p*****h
发帖数: 36 | 1 2-DG is a substrate of HK, not an inhibitor. But it cannot be further
metabolized by downstream enzymes. In this sense, it inhibits glycolysis.
DCA is dirty. So is TZD.
glycolysis |
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K**R
发帖数: 193 | 2 有什么方法能在实验中改变glycolysis rate？ |
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h*******o
发帖数: 4884 | 3 in vitro or in vivo?
in vitro it is easy
You can use hexokinase inhibitor, such as 2-deoxyglucose,
You can use PDH activator, such as dicholoracetate
You can use Pyruvate transporter inhibitor, Thiazolidinediones
There are so many ways to manipulate cellular bioenergetic flux (glycolysis
or Mitochondrial OXPHOS), some may require digitonin or other similar
detergent to permeablize plasma membrane. |
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K**R
发帖数: 193 | 5 暂时是invitro 多谢非常有用！
glycolysis |
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h*******o
发帖数: 4884 | 6 any example of "clean" modulators of metabolic flux/glycolysis?
2DG6P |
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A*******s
发帖数: 9638 | 7 你是学生化的吧？ 学过生理吗？
消化过程从食物进口腔就开始了。 知道咀嚼对消化的影响吗？ 你要是不了解渗透压
对消化的影响， 我就无法跟你交流了。
你说的glycolysis是最最基本的，至于什么时候glycolysis， 什么时候glycogenesis
是生理的内容。 为什么胰岛素降血糖？ 为什么胰岛素增体重？ 不是glycolysis， 而
是glycogenesis。
小测验不及格噢：）
，然后K+通道，细胞内外电势，Ca2+通道，最后是胰岛素释放。diet coke里的代糖，
如阿斯巴甜，在小肠就分解了，不是糖，没有第一步的效果；虽然我没有查文献，但是
料想diet coke应该不会象普通coke那样刺激胰岛素分泌。
解；肥胖的话，暂时想不太明白。的确有实验说，把regular coke换成diet coke，对
减肥没什么效果。我们偶尔说起，觉得大概还是平常的其他饮食起更重要的作用。现在
对diet coke的反对言论多集中在代谢产物的安全性上，关于减肥效果，大概大家都觉
得没太大用，所以也不怎么讨论了。。。 |
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c******t
发帖数: 1733 | 8 并非不同观点，只是补充
ATP 的提供一共有三种代谢途径:
phosphagen: 分 解身体本身的能量储备，就是ATP和磷酸creatine, 代谢产物为ADP, P
和creatine. 这种是功能最快的方式，提供高强度运动最初15秒的能量，大概需要3分
钟身体完全恢复。当储备量用完后人体必需用anaerobic glycolysis or aerobic
oxidation提供能量。phosphagen主要支撑跳高，跳远，百米跑举重等15秒以下的运动。
无氧水解（anaerobic glycolysis）主要提供15秒以上，三分钟以下运动所需能量，比
如800， 200米跑等。该反应在下细胞质中降解血糖或肌糖原。该反应比较快，但低效
，每一个glucose只能产生2分子ATP，代谢产物为乳酸，而乳酸的堆积是该反应的limit
factor. 完全恢复需要1到2个小时。
氧化分解（aerobic oxidation）利用血糖，糖原，蛋白质和脂肪的氧化分解，产生水
和CO2。效率极高，氧化1分子glucose可产生36个ATP，一个18碳链的脂肪酸可产生170
个ATP。该反应和前两 |
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b****i
发帖数: 11322 | 9 【 以下文字转载自 Running 讨论区 】
发信人: maht ()(), 信区: Running
标 题: 有氧/无氧（一些笔记）
