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全部话题 - 话题: bioinfo
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t*****u
发帖数: 17
1
这是一个坑, 去生物信息看看吧:)
c****r
发帖数: 185
2
来自主题: CS版 - 预测几个值图灵奖的得主
Turing Award 认可哪些范畴?
SVM涉及了ML/CV/PR/DM
CS发展的趋势就是跟其它学科勾结,CS+STAT=ML,CS+BIO=BIOINFO。
c**n
发帖数: 39
3
来自主题: CS版 - 预测几个值图灵奖的得主

CS+STAT=ML,
这个不对吧,至少 新的ML 主要是 CS+微分几何,线性袋鼠 啥的
CS+BIO=BIOINFO。
X**********g
发帖数: 480
4
bioinfo 是个 相当烂的 方向
等毕业了, 你都不知道自己 会干啥
n****g
发帖数: 150
5
有不少学校的CS专业就靠bioinfo的funding撑着呢。
t****g
发帖数: 14
6
bioinfo就不用考虑了吧
s*****g
发帖数: 5159
7
我也是次级的。
还是取其精华吧,多核不了解,不过stat learning应该是应用前景比较好的方向。现
在funding/新招faculty还是bioinfo最多,不过谁都知道那是...
s*****g
发帖数: 5159
8
I have little knowledge of computational biology. Two cents,
1. Computational Bio as well as BioInfo occupied about a half of the new cs
faculties in research schools in the past a few years. Probably this is a
new field and schools needs faculties in the field as well as the potential
of they bringing funding. Statistically, NIH is more generous than NSF and
military resources. This implies you got an advantage.
2. From the view of a traditional cs researcher, regardless one is a
database perso
l**y
发帖数: 1
9
Bioinfo 还是比较热的。一些学校应该还在招人(但不是牛校),LZ 可以试试。有人
publications 不那么强也找到了,但不是最近一两年。
v********e
发帖数: 1058
10
Eric Xing是生物出身啊,一般学化学的对生物了解不了多少的。咱们CS一个学科下面
不同分学科的人尚有时觉得隔行如隔山,人家化学和生物可是两座大山。
不过预测蛋白质结构那些应该化学物理知识够了大概就基本可以了吧,如果不计算生理
环境下的结构变化的话。其他大部分bioinfo的东西更主要还是遗传、分子生物这些当
代生物的核心,学化学的大部分是没学过这些东西的,照样得重学
K****n
发帖数: 5970
11
来自主题: CS版 - 本版machine learning的专家
我们搞生物的用ML分几种:
1.自己develop算法的.一般没必要,cs里有多少人自己搞原创之后再发个nips我也不知
道.我们往往就是当CS教授的学生,或者自己的老板和CS老板合做.
2.还有把ML再加上一般数学方法,改到适用于自己这个问题的
3.再有就是下载ML牛人的code,做做regression的
4.还有自己也不知道自己在干什么的
我觉得CS,统计,bioinfo里都不缺这几种人. CS里前面几类人多,生物里后面几类人多.
另外新phd向老phd转变过程中,也是从后面往前面进步的过程.
o*******r
发帖数: 51
12
Bioinfo好忽悠啊,钱刷刷的。
我还是觉得Systems Biology比较实在点~~
L********d
发帖数: 3820
13
好的能上science,nature,计算机其他领域一般上不了,呵呵

工业界基本没啥工作. CRA 08年计算机博士工作机会分布,BioInformatics倒数第几.
