h***e
发帖数: 20195 | 1 【 以下文字转载自 FleaMarket 讨论区 】
发信人: honde (天地有正气，杂然赋流形), 信区: FleaMarket
标 题: 鱼精蛋白民间价暴涨300倍 多地缺货停心脏手术 (转载)
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Sep 26 20:55:14 2011, 美东)
发信人: brihand (brihand), 信区: Military
标 题: 鱼精蛋白民间价暴涨300倍 多地缺货停心脏手术
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Sep 26 18:18:34 2011, 美东)
鱼精蛋白民间价暴涨300倍 多地缺货停心脏手术
http://www.sina.com.cn 2011年09月27日02:03 中国经济周刊
患者：“这种药既不难做，又不贵，为什么买不到？”
医院：“就是因为太便宜了，才买不到。”
药企：“啊！全国就我们一家在做这种药！”
相关部门：“药品停产属企业的市场行为，我们将该情况向有关业务单位汇报后，
方可给出答复。”
“救心药”鱼精蛋白民间价格暴涨300多倍
药，廉价也是一种错？
《中国经济周刊》记者 李妍|北京报道
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h***e
发帖数: 20195 | 2 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: brihand (brihand), 信区: Military
标 题: 鱼精蛋白民间价暴涨300倍 多地缺货停心脏手术
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Sep 26 18:18:34 2011, 美东)
鱼精蛋白民间价暴涨300倍 多地缺货停心脏手术
http://www.sina.com.cn 2011年09月27日02:03 中国经济周刊
患者：“这种药既不难做，又不贵，为什么买不到？”
医院：“就是因为太便宜了，才买不到。”
药企：“啊！全国就我们一家在做这种药！”
相关部门：“药品停产属企业的市场行为，我们将该情况向有关业务单位汇报后，
方可给出答复。”
“救心药”鱼精蛋白民间价格暴涨300多倍
药，廉价也是一种错？
《中国经济周刊》记者 李妍|北京报道
“这几个病房的患者都是做心脏外科手术的，都因为缺这个药(鱼精蛋白)等着呢，
医院都停做手术了，只有紧急抢救的才能做，像我们这样没有生命危险的都得等着。”
李阿姨靠坐在病床上，唉声叹气。
她的手术已经一拖再拖，却仍然遥遥无期。“这要等到什么时候啊？住一... 阅读全帖 |
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p****n
发帖数: 9263 | 3 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: brihand (brihand), 信区: Military
标 题: 鱼精蛋白民间价暴涨300倍 多地缺货停心脏手术
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Sep 26 18:18:34 2011, 美东)
鱼精蛋白民间价暴涨300倍 多地缺货停心脏手术
http://www.sina.com.cn 2011年09月27日02:03 中国经济周刊
患者：“这种药既不难做，又不贵，为什么买不到？”
医院：“就是因为太便宜了，才买不到。”
药企：“啊！全国就我们一家在做这种药！”
相关部门：“药品停产属企业的市场行为，我们将该情况向有关业务单位汇报后，
方可给出答复。”
“救心药”鱼精蛋白民间价格暴涨300多倍
药，廉价也是一种错？
《中国经济周刊》记者 李妍|北京报道
“这几个病房的患者都是做心脏外科手术的，都因为缺这个药(鱼精蛋白)等着呢，
医院都停做手术了，只有紧急抢救的才能做，像我们这样没有生命危险的都得等着。”
李阿姨靠坐在病床上，唉声叹气。
她的手术已经一拖再拖，却仍然遥遥无期。“这要等到什么时候啊？住一... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 4 ·方舟子·
我以前科普过，宫颈癌基本上都是由人乳头状瘤病毒（HPV）导致的，可以
通过接种HPV疫苗预防。如果已经被HPV感染了，就没有清除HPV的办法，只能等
人体免疫系统自己将其清除。在所有的HPV感染中，大约90%会在两年内痊愈，所
有的病毒都会被清除干净，但是有10%的HPV感染，HPV的基因会结合进细胞的基
因组，成为细胞的一部分，这时候就没法被免疫系统清除，也没有药物能够清除，
只能是定期做宫颈癌筛查，即时发现癌变加以治疗。
有国内医生向我反映，我才知道我真是“孤陋寡闻”，国内早就有了能够清
除HPV的神药，“这个东西现在非常火，火到什么程度？医院的医生只要发现HPV
阳性就开，一次治疗费用几万，效果却并非宣扬的那样好。北京协和郎景和院士
和301医院孟元光为该产品站台，又加上姜世勃姜千人，这个公司靠这个要上市。
协和每个月开3000多支，百万的销量。”不禁引起我的兴趣，这是什么神药，居
然号称能够清除HPV，而且还有大名鼎鼎的协和医院和301医院的大名鼎鼎的妇产
科权威为其站台，让患者不信都不行。
这种神药叫做“抗HPV生物蛋白敷... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 5 小弟现在手上有两个博后offer，一个offer做代谢组学，另一个offer主要做蛋白组学
。我博士期间做代谢组学的研究，未来打算在制药行业发展。现在纠结的是从以后找工
作的角度来看，我究竟是做回原来的方向还是转到蛋白方面去呢？谢谢！ |
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R******d
发帖数: 1436 | 6 很多文献都说组蛋白修饰和基因表达水平有关。是不是有两种可能的机理：
1，修饰后的组蛋白直接招募转录因子，或者驱赶转录因子，启动或者中止转录。
2，修饰后的组蛋白和nucleosome/chromatin remodeling蛋白复合体结合，导致染色体
结构开放
或关闭。从而利于或者抑制转录。
请问1和2哪个正确？可否给点支持文献。
非本专业，请不吝赐教，包子酬谢。 |
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g*****p
发帖数: 451 | 7 技术上又没啥突破
自然做起来辛苦，我看现在做的欢的有五拨思路
1.花个二十年建改造技术（只对某种膜蛋白适用），并花力气搞个自动化筛选平台，专
