s******y 发帖数: 28562 | 1 SHANK3 是一个神经突触里面的scaffold蛋白,
在对autism spectrum disorder 的基因筛选中常常出现。
上个月NATURE,Duke University 的Guoping Feng实验室报告他们在老鼠中
KO这个基因后,发现老鼠出现行为异常,喜欢躲在角落里,不爱和新老鼠交往。
而且特别喜欢梳理自己的毛。解剖证据认为该老鼠大脑纹状体的突触有异常,
和人类的autism spectrum disorder的病理症状类似。
http://www.nature.com/nature/journal/v472/n7344/full/nature0996 |
s*********y 发帖数: 1189 | 2 Feng moved to MIT last year.
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : SHANK3 是一个神经突触里面的scaffold蛋白, : 在对autism spectrum disorder 的基因筛选中常常出现。 : 上个月NATURE,Duke University 的Guoping Feng实验室报告他们在老鼠中 : KO这个基因后,发现老鼠出现行为异常,喜欢躲在角落里,不爱和新老鼠交往。 : 而且特别喜欢梳理自己的毛。解剖证据认为该老鼠大脑纹状体的突触有异常, : 和人类的autism spectrum disorder的病理症状类似。 : http://www.nature.com/nature/journal/v472/n7344/full/nature0996
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s*********y 发帖数: 1189 | 3 Feng moved to MIT last year.
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : SHANK3 是一个神经突触里面的scaffold蛋白, : 在对autism spectrum disorder 的基因筛选中常常出现。 : 上个月NATURE,Duke University 的Guoping Feng实验室报告他们在老鼠中 : KO这个基因后,发现老鼠出现行为异常,喜欢躲在角落里,不爱和新老鼠交往。 : 而且特别喜欢梳理自己的毛。解剖证据认为该老鼠大脑纹状体的突触有异常, : 和人类的autism spectrum disorder的病理症状类似。 : http://www.nature.com/nature/journal/v472/n7344/full/nature0996
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j*****d 发帖数: 787 | 4 看来你很有兴趣move到neuroscience
鼓掌
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : SHANK3 是一个神经突触里面的scaffold蛋白, : 在对autism spectrum disorder 的基因筛选中常常出现。 : 上个月NATURE,Duke University 的Guoping Feng实验室报告他们在老鼠中 : KO这个基因后,发现老鼠出现行为异常,喜欢躲在角落里,不爱和新老鼠交往。 : 而且特别喜欢梳理自己的毛。解剖证据认为该老鼠大脑纹状体的突触有异常, : 和人类的autism spectrum disorder的病理症状类似。 : http://www.nature.com/nature/journal/v472/n7344/full/nature0996
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b****y 发帖数: 105 | 5 这种文章特别无聊,很鸡肋
WT.ec_id=NATURE-20110428
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : SHANK3 是一个神经突触里面的scaffold蛋白, : 在对autism spectrum disorder 的基因筛选中常常出现。 : 上个月NATURE,Duke University 的Guoping Feng实验室报告他们在老鼠中 : KO这个基因后,发现老鼠出现行为异常,喜欢躲在角落里,不爱和新老鼠交往。 : 而且特别喜欢梳理自己的毛。解剖证据认为该老鼠大脑纹状体的突触有异常, : 和人类的autism spectrum disorder的病理症状类似。 : http://www.nature.com/nature/journal/v472/n7344/full/nature0996
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j*****d 发帖数: 787 | 6 哈哈。乐死了。人家要动物模型吧
自己补充性地再了解了一些,很多独立性工作哦
https://sfari.org/current-grant-recipients/-/asset_publisher/Qv9z/content/
the-role-of-shank3-in-autism-spectrum-disorders?redirect=%2Fcurrent-grant-
recipients
The role of SHANK3 in autism spectrum disorders
Mount Sinai School of Medicine
The relationship between genetics and autism is not always straightforward,
but some autism spectrum disorders are known to be caused by defects in a
single gene. These simpler cases give researchers the opportunity to create
animal models with the genetic defect and use them to test hypotheses about
the mechanisms at work in autism.
SHANK3 encodes a protein that is essential for communication between neurons
. Disruptions in the SHANK3 gene have been shown to lead to autism. Joseph
Buxbaum of the Mount Sinai School of Medicine and his colleagues have
created a mouse model with a similar disruption in SHANK3. The researchers
plan to use this model to test their hypothesis that interfering with the
expression of SHANK3 disrupts the connections between neurons, leading to
overall developmental delays that ultimately result in autism.
A team of four laboratories will use this mouse model to study autism from a
variety of perspectives. The Buxbaum laboratory is studying the regulation
and biochemical properties of SHANK3. Patrick Hof is looking at changes in
the morphology and distribution of neurotransmitter receptors in neurons
brought on by disrupting SHANK3. Qiang Zhou aims to record electrical
currents from the mouse neurons, a measure of their function, and
investigate whether neuronal communication is abnormal in the mice. Finally,
Jacqueline Crawley at the National Institute of Mental Health plans to
evaluate the ability of the mice to learn and to interact socially,
behaviors that are analogous to those altered in people with autism. The
researchers hope this multi-pronged approach will provide a well-rounded
understanding of the role of SHANK3 — and neurotransmitter biology in
general — in the development of autism.
So far in their studies of the SHANK3 model mice, the group has observed
reduced expression of glutamate receptors and accompanying deficits in
synaptic plasticity — the ability of connections between neurons to change
in strength, which is thought to underlie processes such as learning and
memory. The deficits in plasticity are reflected in both eletrophysiological
and structural abnormalities. These findings point to the possibility that
glutamate receptors represent therapeutic targets in autism.
【在 b****y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 这种文章特别无聊,很鸡肋 : : WT.ec_id=NATURE-20110428
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s******y 发帖数: 28562 | 7 我对神经和脑一直很有兴趣,只是还没有机会涉及。。。
这篇文章证实了领域里面用基因做出来的证据,算是autism field很重要的
一篇文章吧。
当然,这个文章所用的技术没有什么好评论的,各个方面的结果也比较在意料之中,
也许这是为什么大家对此都不感兴趣的原因?
【在 j*****d 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 看来你很有兴趣move到neuroscience : 鼓掌
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c******r 发帖数: 3778 | 8 这有什么?新技术可能带来新知识,但是老技术一样可以带来新知识啊。
这篇文章不错,至少对这个field是里程碑式的,一次证明基因的改变真正可能是
autism的根本原因。
下面可能需要从临床上找找患者中有没有这个基因的loss of function。
然后就是一大堆postdoc继续发现更多的基因和autism有关。
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 我对神经和脑一直很有兴趣,只是还没有机会涉及。。。 : 这篇文章证实了领域里面用基因做出来的证据,算是autism field很重要的 : 一篇文章吧。 : 当然,这个文章所用的技术没有什么好评论的,各个方面的结果也比较在意料之中, : 也许这是为什么大家对此都不感兴趣的原因?
