由买买提看人间百态

topics

全部话题 - 话题: dimer
首页 上页 1 2 3 4 5 6 7 下页 末页 (共7页)
a********k
发帖数: 2273
1
花了一个小时,深深的鄙视一下自己的无聊行径!!
125 蔡亮 男 1980年11月 复旦大学 生命
科学 2007年12月毕业于[美国]北卡大学 [美国]加州大学旧金山分校 博士后
Cai L, Mostov K. Polarity is destiny. Cell. 2009 Nov 13;139(4):660-2. PubMed
PMID: 19914162; PubMed Central PMCID: PMC2900917.
Cai L, Makhov AM, Schafer DA, Bear JE. Coronin 1B antagonizes cortactin and
remodels Arp2/3-containing actin branches in lamellipodia. Cell. 2008 Sep
5;134(5):828-42. PubMed PMID: 18775315; PubMed Central PMCID: PMC2570342.
Cai L, Makhov AM, Bear JE. F-actin... 阅读全帖
b******y
发帖数: 627
2
来自主题: Biology版 - 什么原因导致无法双向IP?
根据上面两位的,我再补充一点。有时,A 可拉 B 但 B 不可拉 A 是因为valence
issue. For example, if A is a monomer and B is a dimer or oligomer, Ab(A) is
a high affinity dimer towards A and make an A dimer. Dimeric A will
interact with oligomeric B at high affinity. Ab(B) binding to B, however,
doesn't increase the affinity with monomeric A and therefore it is hard to
pull it out in the direction.
In addition, more interactions are of low affinity than those of high ones
in the cell. Unfortunately low affinity ones are unders... 阅读全帖
j*b
发帖数: 341
3
这个PKM2和肿瘤代谢的关系已经知道很久了,这两篇还不是原创贴。
cantley还可以发nature,能不能解释一下?
Anticancer Res. 2003 Mar-Apr;23(2A):1155-8.
Tumor marker pyruvate kinase type tumor M2 in patients suffering from
diabetic nephropathy.
Oremek GM, Rutner F, Sapoutzis N, Sauer-Eppel H.
Source
Central Laboratory, Hospital of the Johann Wolfgang Goethe-University,
Frankfurt/Main, Germany.
Abstract
INTRODUCTION:
Compared to normal tissues all tumors investigated so far and especially
those with a metastatic potential overexpress an isoenzy... 阅读全帖
j*b
发帖数: 341
4
这个PKM2和肿瘤代谢的关系已经知道很久了,这两篇还不是原创贴。
cantley还可以发nature,能不能解释一下?
Anticancer Res. 2003 Mar-Apr;23(2A):1155-8.
Tumor marker pyruvate kinase type tumor M2 in patients suffering from
diabetic nephropathy.
Oremek GM, Rutner F, Sapoutzis N, Sauer-Eppel H.
Source
Central Laboratory, Hospital of the Johann Wolfgang Goethe-University,
Frankfurt/Main, Germany.
Abstract
INTRODUCTION:
Compared to normal tissues all tumors investigated so far and especially
those with a metastatic potential overexpress an isoenzy... 阅读全帖
H**T
发帖数: 3007
5
尼玛!现在生物版的几个上窜下跳的是经过科学训练的吗?!
脑残还是咋地?!阅读水平这么差还做科研,还出来现?!
人家讨论的是最小的band,是primer dimer! 不是中间的bands.primer dimer是50bp左
右的band,明白了吗?primer dimer当热不是editing的产物!
连韩春雨的主要贡献都没搞清楚,就出来喷啊,还跳的那么欢实!韩春雨的主要贡
献是将找到特异的菌株,将 NgAgo 的最适工作温度65度成功降到37度。
很可能是完全没有科学素养,在某个实验室混吃等死,心里打算着转行,老板叫他
重复一下韩的实验,他就只读了一下韩文章的method部分,照着做没搞定。
http://www.mitbbs.com/article/Biology/32028889_0.html
发信人: liveinsky8 (live), 信区: Biology
标 题: Re: NgAgo最新结果!Efficient!
