望,包括很多50-100的学校都是这样。我
一个师兄美国前20的cs博士从事bioinfo多年,CNS挂名至少3篇非一作(都是主生物的
文章),引用1500+,被50-100的学校cs系据了N次,前50的基本都杳无音讯。一个大问
题是committee都觉得他提得东西不好申请funding。lz需要在cover letter中考虑这一点
如果你强调你是做machine learning的,cs系的commitee基本都会看你的cs会议/期刊
文章,例如CV三大会ML三大会等等。如果一篇没有就直接skip了。不做生物信息的cs人
基本无视CNS paper
under review = 0

发帖数: 1
28
对,确实没funding
但搞AI或者说纯CS的基本都是这个背景,靠着一堆会议文章堆的简历,大家都没
funding所以竞争也勉强算公平。很多fresh phd引用200直接ap
但是生物信息这种行业略尴尬
和CS的比论文不在一条线上,尤其是一作数量和作者数目。很多纯cs背景人一看十几个
作者或者三、四作者的文章就直接忽略了
和生物的比少CNS一作或者corresponding author,没funding,idea申请funding相对
难。据说一些纯生物背景的人认为bioinfo就是数据处理,找个硕士生跑现成tool就可以

发帖数: 1
29
bioinfo的career path更类似于life science
需要affiliate到大的医学院/医院,慢慢弄到钱再独立出来
没有钱确实学校招了也没啥劲
不像搞AI/CS的,还可以教学生刷题

可以
B*******e
发帖数: 3882
30
来自主题: Gowest版 - 请教 Bioinformatics, Rice VS. NCSU
Rice's bioinfo PHD program is a totally new program.
and the program is more about statistics, NCSU seems to be stronger in this
area.
p****n
发帖数: 1
31
来自主题: Gowest版 - 学生物的能转什么行?
Biostat or Bioinfo
m*****o
发帖数: 30
32
来自主题: Gowest版 - 求助:cs offer选择
(1)For money issue, better choose VT. But should be
able to seek the funding to make up the short once
you are in that program at UMD. Usually not a difficult thing.
(2)In terms of research, there are 4 guys in Dept of CS
at UMD doing research in Bioinformatics
http://www.cs.umd.edu/groups/areas.shtml.
Moreover, should be able to interact with other professors
in the Center for Bioinformatics and Computational Biology
http://www.umiacs.umd.edu/research/bioinfo/ .
For VT, there is a Computati
w******y
发帖数: 8040
33
来自主题: JobHunting版 - 形势不好还是我的问题?
也要看phd研究的方向
不是每个top 10 CS的phd都能拿ms/google保底的
比如bioinfo的就很难

玩好了。
l*******3
发帖数: 1074
34
今年秋开始PhD第四年,明年夏季或秋季毕业;请问各位大佬俺啥时候应该找工作呀?
目前正在作课题,作论文,暂时还没想找工作的事情。特此求教!谢谢各位!
补充说一句:
俺的专业是 Health Informatics/Bioinformatics 专长就是coding,想找医学、生物IT公司一类的职位。目前手上的信息有老板经常发到email-list里的bioinfo的学术职位(俺以后不太想和bio沾边,不太关注这些职位),俺平时就上biohealthmatics.com上去瞅瞅,信息目前就这些了……有相似专业的要毕业的童鞋吗?
TN
发帖数: 1870
35
专长是coding就甭怕找不到工作了

