p*****m
发帖数: 7030 | 1 真猛阿
2007年3月8日，我所马力耕博士实验室在科学(SCIENCE)杂志在线(online)发表题为 “
A G protein-coupled receptor is a plasma membrane receptor for plant hormone
abscisic acid” 的论文，该论文报道一种G蛋白偶联受体是植物激素脱落酸（Abscis
ic acid，ABA）的受体，该受体通过与异三聚体G蛋白α亚基直接相互作用传递脱落酸信
号并调控脱落酸众多反应。
脱落酸是一种重要的植物激素，它参与调控众多植物生长和发育过程，特别是在植物对
逆境，如干旱、盐碱、低温等的反应中发挥重要作用。ABA受体的研究对了解ABA的作用
及其机制有非常重要的意义。以前的众多研究结果表明ABA的作用位点在质膜上，而且这
种推测的质膜上的ABA受体可能是ABA参与逆境反应的主要参与者。
由G蛋白偶联受体（GPCR）介导的细胞信号转导途径是在真核生物中比较保守的信号转导
机制。在动物细胞中GPCR介导的信号途径是重要的信号转导途径，比如动物对视觉、味
觉、嗅觉的感知就是通过GPCR介导的信号途径 |
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j*****d
发帖数: 787 | 2 赞成
这些通道蛋白对于 细胞通讯 是很好的分子例证
另外，GPCR 已经发奖了。 再发一次奖的可能新很小。而且他这片科普写的比较懒惰，
可能比较忙，只提到GPCR 感温 的例子。实际上GPCR的功能研究远比那些结构更有意思
，突破更多。
另外从rao的多篇相关科普来看，为那些诺奖“冤魂”所表达出来的抱怨，表明他是一
个地地道道的 理想主义 者。比较难得。
through the cell membrane”，“In most cells, water moves in and out by
osmosis through the |
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j*****d
发帖数: 787 | 3 赞成
这些通道蛋白对于 细胞通讯 是很好的分子例证
另外，GPCR 已经发奖了。 再发一次奖的可能新很小。而且他这片科普写的比较懒惰，
可能比较忙，只提到GPCR 感温 的例子。实际上GPCR的功能研究远比那些结构更有意思
，突破更多。
另外从rao的多篇相关科普来看，为那些诺奖“冤魂”所表达出来的抱怨，表明他是一
个地地道道的 理想主义 者。比较难得。
through the cell membrane”，“In most cells, water moves in and out by
osmosis through the |
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h******i
发帖数: 1 | 4 For more information about this exciting opportunity, contact Fei Xu (xufeih
@gmail.com) or Professor Raymond Stevens (s*****[email protected]).
DIRECTOR, ANTIBODY DISCOVERY
RuiYi is a newly established biotech company in Shanghai, China, focusing on
discovery and development of novel antibody therapeutics against GPCR
targets. The company’s core technology overcomes previous hurdles of
antibody generation against GPCRs, unlocking this important target class for
the development of highly specific an... 阅读全帖 |
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e****s
发帖数: 1125 | 5 GPCR结构的两头大牛。
当初合作解了第一个Non-rhodopsin的GPCR beta-2.不过据说两人也就此结怨。
Ray Stevens实验室规模大，工厂化作业。Kablika 实验室规模一直比较小。
现在GPCR的结构主要还是他们两在发吧？ |
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e****s
发帖数: 1125 | 6 GPCR结构的两头大牛。
当初合作解了第一个Non-rhodopsin的GPCR beta-2.不过据说两人也就此结怨。
Ray Stevens实验室规模大，工厂化作业。Kablika 实验室规模一直比较小。
现在GPCR的结构主要还是他们两在发吧？ |
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U**l
发帖数: 153 | 7 最近三四年这两个人合作在Science, Nature上灌了这么多篇GPCR结构。如果GPCR的诺
奖再晚发个五六年，Ray Stevens很有可能可以和Kobilka一起share诺奖，现在Kobilka
拿了，Ray Stevens就很难说了。也不是完全没有可能，单凭GPCR结构拿奖可能性很小
，但有可能可以通过X-ray技术拿奖。 |
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w***x
发帖数: 265 | 8 I agree totally with you.
That's not my project anyway. We are not a neuro lab and my boss is doing it
herself.
The repellent is a social signal. The screen was done on genes known to be
involved in chemotaxis/olfaction in
this animal. No GPCR is tested because there are too many. However key
components of the GPCR pathway are involved.
