由买买提看人间百态

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全部话题 - 话题: tof
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b*********2
发帖数: 190
1
点板的方法我个人觉得看不出来太大的区别,我有时间就mix样品和matrix点,没时间
就逮着哪个先点哪个
同意上面的,可以比较不同matrix,比如CHCA,DHB之类的差别
y***l
发帖数: 1095
2
嗯,谢谢再次点拨。。。那就每个样品用两到三种MATRIX来做。那写实验报告的时候要
分析为什么不同MATRIX效果不同,这个答案要点是什么?
b*******g
发帖数: 1309
3
me too,同意
从来都是乱点,能出信号的,怎么着都有信号,哈哈..
b*********2
发帖数: 190
4
我觉得这个还挺不好答的,要有一定的理论基础,作为美国小本的题目挺好,让他们自
己去google吧。。如果嫌太难,你也可以让他们打一个加matrix,一个只有sample没有
matrix的,看信号怎样,然后实验报告就是分析matrix的作用,而不是比较各种matrix
的chemical property了
这个网页里面有表格,写了不同的matrix的适用范围:
http://sr.burnham.org/sr/homepage/proteomics/matrixprep.html
y***l
发帖数: 1095
5
非常感谢,确实一个加MATRIX一个不加,这样更适合实验报告的讨论。不然我自己都不
知道答案就窘了。。。
y***l
发帖数: 1095
6
还有,你们的MATRIX一般都可以用多久啊?我这里有一些CCA的MATRIX,好象不管用,
每次我都要借人家的UNVIERSAL MATRIX才出峰,其实就是简单的一些单白DIGEST之后的
PEPTIDES。不知道这些MATRIX前人放多久了,但是放在冰箱里的,甁装的粉末,会有失
效的MATRIX吗?
b*********2
发帖数: 190
7
一般都会强调用fresh solution的,不过我经常偷懒,配一次用一个月吧,冻冰箱里。
。。
建议order新的matrix,那种一小管一小管称好质量的,往里加solvent就好了
y***l
发帖数: 1095
8
还有,你们的MATRIX一般都可以用多久啊?我这里有一些CCA的MATRIX,好象不管用,
每次我都要借人家的UNVIERSAL MATRIX才出峰,其实就是简单的一些单白DIGEST之后的
PEPTIDES。不知道这些MATRIX前人放多久了,但是放在冰箱里的,甁装的粉末,会有失
效的MATRIX吗?
y***l
发帖数: 1095
9
我每次都配FRESH SOLUTION的。。。只是很难相信粉末状的东西放冰箱也会坏呢。。。
看来还是要买新的了。。。
w******n
发帖数: 13202
10
如果是MALDI,是不是教一点imaging的东西,MALDI的特别之处在此。现在也很热。不久的将来,应该是会有很实在的运用。实验设计也不是很难。
y***l
发帖数: 1095
11
IMAGING的东西偶一点都没有接触过,估计偶是办不到了。。。
e*****e
发帖数: 12
12
难怪美国本科教育差, 这种实验都是不懂的人去准备.

TRYPSIN
b*******g
发帖数: 1309
13
靠, 我们俩怎么这么像
我更懒, 直接放室温,用一个月。。。
b*********2
发帖数: 190
14
呃...只要你跟我不是一个实验室就行...
要不然就糗了
b*******g
发帖数: 1309
15
haha, 应该不是, 我一般都做matrix free 实验,不常用matrix
f*********e
发帖数: 1144
16
我咋怎么也觉得ESI更好用。。。。
这么笨的人,你不是想碰就碰上的,呵呵,运气不错!

了3
y***l
发帖数: 1095
17
不好意思,我巴不得别让我去弄呢,可是系里一个稍懂MS的教授猝死了,临时还没招到
人呢,没办法。。。
p*******8
发帖数: 158
18
Instrument vendor often needs that much time to earn money up to $2000.
However, our university is charged for large price for MALDI training (it
estimated to be $5000, which made me and my boss go crazy ) . What a fuck
greedy, taking us as idiots ! If instrument did not work after your sample,
additional charge will be $1000. Also, they require you take chemistry Mass
spectrometry course before training. Anyway,it's impossible to do it by
yourself even if MALDI is available, nobody using i... 阅读全帖
w******n
发帖数: 13202
19
这个是非常奇怪的学校,不是research oriented的地方吗?
这个是管理层次的问题了。只能是老板之间协商来解决。别无他法。

