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Biology版 - 请问R大牛或者懂RNA-SEQ分析的牛人,DESeq里面怎么对partially replicates的sample进行分析啊?谢!
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z*********8
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请问在DESeq里面怎么对partially replicated的sample分析啊,我有4个组,2组有
replicates,2组没有,建完dataframe后,可以直接对没有replicate的组分析,用“
blind“,也可以对有replicates的组分析,现在我想放在一起分析,人家就报error
>cds=estimateDispersions(cds)
Error in .local(object, ...) :
None of your conditions is replicated. Use method='blind' to estimate across
conditions, or 'pooled-CR', if you have crossed factors.
请问用什么command实现啊?我看了下manual,没有看懂啊!非常感谢
R****n
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nature biotechology 你还要不要脸了!!!迟到的讨论!有些困惑,想问一下各位牛人做试验都重复几次
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