I suggest my boss to identify the components of the repellent using HPLC and
do some calcium imaging instead of using laser ablation only. My boss says
that sinc... 阅读全帖 |
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m*b
发帖数: 1421 | 9 人超级nice
如果能进去那绝对是祖上积德烧过香才能碰到的好事
GPCR这个field肯定还会火一阵
你看施一公做的菌里的transporter十年前能发nature
现在照样能发nature，尽管已经渐露疲态
我觉得照这个架势GPCR结构还有至少5年的阳寿吧
至于难度现在应该不会那么大了
这几年T4L加LCP技术对于GPCR来说已经相当成熟了
现在就是现有的这么多靶点一个一个扫雷一样扫过去就是了 |
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s******c
发帖数: 331 | 10 再忍不住说一句，做GPCR的结构当初也是因为这个领域的发展到了一定阶段，很多重要
的基础性的问题的解答需要结构的信息，才会去做，并不是简单的因为这类蛋白很重要
，能发NCS，所以大家去做结构。如果仅仅是为了解几个GPCR的结构去做结构，首先很
难，然后也长久不了，结构提供的信息也还是很有限，对于GPCR来说，大家最终还是关
心function以及相关的pathology和pharmacology。 |
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s******9
发帖数: 283 | 11 GPCR晶体结构自从解决稳定膜内loops的方法，就出现了井喷。问一问，这几年这么多
GPCR结构，有没发在Nature和Science的新结构吗？
Ray Stevens常驻上海，带着一群弟子搞826计划，准备把人的826个GPCR结构都解出来
，这得有多少篇Nature Science啊。
个人认为，结构推进得这么快，功能分析也要赶快跟上才好。 |
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c**********n
发帖数: 177 | 12 Mark！太赞了！
Raymond近几年来开始着手搞Class B，C & Frizzle的GPCR，虽然因为不能拿到完整WT
结构对于这些GPCR的功能理解还是帮助不大。还是比较看好，Brian Koblika去攻打最
难的GPCR。 |
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S***J
发帖数: 1210 | 13 逻辑不通，真是受不了你们整天神话这两位。。。
K和M不论出于什么目的，最终拿奖的最关键成果就是结构，扯一堆没用的有啥意思？换
句话说，当时如果施一公解出来第一个GPCR，以及第一个GPCR和G蛋白的复合物结构，
他也能拿奖。诺奖才尼玛不管你是一辈子只解了一个结构，还是解了很多。
当然，现在确实是单靠结构不可能拿奖了，GPCR应该是最后一个结构奖了。 |
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S***J
发帖数: 1210 | 14 看你这种死嚼烂打的就烦啊。既然你想认真，那就认真一下。毛主席说过就怕认真二字
。但真心觉得跟你说话费劲啊，呵呵。下面是我帖子的原话，我一句一句跟你讲啥意思
，OK？如果你还有疑问，请跟帖。
1. “K和M不论出于什么目的，最终拿奖的最关键成果就是结构，扯一堆没用的有啥意
思？”
这句话是说K和M能拿奖的最重要的原因是结构；
2. “换句话说，当时如果施一公解出来第一个GPCR，以及第一个GPCR和G蛋白的复合物
结构，
他也能拿奖。”
这句话是说如果施一公解出来上面说的结构，他也可以和别人share诺奖。这句话没有
讨论施有没有能力解出结构。这句话同样是在论证结构本身的重要性。如果把施一公换
成张三李四，这句话同样成立。
3. “诺奖才尼玛不管你是一辈子只解了一个结构，还是解了很多。”
这句话是说诺奖是个单项奖，虽然K和M的奋斗历程很对诺奖胃口，但是如果他二位没有
解出结构拿奖也是不可能的。反过来说，如果K和M在这两个工作之外，还做了很多其他
无关紧要的课题，他们不会因为做了无关紧要的课题就失去诺奖。
4. “当然，现在确实是单靠结构不可能拿奖了，GPCR应该是最后一个结构奖了。”
这... 阅读全帖 |
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q*********0
发帖数: 229 | 15 今天阅读了一下全文
1. 绝对是GPCR乃至结构生物学领域phenomenal的成果，
2. 从文章中所用到的多种方法可以理解为什么有这么多作者
3. 对GPCR引起的Arrestin信号通路做了非常全面的分析，从受体识别到结合，虽然还
没有能够阐述磷酸化GPCR和Arrestin的结合状态。文章给出了比较合理的讨论。
4。关于文章的八卦也听了一些，基本上就是你们说的那些
团队集体不断努力的结果，不同单位不同专业领域的研究人员能够精诚合作这点一定要
赞，最好赞一下Eric Xu的认真执着的科研态度。 |
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e****s
发帖数: 1125 | 16 很认同电镜的观点。
不过说Arrestin和GPCR结合不稳定是不正确的说法。相对G protein和GRK，Arrestin-
GPCR是结合最牢固的。Kd在几个nmol的水平。
Arrestin和GPCR结合有两个最重要因素：1.Receptor要是活化状态；2. Receptor要被
磷酸化。磷酸化还存在Bar code的概念，所以非常的复杂。当然还有其他PTM的作用，
那些就更加难处理了。
我个人认为，蛋白的Homogeneous在结晶里有非常重要的作用。如果磷酸化数目和位点
都不一致，那么结晶就更难了。
其实就算非磷酸化的Receptor，对beta-arresitns而言，还是有很Robust的结合。
protein
arrestin |
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V******1
发帖数: 8 | 17 作为一个结构出身在药厂做研究的, 也忍不住出来说几句。不管大分
子还是小分子，结构对药物设计和开发的意义还是相当重要的。现在市场上根据结构开
发的药物很少，不是因为结构不重要，而是因为蛋白结构在之前的很多药物开发的当时
并不是available的。结构生物学突飞猛进也就是最近十来年的事情。有结构作为参考
，药物开发可以少走很多弯路。根据结构的药物开发不是说单单依赖结构，而是根据结
