b******e 发帖数: 545 | 1 谁能给讲讲MALDI TOF质谱的精确度的允许范围。
我的质谱误差从20到500ppm之间,能用吗?我的分子的分子量在2000-4
000之间,是一系列不同分子量(不同数目的取代基)的化合物的混合物打出来的。
误差到了300ppm (分子量差别就是0.5-1.5之间吧)左右的话能报道吗?
如果能有相关的文献就最好了
谢谢! |
L****r 发帖数: 333 | 2 ∆m = 500 x 4000 / 1000000 = 2.0 Da, 这么小的分子量有2.0 Da 的误差,肯
定太大了,做得好肯定能将误差缩小到0.7 Da之内。
你可以将标准品和样品的两个点都点在一个点之内(不要重合),嘀点的时候将液滴停
留在空气中一会儿,待液滴收缩到很小的时候滴下去,你如果能够做到这样,误差肯定
小于0.5 Da (对这么小的分子量来说) |
a****a 发帖数: 389 | 3 分析的角度来说,对于这种小分子我们一般最高5ppm的误差才能发表。以现在的高分辨
质朴水平,这个5ppm应该不难达到 |
b******e 发帖数: 545 | 4 谢谢!看来你还是由不少经验的。
还有个问题,给你发了站内信,希望解答一下。
【在 L****r 的大作中提到】 : ∆m = 500 x 4000 / 1000000 = 2.0 Da, 这么小的分子量有2.0 Da 的误差,肯 : 定太大了,做得好肯定能将误差缩小到0.7 Da之内。 : 你可以将标准品和样品的两个点都点在一个点之内(不要重合),嘀点的时候将液滴停 : 留在空气中一会儿,待液滴收缩到很小的时候滴下去,你如果能够做到这样,误差肯定 : 小于0.5 Da (对这么小的分子量来说)
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b******e 发帖数: 545 | 5 谢谢。
【在 a****a 的大作中提到】 : 分析的角度来说,对于这种小分子我们一般最高5ppm的误差才能发表。以现在的高分辨 : 质朴水平,这个5ppm应该不难达到
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g*****x 发帖数: 3283 | 6 如果calibrate过
300ppm要么是仪器坏了
要么你做的东西不对
吗?
【在 b******e 的大作中提到】 : 谁能给讲讲MALDI TOF质谱的精确度的允许范围。 : 我的质谱误差从20到500ppm之间,能用吗?我的分子的分子量在2000-4 : 000之间,是一系列不同分子量(不同数目的取代基)的化合物的混合物打出来的。 : 误差到了300ppm (分子量差别就是0.5-1.5之间吧)左右的话能报道吗? : 如果能有相关的文献就最好了 : 谢谢!
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b******e 发帖数: 545 | 7 东西是对的,因为分子量的间隔就是一个取代基的不同。仪器应该没问题,应该是
calibration不是太好。
估计需要重新作,同时每次都要小心calibrate一下,因为我做了很多不同取代基的化
合物,有些就符合得不错~20-30ppm,有些就有大的误差
谢谢
【在 g*****x 的大作中提到】 : 如果calibrate过 : 300ppm要么是仪器坏了 : 要么你做的东西不对 : : 吗?
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w******n 发帖数: 13202 | 8 tof的分辨率不高。2000到4000范围的,分子量误差在0.5到1.5的话,也不算过分了。
看你
干啥用了,如果是多肽,可以考虑做个PSD,看看能不能有片段谱。
如果是分子鉴定,还不如送到专门的结构,打高分辨electrospray吧
吗?
【在 b******e 的大作中提到】 : 谁能给讲讲MALDI TOF质谱的精确度的允许范围。 : 我的质谱误差从20到500ppm之间,能用吗?我的分子的分子量在2000-4 : 000之间,是一系列不同分子量(不同数目的取代基)的化合物的混合物打出来的。 : 误差到了300ppm (分子量差别就是0.5-1.5之间吧)左右的话能报道吗? : 如果能有相关的文献就最好了 : 谢谢!
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b******e 发帖数: 545 | 9 谢谢回复
我的就是普通的化学分子,一个多羟基的化合物被修饰了很多个小分子,就是想用质谱
证明是我的东西,理论上应该错不了,只是质朴的分子量差别比我预料的大,又是刚接
触MALDI TOF,问了几个人都是含糊其辞的说误差可能有点大,来这问问看看
【在 w******n 的大作中提到】 : tof的分辨率不高。2000到4000范围的,分子量误差在0.5到1.5的话,也不算过分了。 : 看你 : 干啥用了,如果是多肽,可以考虑做个PSD,看看能不能有片段谱。 : 如果是分子鉴定,还不如送到专门的结构,打高分辨electrospray吧 : : 吗?
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w******n 发帖数: 13202 | 10 哦,这样的话,不推荐用MALDI-TOF,建议做高分辨质谱,比如orbitrap之类。
如果有FT-ICR也可以。
就分子鉴定而言,的确是要ppm非常小了,你2000-4000的分子量,还可以做的很精确的
。electrospray问题不大。
再不济也可用ion mobilty的G2,虽然也是TOF,但是要好很多。
纯粹的MALDI-TOF的强项不是分子鉴定,1000以内还可以凑活,2000以上,就不合乎发
文章的要求了。
【在 b******e 的大作中提到】 : 谢谢回复 : 我的就是普通的化学分子,一个多羟基的化合物被修饰了很多个小分子,就是想用质谱 : 证明是我的东西,理论上应该错不了,只是质朴的分子量差别比我预料的大,又是刚接 : 触MALDI TOF,问了几个人都是含糊其辞的说误差可能有点大,来这问问看看
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w******n 发帖数: 13202 | 11 你可以查一下附近有没有地方做高分辨质谱的service,我以前是送ohio,10块钱一个
样品,很便宜,后来送的人多,就不做了。
iowa也可以:http://hrmsf.research.uiowa.edu/
不算便宜。
你可以问下你们学校搞有机合成的,问问他们高分辨质谱送到哪里去做,这个他们一定
是有路子的,因为现在HRMS在有机里,基本毫无例外都要做的。 |