物IT公司一类的职位。目前手上的信息有老板经常发到email-list里的bioinfo的学术
职位(俺以后不太想和bio沾边,不太关注这些职位),俺平时就上biohealthmatics.
com上去瞅瞅,信息目前就这些
D******n
发帖数: 2836
36
来自主题: JobHunting版 - offer,stat ms,55000
【 以下文字转载自 Statistics 讨论区 】
发信人: DaShagen (Unbearable lightness), 信区: Statistics
标 题: Offer
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Jan 12 15:29:16 2010, 美东)
终于有offer了,stat ms,bioinfo phd,statistician in a credit company, GA,
55000 salary+8000 sign on bonus,
感觉好鸡肋啊,这点钱。。。。。
到底从不从好呢,我也有且只有这个offer了。。。。
a*****c
发帖数: 2086
37
你这些stat,ml,nlp的技能在bioinfo方面可能会有一些机会,可以试试在这方面的公
司找找看。
k*j
发帖数: 153
38
http://www.cs.cmu.edu/~ckingsf/bioinfo-lectures/suffixtrees.pdf
PAGE 44
Determine the strings in a database {S1, S2, S3, ..., Sm} that contain
query string q:
Build generalized suffix tree for {S1, S2, S3, ..., Sm}
Follow the path for q in the suffix tree.
Suppose you end at node u: traverse the tree below u, and
output i if you find a string containing #i
f****l
发帖数: 8042
39
为毛不可以??再说了35离40还有5年呢。这个背景转CS不是比文科,生物啥的转要容
易很多?只不过生物靠bioinfo,生统和CS貌似最近有越来越眉来眼去的趋势。哪个谁
谁不是说,她上课的时候班上一堆40+大叔吗。
s******t
发帖数: 71
40
我是stat phd 第二年,本来已经选了老板,老板将来会做finance的东西,跟国内的券
商开发衍生品什么的。但是老板自己完全是stat,不懂金融,他国内合作的一个人想跟
他读博,那个人目前在券商工作,老板也很中意他。
我跟老板说我想做finance,老板说他明年on leave,应该是回国搞那个项目去了吧,
可能不是很想带我玩。我也理解,我现在也不很懂金融,只修过些基本的FE的课。
现在另外一个AP,搞的是Dirichlet Process, 目前在申funding,跟gene有关的项目
,手里没人,去找我老板帮忙。我老板就推荐我过去弄。
下周一我,我老板,那个AP,要一起谈谈。我觉得我们三个坐一起我拒绝也不太好拒绝
了。我自己的职业打算是毕业找industry,不药厂,要么bank要么IT,做postdoc估计
没钱养老婆了。
所以现在情况是我老板手里没活给我做,他做finance要靠别人,我凑过去对他也没用
。那个Ap缺人(看他的CV,什么事情喜欢一个人做,paper都是一个人发,真的会带我
玩么)。然后我也怕在DNA,RNA sequence上越走越远,追后只能走postd... 阅读全帖
l********n
发帖数: 364
41
stats去bank应该拼不过码工和学数学的 现在开始做一些ib/pe interns 考考cfa 也许
毕业了可以去的了 我认识两三个这么进的
w*******u
发帖数: 472
42
Stat去bank做risk很容易的
b********t
发帖数: 5261
43
拿master去银行工作
r****s
发帖数: 1025
44
来自主题: JobHunting版 - 贡献电面 (F)
也许你姓Rao,或者英语带浓重的孟买口音,总之三哥可能confused,面试的时候看看
是不是真的。
http://www.cs.cmu.edu/~ckingsf/bioinfo-lectures/suffixtrees.pdf
m*p
发帖数: 1331
45
来自主题: JobHunting版 - 今天见识了烙印的团结
这种老中主心骨一定要顶!
哎,我面的阿三,有一个是我迫于压力说同意招进来的,现在肠子都悔青了,老是组阿
三团跟我和我们组另一个老中对着干,最近一次居然把我这个senior的给变相打败了,
幸好我老板出手相救不然我惨了。哎,,,蝗虫啊蝗虫!!!
(当时的hiring rating:非阿三HM说highly positive, 其他几个阿三说positive, 我
ABC老板说 average, 我觉得negative因为他连random forest都没听说过,还是某名气
还可以的中部大学bioinfo phd。但是最后开会迫于同意了 )

错。
g*r
发帖数: 67
46
【 以下文字转载自 JobMarket 讨论区 】
发信人: gar (ladygargar), 信区: JobMarket
标 题: Programmer Analyst II - Dallas, TX
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Jan 13 18:14:36 2015, 美东)
负责database开发管理 + bioinfo pipeline。
应该可办H1B。
http://jobs.utsouthwestern.edu/career/34351/Programmer-Analyst-
Programmer Analyst II - Center for Human Growth & Development job in Dallas
Job Type: Full-time
State: Texas (TX)
City: Dallas
Salary
Salary Negotiable
Experience and Education
High school graduation or GED plus successful complet... 阅读全帖
e*******o
发帖数: 4654
47
来自主题: JobHunting版 - [求助]国内老码农来美求职
你转python 不愿意换地方也不容易。
如果你水平不错,看看这家,可以remote
http://www.grantstreet.com/careers/
有不少工作是你工作一段时间后,可以remote。
boston 高校应该有做bioinfo的职位,不过pay的太低。你可以找找看。
找到了给我包子。

发帖数: 1
48
来自主题: JobHunting版 - 刷kaggle对找ds工作有多大帮助?
虽然没有马工多,和ds还是有得一拼的吧。。但还是要看发文章质量什么的。
感觉bioinfo以后发展前景会挺不错的。
我是听一个去做bioinformatics scientist的师姐说的。
你要是phd期间文章引用够了,不需要做博后,直接自己上EB1A,只要继续还在biotech
领域就行了。转到别的领域就不好申请EB1A了。
c**********a
发帖数: 659
49
估计一般。以前认识一个bioinfo phd, 辅修了cs master ,毕业后当码农了。
D*********e
发帖数: 646
50
一直不明白怎么这么多bioinfo的在抱怨,那么多DS工作不是都很match吗
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