,
Mass
for
v******0
发帖数: 265
20
来自主题: Chemistry版 - 请教一个质谱问题
感谢两位的回复,我知道ion trap因为可以ion accumulation,所以灵敏度高。我不明
白的是为什么单纯的ion trap(不是Q-trap)不可以做MRM or precursor ion scan?
顺便追加一两个小问题,呵呵。我听说ion trap dynamic range不高,请问具体什么意
思?好像和space charge effect有关,但我不是很懂detail。
另外,为什么ion trap会有个"one third rule"?指的是可以检测的fragment ion mass
不能小于precursor ion的1/3, 为什么ion trap会有这个现象,而其他比如tof就没有
s*******c
发帖数: 179
21
来自主题: Chemistry版 - 请教一个质谱问题

类似MRM可以做SRM。就是和QQQ比,慢不少,所以灵敏度不高。
就是说,trap的电荷越多,对你加载的电场有个反作用力,就trap不严了。所以每次不
能放太多电荷在一起。linear ion trap把离子轴向分散,所以spac charge effect 比
传统3D ion trap 小。
mass
因为一定的Q值只能把某一个m/z范围的离子稳定trap住。新的技术可以打破这个界限了
。tof好像不需要trap离子吧?
你把每种质谱的原理看明白,这些问题就很清楚了。
f*********e
发帖数: 1144
22
ESI-TOF? or ESI-ion trap?
m****e
发帖数: 255
23
Looks like your are using Agilent's TOF. The 922.0099 mass may come from
your tuning mix. The hump on your TIC is normal for gradient.
s**********x
发帖数: 4593
24
去问你们管xps或者tof-sims的
A********s
发帖数: 179
25
来自主题: Chemistry版 - 分子量测量的囧事,求建议
多糖主链接枝多肽侧链
梳形聚合物
用GPC测,发现跟柱子不对付,全部一系列产物全是在最后系统峰附近才出来,都是8.9
附近,测量失败。
用MALDI-Tof测,尝试了不同的matrix,不同的mode,最后全都飞不起来,查遍了文献,
只有类似oligomer能飞的文献,polymer没人报道过能飞,也悲剧了。
求问大家,这咋的能测下分子量啊?
谢谢
y**********3
发帖数: 339
26
来自主题: Chemistry版 - Polymer end group analysis
XPS更差。
试试 MS-TOF
f**********r
发帖数: 91
27
上了MS,MALDI-TOF,产物点在,但是有一个峰是产物+16,不知道是什么峰。谢谢了。
t******t
发帖数: 3045
28
lz如果是说仪器的话
一定要区分,那后者就是指不能做fragmentation 的 LC-TOF或者LC-single Quad了
b**********s
发帖数: 435
29
本人PhD最后一年,在加州湾区,主要是药物化学合成方面的,正在找暑假实习,路过
的童
鞋们帮帮忙,不胜感激!
下面是简单的介绍:
PROFESSIONAL PROFILE
 In-depth and expert hands-on knowledge of organic and medicinal
chemistry, excellent troubleshooting skills, great ability of working
independently and cooperatively;
 Using synthetic and medicinal chemistry methods to develop novel
DNA cross-linking agents targeting on DNA damage repair pathway;
 Expertise in organic compound purification and characterization by
column chromatography, ... 阅读全帖
h*********g
发帖数: 799
30
来自主题: Chemistry版 - 真心求教 质谱找工作
俺在一个排名50左右的学校,主要是学质谱的。不过不是HPLC那种,是SIMS,MALDI-
TOF一类的。老板还算小有名气。 不知道质谱的工作好找不? 都是一个什么情况?多
谢各位赐教。
a*********f
发帖数: 33
31
来自主题: Chemistry版 - Two papers to review
Two papers for review:
(1) microfluidics/ microchip for bioanalysis/protein/peptide (IF>5)
(2) Proteomics: 2D-DIGE/MALDI-TOF MS (IF3.8)
if you have interest, please leave internal messages for your background and
contact information before tomorrow morning. Or, I will decline the review
request.
Thank you!
y*****s
发帖数: 1047
32
来自主题: Chemistry版 - 请教质谱做SRM的离子利用效率
损失大部分是难免的,只考虑离子产生的总时间里有多少比例可以到最后一级, 这能叫
duty cycle吗
QqQ是流水线,出了Q1进q2,出了q2进Q3
QTof出了collision cell只有一个脉冲时间里的进到Tof,完了再进下一个脉冲的,脉
冲之间的间隔应该比脉冲本身占的比重多不少吧
Linear Trap 一段时间打开进离子,然后扫描,完了再打开进离子,不知道扫描时间和
收集离子时间哪个占的比重大
Orbitrap 只看过thermo的一些广告,似乎是 c trap 打开进离子,然后一个脉冲送到
orbitrap扫描,然后c trap再打开收集离子。不知道c trap 收集离子的时间,脉冲时
间和orbitrap扫描时间的长短都是多少。当然前面还有一个Q或者linear trap
b*******g
发帖数: 1309
33
来自主题: Chemistry版 - 请教质谱做SRM的离子利用效率
pulse的频率很高,20k Hz, 每个pulse的时间是0.05ms, inter pluse是包含在0.05ms
之内的
TOF 的pluse pusher不是问题的关键。
一个spectrum 是若干个pluse 累加的,完成一个spectrum过后需要的传输时间很长,
至少在2ms以上。 在传输data前,即使有离子进入detector 也不会被记录的。
甚至仪器在做MS/MS的时候,还有一个 “thinking time”,在50ms level per (MS1+
nMS2) cycle。这些都是造成离子不能被检测到时间。
Trap的accumulation 跟trap 可以在1-10ms完成,对于特别低浓度的可以trap 100ms以
上。 但是检测时间比较长,在50-100ms level,甚至更长。