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Jul 18 08:31:19 2016, 美东)
这个法国人声称重复出来的结果,发现是引物二聚体( dimer... 阅读全帖
L*****r
发帖数: 722
6
来自主题: MedicalCareer版 - 内科陷阱小结 --- 受 Dr yf启发

ct
pretest probability 在去年的Board 复习录像MEDSTUDY里还在强调,不应该过时吧?
我自己还是挺喜欢的,不过查房时提过,却没人理我这碴,郁闷。
D-dimer本来就是rule out不是用来rule in的。是啊,如果阴性了万事大吉;如果阳性
了,虽然说没什么帮助,但总有可能是因为PE而阳性呢,按我们这的惯例,就必需进一
步做CT-angio 或V/Q scan。所以,我们如果临床考虑low pretest probability,可又
不想多事的话,就把D-dimer省了,就此打住。
倒是high pretest probability 时候,假如肾不好,或者别的什么原因不能做CT-
angio,那还不如做个D-dimer赌一把,万一D-dimer阴性呢,那就理所当然地rule out
PE, 把CT-angio省了。
- 高度怀疑PE的病人,干嘛反正总是想看看他的心呢?:)
p*******g
发帖数: 2976
7
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: albertsmwk (.)(.), 信区: Biology
标 题: 第一批“青年千人计划”生物类@publication列表@
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Aug 18 15:04:16 2011, 美东)
花了一个小时,深深的鄙视一下自己的无聊行径!!
125 蔡亮 男 1980年11月 复旦大学 生命
科学 2007年12月毕业于[美国]北卡大学 [美国]加州大学旧金山分校 博士后
Cai L, Mostov K. Polarity is destiny. Cell. 2009 Nov 13;139(4):660-2. PubMed
PMID: 19914162; PubMed Central PMCID: PMC2900917.
Cai L, Makhov AM, Schafer DA, Bear JE. Coronin 1B antagonizes cortactin and
remodels Arp2/3-containing actin branche... 阅读全帖
j*****y
发帖数: 94
8
来自主题: Biology版 - need help_how to disrupt a homodimer?
我的蛋白是个homodimer,蛋白的结晶已经作出来了。dimer interface is formed by
3 helixes from each
protomer,但是两个protomer 不是像手掌对手掌那样的完全对称interact, 而是两个
protomer之间交叉对称 ,i have
tried a bunch of single-site, double and quadruple mutations to try to
disrupt the dimer but failed. 因为
protomer不是整个helix在interact, 而是有一定角度的,所以不知道为什么两个
protomer之间的作用力会这么强。我们用
的是glycerol gradient sedimentation analysis 来确定 s value, 我试过用没有
salt 的 gradient, 结果蛋白变成了
tetramer; 在高浓度salt gradient 下,仍然是dimer.
我曾经想过能不能在helix 和 helix 之间的loop 那儿插入一小段peptide
f*******h
发帖数: 38
9
吴号Michael Karin强强联手
搞结构灌水灌的真快
Crystal structure of inhibitor of κB kinase β
Guozhou Xu, Yu-Chih Lo, Qiubai Li, Gennaro Napolitano, Xuefeng Wu, Xuliang Jiang, Michel Dreano,
Michael Karin & Hao Wu
Department of Biochemistry, Weill Cornell Medical College, New York, New York 10021, USA
Guozhou Xu, Yu-Chih Lo, Qiubai Li & Hao Wu
Department of Pharmacology, University of California at San Diego, La Jolla, California 92093, USA
Gennaro Napolitano, Xuefeng Wu & Michael Karin
Nature (2011) doi:1... 阅读全帖
n*********m
发帖数: 38
10
Look his publication
Conversion of D-ribulose 5-phosphate to D-xylulose 5-phosphate: new insights
from structural and biochemical studies on human RPE.
Liang W, Ouyang S, Shaw N, Joachimiak A, Zhang R, Liu ZJ.
FASEB J. 2011 Feb;25(2):497-504. Epub 2010 Oct 5.
