c***s
发帖数: 70028 | 1 近日，化妆品品牌法兰琳卡再次因为一段仅15秒的广告被舆论讨伐。这段广告不断地重复着“我们恨化学”这句话，甚至直接用这五个大字占满屏幕。广告本意或许是想强调自家品牌的“天然”，但7月在湖南卫视播出后就一直风波不断。近日，央视8套也开始播这则广告，这引起了《结构化学基础》的作者、北大教授周公度的注意。 11月19日，网友爆料周公度递交声明要状告CCTV-8。
7月底，法兰琳卡推出这则“我们恨化学”的全新广告。因为洗脑般的重复“我们恨化学”，引发很大争议。起初是在业内，有人指出没有化妆品可以做到不含化学成分，是伪概念，这样的炒作涉嫌欺诈、误导消费者。但法兰琳卡并未对此回应，事情似乎不了了之。
广告截图
直到前天（19日），北大学生@ cimico稳步贴膘_不足百斤者绝交 微博爆料，北大教授周公度教授请学院帮忙递交一份声明，称要状告CCTV8。原来，近来央视8套在播放这则法兰琳卡的广告。
周公度在声明中写道，CCTV8每晚8点半都会播放这则广告，最后还在屏幕上较长时间显示：“我们恨化学”。这是一则坏广告，毫无基本科学素养，反科学、破坏化学教育。周公度长期从事晶体结构测定和结构化学领域的教学和科... 阅读全帖 |
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r********n
发帖数: 7441 | 2 长见识了，我分形就是在数学分析上有个印象，记得和迭代有关，实际上分形图案可视
化也的确是用程序迭代来实现的
分形
由B．B．Mandelbrot于1975年提出来的分形(fractal)理论，是20世纪70年代同混沌理
论一起发展起来的，是非线性科学的重要组成部分．不同于传统的欧氏几何以零维、一
维、二维、三维、四维对应的点、线、面、体和时空来描述物体的形状，分形理论用“
分维”(fractal dimension)来描述大自然．事实上任何物体的微观平面都是凹凸不平
的，因而欧氏几何所描述的对象，严格来讲，在现实生活中是不存在的．
是用来描述大自然的一门几何学，它所描述的图形可以是分数维．分形的特征是整
体和局部有严格的或统计意义下的自相似性．描述分形的定量参数为分维，而维数的定
义种类很多，如相似维数、Hausdorff维数、盒维数(box dimension)、拓扑维数(
topological dimension)等，需要随研究对象的改变来选择．研究表明，分形在自然界
中随处可见，例如，曲折而不规则的闪电路径，弯曲复杂的海岸线形状、密如蛛网的人
体血管系统、变换不定的宇宙星云分布... 阅读全帖 |
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d*******g
发帖数: 8992 | 3 confocal怎么比结构生物学有用？请再解释一下。
晶体、核磁、电镜，再加上模拟，这是结构学的四大武器，其他的在分辨率都不是一个
层次。你说的共聚焦在结构生物学上根本排不上号。
如果你想知道功能，还是基因突变或敲除更有效一点。不过那个有点像黑盒子，知道哪
个或几个AA变了会改变功能，但不知道为什么。这是我的理解。
ie
菜。 |
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y***i
发帖数: 11639 | 4 搞蛋白质结构真的有什么实际用处吗？
非常非常非常有用，对于功能研究来说，比大部分生物学实验有用。一个结构回答无
数问题，而且是板上钉钉的答案。比如钾通道蛋白，之前大家做功能，做突变，搞出无
数文章各自假说各自功能特性的碎片，结果一个晶体结构就把成千上万的文章的问题都
回答了。
这也很好理解，别的手段都是输入点hello world看看计算机反应如何，结构是把主板
照片cpu结构图打出了一份，不管能不能理解，大部分功能的信息其实都藏在这结构图
里。 |
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a*******m
发帖数: 14194 | 5 都是以前写的，再发一遍
中国的论文大跃进，应该也快到头了！
http://www.mitbbs.com/pc/pccon_6913_477609.html
作者：awaydream
发表时间：2016-04-23
更新时间：2016-04-23
信人: awaydream (昆仑天下), 信区: Military
标 题: 中国的论文大跃进，应该也快到头了！
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Apr 23 10:13:38 2016, 美东)
看faculty版讨论中国高校超越美国高校有感。
我十多年前就看到了中国人口的今天，也看到了
计生委的崩塌。这部分我基本上是对的。
对于中国论文大跃进， 我也做过跟踪和预测，基本上
10年之内大跃进就会戛然而止，裹足不前。随后，就要
进入很痛苦的收缩状态。
前景非常不乐观！
中国人口走到了今天这一步，社会体制改革搞不好，
想翻身是非常困难的。
多说两句：
科研发展到今天， 已经形成了完整的产业链。只要上面能投钱，
给funding，下面就能批量地生产论文。投的钱越多， 产出的论文
量越大，影响因子越高。
但是，有多少论文可以产业化，可以有正... 阅读全帖 |
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d*****1
发帖数: 228 | 6 第九幕 生死过山车
1.中庭之蛇
“一份薄荷味的雪珠冰激凌，一份加草莓酱的。”昂热把一张十美元的钞票拍在冰
