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l***d
发帖数: 1828 | 2 我的预测:
Nuclear receptors
stem cells (not ips)
DNA diagnostics and fingerprinting
trafficking
reprogramming (include ips) |
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M*****n
发帖数: 16729 | 3 也许是Daley谦虚了，
Thompson和Yamanaka看来是一定会得的，
Daley可能会分三分之一。
好像核移植这个是他最早做的，而且最后说核移植的reprogramming 看起来比TF-iPS更
好使一点。
不过听完以后觉得stem cell therapy不是很快能实现的。Daley还是很谨慎的，不是夸
夸其谈。 |
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y****y
发帖数: 123 | 4 山中当年在美国也是整天对着老鼠笼子默默流泪来的
后来回日本接着博后得了抑郁症要退的时候突然拿到那个二流大学的faculty
进去以后还整天被劝说做点有用的东西不好么
再后来...就搞大了
不过相比只需要转四种就可以reprogramming
我觉得最近说的ips其实不是induced的ps只是immortalized的ps比较靠谱
Multilineage-differentiating stress-enduring (Muse) cells are a primary
source of induced pluripotent stem cells in human fibroblasts.
当然不管怎样山中最后还是可能拿奖
但是ips会成为有史以来最大的生物泡沫也说不定 |
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n********k
发帖数: 2818 | 5 With ur second setence, iI don't think kneed to argue with u anymore, u
probably want to know more about hescs etc...btw, there was tons history
about reprogramming before ips...
Prize. |
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n********k
发帖数: 2818 | 6 With ur second setence, iI don't think kneed to argue with u anymore, u
probably want to know more about hescs etc...btw, there was tons history
about reprogramming before ips...
Prize. |
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n********k
发帖数: 2818 | 7 what.s ur point here? Btw, reprogramming takes place other than in
experimental condition, there was even a germ stem cell in blood reports,
likely false though, people could.t reproduce...
Emt, fly germ cells, maybe 【 在 nanog (大家好) 的大作中提到: 】 |
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a****d
发帖数: 1919 | 8 iPS更应该与PCR比较，都是非常有应用价值的技术上的创新。PCR已经成为routin的实
验手段，iPS对于建立疾病模型进行药物筛选来讲，也是一样。当然iPS为大家打开一扇
窗，至少很多人不再认为用几个TFs来reprogramming是天方夜谭了。 |
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O******e
发帖数: 4845 | 9 核移植，基本没reprogramming啥事儿。。。 |
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n********k
发帖数: 2818 | 10 Come on, I don't think the second part is the case...of course they know, I
think it is more about the feasibility and practical or not...Naive as me,
when I applied to Kevin Eggan's lab for postdoc ys ago, I (as a small and
ambitious piece of my letter) proposed to use nuclear cloning to screen for
reprogramming factors...Now, I knew why he didn't even bother to respond to
me...
maybe |
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n********k
发帖数: 2818 | 11 I would agree with you that many may have the ideas...however, either it
would work or how and what facts etc...A question for you: do you think
Yamanaka's mouse work help TJ's human work substantially, except using a
faster system?...that said, I highly both Yu and TJ for their exceptional
work and contribution and in no means I am trying to downplay that...
Mouse work:
Induction of Pluripotent Stem Cells from Mouse Embryonic and Adult
Fibroblast Cultures by Defined Factors
Kazutoshi Takahashi1... 阅读全帖 |
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s******a
发帖数: 472 | 12 http://www.cell.com/molecular-cell/fulltext/S1097-2765(11)00331
Fifty Years after Jacob and Monod: What Are the Unanswered Questions in Molecular Biology?
=====================================================================
Tomorrow's Molecular Biology
Marc W. Kirschner
Harvard University
Today, the term molecular biology has a rather prosaic sound. After all,
there is little in contemporary biology that isn't molecular. It's hard to
remember that 50 years ago, molecular biology was distinctly ... 阅读全帖 |
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D***y
发帖数: 693 | 13 check this out:
Reprogramming of murine and human somatic cells. Bryce W. Careya,b, Styliani
Markoulakia, Jacob Hannaa, Kris Sahaa, Qing Gaoa, Maisam Mitalipovaa,1,
and Rudolf Jaenischa,b, PNAS 2008
using a single polycistronic vector |
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l*****g
发帖数: 43 | 14 比如我做干细胞的，我知道mir302/367在体细胞reprogramming很重要。如果做心脏发
育的，或者神经发育的，也可能知道其中功能很关键的mir，在发育中起很枢纽的作用
，能顺便帮一下忙告诉的意思。
至于能发CNS文章的主意，那是未知的，不能一概而论吧？ |
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i*****g
发帖数: 11893 | 15 这个挺好的，肯定要看过
只是，在TG国看资料不易，我都是七里八拐的到处找人要pdf
另外，transdifferentiation，有一派人看法是，没有什么transdifferentiation or
iPS. it is from the adult stem cell in the primary culture.