PMID:
20923965
[PubMed - indexed for MEDLINE]
Related citations
2.
Structural basis for the inhibition of human 5,10-methenyltetrahydrofolate
synthetase by N10-substituted folate analogues.
Wu D, Li Y, Song G, Cheng C, Zhang R, Joac... 阅读全帖
g***x
发帖数: 645
11
那个lane1 develop 的时候ecl没有覆盖上,后来又重新develop了一次就没问题。应该
和这个没关系
我做的LT 是根据文献做的,reducing agent 就是指beta-ME,DTT 这些,你说的对,
是打开氧化的键,主要包括二硫键的,我的dimer 不是二硫键,是范德华力。
你说的你的例子是不用reducing agent, 但是用煮的,这样也会破坏dimer 之间的键
,起到的也是尽量reduce 蛋白的作用吧,你说的也可以跑出好看的带型,是指二硫键
没有被破坏,dimer 也没有破坏么?
y******n
发帖数: 8667
12
来自主题: Biology版 - question about protein size

en. Very possible dimer.
When running SDS-PAGE, adding more DTT and heating hard might remove dimer.
If it is true, it will confirm it is a dimer.
b******y
发帖数: 627
13
My guess is that A protein is probably multivalent, i.e. one A protein can
bind more than on B. Even if one A can only bind one B, GST is a dimer and a
GST-A dimer can bind two B and increase the local concentration of B.
Furthermore, Glutathione bead substantiates the local concentration effect
by binding more than one GST-A dimer in the vicinity of each other. As such,
the self-assembly activity of B is greatly increased and the whole system
including all beads, all GST-A and all B forms a sin... 阅读全帖
b******n
发帖数: 4225
14
dTomato发光的结构是dimer
所以如果你的目的蛋白能形成dimer或者oligomer你也许能看到fusion的荧光
如果你的目的蛋白是monomer,就很难说能看到荧光了
不过你可以参考钱永健这篇文章构建一下tandem dimer的dTomato
http://www.nature.com/nbt/journal/v22/n12/full/nbt1037.html
m****a
发帖数: 270
15
来自主题: Biology版 - NgAgo最新结果!Efficient!
这图很可疑,他说下面最小的条带是primer dimer,哪有dimer大小都不一致的?最右边
那个水的对照的模糊条带才是dimer,那么其他组里面小的条带很可能就是非特异扩增。
n******d
发帖数: 196
16
来自主题: Chemistry版 - 文献求助---已经找到
这次需要三篇。只要你能提供任何一篇或多篇,请与我联系。n*********[email protected]
1.
Filled melt adhesives based on dimerized fatty acid polyamide derivatives.
Polymer Science Series C
March 2007, Volume 49, Issue 1, pp 13-16
2.
Reaction of Dimerized Fatty Acid with Aliphatic Diamines and Properties of
Reaction Products
Russian Journal of Applied Chemistry
7-2005, Volume 78, Issue 7, pp 1122-1125
3.
Chemistry and Technology of Polyamide Resins from Dimerized Fatty Acids
MICHAEL A. LAUDISE
Applied Polymer Science, Second Edition... 阅读全帖
L*****r
发帖数: 722
17
来自主题: MedicalCareer版 - 内科陷阱小结 --- 受 Dr yf启发

“A positive D-dimer indicates the presence of an abnormally high level of
fibrin degradation products in your body。。。An elevated D-dimer may be
due to a VTE or DIC but it may also be due to a recent surgery, trauma, or
infection. Elevated levels are also seen with liver disease, pregnancy,
eclampsia, heart disease, and some cancers.”