攻一类膜蛋白。有了结果以后可以以技术优势，继续发几个结构挖几桶金。当然等大家
都学会了就没有太大优势了。不过这还是很牛的。
2.搞大工厂，搞个百八十号人。用传统方法用人海战术筛好做的做，只要有1-2篇cns交
帐就ok.当然剩下的都是炮灰
3.从低等生物做起。比如细菌什么的，因为蛋白相对而言表达、稳定性和复杂程度还是
比真核生物强点。这种呢有些结构还是非常重要的，但还有很多也就是些没人care的东
西，
不过膜蛋白相对而言还是比较难做，文章可以顶着膜蛋白的光环跟cns editor讨论一下
，发出来还是有指望的。不过讲工作的时候就没啥意思了，一般会在新闻里吹吹自己发
了cns,虽然没啥意义。
4.经常去开会和打听消息探听情报，从人家组里“偷”半成品。因为这个东西有时候周
期很长，很多组做了4、5年有了结果，保密工作就不好了。有人就专门去探听这种东西
，偷人家的小trick,然后多上几个人跟人家compete
5.老板有个性有兴趣的，做了几十年的单... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 8 新型冠状病毒2019-nCov的爆发引起了人们对于此突发性公共卫生事件的高度关注。冠
状病毒的刺突糖蛋白（Spike glycoprotein, S glycoprotein）是疫苗、治疗性抗体的
研发以及临床诊断的关键靶点。
为了协助对该流行性疾病进行医学防护措施研发，2020年2月15日，美国卫生总署(NIH)
与德克萨斯大学奥斯汀分校Jason S. McLellan研究组（McLellan组在病毒结构方面做
了很多重要的工作，包括MERS等，有着丰富的经验）进行合作在预印版平台bioRxiv发
表文章Cryo-EM Structure of the 2019-nCoV Spike in the Prefusion Conformation
，利用冷冻电镜技术分析了新型冠状病毒表面S蛋白的近原子结构。另外作者们通过生
物物理以及结构方面的证据发现，SARS-CoV-2的S蛋白结合人体ACE2（宿主细胞受体血
管紧张素转化酶2）【1,2】的亲和力要远高于SARS-CoV的S蛋白，解释了新型冠状病毒
传染性之强的主要原因。
新型冠状病毒是会引发发热、严重呼吸道疾病及肺炎的人传人的病原... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 9 尼玛，最后还得中科院上，对不对？
2月15日下午，国务院联防联控机制于北京召开新闻发布会，介绍药物研发和科研攻关
最新进展情况。会议上介绍称，在疫苗研发方面，我国已经开展了灭活疫苗、核酸疫苗
、重组疫苗等多条技术路线的研发。
科技部生物中心主任张新民指出，党中央高度重视新冠肺炎疫苗的研发工作，科研攻关
组成立伊始，就将疫苗的研发作为重中之重的主攻方向，组织了全国优势单位进行联合
攻关，加速推进疫苗研发。由于新冠病毒是一个新病原体，疫苗研发难度比较大、周期
比较长。为确保尽早研发成功，在科研攻关应急项目中我们并行安排了多条技术路线，
包括灭活疫苗、mRNA疫苗、重组蛋白疫苗、病毒载体疫苗、DNA疫苗等并行推进，切实
保障成功率。同时在联防联控机制下，积极协调多个部门给予疫苗研发团队全方位的保
障和支持，使研发工作进度更加紧凑、更加高效。
中科院微生物所研究员严景华在会上介绍，疫苗研发有很多策略，各种疫苗有各自的特
点、优点和缺点，它们都是相辅相成的。我们单位是科学院团队，我们承担的工作是重
组的蛋白疫苗。重组蛋白疫苗是把一个病原体最有效的抗原成份基因拿出来，进行体外
重组，表达蛋白，然后... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 10 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: ABCNBC (小李飞刀), 信区: Biology
标 题: 中国特色社会主义新时代蛋白组学
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Nov 18 12:27:01 2018, 美东)
贝勒医学院教授、“千人计划”秦钧在中国讲“中国特色社会主义新时代蛋白组学”，
不怕被联邦调查局叫去喝咖啡？ |
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m******5
发帖数: 1383 | 11 小弟刚从生化转到发育领域玩
目前正在做一个Homeodomain protein,查10年来的相关的发育领域的文献（DB,
development）非常奇怪地发现都只有in situ 检测蛋白表达和分布，没有免疫组化，
也没有western
我试了市面上所有commercial抗体，也都不能在组织里检测到（western 和免疫组化）
作为阳性对照，转293 overexpress的蛋白检测起来都是没问题的
PS ：我做组织裂解液是用RIPA+超声打散的办法（组织在RIPA buffer里沉淀后直接用
超声打匀，反复三次），理论上也应该没问题？
求指教！
另外还有一个好奇的地方：很多做发育的文章也都只用ｉｎ ｓｉｔｕ来说明问题，这
是什么原因呢？ 是因为组织里免疫检测不到很正常？
另外，没有蛋白水平的检测能说明问题么？ 比如可能蛋白质已经被truncate 了 ，或
者蛋白质aggregate了 ，或者被调控降解了 ，这些都是不能用简单的insitu来证明的
吧？ |
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o***o
发帖数: 11767 | 12 非常感谢组织者给我这个机会，我打头炮，下面由我的朋友饶毅和晓东分别讲生命科学
。我接到邀请之后毫不犹豫接受了邀请，未来论坛，“未来”这两个字对我来说是非常
有吸引力，小时候读未来预测的科普文章觉得都是很激动人心，所以我想在我接下来的
十分钟里，我所能做以我的眼光告诉大家我对未来如何思考，我自己觉得这样一个未来
论坛应该是集中在对未来的思考上，人类未来会面临什么，我们面临什么麻烦和困难，
我们该怎么对付。我作为一个科学家，从事了二十年的科学研究，也有一些可能是更深
层次的思考，今天跟大家一起思考。
告诉大家我的想法之前，我还是准备了一个幻灯片，我想让大家看一看，大家看几个数
字，这是我的原创。宇宙的年龄到现在已经138亿年，但是你可能想象不到，我们宇宙
的半径是465亿光年，也就是说宇宙的形成，空间速度远远大于光在138亿年可以距离两
的倍，这是不可思议。到现在为止只有爱因斯坦广义相对论可以解释，这138亿年宇宙
长河中，太阳系只存在46亿年，大概三分之一的时间，其中地球上的生命大约是35亿年
，如果我们从最简单的生命开始算起，但是这里35亿年里，恐龙居然统治地球长达将近
2亿年，很了不... 阅读全帖 |
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s*****e
