m*****e 发帖数: 47 | 1 请教这里的各位,像23andme这样99美元的基因测序,大概需要什么样的设备?主要步
骤是什么?需要几个工作人员?我主要是想了解一下,组建这样一个实验室,要怎样的
规模和成本。多谢了。 |
f******g 发帖数: 382 | 2 你去查查23andme投资了多少钱。
【在 m*****e 的大作中提到】 : 请教这里的各位,像23andme这样99美元的基因测序,大概需要什么样的设备?主要步 : 骤是什么?需要几个工作人员?我主要是想了解一下,组建这样一个实验室,要怎样的 : 规模和成本。多谢了。
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m*****e 发帖数: 47 | 3 再问一个问题,国内可有实验室做23andme这样的测序?可否給几个链接? |
s******s 发帖数: 13035 | 4 23andme应该不是测序, 而是SNP芯片.
23andme这样的实验室你就别想了, google创始人老婆(或者快成前老婆)开的.
【在 m*****e 的大作中提到】 : 请教这里的各位,像23andme这样99美元的基因测序,大概需要什么样的设备?主要步 : 骤是什么?需要几个工作人员?我主要是想了解一下,组建这样一个实验室,要怎样的 : 规模和成本。多谢了。
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w***a 发帖数: 4361 | 5 关键还不是测序,是背后不断update的database。
这玩意不是凑几个wsn那么容易就山寨出来的。
【在 m*****e 的大作中提到】 : 请教这里的各位,像23andme这样99美元的基因测序,大概需要什么样的设备?主要步 : 骤是什么?需要几个工作人员?我主要是想了解一下,组建这样一个实验室,要怎样的 : 规模和成本。多谢了。
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M*****n 发帖数: 16729 | |
A******u 发帖数: 61 | 7 国内一般都去复旦测
Y染色体STR 几百块钱 全部SNP 一千多块钱人民币
线粒体全序列 两千
跟23andme比价格如何?
【在 M*****n 的大作中提到】 : SNP很便宜了 : 你打算回中国骗钱?
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A******u 发帖数: 61 | 8 当然有了
复旦大学现代人类学教育部重点实验室
家族遗传测试服务
【在 m*****e 的大作中提到】 : 再问一个问题,国内可有实验室做23andme这样的测序?可否給几个链接?
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M*****n 发帖数: 16729 | 9 SNP对临床诊断可用吗?
如果没有FDA批准,是不能做诊断的,只能大家测着玩吧。
【在 A******u 的大作中提到】 : 国内一般都去复旦测 : Y染色体STR 几百块钱 全部SNP 一千多块钱人民币 : 线粒体全序列 两千 : 跟23andme比价格如何?
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A******u 发帖数: 61 | 10 Y染色体SNP跟疾病关系不大吧,复旦那个就是搞家族溯源的,供有这方面爱好的人玩的。
国内这方面的市场不小,一些人很重视家族源流的,还有修家谱什么的。
要是能跟疾病联系起来,估计就更有商业前途了。
华大有做这方面的,但是貌似不太成功。
楼主回国搞这一块,确实是有一定商业前景的啊。
【在 M*****n 的大作中提到】 : SNP对临床诊断可用吗? : 如果没有FDA批准,是不能做诊断的,只能大家测着玩吧。
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M*****n 发帖数: 16729 | 11 Y 那么小一段儿,能有多少SNP? 复旦岂不是要赚死了?是不是金力卢大儒在搞?