柜上，“不用找了。”
几分钟后，昂热吃着他的薄荷味冰激凌，夏弥挽着他的胳膊，吃着那份加草莓酱的。
“和明非去出席了一个活动，反正最近铁路罢丅工，返校也不太容易，不如在芝加
哥多逗留两天，下午没事，就来游乐园看看，明非说他没有去过六旗游乐园，对我们交
给他的任务不是给漂亮学妹做培训而是出席活动表示不满，就带他来看看。”昂热拍打
着臂弯里夏弥细软的手。
“还以为校长都是那种古板的老头，居然会吃薄荷味的冰激凌？薄荷味很潮诶！是
他们新推的。”夏弥舔着嘴唇，眯眯眼笑，一蹦一跳。
“其实我比较喜欢柠檬味的，但是人年纪大了，常常遗憾在自己所剩下不多的人生
里新鲜事太少，所以要选最潮的尝一尝。”昂热微笑。
如果不考虑发色和瞳色，他们就像一对祖孙，在熙熙攘攘的人群里亮眼而和谐。
与之相比，跟在后面的两个人就像是司机、管家、跟班、一类的角色，一个目光咄
咄，一个满不自在。
“师兄！监守自盗嘿！路明非满脸羡慕嫉妒恨，拿肩膀拱了楚子航一下... 阅读全帖 |
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z**k
发帖数: 945 | 7 每日新报：中国科学家重大发现登上《自然》杂志
来源： 每日新报 发稿时间： 2008-07-11 09:48
昨天，世界知名的《自然》杂志在官方网站上发表了中国科学院院士、南开大学校
长饶子和与中科院生物物理研究所刘迎芳研究员领衔的课题组完成的一项有关禽流感病
毒聚合酶结构的研究成果。这项研究揭示了病毒内部的晶体结构，让人们在研制药品时
可直接打击病毒内部，大大提高药物威力。
这篇论文不久后也将在《自然》杂志上推出。饶子和院士表示，这项研究成果对广
谱抗流感(包括人流感和禽流感)药物研究有重要的意义。
饶子和院士参与的这项研究在国际上率先揭示了与流感病毒转录、复制密切相关的
蛋白质的三维结构。通俗地说，病毒内部有一种蛋白质，直接关系到病毒的成长，了解
这种蛋白质的结构，就有可能利用药物深入到内部破坏它，打击它，让病毒失去生命力
。由此，它可以成为抗流感病毒药物设计的重要靶点。
“这只是万里长征的第一步，但这对开发广谱抗流感药物有着奠基性的作用”，饶
子和表示，新型的广谱抗流感药物目前正在进一步研究之中。
新报记者李海燕 任悦
通讯员张剑 |
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j*b
发帖数: 341 | 8 诺奖可以休矣！年年发下去，只能是越来越水，哪有那么多NB工作。
另外，这饶毅整天念叨这个奖，是不是有点太抬举它了，而且也太娱乐化了。
这个做科研的动机到底是个啥？！
是生物化学和生物物理学的工作，有时也给分子生物学。
和水通道，2004年蛋白质降解，2006年基因转录的结构生物学研究，2008年绿色荧光蛋
白，2009年合成蛋白质的核糖体结构。
给，两种错误都犯过。
通道）、也无特殊性。
作。基因转录领域，有两项工作的重要性毫无疑问高于解出转录因子的X线晶体结构：
发现第一个转录因子（Mark Ptashne）、发现RNA多聚酶（Robert Roeder）。但诺贝尔
化学奖委员会过分强调结构而忽略了转录领域中更重要的生物学工作。
后一次。 |
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x*****o
发帖数: 441 | 9 饶毅为什么不说2009年ribosome得也有该给得没给呢，怕得罪Steitz？
是生物化学和生物物理学的工作，有时也给分子生物学。
和水通道，2004年蛋白质降解，2006年基因转录的结构生物学研究，2008年绿色荧光蛋
白，2009年合成蛋白质的核糖体结构。
给，两种错误都犯过。
通道）、也无特殊性。
作。基因转录领域，有两项工作的重要性毫无疑问高于解出转录因子的X线晶体结构：
发现第一个转录因子（Mark Ptashne）、发现RNA多聚酶（Robert Roeder）。但诺贝尔
化学奖委员会过分强调结构而忽略了转录领域中更重要的生物学工作。
后一次。 |
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j*b
发帖数: 341 | 10 诺奖可以休矣！年年发下去，只能是越来越水，哪有那么多NB工作。
另外，这饶毅整天念叨这个奖，是不是有点太抬举它了，而且也太娱乐化了。
这个做科研的动机到底是个啥？！
是生物化学和生物物理学的工作，有时也给分子生物学。
和水通道，2004年蛋白质降解，2006年基因转录的结构生物学研究，2008年绿色荧光蛋
白，2009年合成蛋白质的核糖体结构。
给，两种错误都犯过。
通道）、也无特殊性。
作。基因转录领域，有两项工作的重要性毫无疑问高于解出转录因子的X线晶体结构：
发现第一个转录因子（Mark Ptashne）、发现RNA多聚酶（Robert Roeder）。但诺贝尔
化学奖委员会过分强调结构而忽略了转录领域中更重要的生物学工作。
后一次。 |
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x*****o
发帖数: 441 | 11 饶毅为什么不说2009年ribosome得也有该给得没给呢，怕得罪Steitz？
是生物化学和生物物理学的工作，有时也给分子生物学。
和水通道，2004年蛋白质降解，2006年基因转录的结构生物学研究，2008年绿色荧光蛋
白，2009年合成蛋白质的核糖体结构。
给，两种错误都犯过。
通道）、也无特殊性。
作。基因转录领域，有两项工作的重要性毫无疑问高于解出转录因子的X线晶体结构：