I have no idea about the arguement.. |
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n********k
发帖数: 2818 | 16 Do u need this one? just let me know ur email...any stem cell related you
can just message me...As for transdifferentiation and iPS...the argument is
done in my mind! From myoD--the case was already very clear...btw, it
happens naturally all the time--EMT is a well know phenomena
or |
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i*****g
发帖数: 11893 | 17 算了。我大概2010年看法是，这些个东西，关键可能在于chromatin remodeling，不在
于这个细胞那个细胞的表型
is |
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i*****g
发帖数: 11893 | 18 看完了，老头确实写的不错。7788搜罗了一堆历史和人，事
这个领域初级和中级研究者必读，可以省去你自己费力搜罗分析这个领域
高级研究者要另外考虑，如何击破壁垒，进入无人地带
这些问题，要阅读几篇经典文献，反复考虑几个月
中国那些60岁以上的 ‘院士’，根本没有能力写这种review，他们都已经TG官僚化了 |
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n********k
发帖数: 2818 | 19 your vision is right....
but hinder-sightedly a bit superfluous though... |
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n********k
发帖数: 2818 | 20 了:
Well, many could if they desire to but the question is whether they desire
and deserve...The Chinese system is rotted at the root not necessarily the
people...However unless we could have a revolutionary overhaul from the top
which is unlikely...we would have to do something to the mass first before any
change to the root/the system...just my two cents...Which is exactly why I
support RY, SYG, XDW and PMM... |
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l*******i
发帖数: 153 | 21 因为效率的问题，老板要求我试试miRNA cluster.前前后后试了三次，最初一周内
细胞生长加快，但始终没有colony出现；如果miRNA cluster和OSKM连用的话，倒是可
以非常显著地提高reprogramming的效率。
到目前为止，似乎只有两篇文章证实这个方法的，但效率差别太大；要命的是，第
一篇文章（号称效率提高至10%的那篇）是将miRNA302/367通过lentiviral vector整合
到genome上；而在moleculer therapy上的一篇文章表明，lentiviral vector本身就可
以将fibroblast诱导成iPS。第二篇文章通过连续四天转染mature miRNAs,可以得到iPS
，但是效率极为低（与第一篇文章用的miRNA有些不同）
我现在怀疑第一篇文章的可重复性：第一，单纯通过miRNA cluster，得不到iPS；
第二，即使能得到，效率应该也没有像该文章宣称的那样。联系文章作者，请教实验细
节，没有得到任何回复。不知版里有没有人试过这种方法？
现在越来越发现，iPS就是一个坑，临床应... 阅读全帖 |
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l*******i
发帖数: 153 | 22 可能是存在的，我只是怀疑它的效率是否真的像文章宣称的那样，达到10%？
reprogramming efficiency的计算方法每篇文章都不一样，这里面有没有“水分”呢？ |
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n********k
发帖数: 2818 | 24 highly depends-- in rare cases, excellent reviews are definitely priceless
for a field(e.g Robert Weinberg's review on cancer), some may be important literature
reference/synthesis for the field (e.g: h j Song's annual review, John Graf's
historical perspective of reprogramming etc)...The majority are just shortcuts for beginners/outsiders or easy readings..