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Aug 27 17:02:41 2012, 美东)
跑步一年，在这里学了不少。但是很多概念，还是很困惑。最近重新复习了一把中学生
理卫生和生物。 我不是搞生物或者生化的，本文很多错误是难免的。
０ 运动的基本过生化过程
细胞内的线粒体 mitochondrion 合成 ATP 三磷酸腺苷 (Adenosine triphosphate)。
ATP提供能量给肌纤维，肌肉细胞在神经细胞的信号下收缩肌纤维，产生运动。
1 有氧代谢 (aerobic respiration) 和无氧代谢 （anaerobic respiration)
在讨论有氧代谢和无氧代谢，实际我们讨论的是葡萄糖 glucose 的代谢方式。脂肪的
代谢，无氧是可能的，但是人体基本没有这个能力，跑步的时候完全不用考虑脂肪的无
氧代谢。糖的两种代谢方式都发生在细胞内的线粒体里面。
1.1 糖的有氧代谢
具体细节，大家可以看 http://en.wi... 阅读全帖 |
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p*********l
发帖数: 26270 | 10 【 以下文字转载自 Running 讨论区 】
发信人: maht ()(), 信区: Running
标 题: 有氧/无氧（一些笔记）
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Aug 27 17:02:41 2012, 美东)
跑步一年，在这里学了不少。但是很多概念，还是很困惑。最近重新复习了一把中学生
理卫生和生物。 我不是搞生物或者生化的，本文很多错误是难免的。
０ 运动的基本过生化过程
细胞内的线粒体 mitochondrion 合成 ATP 三磷酸腺苷 (Adenosine triphosphate)。
ATP提供能量给肌纤维，肌肉细胞在神经细胞的信号下收缩肌纤维，产生运动。
1 有氧代谢 (aerobic respiration) 和无氧代谢 （anaerobic respiration)
在讨论有氧代谢和无氧代谢，实际我们讨论的是葡萄糖 glucose 的代谢方式。脂肪的
代谢，无氧是可能的，但是人体基本没有这个能力，跑步的时候完全不用考虑脂肪的无
氧代谢。糖的两种代谢方式都发生在细胞内的线粒体里面。
1.1 糖的有氧代谢
具体细节，大家可以看 http://en.wi... 阅读全帖 |
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m**t
发帖数: 1956 | 11 跑步一年，在这里学了不少。但是很多概念，还是很困惑。最近重新复习了一把中学生
理卫生和生物。 我不是搞生物或者生化的，本文很多错误是难免的。
０ 运动的基本过生化过程
细胞内的线粒体 mitochondrion 合成 ATP 三磷酸腺苷 (Adenosine triphosphate)。
ATP提供能量给肌纤维，肌肉细胞在神经细胞的信号下收缩肌纤维，产生运动。
1 有氧代谢 (aerobic respiration) 和无氧代谢 （anaerobic respiration)
在讨论有氧代谢和无氧代谢，实际我们讨论的是葡萄糖 glucose 的代谢方式。脂肪的
代谢，无氧是可能的，但是人体基本没有这个能力，跑步的时候完全不用考虑脂肪的无
氧代谢。糖的两种代谢方式都发生在细胞内的线粒体里面。
1.1 糖的有氧代谢
具体细节，大家可以看 http://en.wikipedia.org/wiki/Citric_acid_cycle。一个简单的总结就是： 线粒体在氧气充足的环境下，通过Citric acid cycle,燃烧一个葡萄糖分子，产生３７个ATP。代谢产物是二氧化碳和水。这有２个问题... 阅读全帖 |
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m**t
发帖数: 1956 | 12 跑步一年，在这里学了不少。但是很多概念，还是很困惑。最近重新复习了一把中学生
理卫生和生物。 我不是搞生物或者生化的，本文很多错误是难免的。
０ 运动的基本过生化过程
细胞内的线粒体 mitochondrion 合成 ATP 三磷酸腺苷 (Adenosine triphosphate)。
ATP提供能量给肌纤维，肌肉细胞在神经细胞的信号下收缩肌纤维，产生运动。
1 有氧代谢 (aerobic respiration) 和无氧代谢 （anaerobic respiration)
在讨论有氧代谢和无氧代谢，实际我们讨论的是葡萄糖 glucose 的代谢方式。脂肪的
代谢，无氧是可能的，但是人体基本没有这个能力，跑步的时候完全不用考虑脂肪的无
氧代谢。糖的两种代谢方式都发生在细胞内的线粒体里面。
1.1 糖的有氧代谢
具体细节，大家可以看 http://en.wikipedia.org/wiki/Citric_acid_cycle。一个简单的总结就是： 线粒体在氧气充足的环境下，通过Citric acid cycle,燃烧一个葡萄糖分子，产生３７个ATP。代谢产物是二氧化碳和水。这有２个问题... 阅读全帖 |
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q******r
发帖数: 6542 | 13 你好像对前面的调侃生气了？那我就收回那个冷笑话吧-_-!