发现第一个转录因子（Mark Ptashne）、发现RNA多聚酶（Robert Roeder）。但诺贝尔
化学奖委员会过分强调结构而忽略了转录领域中更重要的生物学工作。
后一次。 |
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x********e
发帖数: 35261 | 12 我觉得否定的不是DNA结构的重要性，而是DNA晶体X光衍射对于揭示DNA结构的重要性。
你可以说是last piece of puzzle, 但是没有之前那些重要贡献，我很怀疑花生和克里
克能推出双螺旋的结构。 |
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j**h
发帖数: 126 | 13 美国科学院院士、加州大学洛杉矶分校教授、转运蛋白研究专家罗纳德·卡百克评价，
“学术界对于GLUT1的结构研究已有半个世纪之久，而颜宁在世界上第一个获得了GLUT1
的晶体结构，从某种程度上说，她战胜了过去50年从事其结构研究的所有科学家。这也
是至今获得的第一个人源转运蛋白的结构，并代表了一项重要的技术突破。该成果对于
研究癌症和糖尿病的意义不言而喻！
英文原文不是这样？还是客套？ |
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c********n
发帖数: 225 | 14 谈谈和蛋白打交道的日子 （八）
第八篇 轮回
引子
主题构思于美国独立日，一个国家的生日。每一个新事物的产生，往往都伴随着老事物
的离去。日月轮回， 周而复始。这在LIVE乐队一首经典的Lighting Crashes MTV里，
有着令人心动的视觉体现。旋律混合着实验室几个人深夜coffee break的aroma，深深
印在脑海：
oh now feel it comin' back again
like a rollin' thunder chasing the wind
forces pullin' from the center of the earth again
I can feel it.
这次来简单思考一下轮回吧。
最近施一公与Sjors Scheres合作得到了4.5A 分辨率γ secretase的晶体结构， 和
amyloid生成相关， 涉及到了蛋白在体内轮回的重要性，特别是在neurological
diseases的集中体现。
蛋白aggregation是一点一滴积累起来的，一旦形成就很难被细胞正常的protein
degradation机制消化掉。大量垃圾... 阅读全帖 |
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s******c
发帖数: 331 | 15 你是指yifan今年发的那个ABC transporter的结构？那个大概7-10A的分辨率，是可行
，但是离晶体结构分辨率还差很远，原因就是低分子量（<200KD)以及low symmetry，
哪怕用上了抗体。而且上抗体这个是做结晶的发展起来的技术，水溶蛋白也可以搞抗体
，这个不是随便搞个抗体就行，还得知道抗体bind的大致位置以及抗体结合要稳定，否
则随便结合一段flexible peptide的抗体只会让情况更worse。这个听起来很容易，但
是实际上抗体的screening和generation也很耗时，严格说起来如果找到抗体可以结合
到合适位置上稳定蛋白的flexible的部分，没有任何理由蛋白不会结晶，但实际上做起
来就很难。
大型的水溶蛋白比如ribosome和各种其它的somes也不是容易结晶的，我相信这方面肯
定也有人在做看能不能得到EM的高分辨率的结构。其实这种技术的发展是好事，可以让
人更focus在科学问题上。做结构的很牛的实验室，要么就是用一系列手段去解决一些
问题，要么有技术方法上的突破，仅仅用别人的方法拼人力财力发paper并不是很值得
推广的做法，否则... 阅读全帖 |
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C*********m
发帖数: 213 | 16 不是常见的结构域，晶体结构我们已经搞出来了。根据结构做了突变，正在做突变之后
的DNA结合的变化。
同一结构域在PDB里面有一个和DNA结合的复合物。
GAL4的试验别人以前做过，有转录激活作用。但是文献很老了。 |
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m******i
发帖数: 834 | 17 凝聚态物理学是当今物理学最大也是最重要的分支学科之一。据70年代中期的调查统计
，
凝聚态物理学年发表论文数居首位，占物理学论文总数的三分之一；从事凝聚态物理研
究
的人数也居首位，占总人数的四分之一；而从60年代末到80年代末，获诺贝尔物理奖的
人
数中，从事凝聚态研究的人数，超过了研究粒子物理的人数，接近总人数的一半，也居
首
位。凝聚态物理学得以迅猛发展，首先表现在其研究对象的开拓上。在由原来传统的三
维
周期性结构，向着低维甚至非周期结构的发展中，所涉及到的理论也逐渐地趋于深化与
成
熟，从30年代的晶体结构分析的唯象理论与固体的比热理论、金属自由电子论和铁磁性
理
论，发展到30年代后的能态理论、电子衍射和X射线衍射的动力学理论，以及点阵动力理
论
。60年代以后，在凝聚态物理学中，对称性破缺理论又占据了中心地位。以它为基础，
建
立了能态、元激发、缺陷及临界区域四个层次。与之相应，各种有序态的序参量、广义
刚