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s******y 发帖数: 28562 | 9 我倒是觉得应该看看这个蛋白的功能是怎么调控的,
因为很多真正的患者其实并没有这个蛋白的缺失或者基因变异。
我其实对代谢和基因调控的关系非常感兴趣。
不过。。。还是一直没有机会进入。。。以后独立后可能会作一些有关事情,
如果能弄到钱的话。
【在 c******r 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 这有什么?新技术可能带来新知识,但是老技术一样可以带来新知识啊。 : 这篇文章不错,至少对这个field是里程碑式的,一次证明基因的改变真正可能是 : autism的根本原因。 : 下面可能需要从临床上找找患者中有没有这个基因的loss of function。 : 然后就是一大堆postdoc继续发现更多的基因和autism有关。
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c******r 发帖数: 3778 | 10 绝对的啊
这东西一发现,可以搞的事情太多了。还有一堆homolog,还有整个pathway,从
transcription到function,可搞的东东太多了,都是cns的前途。。。
所以才是里程碑呢。
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 我倒是觉得应该看看这个蛋白的功能是怎么调控的, : 因为很多真正的患者其实并没有这个蛋白的缺失或者基因变异。 : 我其实对代谢和基因调控的关系非常感兴趣。 : 不过。。。还是一直没有机会进入。。。以后独立后可能会作一些有关事情, : 如果能弄到钱的话。
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j*****d 发帖数: 787 | 11 个人感觉算不上太意外
饶毅都证明了基因本突变改变性倾向
动物模型太重要了,别人重复你的东西也有一个平台了,而且是sustainable的
这几天的ARVO回忆有三个特点:imaging, stem cell/progenitor cell/cell
replacement/gene replacement,最后一个就是动物疾病模型指数增加。
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 我对神经和脑一直很有兴趣,只是还没有机会涉及。。。 : 这篇文章证实了领域里面用基因做出来的证据,算是autism field很重要的 : 一篇文章吧。 : 当然,这个文章所用的技术没有什么好评论的,各个方面的结果也比较在意料之中, : 也许这是为什么大家对此都不感兴趣的原因?
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b****y 发帖数: 105 | 12 这就里程碑式的了?
你pubmed一下 mouse model autism spectrum disorder
有人做的细致有人做的粗而以
ASD病人那么多可能的基因突变,很多都可以做出一个老鼠然后说有点像autism病人
要说基因和神经疾病相关最好的,现在估计就是MeCP2了,和Rett Syndrome的关系那叫一个好
【在 c******r 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 这有什么?新技术可能带来新知识,但是老技术一样可以带来新知识啊。 : 这篇文章不错,至少对这个field是里程碑式的,一次证明基因的改变真正可能是 : autism的根本原因。 : 下面可能需要从临床上找找患者中有没有这个基因的loss of function。 : 然后就是一大堆postdoc继续发现更多的基因和autism有关。
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b****y 发帖数: 105 | 13 别太激动了,shank3和autism的关系又不是他们发现的
再说了,人类病人里,shank3突变的也就1%,还赶不上pten突变的多呢
【在 c******r 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 绝对的啊 : 这东西一发现,可以搞的事情太多了。还有一堆homolog,还有整个pathway,从 : transcription到function,可搞的东东太多了,都是cns的前途。。。 : 所以才是里程碑呢。
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h*******o 发帖数: 4884 | 14 还有APP和PS1 对familial AD
autosomal dominant
呵呵
叫一个好
【在 b****y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 这就里程碑式的了? : 你pubmed一下 mouse model autism spectrum disorder : 有人做的细致有人做的粗而以 : ASD病人那么多可能的基因突变,很多都可以做出一个老鼠然后说有点像autism病人 : 要说基因和神经疾病相关最好的,现在估计就是MeCP2了,和Rett Syndrome的关系那叫一个好
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c******r 发帖数: 3778 | 15 呵呵,肯定啊,肯定还有不少其他基因。明显的,人类的autism不少一个病,不是
spectrum嘛。大多数oncogene或者tumor suppressor都是只有百分之几而已,但是对人
类的认识而言,1%就可以是里程碑了。
可不能跟pten比,要说pten可是养活了。。。几千人吧?
过去对autism就是比较迷惑,原因不清楚。很多证据指向这个基因问题,但是证据不足
。这个贡献不是他们做的。但是现在这个老鼠算一个比较强的证据,这样以后有了方向
,更多的autism genes会被发现,功能会了解。也许干预的药物也可以发现。这个文章
对整个领域的影响还是显而易见的。
【在 b****y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 别太激动了,shank3和autism的关系又不是他们发现的 : 再说了,人类病人里,shank3突变的也就1%,还赶不上pten突变的多呢
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c******r 发帖数: 3778 | 16 我不熟悉autism,呵呵,就是看着第一个有phenotype的knockout,应该比较重要?
【在 h*******o 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 还有APP和PS1 对familial AD : autosomal dominant : 呵呵 : : 叫一个好
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b****y 发帖数: 105 | 17 都说了这不是第一个有phenotype的knockout
当然,你有热情是好事
【在 c******r 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 我不熟悉autism,呵呵,就是看着第一个有phenotype的knockout,应该比较重要?
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s******y 发帖数: 28562 | 18 这个,虽然我并不是专业做这个autism的,但是我也必须指出说,
临床数据里面的关于基因和疾病的关系一般不能作为直接证据的,顶多只能说是
有关联。在老鼠里面作敲除或者其他处理才是比较直接的证据之一。
这篇文章的意义(我认为是相当重要的意义)就是给领域里面的人往下追踪
这个蛋白提供了一个非常重要的支持证据
另外,虽然人类autism 疾病里面直接含有这个shank3突变的人其实很少,
但是考虑到其他的一些突变可能是通过这个途径的来起作用的,还有很多
非基因型的因素(比方说heat shock, chemical stress etc) 可以在不依赖于
突变的情况下影响到基因的表型,其实在真实意义上这个shank3 所包含的case
的比例可能远远大于这个1%。
如果我是这个领域里面的话,下一步更重要的做法就是把这个shank3 进行
inducible KO, or stage-specific KO, 看看这个蛋白是否真的在幼年时候
大脑发育的时候起作用。因为大部分autism 病人出现症状的时期都是幼年期,
在青春期之前。
【在 b****y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 别太激动了,shank3和autism的关系又不是他们发现的 : 再说了,人类病人里,shank3突变的也就1%,还赶不上pten突变的多呢
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s******y 发帖数: 28562 | 19 愿闻其详。
能不能介绍另外几个有比较明确phenotype 的突变? 谢谢!
【在 b****y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 都说了这不是第一个有phenotype的knockout : 当然,你有热情是好事
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c******r 发帖数: 3778 | 20 我有灌水的热情,呵呵
【在 b****y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 都说了这不是第一个有phenotype的knockout : 当然,你有热情是好事
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j**e 发帖数: 582 | 21 I don't think in human amilial AD, it is 100% caused by mutation of APP和PS1.
Another good example is Huntington Disease, 100% of human patients have
huntingtin gene mutation.
