h******y 发帖数: 173 | 1 蛋白是已知的,并且发现了它有与DNA互作的迹象,怀疑它是个反式作用因子。
目标DNA是个150KB的病毒基因组,已经做成BAC了。
如何把找到与蛋白互作的确定DNA序列?谢谢。 |
m*********D 发帖数: 1727 | 2 ChIP-seq,如果你有针对你蛋白的抗体的话。 |
Z******5 发帖数: 435 | 3 1. 序列分析预测有没有DBD和TAD domain;也可以预测一下有没有已知转录因子的
domain
2. ChIP-seq后做motif富集分析,看看可能是哪些motif
3. 预测出来后,合成短序列做supershift验证 |
h******y 发帖数: 173 | 4 谢谢楼上两位朋友的回答,看来还是躲不过ChIP,但问题是目标DNA是病毒的染色体,没
有核小体结构啊。 |
c***y 发帖数: 615 | 5 一个蛋白的话,pull-down 就可以吧
【在 h******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 蛋白是已知的,并且发现了它有与DNA互作的迹象,怀疑它是个反式作用因子。 : 目标DNA是个150KB的病毒基因组,已经做成BAC了。 : 如何把找到与蛋白互作的确定DNA序列?谢谢。
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