度、标度不变性、自相似结构等一系列新的概念随之诞生。此外，大量非线性课题相继
出
现，使凝聚态物理不仅在深度及广度上冲破了传统固体物理学，而且向着更深层次与更
大
的 |
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D********g
发帖数: 533 | 18 凝聚态物理学是当今物理学最大也是最重要的分支学科之一。据70年代中期的调查统计
，凝聚态物理学年发表论文数居首位，占物理学论文总数的三分之一；从事凝聚态物理
研究的人数也居首位，占总人数的四分之一；而从60年代末到80年代末，获诺贝尔物理
奖的人数中，从事凝聚态研究的人数，超过了研究粒子物理的人数，接近总人数的一半
，也居首位。凝聚态物理学得以迅猛发展，首先表现在其研究对象的开拓上。在由原来
传统的三维周期性结构，向着低维甚至非周期结构的发展中，所涉及到的理论也逐渐地
趋于深化与成熟，从30年代的晶体结构分析的唯象理论与固体的比热理论、金属自由电
子论和铁磁性理论，发展到30年代后的能态理论、电子衍射和X射线衍射的动力学理论
，以及点阵动力理论。60年代以后，在凝聚态物理学中，对称性破缺理论又占据了中心
地位。以它为基础，建立了能态、元激发、缺陷及临界区域四个层次。与之相应，各种
有序态的序参量、广义刚度、标度不变性、自相似结构等一系列新的概念随之诞生。此
外，大量非线性课题相继出现，使凝聚态物理不仅在深度及广度上冲破了传统固体物理
学，而且向着更深层次与更大的范围蓬勃发展。
90年代 |
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s*******y
发帖数: 988 | 19 转个钚加工的帖子,事实上目前几个大国加工钚,都主要采用的人工方式进行,盖因钚的
性质实在太奇怪,从中我们也可以看出,一般情况下核材料的辐射并不如很多人想象的那
么恐怖:
由于5f电子复杂的成键行为，金属钚在室温和熔点（639.5）之间居然有6种同素异形体
，实属罕见。较小的温度变动即可导致同素异形体间（也就是晶体结构）的转化，致使
金属钚部件的加工十分令人头疼。
只要一点刺激，钚金属的密度变化可高达25%。它可以像玻璃一样脆，也可以拥有像铝
一样的延展性；当钚凝固时，它的体积会膨胀——就如水冻成冰；新加工钚的银光闪闪
的表面会在数分钟内失去光泽。
化学特性上，+2、+3、+4、+6、+7价都有，其中+4价（PuO2）最稳定。锕系元素的主要
化合价不怎么符合IIIB的族号（内电子层的相互作用太复杂了），和镧系均为+3不同。
锕+3 钍+4 镤+5 铀+6 镎+5 钚+4 镅+3 锔+3 锫+4 锎+3 锿+3 镄+3 钔+3 锘+2 铹+3
钚是世界上第二毒的物质（世界上第一毒的物质为钋）。一片阿斯匹林大小的钚，足以
毒死2亿人，5克的钚足以毒死所有人类。钚的毒性比砒霜大4．86亿倍，比... 阅读全帖 |
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X*******8
发帖数: 3895 | 20 蛋白质结构生物学对于寻找抗癌新药还是有些帮助的。裴如你知道某个蛋白在肿瘤里面
超表达了。你知道其结构后，可能知
道它和下游那个蛋白结合产生功能。就可以设计小分子去阻断它们的结合，从而达到抗
癌的目的。不过，做结构的这些人，
基本上没开船性，就是谁谁发现一个有功能的蛋白，他们就马上用现有的方法去分析，
所以你会发现他们的paper都很相
似。 |
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z********2
发帖数: 3556 | 21 我D吐血三升啊！
x-ray crystallography测不出的话，那你说那些蛋白质结构都是怎么出来的。
当然不是所有的晶体结构的分辨率都能达到1点几的分辨率，但是很多小分子是完全可
以的。
TEM你给我一个最高的分辨率是多少？1.9A的二维晶？
你做结构生物学还是材料电镜呢？ |
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x******g
发帖数: 33885 | 22 从回国到现在，施一公每天睡眠不超过6小时。
“您为什么要这么玩命？”记者问。
“如果不这样，对不起回国后注视我的眼睛。”
在国外总觉得是旁观者
2008年2月，40岁的施一公回国，受聘为清华大学教授。当时，他在美国普林斯顿
大学的科研顺风顺水：有一整层楼的实验室，每年科研经费200万美元；著名的霍华德
·休斯医学研究所也给他1000万美元的经费资助。
可是，施一公说：“在美国做得再好，也总觉得自己是一个旁观者。回到国内，我
会成为祖国变化的一部分，生物学的变化、清华的变化，都和我有关。”
回国后能否续写辉煌？施一公坦陈，自己当初压力很大。“我对咖啡敏感，喝完就
心跳加速，可是回国以后必须喝。”争分夺秒的施一公，对咖啡产生了被动依赖。
超常付出，换来不俗成果。回国后，他在世界三大顶级刊物《细胞》《自然》《科
学》上发表论文13篇；首次成功解析了细胞凋亡小体的高分辨率空间三维结构、早老素
原核同源蛋白的晶体结构，为癌症等人类重大疾病的防治提供了新途径。
“我回国的目标非常明确，就是要做出一些有历史意义的科学重大发现，我觉得这
个目标正在实现。”他说，如果在普林斯顿的研究打85分，现在可以打... 阅读全帖 |
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w********h
发帖数: 12367 | 23 貌似他也没说错什么...