发帖数: 970 | 13 由上海血液学研究所所长陈赛娟院士等人领衔的上海血液学研究所/医学基因组学国家
重点实验室在白血病研究领域又有重大发现。该研究团队利用第二代测序技术在国际上首
次对急性髓细胞白血病M5亚型（AML-M5）——急性单核细胞白血病进行了全外显子组测
序，解读了基因组中基因编码区域的信息。他们发现表观遗传学调控中的一个重要基因——
DNA甲基转移酶（DNMT3A）基因在AML-M5中存在高频突变，该基因的突变与患者的不
良预后密切相关；对其编码蛋白质的功能研究表明DNMT3A突变很可能在单核细胞系受累的
急性白血病的发病机理中发挥重要作用，他们的结果为该类白血病的预后预测提供了新的分
子标志，也为其治疗提供了新的思路。2011年3月13日，《自然遗传学（Nature Genetics
）》杂志以长文形式（article）系统报道了这项研究结果，表明中国科学家在肿瘤基因组学
的研究领域已经跻身于世界一流行列。
急性单核细胞白血病是一种特殊类型的急性髓细胞白血病，表现为骨髓和外周血原始和
幼稚单核细胞增多，其临床进程凶险，患者易发生髓外浸润，3年平均无病生存率仅有25%，
且复发率高。因而寻找特异... 阅读全帖 |
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h*******k
发帖数: 975 | 14 晶体组和信号通路，无非是当年打通美国东西铁路的火车站和枕木。
王小东，施一公，这些工头人物，无非是铁路华工里混的好一些，穿的象个人一样，能
和美国爹讲几句话，甚至爬到一个桌子上吃个饭的。
但是有谁会承认美国铁路网是华人控股，设计的呢？美国最鄙视的是被利用的奴隶劳工
，最尊重的是投机和杀人拿地。美国对施一公的尊重，还不如对法轮功的尊重。在物质
报酬上，法轮功的头子，拿的也远远超过施一公。
信号组，晶体组，蛋白组，这些概念，早被 Lee Hood 这些恶霸拿去了。第一个受体
kinase 的概念被证明以后，永远不会有人因为发现下一个 kinase 得什么奖。
中央太平洋铁路全长 690英里，在这漫长的征途中，铁路工人共828万次挥动铁锤，钉
进276万根道钉，完成了这举世瞩目的工程，这其中有超过五分之四的工作是由华工完
成的。
非常遗憾的是，在铁路开通的庆典仪式上，竟然没有邀请一位中国人参加。
蛋白组共计10万个分子，有五分之四是千老完成的，在庆典仪式上，可能有一个中国人
参加，他叫杨焕明。 |
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发帖数: 1 | 15 艾比玛特医药科技（上海）有限公司（Abmart Shanghai Co.,Ltd.）由一群志在改
变传统的科学家和企业家创建于2007年，目前员工约200人。创始人是国家『千人计划
』的特聘专家。
艾比玛特拥有业内前所未有的快速、高成功率、低单价的单抗个性化定制业务全球
科研客户数已超过2000人，使用艾比玛特抗体发表的科研文章超过1200篇，成为这个行
业最领先，最大的企业之一。艾比玛特的技术实力在制药领域也获得广泛认可，全球前
十大制药公司全部是我们的客户，共同开发制药靶标的功能性抗体和检测用抗体。
以下几个方向的人才，要求博士及以上，欢迎自荐或推荐，可联系邮箱：yaping.hao@
ab-mart.com，手机15366099215。
1、肿瘤免疫药物开发平台：肿瘤学(尤佳)，免疫学、细胞生物学、或其他生物医学相
关专业博士，优秀的科研背景（理想：1篇10分以上文章），有三年以上实验室经验。
2、生物信息部：要求优秀的科研背景（理想：1篇10分以上文章）和多年生物信息/大
数据研究的一流track record。蛋白质组学或基因组学方向。
3、功能蛋白质... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 16 艾比玛特医药科技（上海）有限公司（Abmart Shanghai Co.,Ltd.）由一群志在改
变传统的科学家和企业家创建于2007年，目前员工约200人。创始人是国家『千人计划
』的特聘专家。
艾比玛特拥有业内前所未有的快速、高成功率、低单价的单抗个性化定制业务全球
科研客户数已超过2000人，使用艾比玛特抗体发表的科研文章超过1200篇，成为这个行
业最领先，最大的企业之一。艾比玛特的技术实力在制药领域也获得广泛认可，全球前
十大制药公司全部是我们的客户，共同开发制药靶标的功能性抗体和检测用抗体。
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2、生物信息部：要求优秀的科研背景（理想：1篇10分以上文章）和多年生物信息/大
数据研究的一流track record。蛋白质组学或基因组学方向。
3、功能蛋白质... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 17 艾比玛特医药科技（上海）有限公司（Abmart Shanghai Co.,Ltd.）由一群志在改
变传统的科学家和企业家创建于2007年，目前员工约200人。创始人是国家『千人计划
』的特聘专家。
艾比玛特拥有业内前所未有的快速、高成功率、低单价的单抗个性化定制业务全球
科研客户数已超过2000人，使用艾比玛特抗体发表的科研文章超过1200篇，成为这个行
业最领先，最大的企业之一。艾比玛特的技术实力在制药领域也获得广泛认可，全球前
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发帖数: 1 | 18 艾比玛特医药科技（上海）有限公司（Abmart Shanghai Co.,Ltd.）由一群志在改
变传统的科学家和企业家创建于2007年，目前员工约200人。创始人是国家『千人计划
』的特聘专家。
艾比玛特拥有业内前所未有的快速、高成功率、低单价的单抗个性化定制业务全球
科研客户数已超过2000人，使用艾比玛特抗体发表的科研文章超过1200篇，成为这个行
业最领先，最大的企业之一。艾比玛特的技术实力在制药领域也获得广泛认可，全球前
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2、生物信息部：要求优秀的科研背景（理想：1篇10分以上文章）和多年生物信息/大
数据研究的一流track record。蛋白质组学或基因组学方向。
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n***p
发帖数: 79 | 19 http://paper.people.com.cn/rmrb/html/2016-05/30/nw.D110000renmrb_20160530_5-11.htm
本报北京5月29日电 （记者赵永新）近日，清华大学颜宁课题组与中国疾控中心、中
