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c***o
发帖数: 35 | 2 rotten egg smell receptor 这个更奇怪了，跟GPCR好像没有任何关系，俺看到那个蛋
白的名字都晕了，不懂。
story
plasma |
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c***o
发帖数: 35 | 3 Sensory Neuron-Specific GPCR Mrgprs Are Itch Receptors Mediating Chloroquine
-Induced Pruritus
这个不算?
story
plasma |
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c***o
发帖数: 35 | 4 rotten egg smell receptor 这个更奇怪了，跟GPCR好像没有任何关系，俺看到那个蛋
白的名字都晕了，不懂。
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c***o
发帖数: 35 | 5 Sensory Neuron-Specific GPCR Mrgprs Are Itch Receptors Mediating Chloroquine
-Induced Pruritus
这个不算?
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plasma |
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c****l
发帖数: 1086 | 6 GPCR的结构有机会，Brian Kobilka有望 |
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m******g
发帖数: 69 | 7 这个帖子对于一个即将要读生物PHD的人是个很大的打击。 我个人感觉随便找个人，在
实验室教他一个月，怎么cell culture, 怎们做western。只要有钱买抗体，就能做
cell signal的活。我现在觉得cell signal就是一个大大的坑！一看公司送来的signal
poster，他妈的全都有联系。从A一只能联系到Z，随便找个信号分子，做做induction
,看看pathway的key enzyme的变化，就可以下结论说，哦，这个分子影响这个pathway
，然后做做细胞功能assay，得出结论这个分子有神马功能。然后发现这个分子是蛋白
大家族的一员，有开始做其他成员的pathway，或者又发现个上游或者下游的调节因子
，然后又开始做这个因子的pathway，最后做做in vivo，KO mice，会玩的还会看看这
个分子在免疫细胞的作用。
然后做做siRNA,shRNA,FISH,IHC 说是这个东西是潜在的biomarker，又说mAb,si/sh-
RNA可能成为治疗某种疾病的手段。
我感觉太胡掰了，简直是自己给自己讲故事。天天MAPK.NF-KB,AP1,GP... 阅读全帖 |
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c*********7
发帖数: 148 | 8 赞一个！
说说一公吧，一公绝对是个很有才华的结构生物学家，只是他做的东西太广了。什么都
碰一点，提到一公很难想得到一个完完全全属于他的领域。GPCR大家都知道是Kobilka
和Raymond，钾离子通道大家都知道是Roderick MacKinnon，转录翻译complex也是想到
Roger Kornberg，TCR MHC想到Ian Wilson，cytokine receptor想到KC Garcia，HIV
抗体想到Peter kwong，Wane hendrickson 或者Bjorkman... |
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s******c
发帖数: 331 | 9 忍不住继续歪。
做生物的，有hot的领域，也有传统的领域，在hot的领域也不是都能做的很牛，
membrane protein的crystal structure很牛吧，可是发一堆bacteria的或古菌的
membrane protein结构，哪怕都能发NCS，又怎样？别人只能惊叹你有钱，如果你发
GPCR的，真核的channels，transporters，那才算本事。就像fashion一样，你花个1，
2K去买个burberry的格子包包，就觉得自己有品味了？No..... 至少也得是burberry
prorsum级别的才算。 |
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i****g
发帖数: 3896 | 10 施一公主动邀请Brian Kobilka在清华建实验室，是不是想近水楼台学学如何解GPCR的
结构？毕竟他解的那些细菌膜蛋白结构虽然容易发CNS，但没太大现实意义，也不容易
被人重视。
一公都到了这个程度了还把精力全部放在灌cns了，眼界小了点。
他这个人很聪明，但是精力也是有限的，如果满眼都是为了发cns，在国内取得地位甚
至走仕途，
那就浪费了他的聪明。如果把有限的精力放在解决一些最基本最重大的问题上，说不定
能出大成就。
不过他从读书开始走到现在这个地位，基本上是拜cns所赐。所以崇拜cns也是可以理解。
但我总觉得那是薄厚更该关心的。 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 11 RE: 德艺双馨的楼主
please go to
//www.creativebiomart.net/description_10243_28.htm
You Position: Home >> Antibody >> Polyclonal Antibody >> Rabbit PAb >> Anti-Cdh5 PAb
Anti-Cdh5 PAb
Cat. No.
CPB-133RM
>
Immunogen
Recombinant mouse CDH5 protein.
Antibody Type
Rabbit Polyclonal Antibody.
Ig Type
Rabbit IgG.