【在 h*******o 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 还有APP和PS1 对familial AD : autosomal dominant : 呵呵 : : 叫一个好
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h*******o 发帖数: 4884 | 22 In familial but not sporadic AD, APP and PS is 100% autosomal dominant.
It could be either APP or PS1, I haven't heard of any case where both APP
and PS1 mutation were identified.
A transgenic/knockin/out mouse model is a good research tool, but could
tweak the research too much for therapeutic development to focus on a sub-
optimal target. This is particularly true for diseases with unknown/
unidentified etiology.
I am not familiar with autism, but I think both sporadic AD and autism
belong to that category. Focus on one gene could have devastating impact on
therapeutic development since the majority of the diseases cannot be
attributed to a single gene.
PS1.
【在 j**e 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : I don't think in human amilial AD, it is 100% caused by mutation of APP和PS1. : Another good example is Huntington Disease, 100% of human patients have : huntingtin gene mutation.
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m****t 发帖数: 89 | 23 发泄一下。我们实验室最近的一个工作发现某个蛋白质的过量表达能让小鼠产生所有临
床定义的autism的症状,包括这篇shank3没有观察到的reduced vocalization。与
shank3类似,过量表达此蛋白也导致兴奋性突触传递的降低。
我们于去年6月投Nature,比shank3这篇文章还早三个月。其中一个reviewer要我们补
很多实验,有些其实很没有必要。我们花了近4个月时间把审稿
人要求的实验全做了。Resubmission后所有的reviewers都很positive,包括这个要我
们补很多试验的。编辑要我们再作一些小修改,让我们在4个星期内修改完毕。当时我
们都觉得这篇文章就要被接收了。
但我们再次修改后,这个要求我们补很多实验的突然转变态度,说我们用的BAC有一pseudogene,
这些症状有可能是这个pseudogene造成的。但我们做的transgenic小鼠中有把我们研究的蛋白失
活的,过量表达失活蛋白是没有autism相关症状的。这个reviewer一定要我们再做一个
transgenic老鼠把这个pseudogene去掉。然后editor说按照Nature的guideline,所有的
reviewers都必需同意发表,我们的论文才能被接收,于是把我们的文章给据了.
NND,既然要据,为什么开始要我们补实验拖了我们6个月。这篇shank3出来后我们老板
整个抓狂了,原来拖我们是为了这篇文章能顺利发表啊。实验室小就是被人欺负。所以
大家能去学霸实验室就一定要去,至少发文会顺利一些。
WT.ec_id=NATURE-20110428
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : SHANK3 是一个神经突触里面的scaffold蛋白, : 在对autism spectrum disorder 的基因筛选中常常出现。 : 上个月NATURE,Duke University 的Guoping Feng实验室报告他们在老鼠中 : KO这个基因后,发现老鼠出现行为异常,喜欢躲在角落里,不爱和新老鼠交往。 : 而且特别喜欢梳理自己的毛。解剖证据认为该老鼠大脑纹状体的突触有异常, : 和人类的autism spectrum disorder的病理症状类似。 : http://www.nature.com/nature/journal/v472/n7344/full/nature0996
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s******y 发帖数: 28562 | 24 很抱歉听到这个。。。
我觉得Nature 主编其实是在欺负你们。
能不能换到Cell? Or Nature Medicine?
【在 m****t 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 发泄一下。我们实验室最近的一个工作发现某个蛋白质的过量表达能让小鼠产生所有临 : 床定义的autism的症状,包括这篇shank3没有观察到的reduced vocalization。与 : shank3类似,过量表达此蛋白也导致兴奋性突触传递的降低。 : 我们于去年6月投Nature,比shank3这篇文章还早三个月。其中一个reviewer要我们补 : 很多实验,有些其实很没有必要。我们花了近4个月时间把审稿 : 人要求的实验全做了。Resubmission后所有的reviewers都很positive,包括这个要我 : 们补很多试验的。编辑要我们再作一些小修改,让我们在4个星期内修改完毕。当时我 : 们都觉得这篇文章就要被接收了。 : 但我们再次修改后,这个要求我们补很多实验的突然转变态度,说我们用的BAC有一pseudogene, : 这些症状有可能是这个pseudogene造成的。但我们做的transgenic小鼠中有把我们研究的蛋白失
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b****y 发帖数: 105 | 25 你这些说的都对。把shank3换成其他任何一个和autism相关的基因,这套说法都成立。
不是说这篇文章不重要,只是说这并不是一个多么激动人心的发现。shank3和autism的
关系在很多
研究里都非常明确了,这篇文章就是说我把这个老鼠做出来了。这个很牛吗?这篇文章
不出来,大家
也不会说不往下研究shank3的作用。
Guoping Feng本来就是做老鼠出身。channelrhodopsin刚出来的时候,他赶快拿来做个
个老
鼠,发了个neuron。你说有用吗,当然有用。你说有多牛呢?里程碑式的意义?类似的
文章很多。
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 这个,虽然我并不是专业做这个autism的,但是我也必须指出说, : 临床数据里面的关于基因和疾病的关系一般不能作为直接证据的,顶多只能说是 : 有关联。在老鼠里面作敲除或者其他处理才是比较直接的证据之一。 : 这篇文章的意义(我认为是相当重要的意义)就是给领域里面的人往下追踪 : 这个蛋白提供了一个非常重要的支持证据 : 另外,虽然人类autism 疾病里面直接含有这个shank3突变的人其实很少, : 但是考虑到其他的一些突变可能是通过这个途径的来起作用的,还有很多 : 非基因型的因素(比方说heat shock, chemical stress etc) 可以在不依赖于 : 突变的情况下影响到基因的表型,其实在真实意义上这个shank3 所包含的case : 的比例可能远远大于这个1%。
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p*****m 发帖数: 7030 | 26 现在有几个领域里都是一堆一堆这样的文章 channelrhodopsin最甚 呵呵
【在 b****y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 你这些说的都对。把shank3换成其他任何一个和autism相关的基因,这套说法都成立。 : 不是说这篇文章不重要,只是说这并不是一个多么激动人心的发现。shank3和autism的 : 关系在很多 : 研究里都非常明确了,这篇文章就是说我把这个老鼠做出来了。这个很牛吗?这篇文章 : 不出来,大家 : 也不会说不往下研究shank3的作用。 : Guoping Feng本来就是做老鼠出身。channelrhodopsin刚出来的时候,他赶快拿来做个 : 个老 : 鼠,发了个neuron。你说有用吗,当然有用。你说有多牛呢?里程碑式的意义?类似的 : 文章很多。
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b****y 发帖数: 105 | 27 自己搜 MeCP2 Rett Syndrome
autism的animal model也不是一个两个了,搜autism animal model,很多review
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 愿闻其详。 : 能不能介绍另外几个有比较明确phenotype 的突变? 谢谢!
