如何plot巨大data set的heatmap - Statistics版 - 未名存档

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Statistics版 - 如何plot巨大data set的heatmap

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相关话题的讨论汇总
话题: heatmap话题: score话题: data话题: plot

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j***3 发帖数: 142	1 一条直线上有大约 2 million 个点。现在每个点和其他任何一个点都有一个interaction score，在一定的score threshold 下现在已经有～ 10^12个这样的score。 data是这样的： position1 position2 interaction_score ... 请问什么程序能handle这么大的data来plot interaction heatmap？谢谢了。
s*******r 发帖数: 181	2 Gene-gene interaction of imputed genome-wide data? I have used R for heatmap, but definitely not good for 2mx2m. Split by chromsome x chromosome may work.

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