Formulation
0.2 μm filtered solution in PBS with 5% trehalose
Preparation
Produced in rabbits immunized with purified, human cell-derived, recombinant mouse CDH5 extracellula... 阅读全帖 |
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s*******e
发帖数: 1010 | 12 这是四种结构呀，而且和成瘾与止痛相关的GPCR，任何单独一篇都是有意义的文章。 |
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b******k
发帖数: 2321 | 13 筛选本身问题不大 问题是target出来的速度越来越慢吧。这个也不奇怪，low hanging
fruit都吃完了，下来的要么是根本没有单一target,要么是target很难被target(不再
是GPCR,kinase这种的了)。 |
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s******m
发帖数: 255 | 14 替朋友发的，请不要发站内信给我。
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
博雅干细胞科技有限公司是一家于2009年成立、位于无锡的的民营企业，注册
资本一亿人民币，2012年营业额预计5000-6000万。
博雅干细胞是一个国际化的企业：董事长、总裁、副总、首席科学家、技术总监
等均为留学归国人员。当前主营业务为干细胞的存储和技术开发、基于GPCR的新
药创制。公司目前处于快速成长期，一个由公司建设并运营的亚洲最大的干细胞
库将于2012年底竣工。
为进一步增强自身的科研力量，公司的研发中心拟引进三名从事干细胞研究的
“海归”。申请者需要有PhD或MD，或者有硕士学位并有两年以上干细胞研究的
经验。薪资和fringe benefits高于民营企业平均水平。公司实行人人持股机制，
并计划于2014年上市。有意者请发简历至：
h******[email protected] (Senior Scientist, Hao Wang)
l*********[email protected] (HR Director, Lillian Guo)
谢谢！ |
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e****s
发帖数: 1125 | 15 我没什么经验，瞎扯下，
GPCR glycosylation也会让样品跑成Smear。 有没有报道D2R的glycosylation比较厉害
？ |
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l**********1
发帖数: 5204 | 16 pls try Monte Carlo Markov Chain Stochastic simulation
因为目前的技术无法在deterministic 纳米反应酶动力学 确定 PAM or NAM or even
both.
One reference:
Trzaskowski B et al. (2012)
Action of molecular switches in GPCRs--theoretical and experimental studies.
Curr Med Chem. 19: 1090-109.
PubMed link:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22300046
Ps:
具体啥叫 Markov Chain model
pls 考古本版 下
发信人: kdfox11 (狂奔的蜗牛), 信区: Biology
标 题: Re: 感慨一下数学/物理 和 生物 合作之难
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Sep 3 14:21:33 2012, 美东)
如果你想用马尔可夫过程来表示因果关系，也很简单，就是... 阅读全帖 |
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a*****x
发帖数: 901 | 17 Gs alpha。有什么检测方法？集思广益一下。多谢各位大牛。 |
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s****9
发帖数: 932 | 19 Gs is limited. You overexpressed another well-known Gs-coupled protein to
see whether it can interfere your gene expression. |
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s******y
发帖数: 28562 | 20 哇靠，这个问题超过了我的专业范围，我只能大概就我知道的其他文章的例子
来建议一下吧。
要检测是否通过G protein, 无非就是这么几个思路：
1. G-protein specific inhibition: non-hydrolyzable GTP analog, GEF analog,
Knockdown of G-protein.
2. G protein dominant negative mutant
3. G protein dominant positive mutant
4. Or if you know something is in the middle of a pathway, you can also cut
off that middle player with methods similar as above. |
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a*****x
发帖数: 901 | 21 多谢！G protein dominant positive mutant没有听说过，是哪个reference？
non-hydrolyzable GTP analog和GDP analog我以前常用。但是它们不能穿过细胞膜，
所以用在看基因表达的实验有点困难。 |
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s******y
发帖数: 28562 | 22 dominant positive mutant需要做screening 的，除非你有这个资源，不然不要
自己做。一般就是直接查文献看看你关心的那个蛋白有没有人做过。
大体思路就是，其实GTP什么的就是用电荷来改变蛋白结构嘛，所以干脆把相关
binding pocket 的氨基酸给突变加上负电荷，有时候是可以产生dominant positive |
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s******y
发帖数: 28562 | 23 另外，non-hydrolyzable GTP analog和GDP analog，你难道不能用脂类包埋的
方式来辅助过膜么？要确认是否成功过膜也比较简单，同时放点可溶的荧光分子
就好了。 |
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a*****x
发帖数: 901 | 25 试过，不work。文章里有先permeablize cell的，但觉得动作太大了，会引起很多
artifact，尤其我们要看的readout还很慢。 |
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s******y
发帖数: 28562 | 26 那就比较麻烦了。
先看看有没有人做过你们用的Ga的突变体吧。
另外，要证明是否artifact 还是可以的，关键是要做好control experiments,
比方说用普通的GTP 进行对照。我也知道有人用microinjection 的方法来做的，
但是这个方法一样是artifact非常严重，关键是要作好对照。 |
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a*****x
发帖数: 901 | 27 我们以前就是inject的，但是readout很快，而且是单细胞readout,作了很多control。
用permeablized的方法主要担心细胞活不了这么久。。。 |
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s******y
发帖数: 28562 | 28 在我听来的印象中，permeablize 的方法并不比injection harsh 多少。 |
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a*****x
发帖数: 901 | 29 也许。但是之前是inject后几分钟就可以看到变化或者做测试，这里要几十个小时。。。 |
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p*****e
发帖数: 93 | 30 two isoforms for Gas; short one, GasQ213L; long one, GasQ227L. these are
constitutive active mutants. Dominant negative mutants, GasQ213L/D281N and
GasQ227L/D295N. you can buy from www.cDNA.org |
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p*****e
发帖数: 93 | 31 but, I personally think the knockdown is the best way. |
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s******y
发帖数: 28562 | 32 他建议的是knockdown 不是knockout :) |
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l**********1
发帖数: 5204 | 35 看错啦 matrix
作为将功补过
LZ
pls refer
Castellone MD et al. (2005)
title:
Prostaglandin E2 Promotes Colon Cancer Cell Growth Through a
Gs-Axin-b-Catenin Signaling Axis
Science. 310: 1504-10.