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p*****m 发帖数: 7030 | 28 既然你是autism内行 我问你个问题哈 既然现在也有几个behavior还不错得model 那为
什么没什么人用这些model筛autism药?或者至少我是没看到反正
review
【在 b****y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 自己搜 MeCP2 Rett Syndrome : autism的animal model也不是一个两个了,搜autism animal model,很多review
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s******y 发帖数: 28562 | 29 在得到更多临床证据之前,用老鼠模型来筛药在逻辑上是有问题的。
【在 p*****m 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 既然你是autism内行 我问你个问题哈 既然现在也有几个behavior还不错得model 那为 : 什么没什么人用这些model筛autism药?或者至少我是没看到反正 : : review
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p*****m 发帖数: 7030 | 30 呵呵 药厂筛的无厘头药太多了 不说别的 用BACE inhibitor来做AD drug这个逻辑上说
的过去么?
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 在得到更多临床证据之前,用老鼠模型来筛药在逻辑上是有问题的。
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b****y 发帖数: 105 | 31 呵呵,我可不是autism的内行。。。
我没仔细了解过药物的筛选。autism这类疾病主要的表现都是从行为学上来看,可能这
样的话不太容易
high throughput吧。target和readout都不是太明确。
要说筛选药物,也不是没有,mit的Mark Bear不就是号称在筛选治疗fragileX
syndrome的药物
嘛。他就觉得target mGluR mediated LTD就是最重要的,什么都能治。。。可是搞笑
的是,他弄
的公司针对mGluR<D筛了半天,最后进入clinical trial的是GABAB receptor
agonist,这
多少让我觉得。。。
【在 p*****m 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 既然你是autism内行 我问你个问题哈 既然现在也有几个behavior还不错得model 那为 : 什么没什么人用这些model筛autism药?或者至少我是没看到反正 : : review
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s******y 发帖数: 28562 | 32 啊?我怎么隐约记得有人说过Rett Syndrome 好像不算autism?
我刚才去查了一下文献, 发现最早的模型好像是在2007年用neuroligin做出来的。
现在这个用SHANK3作出来的模型,肯定是有意义的(因为正面肯定了用其他数据作
出来的结论,而且也为领域里面的研究提供了一个模型)。neuroligin 和SHANK3
是有相互作用的,所以这个有作用也不意外。
不过,你说的也对,作者是挺投机取巧的,因为这篇文章的结论比较没有
任何意料之外的结果。虽然也是一个必须作的过程,但是这么看来确实
缺乏突破性。有点像当时用iPS作老鼠胚胎的文章吧,就是大家都知道结论
应该是什么,但是谁先作出来谁就抢先发CNS那样?
另外,其实我对PTEN 在autism 里面的意义更有怀疑,因为PTEN 到处都有,
并不限于脑部,而且要产生autism 症状必须用tissue-specific KO,这个。。。
我觉得。。。在逻辑上,在同样的tissue-specific KO一个足够重要的基因,
让突触死翘翘就肯定能够获得类似的症状吧?
【在 b****y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 自己搜 MeCP2 Rett Syndrome : autism的animal model也不是一个两个了,搜autism animal model,很多review
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b****y 发帖数: 105 | 33 呵呵,pten在neuron里KO已经有人在做了。
PTEN这玩艺功能太多,估计其他oncogene在neuron里都多少有点作用。。。
要不你多搞几个在neuron里试试?
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 啊?我怎么隐约记得有人说过Rett Syndrome 好像不算autism? : 我刚才去查了一下文献, 发现最早的模型好像是在2007年用neuroligin做出来的。 : 现在这个用SHANK3作出来的模型,肯定是有意义的(因为正面肯定了用其他数据作 : 出来的结论,而且也为领域里面的研究提供了一个模型)。neuroligin 和SHANK3 : 是有相互作用的,所以这个有作用也不意外。 : 不过,你说的也对,作者是挺投机取巧的,因为这篇文章的结论比较没有 : 任何意料之外的结果。虽然也是一个必须作的过程,但是这么看来确实 : 缺乏突破性。有点像当时用iPS作老鼠胚胎的文章吧,就是大家都知道结论 : 应该是什么,但是谁先作出来谁就抢先发CNS那样? : 另外,其实我对PTEN 在autism 里面的意义更有怀疑,因为PTEN 到处都有,
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s******y 发帖数: 28562 | 34 呵呵,我就不去趟这种浑水了。
我就是查文献的时候看到有的实验室已经在做PTEN在autism里面的功能,
觉得挺纳闷的。
就像你说的那样,大部分功能特别重要的基因(那些很多都是oncogene),
在neuron 里面都肯定有功能的。
比方说我要是发个神经在纹状区把tubulin KO了,几乎也肯定能够产生
autism 症状吧?可是这么做有意义么?
SHANK3, 和Neuroligin 的意义在于他们是非常组织特异性的蛋白,
在基因上搞乱这两个蛋白后产生的形状主要集中在神经和行为上,
这个和autism 病人的特点一致。因为autism 病人主要是行为异常,
其他发育大致都还正常。
而PTEN这种蛋白,在自然情况下不管是以什么方式被搞乱(比方说基因
突变,或者mis-regulation),其表型不太可能集中在脑部,所以不太可能是
autism 的致病原因。
在这个意义上来说,我觉得对SHANK3, Neurologin等几个post-synaptic
scaffold protein 的调控,才是最有可能的autism 的致病原因。
【在 b****y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 呵呵,pten在neuron里KO已经有人在做了。 : PTEN这玩艺功能太多,估计其他oncogene在neuron里都多少有点作用。。。 : 要不你多搞几个在neuron里试试?
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a********k 发帖数: 2273 | 35 很多postsynptic蛋白的KO都做成autism了。。。有点夸张的说。
而且老鼠autism那点behavior实在也不是啥好东西。。。
关键还是human genetics证据吧,没这个啥都不是。
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 呵呵,我就不去趟这种浑水了。 : 我就是查文献的时候看到有的实验室已经在做PTEN在autism里面的功能, : 觉得挺纳闷的。 : 就像你说的那样,大部分功能特别重要的基因(那些很多都是oncogene), : 在neuron 里面都肯定有功能的。 : 比方说我要是发个神经在纹状区把tubulin KO了,几乎也肯定能够产生 : autism 症状吧?可是这么做有意义么? : SHANK3, 和Neuroligin 的意义在于他们是非常组织特异性的蛋白, : 在基因上搞乱这两个蛋白后产生的形状主要集中在神经和行为上, : 这个和autism 病人的特点一致。因为autism 病人主要是行为异常,
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O******e 发帖数: 4845 | 36 what's wrong with that?
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 在得到更多临床证据之前,用老鼠模型来筛药在逻辑上是有问题的。
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n*********b 发帖数: 140 | 37 哗众取宠.
