s*****g
发帖数: 2666 | 1 我想设计一个peptdie loop，希望能end to end close而且要稍微稳定点，能不能通过
设计这样一个序列来实现？EEEE(GS)nRRRR,GS用来保持柔顺度，E和R主要是想通过电荷
吸引力来维持这个结构稍微稳定点 | o****e
发帖数: 1011 | 2 怎么“close”？Covalent or Non-Covalent?
带个Proline“拐弯儿一下”比较靠谱。
peptide loop的例子很多吧。这里面用的大概和你说的比较象：
http://www.pnas.org/content/101/51/17867.full
【在 s*****g 的大作中提到】
: 我想设计一个peptdie loop，希望能end to end close而且要稍微稳定点，能不能通过
: 设计这样一个序列来实现？EEEE(GS)nRRRR,GS用来保持柔顺度，E和R主要是想通过电荷
: 吸引力来维持这个结构稍微稳定点
| A******y
发帖数: 2041 | 3 I assume you are going to make the peptide on resin. You can buy glutamic
acid resin conjugated to the resin for head to tail ligation. Your sequence
should be okay, but remember that longer you make it, the harder it will be.
Do not add proline to the sequence, the solid phase synthesis hates proline
and you will likely to fail the elongation after the proline residue.
However, if you like challenge, feel free to do so. The final cycolization
could be tricky, too. You might not be able to do it on resin if the
formation of the ring is not favorable. If you cannot do it on resin, then
you need to cleave off from resin and do a high dilution reaction.
If you want procedures, go request a Novabiochem catalog, its backpages are
literally a textbook on peptide synthesis. | J*J
发帖数: 132 | 4 问题是EEEEE都是正的，RRRR都是负得， 他们自己靠的这么近互相排斥吧？
你说的稳定是指在plasma里， 还是化学稳定性
-340,GS用来保持柔顺度，E和R主要是想通过电荷
【在 s*****g 的大作中提到】
: 我想设计一个peptdie loop，希望能end to end close而且要稍微稳定点，能不能通过
: 设计这样一个序列来实现？EEEE(GS)nRRRR,GS用来保持柔顺度，E和R主要是想通过电荷
: 吸引力来维持这个结构稍微稳定点
| l******a
发帖数: 3339 | 5 D-Pro-L-Pro的beta-turn
有包子没？
【在 s*****g 的大作中提到】
: 我想设计一个peptdie loop，希望能end to end close而且要稍微稳定点，能不能通过
: 设计这样一个序列来实现？EEEE(GS)nRRRR,GS用来保持柔顺度，E和R主要是想通过电荷
: 吸引力来维持这个结构稍微稳定点
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