m***o
发帖数: 272 | 1 rt.而且这个form只在testes里表达。哎，感觉百忙活了几个月。 |
m***o
发帖数: 272 | |
s******s
发帖数: 13035 | 3 这个难道不是你自己应该知道或者问老板吗？别人怎么会知道
【在 m***o 的大作中提到】
: 刚发现标题不全。我想问有必要在继续往下做吗？
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P****o
发帖数: 172 | 4 If I were you, I will dig a little bit more. First, you can check EST
database whether there are identical sequences. Second, you can compare full
and variant protein by overexpression in terms of trafficking, degradation,
etc. If nothing happened, you are still able to publish your observation,
also submit the new sequence to genebank. |
w******y
发帖数: 8040 | 5 of course you should have a try
design some assays to check the AS variant's stability
【在 m***o 的大作中提到】
: 刚发现标题不全。我想问有必要在继续往下做吗？
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b******2
发帖数: 6 | 6 U can contact me if possible. I have some experiments about this type
isoforms thing in testis and actually, I am quite interested in this issue
though I've changed my direction.
L****[email protected] |
n******7
发帖数: 12463 | |
w******y
发帖数: 8040 | 8 NMD的可能性蛮大的
楼主如果啥也不试就放弃就可惜了
【在 n******7 的大作中提到】
: 是不是NMD了？算算protein序列看看
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s*********t
发帖数: 600 | 9 神马是NMD
【在 w******y 的大作中提到】
: NMD的可能性蛮大的
: 楼主如果啥也不试就放弃就可惜了
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g**********t
发帖数: 475 | 10 谁说没蛋白产物就没有意义阿。有一个假说是AS相关的NMD是一种重要的调节基因表达
的机制。比如你的基因在testes里“需要”降低表达量，于是进化出一种isoform，而
这种isoform由于含有PTC会被NMD降解。这样功能产物的表达量就降低了，而且非功能
isoform被降解了，所以也没啥副作用（除了多耗了点能量）。 |
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n******e
发帖数: 110 | 11 能不能举一个这样的实际的例子呢? 或者给个ref,非常感兴趣这样的调节机制
【在 g**********t 的大作中提到】
: 谁说没蛋白产物就没有意义阿。有一个假说是AS相关的NMD是一种重要的调节基因表达
: 的机制。比如你的基因在testes里“需要”降低表达量，于是进化出一种isoform，而
: 这种isoform由于含有PTC会被NMD降解。这样功能产物的表达量就降低了，而且非功能
: isoform被降解了，所以也没啥副作用（除了多耗了点能量）。
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g**********t
发帖数: 475 | 12 可以看看这篇综述：
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0968000408001
【在 n******e 的大作中提到】
: 能不能举一个这样的实际的例子呢? 或者给个ref,非常感兴趣这样的调节机制
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S*****s
发帖数: 287 | 13 NMD 也不一定是 100% 降解。没有被降解的 RNA 还是会翻译成蛋白。我觉得是 LZ 的
检测方法有问题。建议用 pcDNA vector 克隆然后在细胞里面表达，先看看表达产物是
不是稳定。一个例子是 http://www.jneurosci.org/content/29/9/2833.full.
【在 w******y 的大作中提到】
: NMD的可能性蛮大的
: 楼主如果啥也不试就放弃就可惜了
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n******e
发帖数: 110 | 14 感谢回复!
如果楼主的情况是NMD引起的话,那么如果用药物抑制NMD应该能检测到表达了吧.
【在 g**********t 的大作中提到】
: 可以看看这篇综述：
: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0968000408001
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m***o
发帖数: 272 | 15 十分感谢各位的回复。又学到了新东西！抓住老板谈了谈，老板观点，继续试别的组织
和细胞系看看RNA和蛋白有没有可能表达。我对这个很没有信心。而且刚刚有个发现是
，我发现这个新的form可能是个pseudogene。因为我用genomic DNA，也得到了片段，
我的primer是跨3个exon。虽然我认为这个片段是alternative splicing得到的，但是
我也没证据排除是这个psuedogene转录得到的。如果是pseudogene转录的，但别的组织
都没有。感觉这个新的form在进化中可能有作用，但是现在不知继续研究它还有没有意
义。跟老板谈，老板很不感兴趣，认为我做的太多方向，要有priority。
打印出来了大家推荐的文章，再次感谢。 |