目前Autism 的临床定义还是很含糊。遗传或突变造成的症状不一定具有代表性。
说“解剖证据认为该老鼠大脑纹状体的突触有异常,和人类的autism spectrum
disorder的病理症状类似”是在混淆视听。什么是人类的autism spectrum disorder的
解剖证据,病理症状? |
N*S 发帖数: 783 | 38 N家编辑里面,反正我们方向的那个台湾人真不怎么样。。。
pseudogene,
究的蛋白失
【在 m****t 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 发泄一下。我们实验室最近的一个工作发现某个蛋白质的过量表达能让小鼠产生所有临 : 床定义的autism的症状,包括这篇shank3没有观察到的reduced vocalization。与 : shank3类似,过量表达此蛋白也导致兴奋性突触传递的降低。 : 我们于去年6月投Nature,比shank3这篇文章还早三个月。其中一个reviewer要我们补 : 很多实验,有些其实很没有必要。我们花了近4个月时间把审稿 : 人要求的实验全做了。Resubmission后所有的reviewers都很positive,包括这个要我 : 们补很多试验的。编辑要我们再作一些小修改,让我们在4个星期内修改完毕。当时我 : 们都觉得这篇文章就要被接收了。 : 但我们再次修改后,这个要求我们补很多实验的突然转变态度,说我们用的BAC有一pseudogene, : 这些症状有可能是这个pseudogene造成的。但我们做的transgenic小鼠中有把我们研究的蛋白失
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s**2 发帖数: 1287 | 39 太贵了?
【在 O******e 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : what's wrong with that?
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s**2 发帖数: 1287 | 40 May 16
12:15 pm
Guoping Feng (Massachusetts Institute of Technology).
Title of Talk to Be Supplied Later.
HMS/CHB Neurobiology Seminar Series. Children's Hospital,
Folkman Auditorium, Enders Building, 300 Longwood Avenue, Boston. |
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b***t 发帖数: 1104 | 41 Just a few clarifications on ASD:
Clinical diagnosis of ASD is pretty clearly defined. It involves stereotyped
movement, repetitive behaviors, detachment from the environment, etc. But
remember ASD is a spectrum. The presentations vary a lot between individuals
. They don't necessarily present with the same set of symptoms.
The current belief of ASD pathology is deficits in the limbic system,
especially the amygdala. On the molecular level, regardless of intensive
research efforts, scientists have failed to identify any single gene
mutation as the cause of ASD. Now the search of genetic causes is aimed at
multiple genes additively contributing to ASD. As a matter of fact,
psychiatric genetics have so far failed on these searches as well. A lot of
published data are not reproducible.
On the note of importance of genetics in behavioral abnormalities such as
ASD, the incidence of ASD in monozygous twins is indeed very high (60-90% of
the time one twin having ASD, the other twin has it too) and it's about 6-
10% in siblings.
I'm happy to discuss this further with anyone who's interested. |
s******y 发帖数: 28562 | 42 多说点吧。我对这个题材一直很好奇
stereotyped
individuals
【在 b***t 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : Just a few clarifications on ASD: : Clinical diagnosis of ASD is pretty clearly defined. It involves stereotyped : movement, repetitive behaviors, detachment from the environment, etc. But : remember ASD is a spectrum. The presentations vary a lot between individuals : . They don't necessarily present with the same set of symptoms. : The current belief of ASD pathology is deficits in the limbic system, : especially the amygdala. On the molecular level, regardless of intensive : research efforts, scientists have failed to identify any single gene : mutation as the cause of ASD. Now the search of genetic causes is aimed at : multiple genes additively contributing to ASD. As a matter of fact,
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b***t 发帖数: 1104 | 43 What would you like to know? I'll try my best to answer your questions.
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 多说点吧。我对这个题材一直很好奇 : : stereotyped : individuals
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s******y 发帖数: 28562 | 44 首先一个就是,有没有人去追查过以前的病历记录,看看这个病到底是不是真的
在现在变多了?还是以前因为没有这个概念所以没有诊断?
现在有些病貌似是真的越来越多了,比方说严重的花生过敏症,这个似乎是真的
越来越多,而不是和没有诊断有关。
【在 b***t 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : What would you like to know? I'll try my best to answer your questions.
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s******y 发帖数: 28562 | 45 第二个问题就是对于autism,在脑里面的病理/生理诊断上有没有发现过异常?
比方说脑FMRI或者切片染色,又没有发现什么异常?
【在 b***t 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : What would you like to know? I'll try my best to answer your questions.
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b***t 发帖数: 1104 | 46 To your first question. The answer is yes. The seemingly explosion of autism
cases is due to recognition of autism as a clinical disorder. It took off
in late 80s to early 90s. Those kids that were diagnosed back then are now
entering their early twenties. That brings about a lot of social problems.
Before age 21, government funding covers their public education, special
need schooling and of course medical care. After 21, they will be on their
own. If the family has limited means, these supportive cares will not be
sustainable. If the kids are not fit to work, some of them will eventually
end up homeless. Also, there's not many non-pediatric physicians trained in
autism. So these kids (more likely their parents) will soon find that they
can't find a doctor for continuous care.
Second question. fMRI has revealed that autistic kids have higher activity
in their amygdala areas. This is the most direct evidence that limbic system
is important in ASD. Amygdala functionally regulates fear, anxiety, and
other negative emotions. One indirect evidence is that some kids for unknown
reasons develop calcification in their amygdala and present autism-like
symptoms.
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 第二个问题就是对于autism,在脑里面的病理/生理诊断上有没有发现过异常? : 比方说脑FMRI或者切片染色,又没有发现什么异常?
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s******y 发帖数: 28562 | 47 民间有一股势力是认为这个病和某些vaccination 有关系。
我并不认为这个和vaccination 直接相关,但是我也注意到一点,就是
美国这里有时候医生会一次性的给小儿同时打好几种疫苗,这个往往导致
高烧,而超过一定时间的高烧对神经发育有一定影响几乎是肯定的。
但是我想问的是,在发育期,高烧是否能够选择性的影响limbic system的发育?
有没有人跟踪过这个问题?或者用老鼠做过类似题材?
另外一个相关问题就是,在世界的分布上,有没有国家和地区的分布差别?
比方说中国,欧洲,澳大利亚,和美国的这个病的比例是否相似?
autism
in
【在 b***t 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : To your first question. The answer is yes. The seemingly explosion of autism : cases is due to recognition of autism as a clinical disorder. It took off : in late 80s to early 90s. Those kids that were diagnosed back then are now : entering their early twenties. That brings about a lot of social problems. : Before age 21, government funding covers their public education, special : need schooling and of course medical care. After 21, they will be on their : own. If the family has limited means, these supportive cares will not be : sustainable. If the kids are not fit to work, some of them will eventually : end up homeless. Also, there's not many non-pediatric physicians trained in : autism. So these kids (more likely their parents) will soon find that they
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r******j 发帖数: 780 | 48 这个情况是否可以向主编投诉? 如果你们不怕以后不能发nature,那么你们胆子大一
些,直接跟主编联系,怀疑当时拒稿的决定不是建立在学术基础上的。
pseudogene,
究的蛋白失
【在 m****t 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 发泄一下。我们实验室最近的一个工作发现某个蛋白质的过量表达能让小鼠产生所有临 : 床定义的autism的症状,包括这篇shank3没有观察到的reduced vocalization。与 : shank3类似,过量表达此蛋白也导致兴奋性突触传递的降低。 : 我们于去年6月投Nature,比shank3这篇文章还早三个月。其中一个reviewer要我们补 : 很多实验,有些其实很没有必要。我们花了近4个月时间把审稿 : 人要求的实验全做了。Resubmission后所有的reviewers都很positive,包括这个要我 : 们补很多试验的。编辑要我们再作一些小修改,让我们在4个星期内修改完毕。当时我 : 们都觉得这篇文章就要被接收了。 : 但我们再次修改后,这个要求我们补很多实验的突然转变态度,说我们用的BAC有一pseudogene, : 这些症状有可能是这个pseudogene造成的。但我们做的transgenic小鼠中有把我们研究的蛋白失
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e*******e 发帖数: 1837 | 49 Thanks for the info.