学校的坑现在添的差不多了,到2012估计坑都满了. Bioinfo好忽悠,政府钱多,学校坑都
满了,工业界没机会,最后
挺烂的. 文章质量普遍不敢恭委.
h********g
发帖数: 155
14
有没有前途要看你现在的位置,如果你已经有了教职,那你也许能靠这骗些钱来花。但
你要是还是个学生或波斯道,那你做了BIOINFO就是大凶之兆。等你毕业之后CS工作机
会没你的份,因为别人认为你是搞生物的。所以你搞不好要去跟学生物的那帮烂人去抢
波斯道的位置。
还有CS里做BIOINFOR的大多是些烂人和卢瑟,他们在自己的领域里没IDEA,所以就想到
靠这种方法来骗钱。跟了他们你还要担心他们的人品。这个领域几年之内我看就会逐渐
死掉的。所以要进去之前好好考虑一下。
L********d
发帖数: 3820
15
一边鄙视人家BioInfo,一边羡慕人家funding多,呵呵
a*******e
发帖数: 336
16
未来相搞学术科研究做bioinfo,想去业界就做computer vision and pattern
recognition
v****s
发帖数: 1112
17
来自主题: CS版 - 做生物类数据挖掘的请教
what's your background?
bioinfo is just an application or combination between statistics and biology.
b****n
发帖数: 464
18
本人女,26, 大学学的是纯生物。现在phd第4年,实验室是纯计算的,不过最后的
degree title还是生物的。
渐渐觉得比较喜欢编程的生活。不过没有受过很系统的训练,很多该上的课也没有上过。
目前第一篇paper还在写,希望明年上半年能发表。
本来想这边phd拿到再做打算,可是最近突然意识到,拿到了phd,是不是就不可能再申
cs的master或phd program了。倒不是我非要继续念书,不过觉得自己的编程什么的都
学得半吊子,不知道找工作是不是很成问题。所以突然有想法,拿master走人,去bf所在
的学校申请个cs的master来读,刚好也解决了目前两个人long distance的问题。
pros:
1. 两人团聚
2. 彻底转行,可以接受cs的正规训练
这两点都吸引力很大。
cons:
1. 已经第四年开始了,才拿master走是不是有点可惜。可是如上所述,拿phd走就不能再
读书了,可是很多基础的东西不懂,也没有cs的degree,怕自己做不了什么。
2. 从头再来,花钱花时间。
补充:我的学校医学院算挺有名,但是生物program就还好,bioinfo的算弱势群... 阅读全帖
e****l
发帖数: 318
19
谢谢!
课不是说bioinfo还是不错的吗?很多人转行去读了这个的啊
g**********t
发帖数: 475
20
是,bioinfo用统计比较多。比较接近CS的machine learning方向,不过要有生物学背
景知识才能有好的idea。
f*******d
发帖数: 637
21
bioinfor跟啥都能沾上关系
万金油
所以弄不好就是三不沾,更尴尬
Q*****i
发帖数: 349
22
来自主题: CS版 - 该不该退phd (转载)
bioinfo 不好找工作, 不如码工
l******t
发帖数: 660
23
千万别学bioinfo, 害死人不偿命
K*******a
发帖数: 100
24

是这样的, 因为这个Program的课程设置和CS MS几乎一样, 竞争又没有那么激烈, 所以
我就申请了这个. 况且我是生物出身, 可以免修生物方面的必修课, 多出来的时间可以
用来补算法和数构或者别的核心课程. 不是一心想学bioinfo, 只是想借机学点coding
的本事然后赶紧找工作...
K*******a
发帖数: 100
25

的。
这样啊...那如果我读bioinfo期间多写写code做做网站github上搞几个project呢?
至于学校, 貌似MS给奖学金的很少啊...
多谢了~
w***f
发帖数: 903
26
假设你是老板,要花10分钟时间在100份简历中先选出20个左右准备下一步仔细看, 你
觉得一个拿了Bioinfo MS的人,值得你花时间看他写过几行code, 在个什么网站上挂
了几个project吗?
l******t
发帖数: 660
27
千万别学bioinfo, 害死人不偿命
K*******a
发帖数: 100
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是这样的, 因为这个Program的课程设置和CS MS几乎一样, 竞争又没有那么激烈, 所以
我就申请了这个. 况且我是生物出身, 可以免修生物方面的必修课, 多出来的时间可以
用来补算法和数构或者别的核心课程. 不是一心想学bioinfo, 只是想借机学点coding
的本事然后赶紧找工作...