假设一个病人,胸痛待查,又有点气短,临床上PE 的可能性很低,这时候如果查D-
Dimer,阴性了可以除外PE;阳性了呢,你怎么给这个阳性结果一个解释啊?难道去
chase 所有的可能性:VTE(全身各处的Venous Thromboembolism), DIC, recent
surgery, trauma, infec
R*******t
发帖数: 367
18
我也觉得 d-dimer挺怪的,以前值班时,看D-dimer positive的,急诊order CT r/o
PE, 结果 D-dimer negative的,也还order,硬是没摸出规律来。lol 后来就不看了。

believes
s**********t
发帖数: 217
19
The D-dimer things depends on the method your lab use. It was useless back
to 5-8 years ago. Now I think, in the last 5 year, the labs use the new
method to detect D-dimer. If the D-dimer is negative, you can rule out PE 99
%. Alon with negative doppler, you can rule out PE 100%. in low and moderate
risk for PE patients.
n*******c
发帖数: 501
20
(续上回,先补充一下关于RUQ痛,这个东西妇产科是如临大敌,严阵以待的,所以一入院已经把所有检查包括腹部超声肝功能什么的都做了,确认没有问题的)
不知道怎么办的时候就是搬救兵的时候,危在旦夕,不找senior找谁?
马上打了电话,如此如此,这般这般…
就像大家建议的一样,我order了CTA。
补充说明一下,这个病人的d-dimer是刚好比阴性上限要高些,一点也不奇怪,pregnancy要找个d-dimer阴性的只怕还不容易呢。
“嘟嘟…嘟嘟”page又响了。
拿起电话,一个冷冷的女声,“…Did you just order the CTA for a 33wks
pregnant woman?”
原来是放射科的值班医生,“…What are you looking for?”“…mainly to rule out PE, also to investigate the cause of chest pain…patient is
hemodynamically stable however still in severe chest pain with positive d-di... 阅读全帖
T*R
发帖数: 36302
21
PE很危险,但是确诊比较难。需要做CT angiogram或VQ scan。
普通的CXR和CT诊断不出。
查血D Dimer可以排除,但是不能确诊。
如果每个short of breath的人都做ct angio/d dimer,医院就吃不消。毕竟绝大部分
sob的人不是pe。
这个看医生了。
要我是医生,我会给她做screen。
S*********g
发帖数: 24893
22
【 以下文字转载自 Stock 讨论区 】
发信人: StephenKing (金博士), 信区: Stock
标 题: 向民族英雄包鹏程致敬!为民族英雄包鹏程欢呼!
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Jun 3 20:54:21 2015, 美东)
Pengcheng Bao, Graduate Student
Pengcheng is a second year graduate student. He obtained his B.S. in physics
from Nankai Univeristy in China.
Project: Development of methodology for realistic modeling of heterogeneous
catalytic interfaces.
Tel: 310-206-3215
Email: [email protected]
/* */
PENGCHENG BAO
Education
and Awards
2009 –
NANKAI UNIVERSITY TIANJIN, CHINA... 阅读全帖
R*********e
发帖数: 73
23
得到博士offer的本科生简历(挂网公开的,应该可以讨论把)在下面,先只请教下打动
发考题们给了博士offer的原因,别的不八卦:)哈哈
照说本科生得让发考题们认为极其有科研的潜质,才能打败无数硕士生,发考题们才
会直接给本科生offer直攻博士;
看这份简历,我的感觉是
1.本科成绩好,会读书
2.参加了很多国内老师的项目,参加了一些海外老师的暑期短期项目,有些学术锻炼和想
法,但无明显成果,可能人缘好,会来事;但不排除夸大自己作用的可能
3.得了一些奖学金,国内高校基本上成绩好加积极参加学校各项活动,对老师会来事,自
然就能得.
3.英语写的好
4.积极参加各种活动,精力充沛,勤奋,把自己的时间,安排的满满当当的,有废寝忘食的
倾向.
5.非常有计划性和目的性,经过几年奋斗,作为本科学生,已经达到面面聚到的无短板程
度.
作为本科生,这份简历无疑是优秀的;但是却无法直接得出极其有科研的潜质的结论;相
反无数硕士生申请攻博士,由于年龄大一些和工作经历,也许本科成绩绩点低一些,得的
奖学金项目少一些,但是有实践经验,多数还会有1-2篇海外(尽管可能级别和影响不高)
期刊发表的... 阅读全帖

发帖数: 1
24
来自主题: Faculty版 - Jan's lab : 这里有弟子么?