Are there any well-defined extreme ASD subtypes/categories that are more
suitable for genetic studies?
stereotyped
individuals
【在 b***t 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : Just a few clarifications on ASD: : Clinical diagnosis of ASD is pretty clearly defined. It involves stereotyped : movement, repetitive behaviors, detachment from the environment, etc. But : remember ASD is a spectrum. The presentations vary a lot between individuals : . They don't necessarily present with the same set of symptoms. : The current belief of ASD pathology is deficits in the limbic system, : especially the amygdala. On the molecular level, regardless of intensive : research efforts, scientists have failed to identify any single gene : mutation as the cause of ASD. Now the search of genetic causes is aimed at : multiple genes additively contributing to ASD. As a matter of fact,
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c******r 发帖数: 3778 | 50 这个病的分布肯定跟疫苗使用成正相关。但是原因很简单,主要是这个病在发达国家被
更多诊断,而发展中国家基本没有可能诊断这个病。在中国现在也才刚刚开始了解这个
病。对于绝大多数家长,老师甚至医生都不了解这个病。
而疫苗的使用恰恰也跟经济发展正相关,越是发达国家相对使用更多的疫苗。
因此这些都是经济发展的正相关结果,不能以此作为二者的相关性证据。
好像有些研究认为怀孕期间接触的某些化学物质可能跟autism有关?有人知道具体是什
么物质吗?不知道这些物质都影响什么蛋白,要是能够证明它们有关,再找到具体的
target protein也是个不错的题目。
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 民间有一股势力是认为这个病和某些vaccination 有关系。 : 我并不认为这个和vaccination 直接相关,但是我也注意到一点,就是 : 美国这里有时候医生会一次性的给小儿同时打好几种疫苗,这个往往导致 : 高烧,而超过一定时间的高烧对神经发育有一定影响几乎是肯定的。 : 但是我想问的是,在发育期,高烧是否能够选择性的影响limbic system的发育? : 有没有人跟踪过这个问题?或者用老鼠做过类似题材? : 另外一个相关问题就是,在世界的分布上,有没有国家和地区的分布差别? : 比方说中国,欧洲,澳大利亚,和美国的这个病的比例是否相似? : : autism
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s******y 发帖数: 28562 | 51
我惊讶的问一下,这个有数据么? 直接或者间接的都行。。。
中国印度什么的,诊断可能跟不上,但是澳大利亚啊,欧洲啊什么的应该已经
跟上了吧?
【在 c******r 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 这个病的分布肯定跟疫苗使用成正相关。但是原因很简单,主要是这个病在发达国家被 : 更多诊断,而发展中国家基本没有可能诊断这个病。在中国现在也才刚刚开始了解这个 : 病。对于绝大多数家长,老师甚至医生都不了解这个病。 : 而疫苗的使用恰恰也跟经济发展正相关,越是发达国家相对使用更多的疫苗。 : 因此这些都是经济发展的正相关结果,不能以此作为二者的相关性证据。 : 好像有些研究认为怀孕期间接触的某些化学物质可能跟autism有关?有人知道具体是什 : 么物质吗?不知道这些物质都影响什么蛋白,要是能够证明它们有关,再找到具体的 : target protein也是个不错的题目。
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b***t 发帖数: 1104 | 52 Your speculation might sound reasonable in some sense. But all except one
clinical study up to date have found absolutely no association between
autism and MMR vaccination. (MMR among all vaccinations is the suspected
culprit by general public, probably due to its combined admission and
febrility side effect)The only study that showed increased ASD incidence in
MMR vaccinated kids is now retracted. It led to the famous license
suspension of the British doctor who conducted the study. Actually in UK,
many parents chose not to vaccinate their kids with MMR based on the result
of that unjustified study. But the incidence of ASD hasn't seemed to
decrease.
【在 c******r 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 这个病的分布肯定跟疫苗使用成正相关。但是原因很简单,主要是这个病在发达国家被 : 更多诊断,而发展中国家基本没有可能诊断这个病。在中国现在也才刚刚开始了解这个 : 病。对于绝大多数家长,老师甚至医生都不了解这个病。 : 而疫苗的使用恰恰也跟经济发展正相关,越是发达国家相对使用更多的疫苗。 : 因此这些都是经济发展的正相关结果,不能以此作为二者的相关性证据。 : 好像有些研究认为怀孕期间接触的某些化学物质可能跟autism有关?有人知道具体是什 : 么物质吗?不知道这些物质都影响什么蛋白,要是能够证明它们有关,再找到具体的 : target protein也是个不错的题目。
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l****i 发帖数: 20439 | 53 我看过一期节目 说自闭症的发病率和电视机的普及率有正相关
【在 c******r 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 这个病的分布肯定跟疫苗使用成正相关。但是原因很简单,主要是这个病在发达国家被 : 更多诊断,而发展中国家基本没有可能诊断这个病。在中国现在也才刚刚开始了解这个 : 病。对于绝大多数家长,老师甚至医生都不了解这个病。 : 而疫苗的使用恰恰也跟经济发展正相关,越是发达国家相对使用更多的疫苗。 : 因此这些都是经济发展的正相关结果,不能以此作为二者的相关性证据。 : 好像有些研究认为怀孕期间接触的某些化学物质可能跟autism有关?有人知道具体是什 : 么物质吗?不知道这些物质都影响什么蛋白,要是能够证明它们有关,再找到具体的 : target protein也是个不错的题目。
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b***t 发帖数: 1104 | 54 That sounds like some low-functioning ASD types. These patients usually have
low non-verbal IQs, tics, and other typical ASD social dysfunctions.
【在 e*******e 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : Thanks for the info. : Are there any well-defined extreme ASD subtypes/categories that are more : suitable for genetic studies? : : stereotyped : individuals
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s******y 发帖数: 28562 | 55 这个。。。这个可能性不能排除,但是有没有相关证据啊?
比方说在那种不看电视的地方(比方说美国的清教徒),他们的这种发病率
是不是会低一些?
【在 l****i 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 我看过一期节目 说自闭症的发病率和电视机的普及率有正相关
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c****l 发帖数: 1086 | 56 The study on Pten and autism has been published years ago which used neoron-
specific Cre.