科院微生物组高福院士课题组合作的一项最新成果，在世界上首次解析出NPC1蛋白的清
晰结构，并初步揭示了它的工作过程，从而为干预、治疗罕见遗传疾病“尼曼—皮克病
”和埃博拉病毒打开了新大门。
颜宁教授过去9年一直针对胆固醇代谢调控通路进行系统的结构生物学与生物化学
研究，高福院士一直从事包括埃博拉病毒在内的重大传染疾病相关病毒入侵机制的结构
生物学研究。他们合作的研究论文《NPC1蛋白介导胆固醇转运和埃博拉病毒入侵的分子
机制》，发表在5月26日的《细胞》杂志上。该论文在国际学术界首次报道了人源胆固
醇转运蛋白NPC1的4.4埃分辨率冷冻电镜结构，并分析探讨了NPC1和NPC2两个蛋白协作
介导细胞内胆固醇转运的分子机制，同时为理解NPC1介导埃博拉病毒入侵的分子机制提
供了分子基础。
据悉，“尼曼—皮克病”是一类因为胆固醇、鞘磷脂等脂类代谢失... 阅读全帖 |
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f***y
发帖数: 4447 | 20 http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2014/4/292863.shtm
中国科学家率先解析生命信息载体的结构奥秘
一个困扰生物学界30余年的最基本问题被中国科学家破解了。
据来自中国科学院方面的确切消息，4月25日，美国Science杂志将以长篇幅研究论文形
式报道中科院生物物理研究所一项关于30nm染色质高级结构解析的重大成果，标志中国
科学家在这个现代分子生物学难题上的研究得到世界同行的认可。该论文的评审人评论
该成果是“目前为止解析的最有挑战性的结构之一”，“在理解染色质如何装配这个问
题上迈出了重要的一步”。
61年前，同样是在4月25日，剑桥大学卡文迪许实验室的沃森和克里克在英国Nature杂
志上发表了一篇划时代的论文，向世界宣告他们发现了DNA的双螺旋结构，揭开了遗传
信息如何传递这个“生命之谜”。这个发现使生命科学的研究深入到分子层次，开启了
现代分子生物学时代，成为20世纪最伟大的科学发现之一。
虽然DNA是遗传信息的载体，但DNA在生命体内并不是独立存在的，任何遗传信息的传递
和调控等生命活动都是在DNA与其所缠绕的蛋白质形成的染... 阅读全帖 |
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f***y
发帖数: 4447 | 21 施一公组首次报道人源剪切体原子分辨率结构
http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2017/5/376111.shtm
2017年5月12日，清华大学生命学院、结构生物学高精尖创新中心施一公研究组于《细
胞》（Cell）在线发表了题为《人源剪接体的原子分辨率结构》（An Atomic
Structure of the Human Spliceosome）。这是第一个高分辨率的人源剪接体结构，也
是首次在近原子分辨率的尺度上观察到酵母以外的、来自高等生物的剪接体的结构，进
一步揭示了剪接体的组装和工作机理，为理解高等生物的RNA剪接过程提供了重要基础。
在真核生物细胞内，大多数基因是不连续的，它们的编码区（exon）被称为“内含子（
intron）”的非编码序列隔断。在基因表达过程中，内含子需要经过“剪”和“接”这
两步化学反应被去除，从而使得编码区可以连接成不同的信使RNA（mRNA）。同一个基
因，因为内含子的边界和数量不同，经过剪接，便可以产生出多种编码蛋白的mRNA。
RNA剪接是所有真核生物特有的过程，是真核生物“中心法则”的关键步骤之一，也被
认... 阅读全帖 |
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h**********d
发帖数: 30 | 22 基本情况：
E.coli C43, cyoABCDE knockout(Km)表达cytochrome bo3, tyrA knockout(Cm)
tyrosine生物
合成中的一个酶（从prehenate到4-hydroxy-phenylpyruvate)
pAc-YNH2 plasmid(Tet): proK promoter + 6 copy of M.j tyrosine tRNA, glnS
promoter
+ 3-aminno-tyrosine M.j tRNA synthase (M.j is an archea strain)
pET plasmid(Amp): T7 cyoABCDE w/ cyoB Y288Amber stop codon mutation
要表达的是cytochrome bo3 mutant protein, 在蛋白里genetically引入一个非天然氨
基酸
（peter schultz组的技术，pAc-YNH2质粒也是从他们组拿给MIT的STUBBE组做的，她们
组没遇
到过这个质粒的问题）
这两个质粒同时存在于E.coli c43里的时 |
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C*******e
发帖数: 318 | 23 用LC-MS/MS等相关的色谱质谱作蛋白组学，代谢组学的研究，进工业界找工作好找么？ |
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h*********y
发帖数: 79 | 24 感谢楼上几位兄弟支招，现总结并讨论如下
(1). biotin技术(基于Crosslinking的Lable transfer方法)
感觉应该是应用于细胞内。本人使用的是体外重组蛋白
(2). microscale thermophoresis
没做过MST，仅知道MST能计算Kd，是否也能定量计算分子量或者结合比？有没有做过的
牛人帮我介绍一下？
(3). NMR
蛋白分子量太大。。。
(4). Size exclusion chromatography-multi-angle dynamic light scattering (SEC
-MALS)
从本人实验来看，蛋白A为10KD，配体B蛋白120KD，该方法测定的分子量精度不足以区
分120KD上添加了几个10KD。
(5). 不同的荧光技术（FRET, BRET, Quenching, PF）
如(4)，不知道如何定量。
(6).ETH有个人专门做蛋白组的，可以分离protein complexes，这个或许相关
分离不成问题，关键是定分子量。。。
除了以上建议，另外有朋友建议用Beckman 分析定量超速离心机 Beckma... 阅读全帖 |
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f*****y
发帖数: 464 | 25 见多识广的高人们来说说。我可以看看相关的paper.