Download pdf published by SfN (Chapter from 'The History of Neuroscience in
Autobiography, Volume 8' edited by Larry R. Squire)
Yuh-Nung Jan's CV
Lily Jan's CV
Yuh-Nung Jan and Lily Jan
Birth
Family History and Growing Up
National Taiwan University
The Hiking Trip to Shitou in the Spring of 1967
Graduate School Application
Graduate Study at Caltech (1968锟974)
Seymour Benzer Lab (1974锟977)
Steve Kuffler锟絪 Lab at H... 阅读全帖
s***r
发帖数: 2604
25
来自主题: Living版 - 46v左右的电是做什么的?
原本的dimer switch有四个接口,从墙里伸出三根电线,两红一黑,红的两根线分别连
在同一侧两个接口,
switch的另一侧的两个接口,黑色接了黑色的线,绿色的地线接口空着。
测了电压,两根红色的线一根120,另一根46, 黑色0
原本的dimer switch以前是好用的,最近才坏了
现在换了普通的switch, 连上120红线和0的黑线, looks works
连上120和46的两根红线,灯不亮
求教
c****8
发帖数: 33
26
怎么能当上海科大的副校长?
EDUCATION:
1990 Ph.D. Inorganic Chemistry, Purdue University
1982 Undergraduate Education, East China Normal University, Shanghai,
China.
EXPERIENCE:
1998- Professor of Chemistry, Southeast Missouri State University
1994- Associate Professor of Chemistry, Southeast Missouri State University
1990-1994 Assistant Professor of Chemistry, Southeast Missouri State
University
1993 summer NASA JOVE Research fellow, Lewis Research Center, Cleveland, OH.
1991 summer Visiting Professor,... 阅读全帖
S*********g
发帖数: 24893
27
Pengcheng Bao, Graduate Student
Pengcheng is a second year graduate student. He obtained his B.S. in physics
from Nankai Univeristy in China.
Project: Development of methodology for realistic modeling of heterogeneous
catalytic interfaces.
Tel: 310-206-3215
Email: [email protected]
/* */
PENGCHENG BAO
Education
and Awards
2009 –
NANKAI UNIVERSITY TIANJIN, CHINA
Bachelor of Science in Physics (Condensed Matter Physics), June 2013.
Academic Record:
2009-2010: Overall: 93.40 Ranking 1/141 Maj... 阅读全帖
S*********g
发帖数: 24893
28
【 以下文字转载自 Stock 讨论区 】
发信人: StephenKing (金博士), 信区: Stock
标 题: 向民族英雄包鹏程致敬!为民族英雄包鹏程欢呼!
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Jun 3 20:54:21 2015, 美东)
Pengcheng Bao, Graduate Student
Pengcheng is a second year graduate student. He obtained his B.S. in physics
from Nankai Univeristy in China.
Project: Development of methodology for realistic modeling of heterogeneous
catalytic interfaces.