子,
b*******g
发帖数: 1309
34
来自主题: Chemistry版 - 请教质谱做SRM的离子利用效率
先回答TOF的问题,你的理解不是很正确。
应该是放慢QTOF scan 速度 (就是增加 duty cycle 时间)增加灵敏度,但是跟
resolution无关。
一个pulse的时间,比如5ns的pulse跟50us的flight time 都是不能改变,或者很难改
变。必须加高pulse的电压才能缩短飞行时间(或者把flight tube该短)。缩短飞
行时间才能增加pulse frequency。
能改变的就是每个cycle里面pulse的数量, 如果做100个pulse是5ms (100X0.05ms)
加上digitizting 时间(假设10ms, 我还没查到具体数据,在2ms到几十之间),这样
一个cycle是15ms
如果增加到400个pulse,一个cycle就是30ms.
每个cycle产生一张谱图,每个谱图是所有pulse信号的叠加。100个pulse的信号只有
400 个pulse的1/4. 如果pulse数继续增多,dwell time(简单看就是digitizing时间
)不会减少,但是占的比例就越来越少,说所以信号损失越来越少。
所以说放慢QTOF sc... 阅读全帖
y*****s
发帖数: 1047
35
来自主题: Chemistry版 - 请教质谱做SRM的离子利用效率
google了一下Tof
oaTof没有看到有像linear trap那样的电压来留住离子,但是在离子进到pusher前降低
他们的速度。这样进到flying tube的离子占的比重取决于离子通过pusher长度的时间
(而不是pulse ON时间)和在flying tube飞行时间的比例,如果前者比飞行时间短,
则离子基本都进到flying tube。你能否找得到这两个时间到底哪个长?
y*****s
发帖数: 1047
36
来自主题: Chemistry版 - 请教质谱做SRM的离子利用效率
看到一个地方说duty cycle是5-20%
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1044030506006
The sensitivity of these oaTOFs strongly depends on the “duty cycle”,
which is defined by the ratio of the ions accelerated by a TOF pusher to the
ions introduced to the pusher. It is typically 5 to 20% [ 4 and 7] because
most of the ions are lost, going through the pusher without being
accelerated during the period between the acceleration pulses of the pusher.
Therefore, improvement of this low duty cycle o... 阅读全帖
L****r
发帖数: 333
37
如果测自来水里有没有化学物质, LC-TOF MS 就可以啊。
h*******i
发帖数: 5
38
来自主题: Chemistry版 - 找有机化学或药物化学的博后
找有机化学或药物化学的博后。 详见如下:
Chemistry for Molecular Imaging (344)
The UT Southwestern Medical Center has recently established the Cyclotron
and Radiochemistry Program, which encompasses a GE PETTrace cyclotron, three
small animal scanners (a Siemens Inveon PET/CT Multimodality System, a
Bioscan NanoSPECT/CT Plus system, and an ASPECT M2 1T MRI system), and state
-of-the-art chemistry and radiochemistry laboratories and quality assurance
facilities equipped with high-end analytical instruments including... 阅读全帖
z***3
发帖数: 3
39
来自主题: Chemistry版 - 求审稿 高分子合成方向
求审稿机会。我的方向有环状和星状等不同拓普结构的高分子合成,两性高分子的合成
以及在极性与非极性溶剂中的自组装和药物载释,利用MALDI-TOF MS表征高分子的端基
官能团。有在ACS macro letter, polymer,analytica chimica acta​等杂志上
发表一作6篇,合作文章13篇。 以前帮老板审过JACS,Macromolecules, ACS macro
letter, Polymer等杂志的稿子, 有一定审稿经验。为了将来申请绿卡,现在想开始攒
审稿。如果有朋友可以推荐审稿机会,请发站内信给我,我会提供详细的背景材料和简
历,非常感谢。​
f*******e
发帖数: 411
40
要求:
1. 工作勤奋、踏实,有事业心和团队协作精神。
2. 从事MALDI-TOF质谱或相关领域的工作。
3. 或从事微生物相关工作。
待遇:
1. 非“tenure-track”类职位,一旦录用,为事业编制体系的“讲师-副教授-教授”。
2. 根据个人经历和成绩,经学院审核后录用为讲师或副教授。想问教授职位么,大家
都懂的,青千是必要不充分条件。
3. 同上,享受房补等待遇。
工作内容:
1. 加入科研团队开展与质谱分析相关的代谢组、蛋白质组等研究工作,团队规模约为3
-6人。
2. 指导研究生。
3. 共同开展基金申请工作。
发送邮件到j************[email protected] 并站内确认。
由于需要先确实招聘人员的人选,根据拟录取人选的经历与研究方向,来发布正式的招
聘公告,故先不方便在帖子里告知招聘单位。
私信交流。
b******e
发帖数: 545
41
来自主题: Chemistry版 - 求教:MALDI TOF质谱的精确度
谁能给讲讲MALDI TOF质谱的精确度的允许范围。
我的质谱误差从20到500ppm之间,能用吗?我的分子的分子量在2000-4
000之间,是一系列不同分子量(不同数目的取代基)的化合物的混合物打出来的。
误差到了300ppm (分子量差别就是0.5-1.5之间吧)左右的话能报道吗?
如果能有相关的文献就最好了
谢谢!
L****r
发帖数: 333
42
来自主题: Chemistry版 - 求教:MALDI TOF质谱的精确度
∆m = 500 x 4000 / 1000000 = 2.0 Da, 这么小的分子量有2.0 Da 的误差,肯
定太大了,做得好肯定能将误差缩小到0.7 Da之内。
你可以将标准品和样品的两个点都点在一个点之内(不要重合),嘀点的时候将液滴停
留在空气中一会儿,待液滴收缩到很小的时候滴下去,你如果能够做到这样,误差肯定
小于0.5 Da (对这么小的分子量来说)
a****a
发帖数: 389
43
来自主题: Chemistry版 - 求教:MALDI TOF质谱的精确度
分析的角度来说,对于这种小分子我们一般最高5ppm的误差才能发表。以现在的高分辨
质朴水平,这个5ppm应该不难达到
b******e
发帖数: 545
44
来自主题: Chemistry版 - 求教:MALDI TOF质谱的精确度
谢谢!看来你还是由不少经验的。
还有个问题,给你发了站内信,希望解答一下。
b******e
发帖数: 545
45
来自主题: Chemistry版 - 求教:MALDI TOF质谱的精确度
谢谢。
g*****x
发帖数: 3283
46
来自主题: Chemistry版 - 求教:MALDI TOF质谱的精确度
如果calibrate过
300ppm要么是仪器坏了
要么你做的东西不对