我做的一组gene就似乎是这种情况，至少实验结果是这样。
我是做的是不常用的动物模型。他人paper显示这组gene在别的动物的某些组织和条件
下都有RNA和蛋白一起变化。我用了同样的抗体在我的动物模型，不同的组织和条件，
虽然western有条带，就是做不出来蛋白变化。不知道能不能相信。欢迎高人指点。 |
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h**********d
发帖数: 30 | 26 好的，我也只好一个一个条件慢慢尝试了。
我是让colony在2YT里长到饱和（1.5到两天）后转入M63培养基的，这个以前也是成功
的，并
且是参照文献上类似工作做的。我一般都是从板上挑最大的几个菌落开始长，当然它们
也是长
得最快的。开始诱导都是在E.COLI进入600纳米吸收值0.6到0.7之间（我个人觉得OD高
一些有
利于细胞内低GLUCOSE，高cAMP两个条件满足引发表达，是这样么？）。
我从来没尝试过降低温度表达，因为实验室用的E.COLI C43是专门优化表达细胞色素氧
化酶这
类的膜蛋白的，我这次打算用37，30，25都尝试一下？
诱导后一半长菌4个小时，久了会形成干扰的杂质蛋白CYTOCHROME OO3,大概1，两个小
时黄色
的E.COLI就会开始变红，意味着蛋白已经积累到可以目测的程度了。
蛋白的纯化我到不担心，这个在组里已经是很常规的步骤了，首先它都在膜里的，不会
在清液
中，其次有没有蛋白从颜色就可以看出来，棕红的细胞膜就对了，呵呵。 |
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g*********d
发帖数: 233 | 27 封面故事：《自然》杂志年度新闻人物
今年的“Nature年度新闻人物”是Jane Lubchenco。作为美国国家海洋和大气管理局局
长，她深入
参与了今年最大新闻事件之一——英国石油公司“深水地平线”钻井平台在墨西哥湾的
石油泄漏事件。
远古西伯利亚“人族”个体的基因组被测序
从解剖上来讲，现代人在距今20万年前之后的某个时间点上还在非洲，在此之后相当长
时间才达到欧
亚大陆。与此同时，包括“尼安德特人”（穴居人）在内的古“人族”至少在23万年前
就已在欧亚大陆
了，只是在距今约3万年前才从化石记录中消失。现在，来自南西伯利亚Denisova Cave
中的一个女
性古“人族”个体的基因组已根据从一个手指骨中提取的DNA被测序。这个“Denisovan
”个体所属的
群体与“尼安德特人”有一个共同的起源，而且尽管它并不涉及假设中的从“尼安德特
人”向欧亚人的基
因流动，但它对今天美拉尼西亚人的基因组的贡献达4%～6%。另外，一颗牙齿的线粒体
基因组与手指
骨的线粒体基因组非常像，这颗牙齿的形态表明，这些“人族”个体在演化上与“尼安
德特人”和现代人
都是截然不同的。
与冲动行为有关的... 阅读全帖 |
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m***o
发帖数: 272 | 28 我用HA做为no antibody control because IgG background is too strong。如果以HA
来normalization，我做的TF binding 有显著差别。而我的TF binding如果用 % input
则差别很小。现在的问题是，不同sample 的HA 总是有差别。怎么来消除HA binding
的差异？是不是样品的处理造成？用的细胞是分化组和未分化组。两组蛋白含量差别特
别大。不知相同细胞数超声，但是蛋白含量可以差10倍，是不是超声条件也该不同？但
是电泳看，大小差不多。请高人指点迷津。谢谢！ |
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A****i
发帖数: 71 | 29 本人Pharmaceutical Sciences PhD第五年了，准备毕业找工作，集中精力找工业界的
工作，去年去AAPS会议感觉做bioanalysis是个方向，可是大概投了半年简历了，一份
回信的都没有，请问前辈是不是我做proteomics的background不好啊，目前准备找
postdoc了，请问我可以转哪些方向做博后以适应工业界的要求。
本人的background：
1. 国内master期间，做的天然产物的PKPD，还有一些代谢组，主要用LC-TripleQ。
2. 美国PhD期间，主要做的糖尿病人muscle biopsy的蛋白质组和各种蛋白修饰的组，
用的Thermo的Orbitrap（Elite，Fusion，Lumos）。
3. 其次，做了一些分子生物学的东西，建质粒，overexpress，knockdown，ELISA，
Western。
4. 因为我们自己做很多Human sample，所以当了两年的clinical study coordinator
，基本了解protocol的writing和申报IRB的东西。
现在想转一个好找工业界工作的方向，跪求... 阅读全帖 |
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w**********g
发帖数: 1985 | 30 南京大学miRNA理论颠覆转基因安全神话,引世界轰动!