Anyway, I think for a decent journal, a review paper should be giving a decent and up-to-date literature synthesis..Anything more than tha... 阅读全帖 |
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p*****m
发帖数: 7030 | 25 Induced Pluripotent Stem Cell Core Facility
Guokai Chen, PhD, Director
Mission and Overview
The NHLBI iPSC Core Facility was created in 2011 as the main research site
focusing on the applications of induced Pluripotent Stem Cells (iPSC) within
the NHLBI. Our mission is to accelerate stem cell research in the Institute
by providing investigators consultation, technical services and training in
human pluripotent stem cell technology. Our facility provides training and
technical support in the main... 阅读全帖 |
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y******6
发帖数: 60 | 26 去年发在cell stem cell的文章用miRNA302/367cluster生成iPS, 号称效率提高100倍
，不知道版上有没有大牛有hand-on的经验可以如实告知效果到底如何？
谢谢
cell stem cell Volume 8, Issue 4, 8 April 2011, Pages 376–388
Highly Efficient miRNA-Mediated Reprogramming of Mouse and Human Somatic
Cells to Pluripotency
* Frederick Anokye-Danso1,
* Chinmay M. Trivedi2,
* Denise Juhr5,
* Mudit Gupta2,
* Zheng Cui1,
* Ying Tian1,
* Yuzhen Zhang1,
* Wenli Yang1, 4,
* Peter J. Gruber3, 4, 5,
* Jonathan A. Epstein1, 2, 3, 4,
... 阅读全帖 |
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k**********d
发帖数: 72 | 28 High efficiency of reprogramming CD34+ cells derived from human amniotic
fluid into induced pluripotent stem cells with Oct4.
google上搜出来唯一能下的地方就是mary ann liebert pub.
不知道有没有前辈有账号或者其他途径方便帮我下一下。
谢谢！ |
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b***2
发帖数: 348 | 29 请教一下做ips的大牛们。
我主要是研究大分子投递的。因为ips很火，并且做的方法也算是有限，病毒效果好，
但是有风险，其他的方法据说效果差，我现在想设计一种方法，不用病毒，期望达到接
近病毒的效果。
现在的问题是我没有杀老鼠的protocol，这样自己搞MEF有难度，ATCC的又贵，现在我
的方法也不一定能成功，老板不见兔子不愿意撒鹰出去。我想问一下，初始的细胞材料
，包括做reprogram的和feeder有没有什么容易一些的途径搞到。 |
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D*a
发帖数: 6830 | 30 要写出来你到底做了什么，new method , new target, new mechanism, 这种尽量避免
。不是新的还投什么啊。
这期nature的 News & Views 题目
Drug discovery: Cell lines battle cancer
John N. Weinstein
Photonics: Terahertz collisions
Rupert Huber
Cancer: Clinical trials unite mice and humans
Leisa Johnson
Human evolution: Those feet in ancient times
Daniel E. Lieberman
Articles 和Letters 的题目
Ice-sheet collapse and sea-level rise at the Bølling warming 14,600&#
8201;years ago
A new hominin ... 阅读全帖 |
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g*********3
发帖数: 177 | 31 我本人并不是说NGS对cancer研究没用，只是说不会产生革命性的突破~
1）NGS穷举出mutation不会很难，这也是NGS牛逼的地方，但是真正找到driver很难
2）在function研究方面，无论是RNA-Seq还是ChIP-Seq说的都是一个故事：
transcription，一些初步的数据已经证实protein level翻译水平的贡献率大概是2/3,
另外我觉得NGS的定量分析和microarray一样很丑陋
3）我比较赞同进化的观点，因为cancer不能完全归功于mutation~ LS有两位在讨论
reprogrammed signal pathway~ 这个当然有mutation的例子，但是和mutation无关的
例子简直是太多了~ e.g.a lot of weird metabolism pathways will totally rewire
the epigenetic profiling. Some abnormal metabolites can change the pathway.