Tel: 310-206-3215
Email: [email protected]
/* */
PENGCHENG BAO
Education
and Awards
2009 –
NANKAI UNIVERSITY TIANJIN, CHINA... 阅读全帖
k*****e
发帖数: 22013
29
来自主题: PhotoForum版 - 浓墨重彩拍餐馆
前期失焦,过曝溢出,后期怎么ps也没用,救不回来的。
而且前期拍好了,一下就好,那才是事半功倍。
ps要花很多时间,那才是事倍功半。
有些疏忽,如果前期发现了,拍的时候动一下就可以弄好的。
后期要花很多时间来修图。
比如有张桌子忘了放蜡烛,后期ps加个蜡烛累死我了。
那杯子是透明的啊。坑爹啊。几乎就是手绘了一个杯子。
再比如外景那张,我没有GND滤镜,
所以没办法才拍了两张来合成,有GND的一下就好。
室内的,灯光有dimer的,把灯光调暗到合适,一下就好。
没有dimer的灯,光比太大没办法,只好多次曝光ps合成。
不过ps也是要学的,至少也得知道ps能干什么不能干什么。
或者说,什么事情用ps干太花时间划不来。
s**l
发帖数: 11983
30
**************************
题目:电视剧《悬崖》:外表气质高贵体质人性虚弱的公主
**************************
作者:sill
2012年2月19日
***********
第一部分:综述
***********
引子:"我们是出身高贵,气质脱俗的公主,不是看人脸色,投其所好的小三儿"
-- 《悬崖》编剧全勇先
(1)总评:
道具服饰镜头音乐等方面制作精良华美,风格沉郁大气,具有相当的”大片“特质。此
剧情感丰富,有很多催人泪下的场面。然而关键人物刻画失败,主人公”人性“自私,
算不上一个为解放事业无畏献身的英雄。故事情节进展过慢演绎乏力,存在诸多细节漏
洞。《悬崖》是一部在次要方面非常精致,并且在相当程度上非常感人,但是在整体上
并不成功的电视剧。它的确不是“看人脸色,投其所好的小三儿”,反而是一个“出身
高贵,气质脱俗的公主”,然而却是一个体质和人性都非常虚弱的公主。
(2)剧情简介:
主人公,我党地下工作者周乙,潜入敌人内部和敌人进行长期复杂残酷的斗争,并且和
顾妍秋假扮夫妻6年。周... 阅读全帖
S*********g
发帖数: 24893
31
【 以下文字转载自 Stock 讨论区 】
发信人: StephenKing (金博士), 信区: Stock
标 题: 向民族英雄包鹏程致敬!为民族英雄包鹏程欢呼!
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Jun 3 20:54:21 2015, 美东)
Pengcheng Bao, Graduate Student
Pengcheng is a second year graduate student. He obtained his B.S. in physics
from Nankai Univeristy in China.
Project: Development of methodology for realistic modeling of heterogeneous
catalytic interfaces.
Tel: 310-206-3215
Email: [email protected]
/* */
PENGCHENG BAO
Education
and Awards
2009 –
NANKAI UNIVERSITY TIANJIN, CHINA... 阅读全帖
s******y
发帖数: 28562
32
来自主题: Biology版 - Re: Help! Qualify Question
FPLC or HPLC Gel filtration column, viscosity assay or sedimentation velocity
assay can be used for dimer/polymer assay. Native gel is also used for such
purpose. SDS-PAGE is NOT!
Antibody? Buy it from commercial company.
Actually, for your question, you DON"T have to do those dimer things at all.
They are the properties of a protein but has NOTHING to do with purity.
A proper folding is needed, if your lab is gonna to test it's activity.
However,if only the protein sequence is corncerned (e.g.,
r**r
发帖数: 171
33
1. maybe the problem is induction.
since i don't know the induction condition you use, here is my induction
condition for the protein I tried.(23 du, 2-3hrs) if still not good, try
18 du.
The proteolysis is inherent in GST fusion protein preps. You always get a 30
Kda form which is GST. The other problem about GST is that it is easy to form
dimer, especially the protein you work on is also easy to form dimer.
2. If you can not detect your protein in lysate, try to seqence your whole
vector. I kn
d********r
发帖数: 303
34
来自主题: Biology版 - SBIG: Channels - 5
http://www.hhmi.org/news/images/mackinnon5.gif
Now comes the chloride channel.
What is the differnce.
Potassium channel transports potassium, which is a cation, with positive
charge on it.
chlordie channel transports chloride, which is an anion, with negative charge
on it.
This is the difference.
Look at its structure, you will find each monomer of the chloride channel is
an independent channel. The native form is dimer. So you have two channels
within the dimer. This is not the case for potassi
e****s
发帖数: 1125
35
primer dimers!
你这个100 bp的用Primer dimers最合适了。
定2个50-60左右的primer,15bp 左右的overlapping区域,先overlapping PCR做成100
bp左右的primer.

