a***l
发帖数: 32 | 1 发现一个蛋白调控一片noncoding RNA区域，怎样先map这个noncoding RNA的大小啊，
这一片有几百K,难道设计一堆引物么，或者做很多克隆做RNA探针杂交？。。。。。。
。。
求教啊 | B******o
发帖数: 496 | 2 RACE to get the full length
【在 a***l 的大作中提到】
: 发现一个蛋白调控一片noncoding RNA区域，怎样先map这个noncoding RNA的大小啊，
: 这一片有几百K,难道设计一堆引物么，或者做很多克隆做RNA探针杂交？。。。。。。
: 。。
: 求教啊
| a***l
发帖数: 32 | 3 多谢啊，正在看相关文献，也提到了RACE。。。。 | s******s
发帖数: 13035 | 4 这玩意儿和mRNA都是差不多的
【在 a***l 的大作中提到】
: 多谢啊，正在看相关文献，也提到了RACE。。。。
| j*p
发帖数: 411 | 5 There has been quite a few RNAseq data released recently, many of them been
uploaded to UCSC genome browser as tracks (human and mouse). You may want to
try:
(1) go to that loci of the noncoding RNA you are interested.
(2) check RNAseq data and computational predicted tracks and see whether the
RNA is expressed, how many exons, what is the predicted splicing structure
etc.
(3) then RACE or you might want to test some functional study before RACE.
Personally, I doubted a noncoding RNA covers ~100K.
【在 a***l 的大作中提到】
: 发现一个蛋白调控一片noncoding RNA区域，怎样先map这个noncoding RNA的大小啊，
: 这一片有几百K,难道设计一堆引物么，或者做很多克隆做RNA探针杂交？。。。。。。
: 。。
: 求教啊
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