Pten Regulates Neuronal Arborization and Social Interaction in Mice
Chang-Hyuk Kwon1, 3, 4, Bryan W. Luikart1, 4, Craig M. Powell2, 4, Jing
Zhou1, Sharon A. Matheny1, Wei Zhang1, Yanjiao Li1, Suzanne J. Baker3 and
Luis F. Parada
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 啊?我怎么隐约记得有人说过Rett Syndrome 好像不算autism? : 我刚才去查了一下文献, 发现最早的模型好像是在2007年用neuroligin做出来的。 : 现在这个用SHANK3作出来的模型,肯定是有意义的(因为正面肯定了用其他数据作 : 出来的结论,而且也为领域里面的研究提供了一个模型)。neuroligin 和SHANK3 : 是有相互作用的,所以这个有作用也不意外。 : 不过,你说的也对,作者是挺投机取巧的,因为这篇文章的结论比较没有 : 任何意料之外的结果。虽然也是一个必须作的过程,但是这么看来确实 : 缺乏突破性。有点像当时用iPS作老鼠胚胎的文章吧,就是大家都知道结论 : 应该是什么,但是谁先作出来谁就抢先发CNS那样? : 另外,其实我对PTEN 在autism 里面的意义更有怀疑,因为PTEN 到处都有,
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c******r 发帖数: 3778 | 57 hehe,其实有几十上百的研究证明二者无关。
我只是说lz说的那个相关研究不会有人做,因为不说明问题
in
result
【在 b***t 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : Your speculation might sound reasonable in some sense. But all except one : clinical study up to date have found absolutely no association between : autism and MMR vaccination. (MMR among all vaccinations is the suspected : culprit by general public, probably due to its combined admission and : febrility side effect)The only study that showed increased ASD incidence in : MMR vaccinated kids is now retracted. It led to the famous license : suspension of the British doctor who conducted the study. Actually in UK, : many parents chose not to vaccinate their kids with MMR based on the result : of that unjustified study. But the incidence of ASD hasn't seemed to : decrease.
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j********r 发帖数: 156 | 58 这么说 shank3只在neuron中表达了? 所以和pten相比,更可能是一个ASD-gene。
thanks,
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 呵呵,我就不去趟这种浑水了。 : 我就是查文献的时候看到有的实验室已经在做PTEN在autism里面的功能, : 觉得挺纳闷的。 : 就像你说的那样,大部分功能特别重要的基因(那些很多都是oncogene), : 在neuron 里面都肯定有功能的。 : 比方说我要是发个神经在纹状区把tubulin KO了,几乎也肯定能够产生 : autism 症状吧?可是这么做有意义么? : SHANK3, 和Neuroligin 的意义在于他们是非常组织特异性的蛋白, : 在基因上搞乱这两个蛋白后产生的形状主要集中在神经和行为上, : 这个和autism 病人的特点一致。因为autism 病人主要是行为异常,
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m**********2 发帖数: 6568 | 59 还有一派观点认为是和日用塑料制品中含有的化学物质有关。我更倾向于这个。
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 民间有一股势力是认为这个病和某些vaccination 有关系。 : 我并不认为这个和vaccination 直接相关,但是我也注意到一点,就是 : 美国这里有时候医生会一次性的给小儿同时打好几种疫苗,这个往往导致 : 高烧,而超过一定时间的高烧对神经发育有一定影响几乎是肯定的。 : 但是我想问的是,在发育期,高烧是否能够选择性的影响limbic system的发育? : 有没有人跟踪过这个问题?或者用老鼠做过类似题材? : 另外一个相关问题就是,在世界的分布上,有没有国家和地区的分布差别? : 比方说中国,欧洲,澳大利亚,和美国的这个病的比例是否相似? : : autism
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s******y 发帖数: 28562 | 60 SHANK3是神经特异性表达的。
第一楼帖的那个文章,是total knockout, 但是主要性状集中在神经里面。
相比之下,如果对PTEN total knockout, 我猜小老鼠在胚胎期就死了,
根本就生不出来。
【在 j********r 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 这么说 shank3只在neuron中表达了? 所以和pten相比,更可能是一个ASD-gene。 : thanks,
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S********y 发帖数: 565 | |
l**********1 发帖数: 5204 | 62 Ding
plus
>
April 04, 2012
The New Genetics of Autism – Why Environment Matters
by Thomas Insel
>
Last week’s autism news was about prevalence. The CDC reported a 78 percent increase in autism
prevalence since 2002. This week’s autism news is about genetics—three papers in Nature describe new
genes associated with autism. For many people, these two stories seem contradictory or, at best, unrelated.
Increasing prevalence suggests environmental factors like chemicals and microbes changing over the past
decade, whereas genes change over generations. Why is anyone looking for genetic causes when there is
such a rapid increase in prevalence? Shouldn’t every research dollar be invested in finding the
environmental culprit rather than searching for rare gene variants?
The simple answer is that some autism is genetic. Autism, like schizophrenia and mood disorders, includes
many syndromes. Indeed, we should probably speak of the “autisms.” Some of these autisms are single
gene disorders, such as Fragile X, tuberous sclerosis, and Rett syndrome. While these rare genetic disorders
account for less than 5 percent of children within the autism spectrum, children with any of these disorders
are at high risk for autism, roughly a 30-fold higher risk than the general population and higher than any of
the other known risk factors. Recent genomics research has discovered that many children diagnosed within
the autism spectrum have other genetic mutations that have not yet been designated as named syndromes.
Each of these mutations is rare, but in aggregate they may account for 10 - 20 percent or more of what we
have been calling the autisms.1
The new papers published today in Nature use an approach called whole exome sequencing, mapping every
base of DNA across the exome—the 1.5 percent of the genome known to code for protein. The three
research groups are members of the Autism Sequencing Consortium (ASC), an international team of autism
genetics researchers. All three look for de novo or spontaneous mutations, changes in DNA sequence that
are not found in either parent. Recent sequencing studies in the general population have demonstrated that
each of us diverges genomically from our parents — the process of reproduction introduces variation even
beyond the random mixture of the genomes we inherit from mom and dad. People with autism and
schizophrenia are far more likely to have large de novo copy number variants, sometimes a million bases of
DNA that are abnormally duplicated or deleted and not found in either parent.