.....the interaction between dif... 阅读全帖 |
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Z**********g
发帖数: 222 | 32 不否认人体有限的几个重要通路的改变可能控制着癌症发生发展。我觉得提高疗效一种
可能就是同时抑制它们，来个cocktail靶向治疗。但个人觉得这些通路的改变可能
reprogramming细胞的太多东西了，抑制它们是否足够有效。
叠加 |
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a*q
发帖数: 2109 | 35 本无意灌水，但今日与人争执，已然失言。本该就此打住，但又有若干事情不吐不快。
虑及话题已远离原帖，新开一贴于此。
某人执着于“正统”生物，而认为Engineering远不及Science。但实际上没有什么正统
不正统，有的只是理念的不同。对于Engineering的思路和Science的思路，每个人有自
己的偏好，每个系有自己的风格，每个学校有自己的传承，都不一样。所谓“正统”生
物，说得好听点应该叫传统生物，说的不好听一点就是有点过时的东西。
Science的核心是想回答一个“为什么”的问题，Engineering则可以完全不管原理，只
要新东西能够工作就行。这一点尤其体现在发展一个新方法、新工具的时候。iPS就是
一个例子，山中伸弥找到那四个转录因子能够改变分化了的细胞，但即使到现在我们都
不知道reprogramming的过程是怎么发生的。医学和药学的研究更是Engineering的思路
占主导，因为不知道的东西实在太多，但病是必须得治的。要把所有东西都搞清楚了再
开始治病就太迟了而且也是不现实的。青蒿素的抗疟机制现在还是完全不清楚，连它跟
疟原虫里面什么东西相互作用都不知道，但... 阅读全帖 |
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a*q
发帖数: 2109 | 36 本无意灌水，但今日与人争执，已然失言。本该就此打住，但又有若干事情不吐不快。
虑及话题已远离原帖，新开一贴于此。
某人执着于“正统”生物，而认为Engineering远不及Science。但实际上没有什么正统
不正统，有的只是理念的不同。对于Engineering的思路和Science的思路，每个人有自
己的偏好，每个系有自己的风格，每个学校有自己的传承，都不一样。所谓“正统”生
物，说得好听点应该叫传统生物，说的不好听一点就是有点过时的东西。
Science的核心是想回答一个“为什么”的问题，Engineering则可以完全不管原理，只
要新东西能够工作就行。这一点尤其体现在发展一个新方法、新工具的时候。iPS就是
一个例子，山中伸弥找到那四个转录因子能够改变分化了的细胞，但即使到现在我们都
不知道reprogramming的过程是怎么发生的。医学和药学的研究更是Engineering的思路
占主导，因为不知道的东西实在太多，但病是必须得治的。要把所有东西都搞清楚了再
开始治病就太迟了而且也是不现实的。青蒿素的抗疟机制现在还是完全不清楚，连它跟
疟原虫里面什么东西相互作用都不知道，但... 阅读全帖 |
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a*******a
发帖数: 4233 | 37 The role of Tet3 DNA dioxygenase in epigenetic reprogramming by oocytes.
Nature, 477,606-610.
在oocyte里面做的比较多， 不过实验材料不好搞做起来很麻烦。 |
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l******u
发帖数: 936 | 38 for the discovery that mature cells can be reprogrammed to become
pluripotent |
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c********r
发帖数: 1125 | 39
IPS 美国那个组比他工作要晚，后来的follow up做得再好也没用，nobel 委员会就喜
欢给第一个整出来的，原来色谱那个得奖的日本人也是。
另外我觉得给的是stem cell reprogram这个方向，john Gurdon自然会得，iPS尽管最
近已经开始有质疑的声音出现，但是意义还是很重大，如果只给一个人的话也是给日本
人，我觉得并没有悬念。 |
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n********k
发帖数: 2818 | 40 定一下内行！这个领域有太多的光环和气泡，也误导了太多的人。
关于trans-d， 完全是有可能存在IPS的一些问题；但是，理论上而言，应该是比IPS潜
在问题少，因为不需要那么彻底的REPROGRAMMING等，从应用而言，回到IPS再分化可能
就是一个出力不讨好的事情；至于量得问题，不要直接到终端细胞，到前体细胞或组织
干细胞，最近已经几篇这样的文章了；再回到IN VIVO TRANS-D的，IPS洪水中那么多的
HIGH PROFILE JUNK中，MeLTON的胰腺细胞的TRANS-D是我个人觉得在IPS第一篇（头几
篇吧）文章后的，第一个真正配得上NCS或者是实质性进展的研究。
ESC |
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u**********d
发帖数: 573 | 41 赞！
在基础领域，iPS的实现提出了一个有意思的问题，就是细胞周期与reprogramming的关
系。表观领域的浅矿已基本挖尽，牛牛们纷纷转战干细胞领域，期待这个问题尽快解决。
ESC |
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C********4
发帖数: 308 | 42 能不能大概说说细胞周期和reprogramming的关系？概念和未来的可能方向什么的
另外，能不能请你说说，对于表观遗传＋信号转导，或者＋代谢，可能如何发展？是否
新的金矿？
决。 |
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q********n
发帖数: 321 | 43 reprogramming human cells is much more difficult when compared to miPSCs. I
