有10bp左右的DNA, 如何判断是哪个转录因子TF的binding sequence? - Biology版 - 未名存档

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Biology版 - 有10bp左右的DNA, 如何判断是哪个转录因子TF的binding sequence?

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● 这里有做CHIP-Seq的兄弟么	● [转载] Re: 来点遗传知识启蒙
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相关话题的讨论汇总
话题: tf话题: 10bp话题: dna话题: 转录话题: 因子

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D******9 发帖数: 2665	1 谢谢
u**********d 发帖数: 573	2 motif search 组织特异表达数据，上游信号 EMSA排查：探针突变，supershift luciferase reporter gene assays ChIP 对照要设好哦。你确定就是这10bp在干活？【在 D******9 的大作中提到】 : 谢谢
d****7 发帖数: 109	3 用TOMTOM或者STAMP做个alignment，看看和啥TF的motif像然后就像楼上说的，做实验验证【在 D******9 的大作中提到】 : 谢谢
D******9 发帖数: 2665	4 我这个序列就是alignment出来的， CTGTAATCCCA，想知道哪个转录因子能结合它。用了GENOMATIX的几个软件，都不行。谢谢楼上两位。
r*******y 发帖数: 48	5 go to TR search http://www.cbrc.jp/research/db/TFSEARCH.html
d****7 发帖数: 109	6 看你另一个帖子我给你的回帖【在 D******9 的大作中提到】 : 我这个序列就是alignment出来的， CTGTAATCCCA，想知道哪个转录因子能结合它。 : 用了GENOMATIX的几个软件，都不行。 : 谢谢楼上两位。

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