核心提示：南京大学张辰宇教授课题组一项非常令人惊奇的发现——植物的微小核糖核
酸（microRNA）可以通过日常食物摄取的方式进入人体血液和组织器官。并且,一旦进
入体内,它们将通过调控人体内靶基因表达的方式影响人体的生理功能,进而发挥生物学
作用.南京大学的miRNA理论发表以后引起世界极大关注，美国老牌权威杂志《大西洋月
刊》不得不发出惊呼：转基因食品确实具有非常真实的危险，会给人类的健康带来麻烦！
这回真的是“麻烦大了”，因为转基因的生物被人类做了手脚后，牵一发会动全身，那
么复杂的一个巨大系统，往里面插几个基因，算是“已知”的改动，会不会因此多了或
者少了几个microRNA？在新知的微小核糖核酸面前，转基因食品的安全性是不可能有保
证的，因为干转基因、测转基因的那一套“严格的”规定，根本就没有考虑微小核糖核
酸。而肆意生产销售的转基因食品饲料对动物的杀伤力，已经被一再地证明了。那个只
能骗骗傻子和官员的“小鼠7天灌胃”实验，无疑已经永远钉在中国科技史的耻辱柱上
了！
转基因毒蛋白进入人体血液的机理，终于被揭开了!
附文一... 阅读全帖 |
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y********g
发帖数: 22 | 31 结构生物学有啥用？就好像问学建筑有啥用，不就是把转头水泥钢筋堆起来吗。
问搞定向爆破的有啥用，随便放个炮不就行了。
问拷起来的找钥匙干吗，就一直背着手呆着好了，或者等它锈掉断掉。
设想没有DNA双螺旋结构的解析，现代分子生物学不知道要推迟多久？它的应用像DNA侦
测罪犯，亲子鉴定也不会有吧。
蛋白结构用处应该不少吧，结构是功能的基础吗。至少可以看看分子，病毒，细胞，组
织是由什么堆起来的。要是有个蛋白变异了可能框框就堆不起来了，镰刀形红细胞是咋
回事？疯牛病是咋整的？
堆好了框框里还得有东东可以动啊，要不像汽车没轮子。你动一哈胳膊就要烧肱二头肌
里的葡萄糖，烧它要氧气，不然你马上变酸了，为啥氧气好好的在肺里要跑肌肉里去，
回答这个问题的需要结构生物开端鼻祖们做的两个蛋白：血红蛋白和肌红蛋白的结构提
示的信息。
现在结构做烂了，弄个漂亮的图发个好文章都背离了初衷。反倒工业界还实在点，我就
死磕结构搞个药出来，谁说结构没用？有没有? |
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B*D
发帖数: 5016 | 32 从北朝转的
http://www.cctvdream.com.cn/bbs/forum.php?mod=viewthread&tid=51
ge%3D1
注：由于之前实验室有同事认为本文对之前实验室的研究细节有泄密嫌疑，因此文章做
了删节处理。当然，公开发表的文献懂行的读者能猜出这些此处已删除的背面都是什么
，就请大家给个面子，不要人肉了。前面一段主要是让大家直观了解一下现代尖端生物
研究中上下游的长度，QA，QC的复杂性和研发技术平台的长期性。花十年，2-3代博士生
打造世界一流技术平台的艰辛，真的很不容易。这也从一个侧面阐述了“引进即落后，
追也追不上”的怪圈的产生原因，并通过一个例子来讲述怎样打破怪圈，建立世界一流
技术平台。
小议生物学研究中的技术平台的作用
上个月，我以前的实验室（后文为了描述方便，称为北大实验室）发表了一篇Cell的封
面文章，这是一个非常难得的成果。关系挺铁的哥们发了好文章，让人激动不已。关于
这篇文章的科学意义，Cell有专文评述，网上也有很多文章讨论，这里就不多谈了。笔
者特别欣慰的是，这篇文章标志着北大实验室相关技术平台达到世界一流水平。这个技
术平... 阅读全帖 |
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n******e
发帖数: 110 | 33 谢谢指点。收藏了！
不过现在比较疑惑的问题是，这个比较蛋白在肿瘤和正常组织的表达那种方法合理：
是比较在一样的总蛋白中的表达量，还是通过一些house keeping基因的蛋白作为参照
来上样。
在培养的细胞中，这两种方法可能会比较一致。可在临床组织里，至少在我买到的两组
样品里差异还是很大的。这个在你的这篇文献里也有表现。
主要是样品太贵了，目标蛋白本身含量就少，要再去normalize，太费了。要不就不这
么纠结了。 |
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g*****n
发帖数: 241 | 34 我最近在比较C. elegans不同的突变体里的两个蛋白表达量的变化，结果总是重复性不
好。
1：我预测蛋白A在某个突变体里表达量增加，用了两组biological repeats，都很明显
。但因为actin量不一样（mutant比wt 的actin少5倍，但蛋白A的量反而还高一些），
我就重新调整了上样量想做个好看的图(technical repeats)，结果调整了之后反而A的
增加没有那么明显了，只是略微增高。
2：蛋白B我预测也是在突变体里增加，做了一遍WB很明显，然后做了两个不同的
biological repeats，结果变成了几乎没有变化。
我现在纠结的是到底是我WB的技术环节出了问题，还是由于其他什么原因？我觉得1和2
很可能属于不同的原因。
PS：我用来做比较的WB条带没有饱和。
谢谢大家 |
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e*******6
发帖数: 72 | 35 公司简介：
安必奇生物科技有限公司是一家新兴的生物产品研发服务的公司，成立于2005年，总部
Creative Dynamics 位于美国纽约州，是一家创新型企业。公司依托深厚的国际资源背
景、经验丰富的留美科研人员致力于生物产品和化学产品的研发服务，在北京、天津、
成都、西安、兰州均设立有子公司，并继续在全国各地（如上海、武汉等城市）兴建子
公司，最终做到公司布局全国化。公司坚持以美国总公司为主导，子公司专业经营的联
合运营体系作为公司高效运营的组织基础，经过几年的不懈努力，公司已初具规模，目
前已为300多家国际领先的制药公司和科研机构提供产品和服务，客户遍布欧美、日本
、新加坡等各个国家，我们奋斗的目标是创立自己的企业品牌，成为全球知名药企。
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分子... 阅读全帖 |
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C*******e