吗?
b******e
发帖数: 545
47
来自主题: Chemistry版 - 求教:MALDI TOF质谱的精确度
东西是对的,因为分子量的间隔就是一个取代基的不同。仪器应该没问题,应该是
calibration不是太好。
估计需要重新作,同时每次都要小心calibrate一下,因为我做了很多不同取代基的化
合物,有些就符合得不错~20-30ppm,有些就有大的误差
谢谢
b******e
发帖数: 545
48
来自主题: Chemistry版 - 求教:MALDI TOF质谱的精确度
谢谢回复
我的就是普通的化学分子,一个多羟基的化合物被修饰了很多个小分子,就是想用质谱
证明是我的东西,理论上应该错不了,只是质朴的分子量差别比我预料的大,又是刚接
触MALDI TOF,问了几个人都是含糊其辞的说误差可能有点大,来这问问看看
w******n
发帖数: 13202
49
来自主题: Chemistry版 - 求教:MALDI TOF质谱的精确度
你可以查一下附近有没有地方做高分辨质谱的service,我以前是送ohio,10块钱一个
样品,很便宜,后来送的人多,就不做了。
iowa也可以:http://hrmsf.research.uiowa.edu/
不算便宜。
你可以问下你们学校搞有机合成的,问问他们高分辨质谱送到哪里去做,这个他们一定
是有路子的,因为现在HRMS在有机里,基本毫无例外都要做的。
k****o
发帖数: 728
50
来自主题: Chemistry版 - 请教Q TOF维护问题
多谢!最近室内温度确实不稳。怎么检查散热网是否脏了?
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