解蛋白结构嘛,第一关得得到晶体...
然后上各种X-ray,一维二维地看...第二关的就是解析了...
Cryo-TEM能给一些直观的结构,其他的都是辅助的... |
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x****y
发帖数: 1853 | 24 好吧，我收回这句话。
应该改成磁共振看不了大分子的三维结构(大部分病毒的dna/rna)，能看到的结构受到
很多实验限制，精度比晶体学差。 |
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s****n
发帖数: 8912 | 25 好像在千人网看见的消息
付最近的媒体报道
清华大学教授颜宁：科学研究只有第一
来源：光明日报 作者：邓晖 2016-06-12 14:08:56
【归国情·创业梦】
一次次对人体细胞里“门”的探索，让“70后”教授颜宁为之着迷。
6月2日，清华大学生命科学学院颜宁研究组与中国疾控中心、中科院微生物所高福
院士研究组合作在《细胞》杂志发表论文，首次报道了人源胆固醇转运蛋白NPC1的4.4
埃分辨率冷冻电镜结构与埃博拉病毒GPcl蛋白复合体6.6埃分辨率的冷冻电镜结构，为
看清NPC1介导埃博拉病毒入侵的“门”提供了分子基础。一年多前，颜宁研究组更是解
开了一个困扰全球生物学家半个世纪之久的难题：率先解析出葡萄糖转运蛋白GLUT1的
三维晶体结构，让人们清楚看到葡萄糖进入人体细胞的“门”长什么样。
国际蛋白质学会青年科学家奖、赛克勒国际生物物理奖……接二连三的重大发现，
让荣誉纷至沓来。可这位青年女科学家却一如既往地淡定。她始终铭记自己走上科学道
路时的理想：“发现某些自然奥秘，在科学史上留下自己的印迹。”
“回国是完全正确的选择”
1996年，颜宁成为清华大学生物科学与技术系的一名新生，... 阅读全帖 |
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w*******e
发帖数: 15912 | 26 from 新语丝
评施一公“大师”忽悠“生命科学”
·方舟子·
近日，清华大学副校长、清华大学生命科学学院院长、中国科学院院士施一
公教授在“未来论坛”年会上发表题为《生命科学认知的极限》的演讲，做大师
状要给生命科学发展指一条明路。我们来看看施大师的一些高论。
【施一公：不要说我们对老年痴呆症的病因不清楚，对大脑这样一个神秘的
器官我们也知之甚少，我们基本上可以说什么都不知道。……我们在用我们的五
官，就是视觉、嗅觉、听觉、味觉、触觉理解这个世界。这个过程是不是客观的
呢，肯定不是客观的。我们的五官感受世界以后，把信息全部集中到大脑，但是
我们不知道大脑是如何工作的，所以在这方面也不能叫客观。……不管你怎么做
研究，都无法解释人的意识，这超越了我们能说出和能感知的层面。】
施一公是结构生物学家，如果他要讲讲蛋白结构测定什么的我们还可以听听，
然而他却要抹杀二三十年来神经科学、认知科学的进展，以为他不知道的神经生
物学家也不知道，听这种妄言，还不如听神棍吹牛有娱乐价值。难怪我一个研究
神经生物学的同学评论说：“... 阅读全帖 |
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a*******m
发帖数: 14194 | 27 老邢确实是烂泥糊不上墙，有点价值的文章都被丫的以清水，节省空间为名
删掉了。
用U盘做服务器，办网站，也真是服了！
施一公这个辞职，一下解开了颜宁为何出走的谜团，形势的确变了。
Faculty版 - 国内风向确定已经变了。。。
https://www.weiming.info/zhuti/Faculty/31814929/
1 (共1页)
w********h
发帖数: 12367
1习近平：科技工作者把论文写在祖国的大地上
2016年06月11日10:36 综合
导语: 党的十八大以来，以习近平同志为总书记的党中央主动认识新常态、适应新
常态、引领新常态，全面推进社会主义经济建设、政治建设、文化建设、社会建设、生
态文明建设和党的建设，取得数百项重要改革成果。央广网于近期策划推出《习近平治
国理政“100句话”》专栏，全方位梳理十八大以来习近平总书记的重要讲话、理论表
述及形势论断，对习近平总书记的讲话精神进行深度解读。
习近平讲话原文：广大科技工作者要把论文写在祖国的大地上，把科技成果应用在
实现现代化的伟大事业中。
2016年5月30日，中共中央总书记、... 阅读全帖 |
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B***o
发帖数: 549 | 28 其实，医用酒精也可以吧！
北大团队:咳嗽药水"沐舒坦"具治疗新冠病毒潜力
澎湃新闻
01月28日 22:31
关注
点击进入疫情地图>>
原标题：北大团队发现：咳嗽药水“沐舒坦”具备治疗新型冠状病毒潜力
氨溴索，以“沐舒坦”为人们所熟知，是一种呼吸道润滑祛痰药临床上常用于急慢性支
气管炎等疾病。如今，中国科学家通过人工智能药靶筛选，发现其具有治疗新型冠状病
毒（2019-nCoV）的潜力。
以上成果来自北京大学基础医学院的王月丹和初明团队。1月25日，该团队宣布在了解
新型冠状病毒2019-nCoV的功能性受体后，采用自主研发的人工智能药靶筛选系统，重
点针对2674种已上市的药物以及1500种中药提取物进行了药物筛选，发现了多种潜在药
物，有望治疗新型冠状病毒感染肺炎，其中包含了常用药物沐舒坦等。
王月丹是北京大学医学部基础医学院免疫学系副主任，医学部生物医学实验教学中心副