发帖数: 4348 | 36 刚从一个会议回来
有个talk就像放了一颗卫星一样引起大家广泛关注和讨论
不知道版上有没有讨论过
写下来和大家分享哈
就是斯坦福搞了个超级强大的Free Electron Laser
"ultra fast",大概3-60 fs
"extreme high intensity"，差不多是目前第三代Synchrotron的10^12倍(十的十二次方)
Linear的，占地小
最神奇的是Arizona State一个组用这个超级高能的Laser做蛋白结晶的衍射
不仅能收集到衍射pattern
而且居然没有 crystal damage
最最神奇的是，不需要大的蛋白晶体了
都用的nm scale的，大概只有几百个分子的，肉眼看不到的晶体
全部全自动，用auto sampler上样
不需要在cryo-protect，不要mount，不用rotate。。。。
甚至可以遥控的搜集数据
但是数据量非常之大，大到必须要考到硬盘上寄走，无法直接联网下载
talk之后传统搞结构的纷纷喜忧参半
因为大概十年内大家都会开始用这种方法得到蛋白结晶的衍射数据
不用再长很大的晶体会使解构容易不止十倍
以前学的各种t |
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C*******e
发帖数: 4348 | 37 是啊，其实这个Free Electron Laser在2006年就建了
我一会儿贴个图上去，是第一个用FEL衍射然后“解构”的一张图片，是发表在2006年
的Nature
Physics上的
给talk的那个组就要发Science文章了，他们是第一个用这个FEL搞蛋白结构的
一开始没有任何一个组织愿意给他们资助
因为没有人相信这么大的能量下蛋白不会被摧毁，
没有人能相信他们能拿到衍射数据
现在嘛，$$$$滚滚而来啊～
而且可以说是将会彻底改变蛋白结晶的现状 |
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r********g
发帖数: 109 | 38 你用免疫荧光检查的，不就是你的目标蛋白聚集吗？你是怀疑抗体吗？还要分析什么组
分？我觉得重要的是要把该蛋白的聚集和功能联系起来啊。
还有，你确定这种聚集是特异的吗？有没有看其它类似膜蛋白在受到同样刺激后也
聚集？ |
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j****x
发帖数: 1704 | 39 其实做global docking的目的之一，就是根据具体结果来判断是否存在decent
physical interaction，这也是每年CAPRI(Critical Assessment of Predicted
Interactions)竞赛项目的核心任务。有兴趣的话可以去参考一下近几年的报告。
当然也有不依赖于结构的相互作用预测方法了，比如单纯基于一维序列分析的，基于
domain interaction mining的，再有就是基于所谓系统生物学整合分析的各种经典
PPIP方法，用来解决你所说的“有”或“无”的问题。这个领域是早年生物信息学的最
热点方向之一，不过随着多种便捷/高通量实验方法的规模化运用及大规模数据的产生
，这个领域逐渐走入数据挖掘的路线。但是这里所指的interaction，往往并不单纯局
限于physical interaction。
楼主当然也可以首先通过这些经典的PPIP方法来判断是否存在相互作用，但无论这部分
结果如何，想进一步通过已知的蛋白精细结构来辅助结果阐释，docking都是必经之路
了。当然我个人也认为离开实验依据的docking很难有真... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 40 1. 可以
2. 你提的问题是存在的，但是现在蛋白组的覆盖率已经很高了，通常覆盖几千个蛋白
不成问题，但极低丰度的蛋白仍然难以被检测。
3. 基于同位素标记的手段最准确，非标记定量也有很多人在用了。通常有一些
normalization的手段，直接看信号强度不太准确。 |
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i****f
发帖数: 473 | 41 G蛋白偶联受体是药物研发中最广泛应用的成功药靶，作用于G蛋白偶联受体的药物对疼痛
、认知障碍、高血压、胃溃疡、鼻炎和哮喘等各类疾病具有良好的治疗作用。目前临床上
使用的约500种药物中，有30％以上以调节G蛋白偶联受体功能为靶标。
长期以来，人们一直认为β抑制因子仅仅是一个调节受体信号的细胞浆蛋白质，它的作用
是抑制受体。复旦大学马兰教授领衔的课题组与中科院上海生命科学研究院裴钢院士领衔
的课题组，经过长达4年的联合研究，最终发现β抑制因子能够直接进入细胞核，引起染
色质重构并诱导药物靶基因的激活，从而对细胞功能产生长期的调节作用。
然而并不知道β-arrestin 1进入核以后如何发挥作用。此次研究发现，β-arrestin 1进
入细胞核后，有选择性富集于一些具有特殊启动子的基因前，如P27, C-fos，从而增强组
蛋白乙酰化转移酶P300，最终促进这些基因的转录。这一研究首次证明了，β-arrestin
1扮演了GPCR信号从胞浆到细胞核的浆-核信使（cytoplasm-nucleus messenger ），同时
阐明了GPCR信号从胞膜--胞浆--胞核的信号传递的机制。
马 |
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j********e
发帖数: 1187 | 42 本来读完之后觉得终于可以名正言顺的成为肉食动物了。直接就把米饭戒了，大口吃肉
一个多月。这几天手痒把原文献下载了看看，发现NT的作者不是科盲就是故意在误导读
者。
第一，参加人员50%是黑人，平均体重97公斤，平均腰围110厘米，平均BMI 35。
第二，完全不是想吃多少就吃多少。参加人员每日热量的摄入从之前的2000大卡减少到
了平均1500大卡以下。
第三，低脂肪组的的热量摄入比低碳水组在不同时期平均高了80-150大卡。
第四，尽管低碳水组的饱和脂肪摄入百分比超过了推荐值，但实际上摄入量还是比他们
之前的低了20%左右。
一堆200斤的大胖子，每天吃到1500卡以下，过了一年平均减去了大约12磅的体重，低
脂肪组更是只减少了大约5磅。这说明喝凉水都长胖完全是可能的。研究人员不该看看