的。
【在 A******u 的大作中提到】 : Y染色体SNP跟疾病关系不大吧,复旦那个就是搞家族溯源的,供有这方面爱好的人玩的。 : 国内这方面的市场不小,一些人很重视家族源流的,还有修家谱什么的。 : 要是能跟疾病联系起来,估计就更有商业前途了。 : 华大有做这方面的,但是貌似不太成功。 : 楼主回国搞这一块,确实是有一定商业前景的啊。
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A******u 发帖数: 61 | 12 不少了,听说常用来做遗传分析的SNP有800多个。
金力不屑搞这点钱。下面的青椒副教授们搞的,也不完全是盈利为目的,没开公司。
所以楼主要是商业化起来,还是有点意思的。
【在 M*****n 的大作中提到】 : Y 那么小一段儿,能有多少SNP? 复旦岂不是要赚死了?是不是金力卢大儒在搞? : : 的。
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a********k 发帖数: 2273 | 13 23andme做全基因组SNP的总费用才200刀左右,他现在每年赔钱占领市场,千万刀级别
的赔钱。有google在后面撑腰罢了,闲杂人等还是算了。
如果Illumina送你仪器,(23andme和一些大公司的仪器很多是送的),几十万就差不
多了。
【在 m*****e 的大作中提到】 : 请教这里的各位,像23andme这样99美元的基因测序,大概需要什么样的设备?主要步 : 骤是什么?需要几个工作人员?我主要是想了解一下,组建这样一个实验室,要怎样的 : 规模和成本。多谢了。
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w****w 发帖数: 521 | 14 有没有类似http://pkdb.mayo.edu 这样的包含其它基因和疾病的数据库?如果有的话临床应该很有用。
【在 w***a 的大作中提到】 : 关键还不是测序,是背后不断update的database。 : 这玩意不是凑几个wsn那么容易就山寨出来的。
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b****r 发帖数: 17995 | 15 HGMD,非常好用的数据库,据我所知基本是手工trim的。估计你砸几千万刀和几年时间
,还赶不上它数据质量,更别说声誉了
这行虽然动静不大,其实门槛已经相当高了。要找个niche很不容易。我觉得这个领域
的大突破应该还是会来自于技术方面,比如新的测序技术或者array技术,可惜那应该
基本是物理或者化学或者工程领域的东西
【在 w****w 的大作中提到】 : 有没有类似http://pkdb.mayo.edu 这样的包含其它基因和疾病的数据库?如果有的话临床应该很有用。
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b****r 发帖数: 17995 | 16 我倒觉得这个数据库几个wsn就能搞个大概了。我最近考虑过做一个相关的检测项目,
研究过一下,基本上都是基于well known 的mutation,数量并不是太大,更新也谈不
上多快,而且又没有太大的法律风险,反正不是诊断
【在 w***a 的大作中提到】 : 关键还不是测序,是背后不断update的database。 : 这玩意不是凑几个wsn那么容易就山寨出来的。
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w****w 发帖数: 521 | 17 现有的测序技术还不够?我觉得如果某个疾病病人足够多,应该搞得起来。
【在 b****r 的大作中提到】 : HGMD,非常好用的数据库,据我所知基本是手工trim的。估计你砸几千万刀和几年时间 : ,还赶不上它数据质量,更别说声誉了 : 这行虽然动静不大,其实门槛已经相当高了。要找个niche很不容易。我觉得这个领域 : 的大突破应该还是会来自于技术方面,比如新的测序技术或者array技术,可惜那应该 : 基本是物理或者化学或者工程领域的东西
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w****w 发帖数: 521 | 18 关键还在市场。我帮人写了个癌症风险检测软件,生意好像不怎么样。
【在 b****r 的大作中提到】 : 我倒觉得这个数据库几个wsn就能搞个大概了。我最近考虑过做一个相关的检测项目, : 研究过一下,基本上都是基于well known 的mutation,数量并不是太大,更新也谈不 : 上多快,而且又没有太大的法律风险,反正不是诊断
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b****r 发帖数: 17995 | 19 做生意第一考虑得就应该是性价比
现在的测序还是太贵太贵,而且除了单基因病,其他信息的临床用途还非常有限
【在 w****w 的大作中提到】 : 现有的测序技术还不够?我觉得如果某个疾病病人足够多,应该搞得起来。
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b****r 发帖数: 17995 | 20 可能接近一半的人会死于肿瘤,对于肿瘤,关键我觉得不是市场,而是你的预测能力到
底多准
打个比方,吸烟对肿瘤的预测那么准了,大家仍然觉得不够,还是会去吸
换一个思路,没有病的任何有病的人对健康的追求是不一样的,如果你预测的是肿瘤患
者对什么化疗药物敏感,那对预测能力的要求就会低多了
【在 w****w 的大作中提到】 : 关键还在市场。我帮人写了个癌症风险检测软件,生意好像不怎么样。