主任兼病原与免疫综合实验室主任，参与的《SARS分子病理学及免疫学发病机制研究》
项目获得了2007年教育部高等学校自然科学奖（一等奖）。
王月丹和初明团队药物筛选的基础来自1月21日的一篇重磅论文。中科院上海巴... 阅读全帖 |
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D**W
发帖数: 253 | 29 请问各位faculty一个发paper的问题。一篇准备好了的manuscript为了等晶体结构的结
果等了两年了，可蛋白结构还是没法100%完成，可能永远完不成。一直在和老板商量不
等蛋白结构把paper发了，可现在老板对这个题目觉得没什么兴趣了，而manuscript等
了两年,结果用老板的话说"nothing new"。Well, it's new two years ago. 我理解老
板在意他的reputation，毕竟他是领域里个大牛。可我需要publication, 即使发在烂
杂志上也比发不出好。各位有什么主意吗？如果是你的学生或是postdoc，你会同意他
不署你的名把paper发了吗？老板人非常好，不想因为这事处理不好伤了关系，可我也
确实急需publication。敬请赐教！多谢了！ |
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m****m
发帖数: 395 | 30 求审稿机会，膜蛋白、不可溶性蛋白、可溶性蛋白，X射线晶体衍射、核磁共振，结构
生物学、蛋白结构与功能、蛋白表达和纯化技术
站内联系，多谢！！
邮箱： [email protected]/* */ |
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m****m
发帖数: 395 | 31 求审稿机会，膜蛋白、不可溶性蛋白、可溶性蛋白，X射线晶体衍射、核磁共振，结构
生物学、蛋白结构与功能、蛋白表达和纯化技术
站内联系，多谢！！
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p*****m
发帖数: 7030 | 32 他作apoptosis pathway的蛋白结构还是很重要地把 解决了apoptosome的组装机制问题
晓东和他之前一起开那个公司做的那个smac mimic还是从smac-IAP的晶体结构出发设
计出来的 那公司后来倒是不知道做得如何就是了
作pp2a也有几篇还有意义的文章
这几年回国之后只知道抓膜蛋白解结构了 我作为外行还没看出内在的科学逻辑是什么
也许有 也许就是为了赶紧发些大paper站稳脚跟把 我反正不知道 |
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s******c
发帖数: 331 | 33 晶体学取得突破性进展才几年？一个新药的研发周期是几年？在10年前你做一个
soluble protein，比如一个重要的protease的结构，可能发Nature or Science，因为
那个时候还很难做，现在？structural genomics如火如荼的做structures也不过最近7
，8年的事，很多重要的drug target的结构解出来也不久，drug discovery一定从
protein structures中间受益很多，只是这种益处还没有大规模的表现在新药上，give
it time, you will see. |
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g*****p
发帖数: 451 | 34 这个问题不难回答
从你以前的帖子已经知道你找到了酶被水解的位点
那你只需要合成一段相关的底物就可以了
然后还可以标记一下荧光，加点酶，看能不能切
要是能切的话，连kcat/km都可以算出来
如果能切，一般来说trans-leavage和cis-cleavage的认定才是
最头疼的事
一般来说得需要做个核磁或者晶体结构才行
要是你能拿到zymogen的结构呢，这个是比较好回答了
但你也说了这个酶不稳定，你想拿到zymogen的结构不做几个点突变把它稳定住
是不行的
不过现在为止你的实验数据有点让我困惑的地方（我不是说你的实验数据不对，只是说很
难解释这个现象，所以希望你先再确证一下）
1.你说4度放过夜，该酶都会变成truncated，这个和你开始express出来recombinant的
protease有两者混合的现象结合起来看，很难让我相信这个酶会有autocleavage的活性
因为要知道，ecoli表达重组蛋白，其细胞中的protease浓度是很高的。如果真的具有
自剪切活性，你根本不可能拿到full-length的protease,expression的时候就自己切光
了。因... 阅读全帖 |
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i***0
发帖数: 160 | 35 作为一项技术，它确实不够普及，可是最近电镜技术的发展也让这个老技术焕发新的生
命力，比如膜蛋白的晶体结构多是通过修饰稳定后才能结晶，可是这样带来的稳态结构
是否能反映天然状态一直是个困扰。ｃｒｙｏ－ＥＭ是液相状态的结构，可以反映大分
子颗粒的ｄｙｎａｍｉｃ的构象。一个经典就是ＡＴＰａｓｅ质子通道的多态性（见
Steve Lutke 的文章）。如果可以合作， 还是挺有意思的。 |
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r*********g