构作为指导可以进行更有效的筛选和design。从这点来说，拿到一个重要drug target
的结构其实是非常有意义的。
同理，那些说发现机理不需要依赖结构，从而conclude结构没用的，也是有问题的。的
确，很多情况下没有结构，把一个目标蛋白的分子机制搞清楚也是可能的，但是没有结
构就像盲人摸象，你要有时间有经费一直摸下去也能把象摸个大概。GPCR的结构不是没
用，而是因为技术上的瓶颈，一直拿不到而已。如果GPCR发现之初其高分辨率的结构就
已经知道，我相信对GPCR的分子机理的研究绝对会提早很多年。研究一个black box的
input和output和直接看到这个box里面的东西是怎么work的，研究... 阅读全帖 |
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a**y
发帖数: 464 | 18 Several postdoc positions are available in Dr. Huiwang Ai’s lab at UC
Riverside http://ailab.ucr.edu. The expertise of our lab is on protein engineering and fluorescent redox probes. Recently, our lab has explored new areas, including the biology and toxicology of oxidative stress, imaging of brain activities, and bioluminescence. We are looking for postdoctoral fellows with the following expertise:
1. Molecular biology, with previous experiences in sophisticated molecular
cloning, gene librar... 阅读全帖 |
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A*******y
发帖数: 11148 | 19 Identifying G-Protein Coupled Receptors (GPCRs)
TAGS: Life Sciences, Chemistry, Nature, Theoretical-IP Transfer
AWARD: $35,000 USD | DEADLINE: 9/14/10 | ACTIVE SOLVERS: 144 | POSTED:
7/14/10
The Seeker is looking to identify G-Protein Coupled Receptors (GPCRs) that
qualify as potential biological targets for the development of new ligands.
You can try our new Team Project functionality on this Challenge.
Source: InnoCentive Challenge ID: 9569688 |
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t***o
发帖数: 24 | 20 GPCR结构出来有几个做GPCR的人不看的。当然你要说那几个结构也没有出新药所以没用
也可以。
个人觉得，判断一项工作不是看发什么杂志或什么高深的方法。找一片写的好的REVIEW
, 什么是对这个community有价值
的就很清楚了。 |
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e****s
发帖数: 1125 | 21 不觉得Arrestin会有你上面想要的功能。
他和G-protein没有直接的相互作用，某种程度上可以说，两者竞争GPCR的结合位点，
Arrestin结合GPCR的时候，通常G-protein, GRK 都已经完成自己的工作release了。 |
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s******c
发帖数: 331 | 22 据说美国做GPCR超过60%的PI都是从他实验室出来的，而且做GPCR的去industry也很容
易，不过他年龄挺大了，不太管科研，实验室据说气氛不太好。 |
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h*****o
发帖数: 342 | 23 很多GPCR都是dimer
我研究过一个叫PAR1的GPCR，它能被很多蛋白酶激活，像thrombin, APC, MMP1,
plasmin，等等。那同一个受体怎么能介导不同的信号通路呢？最近发现某些蛋白酶（
比如APC)是先结合到一些特异性的膜受体上(比如EPCR)，然后再就近切PAR1。所以你说
这种同类聚集的特异性是有可能的，也许还是必要的。 |
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i***0
发帖数: 160 | 24 For GPCR internalization, you can try beta-galactosidase complement assay.
search if DiscoverRx has already made the corresponding cell line. That
assay can give you sig/background=10. Internalized GPCR (tagged small
subunit of beta-gal) collocalized with endosome anchored marker protein (
tagged with large subunit of beta-gal) will boost beta-Gal activity. I have
tried this assay. once you have the stable cell line, the protocol is very
simple and the result is very potent. |
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s******c
发帖数: 331 | 25 lol.
Just in terms of number of new GPCR structures, Kobilka lab published 5 new
GPCR structures in the past 4 years besides the first beta2 receptor
structure published in 2008.