你在阐述你的观点，我也在阐述我的观点。你觉得商业公司的宣传不对，我觉得你的观
点不对，这都很正常。我不是学生化的，我学过生理。但我依然觉得，讨论代糖是不是
和普通的糖引起一样多的胰岛素分泌，考虑胰岛素是被什么刺激分泌的最直接，而咀嚼
之类的消化问题，在这里不是讨论重点。
我提到glycolysis，是在讨论血糖高了以后怎么引起胰岛素分泌，不是在说胰岛素高了
怎么降血糖。一码归一码，考试题里把这两个弄混的学生多了去了，很失望你也误解。
真要说什么在胰岛素降血糖的过程中起最重要的作用，我当然不会选glycolysis，而是
降低的gluconeogenesis和增加的glucose uptake and lipogenesis，当然，还有你说
的glycogenesis。
大周末的忍不住跟你学术起来是我不对，大概就懂这点东西，看着别人说不对所以想纠
正。下次忍忍就过去了：）
看在讨论了半天的份上，明天不喝饮料了~ 祝lz工作愉快~
glycogenesis |
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b******n
发帖数: 82 | 14 http://www.cell.com/abstract/S0092-8674%2810%2901180-3
The ER UDPase ENTPD5 Promotes Protein N-Glycosylation, the Warburg Effect,
and Proliferation in the PTEN Pathway
Min Fang, Zhirong Shen, Song Huang, Liping Zhao, She Chen, Tak W. Mak,
Xiaodong Wang
* Highlights
* The ER UDPase ENTPD5 is upregulated by AKT in PTEN mutant cells
* ENTPD5 hydrolyzes UDP to UMP to promote protein N-glycosylation
* ENTPD5, along with CMPK1 and AK-1, hydrolyze ATP to AMP, increasing
aerobic glycolys... 阅读全帖 |
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h******y
发帖数: 351 | 15 Actually, tumor cells do not prefer to use oxygen. The so-called Warburg
effect is the observation that most cancer cells predominantly produce
energy by a high rate of glycolysis followed by lactic acid fermentation in
the cytosol, rather than by a comparatively low rate of glycolysis followed
by oxidation of pyruvate in mitochondria like most normal cells.
