s******s
发帖数: 13035 | 1 要分离DNA和蛋白。DNA去做seq, 蛋白去做MS Spec. 大家有什么好主意？
我就想到了Trizol, 不过貌似Trizol下来的蛋白很不好溶，做Ms Spec质量
很不好。有没有什么commercial的kit? 最好column based比较容易做 | c*********r
发帖数: 1312 | 2 好像Qiagen的RNA提取的试剂盒就可以，隐约记得说明书上有说把RNA binding之后的溶
液可以留着做蛋白提取。
Appendix F: Acetone Precipitation of Protein from Buffer RLT Lysates 72
http://www.google.com/url?sa=t&source=web&cd=1&sqi=2&ved=0CBMQF
不过“The precipitated, denatured protein is suitable for applications such
as SDS-PAGE, western blotting, and 2D gel electrophoresis.”不知道是否时候MS
。但PAGE之后还是可以MS的吧。
【在 s******s 的大作中提到】
: 要分离DNA和蛋白。DNA去做seq, 蛋白去做MS Spec. 大家有什么好主意？
: 我就想到了Trizol, 不过貌似Trizol下来的蛋白很不好溶，做Ms Spec质量
: 很不好。有没有什么commercial的kit? 最好column based比较容易做
| c*********r
发帖数: 1312 | 3 哦。。。没看清你说的是DNA。可能其它的DNA提取的kit也有类似的吧。。。^_^
【在 s******s 的大作中提到】
: 要分离DNA和蛋白。DNA去做seq, 蛋白去做MS Spec. 大家有什么好主意？
: 我就想到了Trizol, 不过貌似Trizol下来的蛋白很不好溶，做Ms Spec质量
: 很不好。有没有什么commercial的kit? 最好column based比较容易做
| Z******5
发帖数: 435 | 4 多搞点样品，分成两份。
一份拿DNA酶处理后，（跑双向分开？），做MS spec
另一份可以考虑按照ChIP 的protocol，用蛋白酶，RNase等处理，收集DNA。 | c******y
发帖数: 148 | 5 我上次做pull down，提完RNA之后，把第一步加trizol的EP管中的沉淀吸取出来，用氯
仿洗了下（不能完全去除酚），然后加入6M urea溶液，含些许秀芬兰，震荡，能把中
间层白色沉淀溶解，然后吸取上清，SDS胶能够检测到拉下来的蛋白（质谱结果等待中）
你可以参考下这个方法 |
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