think Thomson deserves his share. |
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a*****x
发帖数: 901 | 44 为什么换了体细胞的细胞核就告诉细胞要分裂了呢？而且同时reset该细胞的
epigenetics marker让它reprogram？nuclear transfer的细胞和ES细胞有什么不同？
这些机制都弄清楚了吗？ |
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t****p
发帖数: 1504 | 45 引言
山中伸弥（Shinya Yamanaka）获得诺奖已经有几天了，虽然两年前在听完他的讲座后
我兴致很高地写了两篇文章，这些天我却没有多少动力再写一篇完整的文章来介绍他的
工作。
我一直对中国现在还盛行的规划性科研，应用导向型科研耿耿于怀。这些所谓的重大项
目在立项的当初对目标/前景写得宏大无比，之后却通常草草收场。如果那些重大项目
真的能实现立项当初的用意，那诺贝尔奖早就在中国遍地开花了。广大科研人员都觉得
这种运行模式是一个笑话，饶毅、施一公等大牛也重炮轰击，但是分钱游戏还在进行着
。而公众，包括相当一部分科研人员也并不了解科研的自身规律，总是一再地问做基础
研究有什么用。
Shinya Yamanaka的成功是典型的小实验室自由探索的成功。他的成功再一次提示，有
相当多的科学突破是不可预测的。如果中国有大批优质的小实验室得到稳定的资助，那
么类似的科学突破就会随机但是必然地产生。从这种意义上讲，展示Shinya Yamanaka
在研究过程中的这种随机性和必然性，向公众科普科研活动是如何进行的，是值得我花
一点时间的。
解析Shinya Yamanaka发现诱导干细胞（iPS... 阅读全帖 |
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t****p
发帖数: 1504 | 46 引言
山中伸弥（Shinya Yamanaka）获得诺奖已经有几天了，虽然两年前在听完他的讲座后
我兴致很高地写了两篇文章，这些天我却没有多少动力再写一篇完整的文章来介绍他的
工作。
我一直对中国现在还盛行的规划性科研，应用导向型科研耿耿于怀。这些所谓的重大项
目在立项的当初对目标/前景写得宏大无比，之后却通常草草收场。如果那些重大项目
真的能实现立项当初的用意，那诺贝尔奖早就在中国遍地开花了。广大科研人员都觉得
这种运行模式是一个笑话，饶毅、施一公等大牛也重炮轰击，但是分钱游戏还在进行着
。而公众，包括相当一部分科研人员也并不了解科研的自身规律，总是一再地问做基础
研究有什么用。
Shinya Yamanaka的成功是典型的小实验室自由探索的成功。他的成功再一次提示，有
相当多的科学突破是不可预测的。如果中国有大批优质的小实验室得到稳定的资助，那
么类似的科学突破就会随机但是必然地产生。从这种意义上讲，展示Shinya Yamanaka
在研究过程中的这种随机性和必然性，向公众科普科研活动是如何进行的，是值得我花
一点时间的。
解析Shinya Yamanaka发现诱导干细胞（iPS... 阅读全帖 |
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Z**********g
发帖数: 222 | 47 Mark.
Reprogramming Energy Metabolism已经被Weinberg归纳为肿瘤emerging Hallmark了。 |
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Z**********g
发帖数: 222 | 48 Mark.
Reprogramming Energy Metabolism已经被Weinberg归纳为肿瘤emerging Hallmark了。 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 49 炸药生理医学奖的2013 Y 提名 RAW 被取消了吧
from this one:
HTTP : //www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1535610803000308
more pls refer
同主题阅读：Re: 大家说说Cancer cell metabolism吧，这个越来越火啊！
[版面:生物学][首篇作者：lostashoe] , 2012年11月02日
http://www.mitbbs.com/article_t1/Biology/31748337_0_3.html
>>
打脸的文章出来了
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23267074
M2 isoform of pyruvate kinase is dispensable for tumor maintenance and
growth.
alfa-
---
>>
发信人: Zebrafishing (饕餮), 信区: Biology
标 题: Re: 大家说说Cancer cell metabolism吧，这... 阅读全帖 |
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A*******s
发帖数: 9638 | 50 有人认为是浪费时间和精力。
AAN: Stem Cells Show Promise in Mouse Model of ALS
THURSDAY, Jan. 10 (HealthDay News) -- Implantation of a neural stem cell (
NCS) fraction of induced pluripotent stem cells (iPSCs) shows promise in a
mouse model of amyotrophic lateral sclerosis (ALS), according to a study
released in advance of its presentation at the annual meeting of the
American Academy of Neurology, which will be held from March 16 to 23 in San
Diego.
Stefania Corti, M.D., Ph.D., from the University of Milan, ... 阅读全帖 |
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