Unlike what we would think, malignant rapidly-growing tumor cells typically
have glycolytic rates that are up to 200 times higher than thos... 阅读全帖 |
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z*t
发帖数: 863 | 16 在做相关项目，上来胡说几句，当是抛砖引玉，大家多多指正
otto warburg老早就发现cancer更喜欢glycolysis，还因此得了诺奖，之前的肿瘤代谢
主要在体外造影上有一定的应用，为啥肿瘤代谢要到现在又火了呢。在这个field里真
正让代谢又火起来的个人看来是三个topic: PKM2, IDH1/2, Lkb1/mTor/AMPK。
尤其是Lewis Canteley 2008 Pkm2的nautre，让人们知道了cancer cell是如何建立
Warbug
effect的，这之后各种可能和warburg effect相关的pathway又被人们陆续挖掘了出来
。而通过对PKM2/LDHB等glycolysis相关酶的knockdown, tumor cell的生长也确实受到
了影响。
这个领域重新开始火的另外一个原因是在2000-2010这十年间组学概念的热潮，催生了
代谢组这个概念。现在用GC/LC-MS进行代谢组的测定已经成为和microarray测转录一样
的技术了，肿瘤代谢的第二个重磅炸弹是Bert Vogelstein发现在glioma里有相当高比
例的ID... 阅读全帖 |
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z*t
发帖数: 863 | 17 在做相关项目，上来胡说几句，当是抛砖引玉，大家多多指正
otto warburg老早就发现cancer更喜欢glycolysis，还因此得了诺奖，之前的肿瘤代谢
主要在体外造影上有一定的应用，为啥肿瘤代谢要到现在又火了呢。在这个field里真
正让代谢又火起来的个人看来是三个topic: PKM2, IDH1/2, Lkb1/mTor/AMPK。
尤其是Lewis Canteley 2008 Pkm2的nautre，让人们知道了cancer cell是如何建立
Warbug
effect的，这之后各种可能和warburg effect相关的pathway又被人们陆续挖掘了出来
。而通过对PKM2/LDHB等glycolysis相关酶的knockdown, tumor cell的生长也确实受到
了影响。
这个领域重新开始火的另外一个原因是在2000-2010这十年间组学概念的热潮，催生了
代谢组这个概念。现在用GC/LC-MS进行代谢组的测定已经成为和microarray测转录一样
的技术了，肿瘤代谢的第二个重磅炸弹是Bert Vogelstein发现在glioma里有相当高比
例的ID... 阅读全帖 |
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g*******n
发帖数: 91 | 18 多谢hmis，但是 SHUTTLE说的不是glycolysis产生NADH的ATP吗 如果这样 glycolysis应该在内啊
TCA本身产生24个ATP 固定的 再加pyruvate产生的2NADH,总共30个ATP，无所谓shuttle不shuttle吧 |
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h**s
发帖数: 1757 | 19 You r welcome.
FA uses aerobic, that means need O2,so I assume it means TCA only.
And second graph ,FA said anaerobic glycolysis,I assume it means before
mitochondia part.
For shuttle,I think it is important to know which shuttle 2 ATP and which
one 3 ATP . Body can not seperate which NADH produced from TCA and which one
produced from glycolysis,right?:>)) |
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l*******r
发帖数: 39279 | 20 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: zxt (Asoka & Akaba), 信区: Biology
标 题: Re: 大家说说Cancer cell metabolism吧，这个越来越火啊！
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Nov 4 01:53:57 2012, 美东)
在做相关项目，上来胡说几句，当是抛砖引玉，大家多多指正
otto warburg老早就发现cancer更喜欢glycolysis，还因此得了诺奖，之前的肿瘤代谢
主要在体外造影上有一定的应用，为啥肿瘤代谢要到现在又火了呢。在这个field里真
正让代谢又火起来的个人看来是三个topic: PKM2, IDH1/2, Lkb1/mTor/AMPK。
尤其是Lewis Canteley 2008 Pkm2的nautre，让人们知道了cancer cell是如何建立
Warbug
effect的，这之后各种可能和warburg effect相关的pathway又被人们陆续挖掘了出来
。而通过对PKM2/LDHB等glycolysis相关酶的knockdown, tumor cell的生长... 阅读全帖 |
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t****3
发帖数: 6964 | 21 没文化真可怕，你知道我们为啥需要吃淀粉吗？知道glycolysis和Krebs cycle是干嘛
用的吗？ |
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C********7
发帖数: 1035 | 22 RSC journal
Keyword: Fe2O3 nanowire, Nickel-Nitrilotriacetic acid coating, Protein
assembly, purification, blood glucose degradation, glycolysis.
