a**********3
发帖数: 86 | 1 如题，现在做一实验。想要探讨A蛋白对于某cell line的作用。低浓度的A作用于细胞
48h后，进行real time RT-PCR检测发现A蛋白显著促进osteocalcin (OCN)(+60%)的基
因表达，而显著抑制osteopontin (OPN)(-27%), dentin matrix protein-1 (DMP-1)(-
64%)及bone sialoprotein（BSP）(-22%)的表达。想进一步深究A对于osteocalcin的基
因表达增强的机制，是否可以从gene promoter方面研究？另一方面，关于A对于其余三
个蛋白特别是DMP-1的抑制作用，又可从哪些方面进行深入探讨？本人为科研新手，希
望大家不吝赐教。 |
C*********h
发帖数: 83 | 2 我感觉RT-PCR或者说QPCR，差异如果<2就不要follow了。 |
C*********h
发帖数: 83 | 3 真要做的话，可以做个array或者RNASeq,看整体基因表达的变化。
再找可能的TF |
a**********3
发帖数: 86 | 4 谢谢回复。那么如果做DNA microarray大约成本要多少？
【在 C*********h 的大作中提到】
: 真要做的话，可以做个array或者RNASeq,看整体基因表达的变化。
: 再找可能的TF
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l********e
发帖数: 415 | 5 mouse phenotype/human disease
没有的话，洗洗睡吧
(-
【在 a**********3 的大作中提到】
: 如题，现在做一实验。想要探讨A蛋白对于某cell line的作用。低浓度的A作用于细胞
: 48h后，进行real time RT-PCR检测发现A蛋白显著促进osteocalcin (OCN)(+60%)的基
: 因表达，而显著抑制osteopontin (OPN)(-27%), dentin matrix protein-1 (DMP-1)(-
: 64%)及bone sialoprotein（BSP）(-22%)的表达。想进一步深究A对于osteocalcin的基
: 因表达增强的机制，是否可以从gene promoter方面研究？另一方面，关于A对于其余三
: 个蛋白特别是DMP-1的抑制作用，又可从哪些方面进行深入探讨？本人为科研新手，希
: 望大家不吝赐教。
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q******g
发帖数: 3858 | 6 可以做些western看看蛋白的表达量，或者做个细胞染色看看。
得到和PCR相似的结果后，如果该蛋白是转录因子，可以做ChiP， 看看是不是直接调控
。如果不是，看看它能和那些转录因子相互作用，或者调控什么信号通路。 |
a**********3
发帖数: 86 | 7 谢谢回复！我也正想考虑做western，你的回复给我不少启发。
【在 q******g 的大作中提到】
: 可以做些western看看蛋白的表达量，或者做个细胞染色看看。
: 得到和PCR相似的结果后，如果该蛋白是转录因子，可以做ChiP， 看看是不是直接调控
: 。如果不是，看看它能和那些转录因子相互作用，或者调控什么信号通路。
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