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a********k 发帖数: 2273 | 21 去年AACC的仪器奖给了Life,每个SNP成本已经做到了6 cents。现在大公司基本都在换
他家的仪器了。
【在 b****r 的大作中提到】 : 做生意第一考虑得就应该是性价比 : 现在的测序还是太贵太贵,而且除了单基因病,其他信息的临床用途还非常有限
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a********k 发帖数: 2273 | 22 不是测序太贵,是FDA的regulation太贵。
research实验室送个exon的bidirectional也就是$4-$5
到了诊断实验室给病人就到了$400-$500
【在 b****r 的大作中提到】 : 做生意第一考虑得就应该是性价比 : 现在的测序还是太贵太贵,而且除了单基因病,其他信息的临床用途还非常有限
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w****w 发帖数: 521 | 23 就几个SNP,不可能很准的。而且如果false positive,没给癌搞死,先给吓死,不像测
家谱那样可以测着玩。
【在 b****r 的大作中提到】 : 可能接近一半的人会死于肿瘤,对于肿瘤,关键我觉得不是市场,而是你的预测能力到 : 底多准 : 打个比方,吸烟对肿瘤的预测那么准了,大家仍然觉得不够,还是会去吸 : 换一个思路,没有病的任何有病的人对健康的追求是不一样的,如果你预测的是肿瘤患 : 者对什么化疗药物敏感,那对预测能力的要求就会低多了
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w***a 发帖数: 4361 | 24 本来就是风险报告,又不是诊断。
炒股有风险,还不是乌泱乌泱的去炒,被吓死的没几个吧。
【在 w****w 的大作中提到】 : 就几个SNP,不可能很准的。而且如果false positive,没给癌搞死,先给吓死,不像测 : 家谱那样可以测着玩。
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w****w 发帖数: 521 | 25 Pharmacogenetics说起来容易,但要涉及医生,药房,药厂,弄起来还是挺麻烦的。
【在 b****r 的大作中提到】 : 可能接近一半的人会死于肿瘤,对于肿瘤,关键我觉得不是市场,而是你的预测能力到 : 底多准 : 打个比方,吸烟对肿瘤的预测那么准了,大家仍然觉得不够,还是会去吸 : 换一个思路,没有病的任何有病的人对健康的追求是不一样的,如果你预测的是肿瘤患 : 者对什么化疗药物敏感,那对预测能力的要求就会低多了
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b****r 发帖数: 17995 | 26 你说的有一点点对,嗬嗬
FDA也就是今年才开始加入这事,之前其实是由其他机构管理的。FDA近来以后,成本还
要更高
你这个类比不知道你是故意的,还是确实没有基本知识。4-5刀的,那是最便宜的情况
了,客户要批量都弄好引物模版,只要排枪上机器跑一下
诊断实验室拿到的是全血,从抽DNA,买引物模条件,作出PCR,测出很清楚的双向序列
,人工分析完数据,人工写好报告, 所有加一起算。而且有突变总还要再确证一次吧
,又是从抽dna 开始做一遍,这都是质控之外的。而且你不会以为一个基因只要一对引
物吧?单基因检测可以说是临床实验室非常不赚钱的项目,更多是社会服务目的。
【在 a********k 的大作中提到】 : 不是测序太贵,是FDA的regulation太贵。 : research实验室送个exon的bidirectional也就是$4-$5 : 到了诊断实验室给病人就到了$400-$500
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b****r 发帖数: 17995 | 27 再说现在大家都搞NGS 我们开始说得也都是NGS.当然了,成本的算法也是类似的了。更
别说临床上的检测结果关系到患者的健康,就是没有监管,你也得多花点功夫认真做吧?
【在 a********k 的大作中提到】 : 不是测序太贵,是FDA的regulation太贵。 : research实验室送个exon的bidirectional也就是$4-$5 : 到了诊断实验室给病人就到了$400-$500
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w****w 发帖数: 521 | 28 比较了一下PKD1的nonsense/missense mutation:
HGMD 407,Mayo 884,大概300多一点共同。
这里其实mutation matching不是很重要,关键还是准确测序,减少false positive,早
期诊断就有用了。
这个先做long range PCR,不知是否很准确?
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10854095?dopt=Abstract
【在 b****r 的大作中提到】 : HGMD,非常好用的数据库,据我所知基本是手工trim的。估计你砸几千万刀和几年时间 : ,还赶不上它数据质量,更别说声誉了 : 这行虽然动静不大,其实门槛已经相当高了。要找个niche很不容易。我觉得这个领域 : 的大突破应该还是会来自于技术方面,比如新的测序技术或者array技术,可惜那应该 : 基本是物理或者化学或者工程领域的东西
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