发帖数: 1160 | 36 请教一下大家一下，有两个功能是需要的：
1. 根据已有晶体结构的homologous protein预测目标蛋白结构？
2. 在蛋白上做突变，然后看其与新substrate的结合，需要重新模拟结构，比较和WT的
变化。
我以前用过MOE，Insight 2， 但大概是快8年前了，想问一下现在大家用什么软件，有
免费的更好，非常感谢。 |
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r*********g
发帖数: 1160 | 37
谢谢楼上两位，我原来做homology model的时候是选两个已知晶体结构的蛋白和自己目
标蛋白align，然后还要修改一些参数。这个I-Tasser貌似只需要输入序列就可以了，
所以我assume是机器自动去找同源并确有解析结构的蛋白在幕后做结构分析，是这样么
？准确度如何？ |
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c******n
发帖数: 16403 | 38 长期以来，由于滥用抗生素导致细菌耐药，产生所谓的“超级细菌”，已成为一个全球
医疗卫生难题。中科院生物物理研究所研究员黄亿华团队的一项最新研究成果为研发能
够攻克“超级细菌”的新型抗生素铺平了道路，使铲除“超级细菌”成为可能。国际知
名学术期刊《自然》近日在线发表了这项重要成果。
世界卫生组织的数据表明，农业和医疗上的抗生素滥用已使耐药性菌株在世界各地快速
增殖，造成的严重后果是将来即便是普通感染和轻伤也有可能致命，现在可以治愈的一
些常见细菌感染未来或许将再次肆虐。
“研究能够攻克这些‘超级细菌’的新型抗生素成为当务之急。但我们首先必须在细菌
上寻找新的靶标，而阻止细菌外膜的生成很可能是一个最为有效的途径。”黄亿华说。
此前研究发现，有超过半数的抗药菌株是由一类“革兰氏阴性细菌”引起的。这类细菌
表面拥有双层的膜结构，即外膜和内膜，使得一般药物更难进入其胞质中发挥作用。革
兰氏阴性细菌外膜主要由脂多糖组成。脂多糖又称内毒素，不仅是外膜的主要成分，也
是导致炎症反应以及人体天然免疫反应的主要原因，由一位德国微生物学家于19世纪末
发现。美国科学家布鲁斯・博伊特勒因发现人体... 阅读全帖 |
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m*b
发帖数: 1421 | 39 这个确实比较赞
现在看来人1g确实是一直站在潮头浪尖上
2000年左右水溶蛋白晶体单独就可以高水平文章
重要的水溶蛋白单独结构就可以发好文章
果断找了凋亡这个热点切入进去
5年后水溶蛋白慢慢离不开功能合作了，颓势已现
马上进入膜蛋白这个高速通道
再5年后，渐渐在pnas，nsmb这样的子刊上也能看到膜蛋白了结构了
说明膜蛋白也慢慢在没落了
马上抓到电镜这个新星
11g在科研上的嗅觉真是数一数二 |
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w******l
发帖数: 67 | 40 你的问题一点都不土！
有疑问么？当然是in vivo的结构最有用。
就像新合成一种药，虽然不能根治某病，但是可以延长病人的寿命/生活质量，这个药
就是在当前有效的。
晶体/电镜结构也一样，这个也需要问？ |
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w******l
发帖数: 67 | 41 他说的再好能改变晶体/电镜结构是目前能达到最接近in vivo结构的事实么？
还你挺他。。。 |
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x********e
发帖数: 35261 | 42 就事论事，不要在这里瞎扯。我都是举例用事实证明我的观点的。你觉得我哪点说的不
对就直接指出来，顺带帮大家科普一下。我早就说了，请各位做结构的大牛聊聊晶体结
构近几十年有什么技术上的突破，是不是已经确定结晶和in vivo坏境下结构都一样，
如果不是，将来会从哪个方向上去解决这个问题。你既然是领域内的，能不能回答一下？ |
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g*****n
发帖数: 250 | 43 这是典型的道听途说。根据结构设计药物，不是指只根据11G搞的那种3D结构。根据2D
结构和从2D推测的3D 也可以。在你的例子中，好几个都不是根据3D。比如NSAIDs （阿
司匹林，ibuprofen)，老早年就有了。Cimetidine是在1960年代用Rationaldrug
design途径搞出来的，不是根据晶体结构。
as |
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S******l
发帖数: 14311 | 44 做结构的以最后的结构的重要性说话，与用什么技术无关。 公哥如果能获奖，并非说
冰冻电镜也一定要先获奖或者同时获奖。
ATPase，钾通道等晶体结构获奖，与X-ray获不获奖，没有半毛钱关系，只是工具而已
。
看好公公拿炸药奖 |
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s****n
发帖数: 8912 | 45 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: sautin (老将萨乌丁), 信区: Military
标 题: 热烈祝贺颜宁当选国家10大青年科学家