Contact me with your name, email, list of publications if interested in. |
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m***6
发帖数: 424 | 23 某小杂志征募审稿人1-3名
希望能帮到兄弟姐妹
但是有一点希望 专业对口 审稿认真的XDJM
专业方向 偏一点药理
专业词汇：Warburg Effect, Hypoxia， Natural compound, glycolysis
请发3-5篇自己的相关文章 给我站内即可
然后审稿人需要的是： 名字，单位，邮箱，职位 |
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l******l
发帖数: 2679 | 24 这一篇写得好，很专业。与俺的泛泛而谈从宏观上描述不同，这篇从微观入手，
分析得更细致清晰，特别适合和LZ一样有一些生化背景的人阅读。俺即达到了
抛砖引玉的目的，同时也学到些东西。
俺不在这个领域做事，不怎么关心机体在运动时微观机制，但比较注重其宏观效应。
讨论有氧无氧的动机是探索其对运动效率和大多数人关心的减肥的影响。
在这个帖子中，从ATP的角度看，无氧代谢（anaerobic glycolysis）的能量
利用率比有氧代谢（aerobic oxidation)要低多了，前者每个glucose只能产生
2分子ATP，而后者则可产生36分子ATP。从减肥的角度看，低效的能量利用率无疑是
个福音，单位的时间内可以燃烧更多的热量。但有氧运动由于代谢物的堆积，做不长。
而无氧运动虽然单位时间内消耗的热量低，但却可以作很长。如果不计投入的时间的话，
最终也能有很好的减肥效应。
俺觉得把这两者结合起来，就能get the best from both worlds，而这种运动
就是HIIT或CROSSFIT。所以热衷于高效减肥的，应该多考虑这种混合型的运动。
P
动。
limit |
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a***a
发帖数: 40617 | 25 我keto（可不是限制，是完全30g以下甚至10g以下的限制）的时候的体会是one rep
max影响不大，后面的供能跟不上
比如如果都是3~5reps的比，keto和不keto重量没区别
但是延长到10reps以上的，就有比较明显区别了
后来我看了书以后感觉可以接受的解释就是
头几秒都是靠atp和creatine供能，所以肌肉有没有糖原无所谓
但是10秒以后需要glycolysis供能了，有没有糖原就有区别了
我现在的看法是，不是特别着急（比如一个月要cut 20 lb，参加比赛，相亲，beach
showoff之类），不需要上keto
我现在大概15%，准备用2个月的时间试试现在这个plan，如果能顺利降到我keto时候的
体脂肪（10~12%），然后比较一下肌肉是少了还是多了，再review这个plan
如果还有必要，比如向8%前进，可以再重新捡起keto
3:4：3配比是一回事，carbs的质量也是一个重要的考量
建议全部换成缓释碳水(glycemix index 《 50）的
另外有的人建议配比可以根据人的体质调节，如果是“天然肥”的，可以进一步
restrict carbs... 阅读全帖 |
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j*******n
发帖数: 10868 | 26 正好看了2010年1月号的M&F，里面有个6周的计划，每周6天，三个program轮着进行，
分别侧重于power/strength，muscle growth，和endurance。
power/strength的特点是小组数（2），大重量，小reps(2-4)，短时间（5-10秒），主
要是ATP/CP反应。
muscle growth的特点是中组数（3），中重量，中reps（10-12)，中等时间（60-100秒
），主要是glycolysis反应（glucose->ATP）。
endurance的特点是大组数（4），小重量，大reps（25-30），长时间（>2 min），
full aerobic/oxidative to convert everything you have to ATP。
所以，为了增强endurance，我需要做。。。
Squat 4/25-30, rest<30sec
Leg press 3/25-30, rest<30sec
Leg Etx 3/25-30, rest<30sec
Romanian Deadlift 3/25-30 rest<30s |
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j*******n
发帖数: 10868 | 27 这个是一个6-week program的一天的一半的量:)
6-day split program，3天一个循环，一周两个循环，6周共12个循环，ATP/CP，glycolysis，和aerobic/oxidative交叉轮流进行。这5个针对legs的练习是aerobic/oxidative 3天的一天中大概一半的量，此外还有calves和abs。这个计划太牲口了，估计半年之内都不会去尝试。 |