Another thing, there are less than 10 people including grad students in
Kobilka lab. There are more than 40 postdocs in Stevens lab. |
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w***x
发帖数: 265 | 26 无脊椎动物：研究一个已知提取方法的、成分未知的、具有生态意义的repellent，没
有鉴定出详细的repellent成分。已通过genetic screen筛出了一些为avoidance （针
对此repellent）行为所需要的基因。通过ablation实验大致确定了哪些神经元是参与
repellent detection的，并确定此repellent是通过GPCR起作用的。由于genome中GPCR
过多，受体没有找到，转向看哪些G-alpha subunit参与detection。
除此之外，无calcium imaging data。 |
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L*********y
发帖数: 322 | 27 Overall, your project sounds interesting. However, you might want to collect
more data or do far more in-depth analysis prior to submitting your story
to top journals. Below are my specific questions:
Where do you obtain this repellent? From plants or from insects?
Can you elaborate on what ecological impacts this repellent has? Can it be
used as insecticide?
If you are sure this repellent is a mixture instead of a pure chemical, can
you identify its chemical components by doing HPLC, per say?
已... 阅读全帖 |
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I***a
发帖数: 13467 | 28 有最后的肯定的结论吗？
另外，那个博主好像特别希望是造假。 |
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I***a
发帖数: 13467 | 30 大家都是做实验的，
别谈预测啊我认为啊什么的，
直接举文章数据啊啥的， |
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A******y
发帖数: 2041 | 32 That's like saying all histone deacetylases are deacetylase and you want all
papers got it wrong to retract their papers. Hint: I think more than half
of them are not deacetylases, neverless "histone" deacetylases. |
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K**4
发帖数: 1015 | 33 具体问题还是要具体分析的
你举个属于histone deacetylase家族的，但是没有这个活性的例子
我们具体讨论，我觉得很多情况是失活的吧。
all
half |
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A******y
发帖数: 2041 | 34 What are you talking about? They have activities, just no activity against
acetylated lysine. Sirtuin 5 and 6 used to be no activity against
acetylated lysine...their natural substrates known now. My interest is in
HDACs, let's hope I don't get scooped...too many projects not enough money
and able hands... |
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s*******s
发帖数: 132 | 36 你要说的是乙酰，不是甲基
你给的文章恰恰说明了Sirt5不是deacetylase，是deacylase |
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s*******s
发帖数: 132 | 37 good luck.
I used to work on one of the HDACs, dropped that project.......
against |
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K**4
发帖数: 1015 | 38 Deacetylase specifically refers to removing the acetyl group, whereas
deacylase is more general in that it can remove R groups that are acetyl or
longer. Reaction wise they should just be the same. |
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A******y
发帖数: 2041 | 39 Yes, let's hunt down all papers telling you that Sirt5 is a deacetylase and
tell the PI to retract. Same things for HDAC classIIa etc. |
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A******y
发帖数: 2041 | 40 I need all the luck I can get...although I do have a R01 in HDAC. I nee
more! Btw, I know the paper's author shown above pretty well. |
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b******k
发帖数: 2321 | 41 我觉得这个all right啊，如果Ma文章里的实验数据都是valid的，只有那个结构预测有
问题，那这个gcr2还是蛮有意思的呀 |
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b******k
发帖数: 2321 | 43 ft 那这就说明问题了 看来问题不光是结构预测有错误 大概实验数据也有问题，否则
他完全应该理直气壮的写进CV |
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A******y
发帖数: 2041 | 45 Na, someone is going to scoop it :(. |
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s*******s
发帖数: 132 | 46 那说说你对于Sirt5和6两篇文章的看法？呵呵，我想看看大家的想法
越critical的越好 |
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K**4
发帖数: 1015 | 47 相信很多人都想听听你们二位有些什么独到的见解，最好单独发个主题。
拿了纳税人的钱，总得做出为人类有贡献的东西出来不是。
最后提醒一下，正如前面几位注意到的，相关文章的作者已经排除了自己的文章，这圼
已经没什么可继续讨论的必要了 |
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K**4
发帖数: 1015 | 48 终于仔细读了你提到的那片文章
涉及到的Sirt members充其量有个底物特异性和活性大小的问题
上升不到什么推翻前有的定论，又什么paper retraction 的高度
和LZ要表达的问题性质完全不是一码事
against |
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A******y
发帖数: 2041 | 49 But there are a lot papers literally are looking at SIRT5 and SIRT6 as
deacetylases (they are
not!) Just becasue you artificially increase the substrate concentration in
a test tube and get some activity, does not mean they are deacetylase. Btw
, there are Cell papers look at SIRT5 as deacetylase in-vivo, and in my
opinion, they are looking at other SIRT or HDAC that binds SIRT5. SIRT and
HDACs are all in a huge complexes.
Btw, the same thing for HDAC class IIa, HDAC8, HDAC6 domain 1, HDAC10,... 阅读全帖 |
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