its Fig. 2B
PubMed link:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16293724 |
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M*****e
发帖数: 279 | 36 Try toxins, such as PTX, CTX |
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d******u
发帖数: 99 | 37 张大鹏的那个虽然有人质疑，但是他之后在plant cell和plant phys又有后续文章，从
遗传学上证明可能的确有通过镁敖合酶受体的ABA信号通路。马博主要是被陈金贵给坑
了，那哥们发了几个小文章到处说gcr2不是aba receptor，突变体没有表型什么的。
前年那个系列的受体真实性肯定没问题，从结构到体外重组aba信号通路都做了，不过
对于中国学者的两个受体现在一棍子打死也还有点早。
话说09年Sarah Assaman发了个cell说一个gpcr是aba 受体，最近有人又发文章质疑了
，说突变体没表型。
aba表型有时候比较tricky，种子萌发，时间长点短点，光强点弱点，可能就会看到或
者看不到表型，所以都不好讲。科学还是要百家争鸣吧。 |
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a*****x
发帖数: 901 | 38 控制expression或者activity的很多，但是有控制degradation的吗？ |
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s******y
发帖数: 28562 | 39 有啊。
Proc Natl Acad Sci U S A. 1995 Nov 21;92(24):11259-63.
Signal-induced degradation of I kappa B alpha requires site-specific
ubiquitination.
Scherer DC, Brockman JA, Chen Z, Maniatis T, Ballard DW.
Source
The inhibitor protein I kappa B alpha controls the nuclear import of the
transcription factor NF-kappa B. The inhibitory activity of I kappa B alpha
is regulated from the cytoplasmic compartment by signal-induced proteolysis.
Previous studies have shown that signal-dependent phosphorylation ... 阅读全帖 |
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s******y
发帖数: 28562 | 40 具体哪个我不知道，但是应该是由外部信号控制的。 |
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s******y
发帖数: 28562 | 41 在我模糊的记忆中（大学时候学的了。。。）
貌似是TNF receptor |
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p*****e
发帖数: 93 | 44 1.
CARMA3 deficiency abrogates G protein-coupled receptor-induced NF-κB
activation
Brian C. Grabiner1,5, Marzenna Blonska1,5, Pei-Chun Lin1, Yun You1, Donghai
Wang4, Jiyuan Sun1, Bryant G. Darnay2, Chen Dong3, and Xin Lin1,6
2.
MEKK3 is required for lysophosphatidic acid-induced NF-kappaB activation.
Sun W, Li H, Yu Y, Fan Y, Grabiner BC, Mao R, Ge N, Zhang H, Fu S, Lin X,
Yang J.
3.
Bcl10 plays a critical role in NF-κB activation induced by G protein-
coupled receptors
Donghai Wang * , † ... 阅读全帖 |
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a*****x
发帖数: 901 | 45 你是说ikBa的降解？老实说那个数据真的没有什么说服力。。。不过多谢了!
Donghai |
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p*****e
发帖数: 93 | 46 ? Ok, see figure 4C in the following paper.
The Lysophosphatidic Acid 2 Receptor Mediates Down-regulation of Siva-1 to
Promote Cell Survival*
Fang-Tsyr Lin ‡ 1 , Yun-Ju Lai ‡ 2 , Natalia Makarova § , Gabor
Tigyi § and Weei-Chin Lin |
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f*****r
发帖数: 993 | 47 他们是师徒吧, 八十年代末就开张了, 干的太好了, 不给奖都不行. 前年和其他几个朋
友聊天, 有两个也拿到了几个GPCR的晶体, 忙着分析. 看看这两年koblika发的一标的
nature, 估计在往这里挤, 铁定没戏. |
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m***i
发帖数: 4637 | 48 不过网页上指的是
The study of Gpcr
不单指结构
★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.5 |
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m*b
发帖数: 1421 | 49 koblika在解出结构前也是gpcr领域的大拿吧 |
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s****m
发帖数: 472 | 50 They were the first ones to clone the gene of Adrenergic receptors!
Also the beta-arrestin signaling in addition to the traditional G protein
signaling from GPCRs. |
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