自己的数据采集哪里有遗漏么。我想最有可能是参与人员偷偷吃东西了，但还是想完成
实验，应该有钱拿吧。
另外尽管有饮食建议，低脂肪组的蛋白质摄入量还是显著地比低碳水组的低大约20%。
这也算实验设计的一个纰漏吧。有可能低脂肪组蛋白摄入够了后可以减少lean mass的
降低，从而更增加fat的减少。 |
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j****u
发帖数: 1413 | 43 请见：http://www.ustcif.org/default.php/content/2796/
2015年12月19日晚，中国科大生命学院拜会新创基金会并商定：2016年1月26-31日将在
上海推出“生命医学健康行业精英冬令营”。届时将邀请10-20位生命科学、医学与健
康行业领袖开设集中课程，为生院本科生讲述行业前景，并树立职业视野与雄心。
说明：以上课程向上海等地校友开放。
缘起：中国科大生命学院几十年来吸引了一批中国最卓越生源，但部分学生进校后并不
了解学术界之外的工业界的广阔机遇。2014年，新创基金会推出《生命学院校友去哪儿
？中国科大生命科学学院校友职业发展与分布研究》，量化生命科学学院毕业生的职业
发展状况，并期望启发学生职业规划。
为进一步解决生命科学学生的职业困惑，生命学院与新创基金会讨论通过“国内游学计
划，1）邀请行业领袖到中国科大本部开设Distinguished Industry Lecture Series。
2）更进一步：能否在京沪分别推出夏令营与冬令营，就地要求工业界领袖为中国科大
学生开设一周左右的短训课程，辅以参观著名创业公司与外企。
尽管时... 阅读全帖 |
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s*k
发帖数: 144 | 44 外行诹几句，您老将就看吧。
一般chromosome condensation 是在该段染色体不活跃的时候。
所谓不活跃就是该段DNA暂时不需要作为模板去生成对应的RNA
(这个过程叫transcription)或复制出另外的双链DNA的时候。
一般认为与大范围的基因表达调控有关。在细胞分裂前也要
condense, 这是最明显最广泛的condensation, 主要作用是让
乱丝样的DNA收紧一些，绕成个大线团，别在染色体分家的过程中
挂上谁。
这事参与的东东不少,用手指头再加脚趾头大概是点不清它们。
至少有些是与组蛋白(就是被DNA缠在身上的那一组蛋白)的磷酸化有关。
对了，教主，什么时候您能给大家科普一下热力学呀？ |
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Z******5
发帖数: 435 | 45 1）However, I do not know 聚合酶2的峰值位置，组蛋白修饰，转录因子结合?
A.这个说起来比较复杂。
a. 和转录起始位置相关的一些组蛋白修饰看这篇文献 The mammalian epigenome.
Cell. 2007 Feb 23;128(4):669-81.
b. 聚合酶2的我忘了哪篇文献了，不过很好理解，基因的转录肯定需要聚合酶2的
结合，自然就会有聚合酶2的结合ChIP数据。你可以去UCSC随便找几个熟悉的基因看看
，比如GAPDH等。
c. 转录因子的ChIP在UCSC genome browser上的数据是有限的，现在已经有几十个
转录因子了吧，这个只是参考。还是那句话，找个你熟悉的基因，看看周围的结合情况
就知道了。
d. 再提一下RIKEN的问题，你可以参考下面几篇文献
Cap analysis gene expression for high-throughput analysis of
transcriptional starting point and identification of... 阅读全帖 |
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d********l
发帖数: 293 | 46 俺是做膜蛋白结构的，想找个组做博士后。可惜俺对美国的情况了解很少。
看了这里的很多帖子，深感碰上不好的老板简直生不如死。。。
想试试下面的几个组，但是不知道老板为人如何。还请高人指点，不胜感激。
Douglas Rees @ caltech
Eric Gouaux @ vollum
Christopher Miller @ brandeis |
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d********l
发帖数: 293 | 47 谢谢楼上的回复。
push也就罢了，组内竞争就没什么意思了，不喜欢这种气氛。
大家还能推荐一些做膜蛋白比较好的组么 |
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t**d
发帖数: 52 | 48 这种方法可行吗？比如观察p38的磷酸化，用p-P38 Ab做免疫组化？，但我研究的蛋白
的磷酸化抗体都是针对某一磷酸化位点的，例如p-Tyr,通常用来IP的，如果做组化，假
阳性一堆 |
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h******u
发帖数: 602 | 49 用石蜡切片。
以前做免疫组化检测某蛋白在肿瘤中表达的时候，正常组织和肿瘤组织相近，在一张切
片上，因此很容易比较，染色条件肯定一样，没误差。
现在检测白血病骨髓（AML)中某蛋白表达变化，用正常的骨髓做对照，没法将他们放到
一张片子上。虽然说染色条件一样，但不同时间做的染色肯定会有差别，比如同一张片
子今天和明天染色可能就有差别。如何做能最大程度的减少这种因素呢？
谢谢了。 |
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e***o
发帖数: 344 | 50 想表达10个好的标签蛋白（如HA, FLAG, V5, GST什么的）在小鼠脑里，也可以是被二
抗识别的一抗的序列。植物里线虫果蝇什么里的抗原也可以。然后直接标记抗体做多色
的免疫
组化。要求是特异要很好。最好不太贵。谢谢。
希望各位有一手亲身经历的XDJM们多多帮助。一个好的抗原序列加上一个抗体的信息就
答谢一个包子。 |
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