v***a 发帖数: 1242 | 1 老板不赞同我的想法,要把我做了2年的1/2数据给一笔勾销(因为认为无法解释),把
剩下的变成一篇很简单的paper,可我觉得自己的逻辑也没有问题啊,请大家帮忙看看
哈!
已知组织中有2种细胞相互作用(但整个组织中不止这2种细胞)。in vivo的老鼠实验
证明,某药物的treatment会引起该组织中蛋白O和P的表达量急剧上升(蛋白O和P有co-
immunoprecipitation)。正常情况下,整个组织的蛋白O和P表达量很低,2种相互作用
的细胞也是一个2种蛋白的表达量都非常高(代号为1),一个表达量都很低(其表达比
例跟整个组织水平持平或略高;代号为2)。
在in vitro情况下单独培养细胞1,用上述的药物进行处理,没有发现蛋白O的表达量有
变化,但是蛋白P在后期有上升。如果在细胞1中超量表达蛋白O,蛋白P表达量会在后期
显著增加。
把细胞1和2在in vitro的条件下共同培养,再用药物处理,发现O也有上升。
另外发现,细胞2和细胞1共同培养能诱导蛋白O的表达量增加。
我得出结论说,药物通过刺激细胞2,进而使细胞1中的蛋白O增加,再诱导蛋白P增加,
激活其它信号通路。但我也想不通的是,怎么解释P在只有细胞1,接受药物后没有O增
加的情况下,也能增加呢(虽然在O过表达的情况下P增加得多很多)?
谢谢指正! |
I***a 发帖数: 13467 | 2 药物促进P在1中表达(不管体内还是体外),
2种细胞一起能促进O表达,O的表达也能促进P表达,在体内加上药物这种效应更强? |
m******5 发帖数: 1383 | 3 菜鸟弱弱说一句,主要看你这个o和p是什么蛋白
容易不容易放在一个context里
如果o simply就是个应激蛋白之类的就不一定重要
还有,o和p你做出了相互作用,有功能实验么?光相互作用也不能直接说明有任何功能 |
D*a 发帖数: 6830 | 4 通篇都是表达量,是western? 不能把老鼠组织直接上immunohistochemistry看吗 |
v***a 发帖数: 1242 | 5 谢谢!
【在 I***a 的大作中提到】 : 药物促进P在1中表达(不管体内还是体外), : 2种细胞一起能促进O表达,O的表达也能促进P表达,在体内加上药物这种效应更强?
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v***a 发帖数: 1242 | 6 O不是一个应激蛋白,现在关于O的研究还不多
O和P可能会调节一个共同的信号通路,但是还没想好怎么解释细胞1单独培养或和细胞2
共同培养的问题,比如我老板要求我在共同培养的条件下超量表达O,再加药物看P的反
应,但是这样实验难度太大了;而且药物已经能够在共同培养条件下激发O的表达,我
也还没想通,如果再超量表达,那有什么意义呢?
【在 m******5 的大作中提到】 : 菜鸟弱弱说一句,主要看你这个o和p是什么蛋白 : 容易不容易放在一个context里 : 如果o simply就是个应激蛋白之类的就不一定重要 : 还有,o和p你做出了相互作用,有功能实验么?光相互作用也不能直接说明有任何功能
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v***a 发帖数: 1242 | 7 是啊。也看了immunohistochemistry,在药物处理过后,是在细胞1和2的界面明显增高的
【在 D*a 的大作中提到】 : 通篇都是表达量,是western? 不能把老鼠组织直接上immunohistochemistry看吗
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m******5 发帖数: 1383 | 8 如果超量表达能引发别的下游基因的表达量也增加就很有意义吧?
有已经报道的O或者P的downstream target么?
胞2
【在 v***a 的大作中提到】 : O不是一个应激蛋白,现在关于O的研究还不多 : O和P可能会调节一个共同的信号通路,但是还没想好怎么解释细胞1单独培养或和细胞2 : 共同培养的问题,比如我老板要求我在共同培养的条件下超量表达O,再加药物看P的反 : 应,但是这样实验难度太大了;而且药物已经能够在共同培养条件下激发O的表达,我 : 也还没想通,如果再超量表达,那有什么意义呢?
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v***a 发帖数: 1242 | 9 O没有report过的downstream target,P在我目前得到的结果中看起来是O的下游target
。我得查查P。谢谢你的启发哈!
【在 m******5 的大作中提到】 : 如果超量表达能引发别的下游基因的表达量也增加就很有意义吧? : 有已经报道的O或者P的downstream target么? : : 胞2
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F******p 发帖数: 2099 | 10 你说这么多也没看出有啥功能性的东西。建议找个KO看看。 |
c****y 发帖数: 373 | 11 细胞2和细胞1共同培养能诱导蛋白O的表达量增加,共同培养的P表达量是否增加? |