,
primer
PCR
z*t
发帖数: 863
36
来自主题: Biology版 - 求助high GC content的real-time PCR
目前在用real-time PCR扩一段基因组上GC rich region,设计了几条引物扩增不同的区
域,普通PCR跑胶没有见到可见的smear或者dimer。用ABI的SYBR green master mix
dissociation curve能见到多个peak,amplication curve也很奇怪。跑胶可以看到
smear和dimer...最简单的方法是换引物。。。但是俺要扩的区域CG含量很高。。。换
了primer估计还会有类似问题。。。
对付high CG常用的DMSO/Betaine啥的,在real-time PCR中有没有类似应用?
求做过high gc real-time PCR的大侠指点迷津啊
z*t
发帖数: 863
37
来自主题: Biology版 - 求助high GC content的real-time PCR
how about primer dimer? I can see the main band, but since it's high GC, the
primer dimer and unspefic product really anoy me
n****0
发帖数: 696
38
来自主题: Biology版 - 问个realtime efficiency的问题
I have many genes. Should I check the efficiencies individually?
And I have some other questions. Would the primer dimers cause a lot of
problems?
I used RT-PCR to check the primers, some of them have faint unspecific bands
. And I used 38 cycles. My senior said it is not a problem in real time
since we won't use the signal of this high cycle and it is relative. Is it
true?
If the melt curve give a good single peak, can I assume the primer dimers
and unspecific product signal is too low and won'... 阅读全帖
M*******h
发帖数: 294
39
来自主题: Biology版 - 急问做过HiSeq library的大牛们!
我做的一个ChIPseq library有primer dimer。不想重新做library的话,应该如何去掉
dimer,重新做size selection还是做Ampure bead?哪个更好啊?还有library里出现
了两条带,有一条高于预期很多的带,看上去像是overamplify了(可是gel
extraction的时候明明没有切到的-.-!!!),这会不会影响测序,是否需要重做呢?万
分感谢大家!
c**i
发帖数: 265
40
来自主题: Biology版 - 请教一个关于homodimer的问题
我做了一个A和B的fusion protein。A本身可以形成homodimers,在一定刺激下可以形
成oligomers。原本设计是利用A的oligomerize来激活B蛋白,但实验发现B蛋白在非诱
导下也有一定的激活(由于homodimers),但在刺激下活性加强。
现在使用的是一个GGGSGGGS的flexible linker,请问大家有没有可能通过使用rigid
linker来分开B蛋白,使得即使A形成homodimers,B也由于不可自由移动而无法
dimerize。在刺激下,B则和cluster中的其他B蛋白dimer而达到减少背景的目的。
谢谢大家了。
b******i
发帖数: 287
41
我很小白,只是好奇:
为什么Lane 1没有Actin的带?
Load少一点样品,会不会没有这么弥散呢?那团dimer很浓啊。。。。
你做的LT的是根据文献做的?Reducing Agent你指的是什么啊?beta-ME or DTT? 这些
不是通常只是打断二硫键的么(如果我错了别笑~~)?你的Dimer是由二硫键所形成
的么?我曾经跑过一个Non-reducing的Gel,不加bete-ME or DTT,同样用高温处理过
,也可以跑出很好看的带型啊。
X******n
发帖数: 914
42
我用过的是tdTomato,是个tandem dimer。没用过dtomato,但这个可能会导致你的蛋
白形成dimer。
T*****e
发帖数: 247
43
你说的A转录因子是sequence-specific TF吧
A和X结合是physical binding?X是co-factor?还是X是某个酶?
当然有可能X结合A,抑制B转录
有几种可能:
1. X影响A的入核
2. X在特定条件下被load到A上,但是X是组蛋白修饰酶,改变B启动子区的
accesssibility
3. A正常要形成dimer才能结合B启动子,但是X抑制了这个dimer的形成
其他情况应该还有吧,暂时就这些
n**********g
发帖数: 196
44
没看懂他做测序的逻辑:
他说主带下面的小片段是deletion造成的,最最下面的是primer dimer
所以据此逻辑应当测中间的那些片段
但是他竟然在sample 3 (只有WT和primer dimer)里测到了信号,说可能有indel,挺
无语的。。。
a*********d
发帖数: 2763
45
来自主题: MedicalCareer版 - 请教啊!
d-dimer should be only used in pt with low clinic suspicious PE(low pretest
probability), because it has high negative predictive value.
however unfortunately in our residency population, who will have millions
other reasons casuing elevated d-dimer, it's essentially a useless test.