K*******a
发帖数: 100
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的。
这样啊...那如果我读bioinfo期间多写写code做做网站github上搞几个project呢?
至于学校, 貌似MS给奖学金的很少啊...
多谢了~
w***f
发帖数: 903
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假设你是老板,要花10分钟时间在100份简历中先选出20个左右准备下一步仔细看, 你
觉得一个拿了Bioinfo MS的人,值得你花时间看他写过几行code, 在个什么网站上挂
了几个project吗?
W***o
发帖数: 6519
31
Thank you for your reply. I am a Bioinformatics postdoc (just switched from
web biology to bioinfo) and want to get a
degree in CS by taking online courses. I want to get an official MS degree
so that I have the right credential for a better career future. I work full
time, and don't have time to go to classroom. is it still worth taking UIUC
online class and eventually getting their MS degree?
B*****g
发帖数: 34098
32
据我了解,bioinfo最近很难找工作,大规模同学转向马工和童工
s**********o
发帖数: 14359
33
好像是经济不好,搞研发的都在裁人,比如那个卖基因测试仪器的公司,我差点进去,
没多久估计就被裁了,不过十年河东十年河西,等他学出来了,BIOINFO可能又火了,
这个东西不好说。我同学现在苦等绿卡呢,在哪个什么北TEXAS什么玩意,编程水平还
挺高的,投错了胎。
e****y
发帖数: 271
34
谢谢二位!
哈哈 等我学出来bioinfo也不会火,因为我半年就毕业了。我只是口水药厂的DB dev和
DBA职位
看来我还是好好学习DB,提高自己竞争力要紧。
s**********o
发帖数: 14359
35
既然是想转行,就彻底一点,转个普通的DB DEVELOPER,工作机会多,别舍不得你那个
BIOINFO,自己把自己的面搞窄了,机会就少了,不要以为每家药厂DB DEVELOPER每年
都在招人,这东西也是一个萝卜一个坑,十家药厂有可能有一个招人,十年一次吧,也
就是说,一年之内100家药厂有一个可能招人,还不一定要你。你自己觉得好像很专,
但一般的DB DEVELOPER,,人一看你个搞生物的,不敢要你,万一你呆一年去搞生物怎么
办。
s**********o
发帖数: 14359
36
DB DEVELOPER还是搞商业的多,跟钱打交道才有钱赚,卖东西的,MARKETING的,银行
投资的,然后是医院HEALTH CARE的,还有学校教育的,BIOINFO小之又小。
n******7
发帖数: 12463
37
来自主题: Hardware版 - 生物postdoc求推荐laptop+显示器
你说的这是bioinfo
你看楼主列的
前两个office, illustrator就不要想linux了
n******7
发帖数: 12463
38
来自主题: Hardware版 - 用于科学计算的单机该怎么配
看样子你是自己玩票做bioinfo?