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h****8
发帖数: 599 | 28 所以我觉得此类杂志提供的Ｐｒｏｇｒａｍ只适合已经练到接近ｅｌｉｔｅ的人。
我以前每个星期练１６０组，见效很慢，而且累得要死 现在每星期８０组不到，反倒
保持力量稳定增长。
以前练得时候觉得练得越变态越牛比，现在觉得练得科学才牛比。往死里练谁都会，不
出效果有什么用
glycolysis，和aerobic/oxidative交叉轮流进行。这5个针对legs的练习是aerobic/
oxidative 3天的一天中大概一半的量，此外还有calves和abs。这个计划太牲口了，估
计半年之内都不会去尝试。 |
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h****8
发帖数: 599 | 29 The WeighTrainer
Carbohydrates, Insulin and the Glycemic Index
by Casey Butt
You'll remember from the What A Weight Trainer Needs To Know About Muscle
article that glycogen is the main component in the anaerobic glycolysis
mechanism of ATP production and ATP is what fuels intense muscular
contractions. Each set you do decreases the muscles' momentary ability to
produce ATP and the substrates (including glycogen) required to produce more
ATP, and time is then needed for stores of these substrates |
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q******r
发帖数: 6542 | 30 “渗透压不同，对胃肠刺激就不同。”A++越说越不靠谱了，你要是我课上的孩子，小测验不及格噢：）
你看一下胰岛细胞怎么释放胰岛素的图，初始步骤是glycolysis 导致 ATP/ADP 增加，然后K+通道，细胞内外电势，Ca2+通道，最后是胰岛素释放。diet coke里的代糖，如阿斯巴甜，在小肠就分解了，不是糖，没有第一步的效果；虽然我没有查文献，但是料想diet coke应该不会象普通coke那样刺激胰岛素分泌。
至于你的第三点，我觉得你要说狼来了的结果是得糖尿病的风险增加，我倒还可以理解；肥胖的话，暂时想不太明白。的确有实验说，把regular coke换成diet coke，对减肥没什么效果。我们偶尔说起，觉得大概还是平常的其他饮食起更重要的作用。现在对diet coke的反对言论多集中在代谢产物的安全性上，关于减肥效果，大概大家都觉得没太大用，所以也不怎么讨论了。。。 |
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O******e
发帖数: 4845 | 31 ☆─────────────────────────────────────☆
icecreamman (qiqi) 于 (Mon Sep 25 17:27:43 2006) 提到:
我不很看好时下的Targeted Therapy，迄今的clinical trial结果都不太好(Gleevec是
例外)，针对PI3K，MAPK，EGFR, Ras到B-Raf的各种药，或是毒性太大，或是无疗效。
我自己比较中意angiogenesis和cancer cell metabolism，因此看好VEGF，mTOR，AMPK
，HIF和glycolysis。
我倾向于把癌症看作是metabolic疾病，而不是genetic疾病。我猜测未来的突破也许会
来自elucidation of the metabolic basis of cell transformation and theparies
based on metabolic perturbation。今天来研究代谢，手段方法比三四十年前多了很
多，所以很可能会有意想不到的新发现。
从大的角度上说，我更认同中医对人体对疾病的理 |
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p*****n
发帖数: 981 | 32 ☆─────────────────────────────────────☆
HENBEN (benben) 于 (Thu Feb 8 12:40:58 2007) 提到:
The same old story. The figures were made up, but the the conclusions are
correct, blah, blah.....