L*****r
发帖数: 722
46
来自主题: MedicalCareer版 - 内科陷阱小结 --- 受 Dr yf启发

diagnostic
那个echo sign叫谁的名字来着?我们好像半年多以前热过一阵,可现在没人提了,所
以连名字都记不住了,都没法查。好像是敏感性很低的,但特异性还行,所以阳性了比
较支持抗凝,但阳性不多见。对吗?
不知道为什么,我们这儿pretest probability从来没人提,我还是看MedStudy看来的
。好用么?
d-dimer我们实在没法喜欢,因为假阳性太多了。如果临床pretest probability (我猜啊)很低了的话,我们就不愿做d-dimer。因为做出来太可能阳性了。当然也知道多半是假阳性
,但是下一步怎么办呢?又不能视而不见,最后还得做V/Q scan。
s*******r
发帖数: 174
47
来自主题: MedicalCareer版 - 内科陷阱小结 --- 受 Dr yf启发
pretest probability就是usmle说的是不是临床高度怀疑啊,你有个number帮你决定
order哪个test, attending问起来总不是我凭空想的嘛。是不是过时了我不知道,反
正我们这还用。我的理解主要是PE跟CP 一样,喊狼来了喊得太多了,就没人在意了。
D-dimer本来就是rule out不是用来rule in的。阳性结果是没什么帮助,所以要low
probability才做嘛。经常看到 ct chest w/ contrast: rule out PE,严格来讲, ct
是rule in的嘛:)
echo 有时实在没办法了,病人啥也做不了,check一下也没什么不好吧。反正你高度怀
疑PE的病人你总是想看看他的心不是:)我有一个病人PEA coded, kidney不行不能做
CT,echo right hart strain, 我们刚好有几个月前normal的echo,这种就比较
comfortablely抗凝了。

猜啊)很低了的话,我们就不愿做d-dimer。因为做出来太可能阳性了。当然也知道多半
是假阳性
L*****r
发帖数: 722
48
来自主题: MedicalCareer版 - 内科陷阱小结 --- 受 Dr yf启发

pre test high probability,d-dimer有什么用,阴性就真stop了?这才是更让人难受
的结果吧,总有
对不起,我说过我们这儿没人计算pre-test probability score的,所以我说的pre-
test probability 是个模糊概念,和你头脑里的可能很不一样。其实我不应该用pre-
test probability这个词的,很抱歉混淆视听了。如果按你用的pre-test probability
score来说,Uptodate 里面很明确:
“Conclusion — Taken together, the evidence indicates that a D-dimer level
<500 ng/mL by quantitative ELISA or semi-quantitative latex agglutination is
sufficient to exclude PE in patients with a low or moderate pretest
probability of PE. ”
就是说moderate
s*******w
发帖数: 1879
49
来自主题: MedicalCareer版 - 内科陷阱小结 --- 受 Dr yf启发
推荐大家去看本周的new england journal of medicine,也许现在就变成上周了。基
本一期都是讲PE的,其中mgh的那个case report很有意思。
里面有篇review专门讲acute PE的,里面有一张诊断flow chart,里面写说d-dimer的
作用有点像预筛,d-dimer为neg的肯定不是。
外行人随便打酱油说两句,各位前辈指正。
A*******s
发帖数: 9638
50
Thanks for the education.
alk phos is also non-specific. Regarding D-dimer, our cardiologist believes
it is a scam or conspiracy of radiologists and ER Docs. lol. Only 1% D-
dimer positive has a PE, but 99% negative gets CT anyway. No wonder
radiologists get a nice pay. :)
首页 上页 1 2 3 4 5 6 7 下页 末页 (共7页)