CPU差不多就好,你单机跑,快慢也就那样,核多很重要
内存越大越好,不解释
硬盘越大越好,特别做NGS的
GPU计算还用得不多,当然这个也看领域。
像MD这种方向,跑现成工具,似乎还是有些用的
自己写代码的基本不用
n******7
发帖数: 12463
39
来自主题: Hardware版 - Mac Pro 配置推荐
那还是别折腾mac pro了,老老实实PC+linux
我同事几个月前配你这类似的,HP workstation, 6 core + 32GB + 2TB HDD,不到2K
因为我们是当destkop用的,所以其实内存应该在加点,要是你们跑job
reads alignment是高度可并行的,所以core多点好,现在似乎6-core的价格还在性价
比线性范围内。上双CPU价格就上去了
你们要只处理自己的数据,比如RNA-SEQ,Exome sequencing,其实不用太fancy的机器,
我想你们比较穷的话,自己的data也不多
这些个bioinfo工具linux下面跑没有任何问题。大部分应该osx下面也能跑,不过难说
某些有问题。
你们干活的机器,实在没有必要上mac. 装个debian,什么bowtie2,samtools直接在库
里面,一行命令安装好。不然我琢磨你这背景安装就要折腾半天
l*******3
发帖数: 1074
40

看来是搞bioinfo的,当年我也这么玩过,后来不久机器就落灰了,再后来把神U也出了
,摸摸脑袋,发现15%是为了工作,85%是为了满足作为geek的爱好
l*******3
发帖数: 1074
41

看来是搞bioinfo的,当年我也这么玩过,后来不久机器就落灰了,再后来把神U也出了
,摸摸脑袋,发现15%是为了工作,85%是为了满足作为geek的爱好
n******7
发帖数: 12463
42
来自主题: Hardware版 - 求用作matlab计算的电脑配置
你这是真爱,转行吧
记得你是搞MD的,这个没啥意思,在bioinfo里面都是非主流
x******8
发帖数: 350
43
谢谢回答啊,我没有bioinfo背景,正在学习哈。
知道的话告诉几个呗
P********e
发帖数: 2610
44
It is said AI is least industrial needed area, right now
maybe better than bioinfo
d*******r
发帖数: 3299
45
来自主题: Programming版 - 牛人们来看看这个Dao语言怎么样
我也没什么想法,如果建议的话,我觉得可以先试着做自己擅长自己懂的吧。
我记得LZ是做BioInfo的。可以写一些科学计算,或者建模的东西?
N*******t
发帖数: 66
46
来自主题: Programming版 - 牛人们来看看这个Dao语言怎么样
动手做过一点Bioinfo的模块,但没坚持下来,
主要是当时语言本身还没不少东西要做。
最近语言本身的所有特性都已经做好了,
现在的主要目标是测试和文档。这之后
大概才能比较专心地做大的模块和库了。
n******7
发帖数: 12463
47
都是一些琐碎的问题
http://www.mitbbs.com/article/Programming/31349753_3.html
反正我是没信心了,还是用最主流的工具省心
另外对于做bioinfo来说,bioconductor太有用了
n******7
发帖数: 12463
48
来自主题: Programming版 - 大数据在工业界流行的黑暗真相
我感觉对bioinfo data
大家的mining的水平都差不多
瓶颈一直在于data的数量和质量
比如我们有些自己的想法,别人看了立刻可以copy一个出来
只有有自己的data才能保证优势
n******7
发帖数: 12463
49
来自主题: Programming版 - 转行的不应该看不起科班出身的
bioinfo天天用cluster好不好
我不是学计算机的,杀了很多年老鼠
l**********n
发帖数: 8443
50
【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: zhaoce (米高蜥蜴), 信区: Military
标 题: java之后,人类就已经不再意计算机语言了
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Jan 25 19:13:08 2016, 美东)
你可以说计算机语言已死
或者说是一个夕阳产业了
就是人类已经发现了这个领域的最优解
就不再继续折腾了,你只需要学会人类定义好的规则就好了
计算机语言这个领域已经没有什么难题需要人类去解决了
java之前,人们之所以搞计算机语言
是因为觉得机器的对话方式,跟人类对话方式有比较大的差异
所以人类可能看不懂机器在执行什么,比如01001011110101010
给你这么一串,你滴不懂这个是啥意思
但是java之后,基本上人能看懂了
所以满足了这个目的之后,还在折腾计算机语言的
不是脑子有屎就是目光短浅,人家解决过的问题
你解决了干嘛?就犹如数学上的某个猜想,已经得到了证明
你再证明一遍?有用吗?你就算证明出来了,人家多半也会说你是抄的
所以计算机语言这个level,已经没有什么可以继续搞的了
剩下无非继续傻瓜化,做成脚本或者置标语言... 阅读全帖
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