Retraction
Methylglyoxal Modification of mSin3A Links Glycolysis to Angiopoietin-2
Transcriptionp625
Dachun Yao, Tetsuya Taguchi, Takeshi Matsumura, Richard Pestell, Diane
Edelstein, Ida Giardino, Guntram Suske, Naila Ahmed, Paul J. Thornalley,
Vijay P. Sarthy, Hans-Peter Hammes, and Michael Brownlee
☆──── |
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v*******a
发帖数: 759 | 33 还没看文章，不过"converts ATP to AMP, resulting in a compensatory
increase in aerobic glycolysis known as the Warburg effect",这个因果关系怎么
得出来的？AMPK被激活了吗？ |
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c******n
发帖数: 5697 | 34 Arsenate也就是AsO4(3−)是phosphate analogue，也就是说对蛋白酶来讲，AsO4(3−)和PO4（3-）无区别，所以细菌的enzyme完全可以把它错当PO4（3-）使用，加入DNA和protein里，这个没有多大意义，你们还争论用不用分析化学鉴定，没意思
最主要的是As妨碍普通细胞的呼吸oxidative phosphorylation，普通细胞没法在As下生存，不可能繁殖
但是这种几年前就被发现了的细胞有酶可以中和As，还可以靠As呼吸， 所以可以靠As生长，所以在用As替换P的环境下繁殖，就丝毫不足为奇了
所以更有意义的发现不是As替代P， 而是细菌可以在As里繁殖。这是个老消息了，可怜NASA不要脸，又玩花样骗钱
早就说过了，NASA是个很可怜的机构，在资本主义社会中没有任何存在的意义，所以要向好莱坞学习，不停搞出新闻来，才可以吸引缴税人民的注意力，搞研究经费
http://www.microbemagazine.org/index.php/02-2010-home/1358-microbial-arsenic-metaboli... 阅读全帖 |
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h**********r
发帖数: 671 | 35 paper1
Title: optimization of a blueprint for in vitro glycolysis by metabolic real
-time analysis
Nature Chemical Biology (2011) DOI: doi:10.1038/nchembio.541
Matthias Bujara,1 Michael Schümperli,2 René Pellaux,1, 2 Matthias
Heinemann2, 3 & Sven Panke1, 2
Paper2
Title: Enzyme mechanism as a kinetic control element for designing synthetic
biofuel pathways
Brooks B Bond-Watts,1, 2 Robert J Bellerose1, 2 & Michelle C Y Chang1, 2, 3
Nature Chemical Biology, Volume: 7, Pages: 222–227 (2011)
Please s... 阅读全帖 |
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N*****h
发帖数: 324 | 36 看到的文献里大多是检测氧气的消耗，但是我们没有设备，暂时做不了。有没有其它方
法检测呢？最好是有kit。我的实验目的是想证明某个药物会抑制Glycolysis，但是可
以增加TCA cycle。十分感谢。 |
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h*******o
发帖数: 4884 | 37 There are many ways to assess mitochondrial/bioenergetic capacity.
Of course the most direct and wildly accepted is to measure mitochondrial
respiration through a Clark-type electrode.
Alternatively, cellular oxygen consumption can be measured through an oxygen
sensitive probe (used to be called A65N, but now commercialized as
MitoXpress via Luxcell). This method only requires a fluorescent plate
reader in addtion to mitoXpress, which should be available to most
biomedical labs/departments.
My p... 阅读全帖 |
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j*b
发帖数: 341 | 39 这个PKM2和肿瘤代谢的关系已经知道很久了，这两篇还不是原创贴。
cantley还可以发nature，能不能解释一下？
Anticancer Res. 2003 Mar-Apr;23(2A):1155-8.
Tumor marker pyruvate kinase type tumor M2 in patients suffering from
diabetic nephropathy.
Oremek GM, Rutner F, Sapoutzis N, Sauer-Eppel H.
Source
Central Laboratory, Hospital of the Johann Wolfgang Goethe-University,
Frankfurt/Main, Germany.
Abstract
INTRODUCTION:
Compared to normal tissues all tumors investigated so far and especially
those with a metastatic potential overexpress an isoenzy... 阅读全帖 |
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m*********r
发帖数: 49 | 40 刚加入glycolysis in cancer and stem cells.从这帖子了解了不少东西，收藏一下，
谢楼上各位 |
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z*t
发帖数: 863 | 41 Welcome:)
besides glycolysis. 最近越来越多的证据表明serine和glycine对cancer metabolism
同样重要。
Serine,glycine可以回补丙酮酸，并参与one carbon unit的代谢。一直认为重要的
glutamine可以回补a-kg
虽然目前的数据只是体外的细胞系试验，但考虑到Serine , glycine和glutamine（or
glutamate)是血清中含量最高的生糖氨基酸,氨基酸的利用同样可以成为potential的
drug target |
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j*b
发帖数: 341 | 42 这个PKM2和肿瘤代谢的关系已经知道很久了，这两篇还不是原创贴。
cantley还可以发nature，能不能解释一下？
Anticancer Res. 2003 Mar-Apr;23(2A):1155-8.