These new papers go beyond the previous discovery of de novo copy number variants to identify de novo
single base changes associated with autism. This is tough sailing because there are so many of these
changes in all of us and most of these single base changes have no impact. These studies tried to improve
the odds of success by focusing on individuals from families with no one else affected (these are called
“simplex” families), and sometimes comparing the individual with autism to a sibling without autism. The
results are intriguing.
link:
//www.nimh.nih.gov/about/director/2012/the-new-genetics-of-autism-why-environment-matters.shtml
from
http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31654335.html
【在 S********y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png)
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C*********m 发帖数: 213 | 63 SHANK3和autism的关系早就发表过了
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : SHANK3 是一个神经突触里面的scaffold蛋白, : 在对autism spectrum disorder 的基因筛选中常常出现。 : 上个月NATURE,Duke University 的Guoping Feng实验室报告他们在老鼠中 : KO这个基因后,发现老鼠出现行为异常,喜欢躲在角落里,不爱和新老鼠交往。 : 而且特别喜欢梳理自己的毛。解剖证据认为该老鼠大脑纹状体的突触有异常, : 和人类的autism spectrum disorder的病理症状类似。 : http://www.nature.com/nature/journal/v472/n7344/full/nature0996
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l**********1 发帖数: 5204 | 64 Both are new 2012 Nature papers:
//www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature10945.html
尤其这篇
//www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature11011.html
its full text noted SHANK3:
//www.hudsonalpha.org/sites/default/files/nature11011.pdf
NB: 不温故SHANK3哪来知新 SNP
还有要是不同组出了 自闭症 自相矛盾的gene locus SNP 结果一次的话 还好说 注意这里指基因名称
反复出现的话
Nature Senior Editor 2011 还混2013 senior editor 那 啊!?
【在 C*********m 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : SHANK3和autism的关系早就发表过了
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f*********e 发帖数: 24 | 65 Relation between MeCP2 and Rett syndrome
1999-10 Nat Gen Huda Y. Zoghbi Rett syndrome is caused by mutations
in X-linked MECP2, encoding methyl-CpG-binding protein 2
Mouse models: whole-body knockout, brain-specific, brain-region-specific,
knock-in,..., over-expression, rescue, ...
2001-03 Nat Gen Adrian Bird A mouse Mecp2-null mutation causes
neurological symptoms that mimic Rett syndrome
2001-03 Nat Gen Rudolf Jaenisch Deficiency of methyl-CpG binding
protein-2 in CNS neurons results in a Rett-like phenotype in mice
2009-12 PNAS Jeffrey L. Neul Huda Y. Zoghbi "Loss of MeCP2 in
aminergic neurons causes
cell-autonomous defects in neurotransmitter
synthesis and specific behavioral abnormalities"
2010-11 Nature Huda Y. Zoghbi Dysfunction in GABA signalling
mediates autism-like stereotypies and Rett syndrome phenotypes
2011-11 N Neuro Zhaolan Zhou "Rett syndrome mutation MeCP2 T158A
disrupts DNA
binding, protein stability and ERP responses"
2012-01 Nat Gen Huda Zoghbi Crh and Oprm1 mediate anxiety-related
gehavior and social approach in a mouse model of MECP2 duplication syndrome
2002-07 Neuron Huda Y. Zoghbi Mice with Truncated MeCP2
Recapitulate Many Rett Syndrome Features and Display Hyperacetylation of
Histone H3
2004-09 HMG Huda Y. Zoghbi Mild overexpression of MeCP2 causes a
progressive neurological disorder in mice
2006-00 BIOL PSYCHIATRY Lisa M. Monteggia "Postnatal Loss of Methyl
-CpG Binding Protein 2 in the
Forebrain is Sufficient to Mediate Behavioral Aspects
of Rett Syndrome in Mice"
2007-10 HMG Juan I. Young Huda Y. Zoghbi "Cell-specific
expression of wild-type MeCP2
in mouse models of Rett syndrome yields
insight about pathogenesis"
Rescue mouse model:
2006-11 PNAS Rudolf Jaenisch "Partial rescue of MeCP2 deficiency by
postnatal
activation of MeCP2"
2007-02 Science Adrian Bird "Reversal of Neurological Defects in a
Mouse Model of Rett Syndrome"
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 啊?我怎么隐约记得有人说过Rett Syndrome 好像不算autism? : 我刚才去查了一下文献, 发现最早的模型好像是在2007年用neuroligin做出来的。 : 现在这个用SHANK3作出来的模型,肯定是有意义的(因为正面肯定了用其他数据作 : 出来的结论,而且也为领域里面的研究提供了一个模型)。neuroligin 和SHANK3 : 是有相互作用的,所以这个有作用也不意外。 : 不过,你说的也对,作者是挺投机取巧的,因为这篇文章的结论比较没有 : 任何意料之外的结果。虽然也是一个必须作的过程,但是这么看来确实 : 缺乏突破性。有点像当时用iPS作老鼠胚胎的文章吧,就是大家都知道结论 : 应该是什么,但是谁先作出来谁就抢先发CNS那样? : 另外,其实我对PTEN 在autism 里面的意义更有怀疑,因为PTEN 到处都有,
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f*********e 发帖数: 24 | 66 SnapShot: Genetics of Autism
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0896627311008
,
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 啊?我怎么隐约记得有人说过Rett Syndrome 好像不算autism? : 我刚才去查了一下文献, 发现最早的模型好像是在2007年用neuroligin做出来的。 : 现在这个用SHANK3作出来的模型,肯定是有意义的(因为正面肯定了用其他数据作 : 出来的结论,而且也为领域里面的研究提供了一个模型)。neuroligin 和SHANK3 : 是有相互作用的,所以这个有作用也不意外。 : 不过,你说的也对,作者是挺投机取巧的,因为这篇文章的结论比较没有 : 任何意料之外的结果。虽然也是一个必须作的过程,但是这么看来确实 : 缺乏突破性。有点像当时用iPS作老鼠胚胎的文章吧,就是大家都知道结论 : 应该是什么,但是谁先作出来谁就抢先发CNS那样? : 另外,其实我对PTEN 在autism 里面的意义更有怀疑,因为PTEN 到处都有,
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h*******v 发帖数: 27 | 67 I read that paper sometime ago. It's a little odd that they examined
striatum instead of cortex. They tried to make a story that cortico-striatal
synapses were sick and other regions were spared (they examined synaptic
plasticity in hippocampus and found it is alright, if I remember correctly).
If so, they should at least rescue the striatum region with virus-delivered
shank3. Without the rescue experiment, no causality is established and the
autistic phenotype could simply be the combined secondary effects from
multiple regions.
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : SHANK3 是一个神经突触里面的scaffold蛋白, : 在对autism spectrum disorder 的基因筛选中常常出现。 : 上个月NATURE,Duke University 的Guoping Feng实验室报告他们在老鼠中 : KO这个基因后,发现老鼠出现行为异常,喜欢躲在角落里,不爱和新老鼠交往。 : 而且特别喜欢梳理自己的毛。解剖证据认为该老鼠大脑纹状体的突触有异常, : 和人类的autism spectrum disorder的病理症状类似。 : http://www.nature.com/nature/journal/v472/n7344/full/nature0996
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x*******t 发帖数: 3764 | 68 有phenotype就好
不过autism associated的gene目前知道的也有好多了吧,不知道是不是只有这个有
phenotype |
g*********5 发帖数: 2533 | 69 add flag and IP, spec and get some genes for following study...
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 我倒是觉得应该看看这个蛋白的功能是怎么调控的, : 因为很多真正的患者其实并没有这个蛋白的缺失或者基因变异。 : 我其实对代谢和基因调控的关系非常感兴趣。 : 不过。。。还是一直没有机会进入。。。以后独立后可能会作一些有关事情, : 如果能弄到钱的话。
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