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Jul 10 09:35:31 2016, 美东)
好像在千人网看见的消息
付最近的媒体报道
清华大学教授颜宁：科学研究只有第一
来源：光明日报 作者：邓晖 2016-06-12 14:08:56
【归国情·创业梦】
一次次对人体细胞里“门”的探索，让“70后”教授颜宁为之着迷。
6月2日，清华大学生命科学学院颜宁研究组与中国疾控中心、中科院微生物所高福
院士研究组合作在《细胞》杂志发表论文，首次报道了人源胆固醇转运蛋白NPC1的4.4
埃分辨率冷冻电镜结构与埃博拉病毒GPcl蛋白复合体6.6埃分辨率的冷冻电镜结构，为
看清NPC1介导埃博拉病毒入侵的“门”提供了分子基础。一年多前，颜宁研究组更是解
开了一个困扰全球生物学家半个世纪之久的难题：率先解析出葡萄糖转运蛋白GLUT1的
三维晶体结构，让人们清楚看到葡萄糖进入人体细胞的“门”长什么样。
国际蛋白质学会青年科学家奖、赛克勒国... 阅读全帖 |
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m****m
发帖数: 395 | 46 求审稿机会，膜蛋白、不可溶性蛋白、可溶性蛋白，X射线晶体衍射、核磁共振，结构
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a****n
发帖数: 135 | 47 别人不说，那个严纯华， 黄wei这两个都是大骗子，靠玩弄权术上位的。
黄wei这个垃圾，在北大就是团围书记还是学生主席的，不记得了，
成绩蓝狮一样，搞女人很有一套，
在新加坡补血无数，整天跟权贵拉关系，这垃圾就一个学化学的，怎么成了技术科学部
的原始了？
严老板，靠徐光线挺着，不是他多好，而是那个年代国内没人可用，那时候的人基本上
都留在美国, 他78的，Duke杨伟涛, 明尼苏达那个，还有加州理工的王振刚, 都是BS82的，
看看人家做的东西的难度。严春华那算什么呀，几个无机结构，发几个文章自娱自乐，自欺，欺人，
也什么中科院院士啊，别骗人了。这样的方向，在美国根本没几个做，连经费都很难搞到，在中国可以骗，吹。你看看Arizona那个北大出来的教授，也是无机结构，文章都是顶级刊物，你问问他，他那方向，经费好搞嘛
严春华当过方正副总裁，拉关系，靠手下人干活，自己补血无数的混混。做的领域也是垃圾领
域，跟接一个晶体结构就上一个SCIye差不多的活。
北大真牛的，赵新生来路华，都没
上，人家做的难，深，那才是真牛。严实验室出来的很多哈，别见怪。 |
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f*******e
发帖数: 5594 | 48 客气了，赐教不敢，就我的理解能说多少就多少吧，完全解释，一句两句不太可能。
先说明一下，我前面说的都是中医的概念，想要把所有中医的概念完全对应到物质上的
具体东西，是不可能的。我提到的”现代科学的角度“，也只是便于一部分人理解而已
，绝不是一一对应。
问：水的性质大家都知道。有气态，液态，固态三种，这个是咱们小学学的啦。三者之
间的转换，相信大家也都知道。所以不必在天才能为气，在地才能成形。不知道你说的
这个气是不是指水蒸气？还是气功的气？有形的结构，不知道你说的是不是分子结构？
"雾"、“沤”、“渎”，”湿“、“水"、”饮“、”痰 “这些的结构有何不同？据我
所知，分子结构完全相同，晶体结构也完全相等。当然除非这些词的概念跟我理解的不
一样。
答：我说的水的气的特性，是指寒，是六气“风、寒、暑、湿、燥、火”之一。”在天
为寒，在地为水“。并不是气、液、固三态，这三态也都是形。气与形的关系是”本“
与“标”的关系。那么气是什么，估计你又会有很多问题了。气比水更抽象，更难理解
一些。它更多的指的是一种动力，能量。所以，中医里的水，不单是一种物质，还是一
种能量的体现。
再说具体的水，它的 |
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x******i
发帖数: 21 | 49
CADD 在美国已经明显没有7/8年前火热了.国内可能正处在初级兴奋状态.
工作机会不多,一个CADD group 没有几个人, 而且据说只有大的制药公司才买得起整套
专业软件,因为需要与做晶体结构分析的结构生物学同行紧密合作.换句话说, 不能全靠
in silico modeling, 必须拿到药物与receptor or enzyme 共结晶结构才能给做合成
的指出方向. 至于用简单的CADD软件做SAR,恐怕每个well-trained chemist 都会一些.
my two cents. |
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x******i
发帖数: 21 | 50
CADD 在美国已经明显没有7/8年前火热了.国内可能正处在初级兴奋状态.
工作机会不多,一个CADD group 没有几个人, 而且据说只有大的制药公司才买得起整套
专业软件,因为需要与做晶体结构分析的结构生物学同行紧密合作.换句话说, 不能全靠
in silico modeling, 必须拿到药物与receptor or enzyme 共结晶结构才能给做合成
的指出方向. 至于用简单的CADD软件做SAR,恐怕每个well-trained chemist 都会一些.
my two cents. |
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