Tumor marker pyruvate kinase type tumor M2 in patients suffering from
diabetic nephropathy.
Oremek GM, Rutner F, Sapoutzis N, Sauer-Eppel H.
Source
Central Laboratory, Hospital of the Johann Wolfgang Goethe-University,
Frankfurt/Main, Germany.
Abstract
INTRODUCTION:
Compared to normal tissues all tumors investigated so far and especially
those with a metastatic potential overexpress an isoenzy... 阅读全帖 |
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m*********r
发帖数: 49 | 43 刚加入glycolysis in cancer and stem cells.从这帖子了解了不少东西，收藏一下，
谢楼上各位 |
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z*t
发帖数: 863 | 44 Welcome:)
besides glycolysis. 最近越来越多的证据表明serine和glycine对cancer metabolism
同样重要。
Serine,glycine可以回补丙酮酸，并参与one carbon unit的代谢。一直认为重要的
glutamine可以回补a-kg
虽然目前的数据只是体外的细胞系试验，但考虑到Serine , glycine和glutamine（or
glutamate)是血清中含量最高的生糖氨基酸,氨基酸的利用同样可以成为potential的
drug target |
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l****b
发帖数: 400 | 45 GAPDH is a glycolysis enzyme and is regulated by many things. In another
words, it is an awful control. Tubulin is better. HSP90 is also good. both
have good antibodies.
But disappearing actin is interesting. worth looking after, don't you think?
Actin
GAPDH, |
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w***r
发帖数: 709 | 46 Lin HK, Bergmann S, Pandolfi PP (2004) Cytoplasmic PML function in TGF-beta
signaling. Nature. 431, 205- 211. News and Vews by Le Roy C. and Wrana J. L
(2004) Nature. 431, 142. Commented by Kotz J (assistant editor of Nature
Chemical Biology) (2004). Selected as a Featured Article (Sep 2004) in
Nature Signaling Gateway from Nature publishing group.
Lin HK*, Wang G, Chen Z, Teruya-Feldstein J, Liu Y, Chan CH, Yang WL,
Erdjument-Bromage H, Nimer S, Tempst P, Pandolfi PP* (2009) Phosphorylation-
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h**********r
发帖数: 671 | 47 问题是弄了这个玩意儿不会用，而且把钱花光了。因为没钱，培训过的人也被fire了。
机器吃人啊～
我比较喜欢这类型的paper：
α-ketoglutarate coordinates carbon and nitrogen utilization via enzyme I
inhibition
Christopher D Doucette, David J Schwab, Ned S Wingreen & Joshua D Rabinowitz
Nature Chemical Biology 7, 894–901 (2011)
实验很多组能做，模型也不复杂。story还挺漂亮的。
另外，Rethinking glycolysis: on the biochemical logic of metabolic pathways
Nature Chemical Biology 8, 509–517 (2012)
Arren Bar-Even, Avi Flamholz, Elad Noor & Ron Milo
话说Weizmann真不缺牛人。
有data了一定找你！！！ |
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g*********3
发帖数: 177 | 48 LZ已经拿到paper了吧～ 刚看了下，感觉。。。
一直期待着stem cell和cancer有一样的metabolism profile，或者说stemness能有一
些共同的profile，看了大牛的review发现即使是glycolysis这最经典的通路都不一样。
难道bio真是case-by-case的。 |
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d*******s
发帖数: 24 | 49 感觉完全取决于细胞是增殖期 还是休眠期
增殖期的细胞会依赖glycolysis 癌细胞属于这一类
休眠期的细胞会依赖catabolic mechanism 比如pyruvate oxidation(TSC) fatty
acids oxidation(LT HSC)
分化期的细胞会依赖OXPHO
所以，细胞的内在需求决定了代谢方式。 这种内在需求又是有微环境保障的。 |
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