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g*********5
发帖数: 2533 | 2 没有问题。
有人还用人的基因去rescue酵母的knockout呢。 |
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b******k
发帖数: 2321 | 3 你觉得encode给生物学家提供了什么新的insight?基因组里面大量非编码序列是有用的
，这个不需要encode我们也都知道啊。至于具体的protein-DNA binding的信息，老实
说离开了时间和组织特异性那些信息基本没啥用 |
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o**********n
发帖数: 2 | 4 我目前在做lncRNA，现在有的plko系统感觉效率不是很高，想用CRISPR系统来试试？
有没有哪位高人指点一下如果要使用CRSIPR去knock out或者knock down 某个lncRNA，
应该怎样操作呢？
如果在该lncRNA的启动子区域选择位点可行吗？但是又要怎样选择gRNA的序列呢？
或者是不是可以在该基因的两端各设计一条gRNA把它整段剪去呢？
谢谢各位，欢迎讨论 |
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j****x
发帖数: 1704 | 5 你知道一个蛋白编码序列中中，有多少个ATG吗？又有多少个可以作为start codon的
ATG吗？
第二个问题，我觉得所答非所问，或者我没理解你的意思。我重复一遍我的问题，天然
mRNA有多少使用连续两个stop codon的，又有多少出现过通读。谢谢。
E. |
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x****6
发帖数: 4339 | 6 近5年，随着crispr/cas9的技术越来越成熟，它被越来越多的人关注，影响力延伸到普
罗大众。在学术界，这门技术已经普及；在工业界，一系列初创公司应运而生，以
editas为代表，它已经通过第二轮融资，已然是生技初创公司的巨无霸。
在承认它在提高基因编辑，特别是在高等生物里，起到巨大作用的同时，我不禁要问：
它到底解决了什么实际问题？
Genotype-phenotype mapping仍然是一个巨大的黑匣子，我想在未来的几代科学家这个
时间尺度内都将不会改变。人类/动物基因组编码序列就是本天书，现在基本上是看不
懂的；而绝大多数表型，包括疾病，都是多因子影响的。连书都没看懂，怎么去朝着特
定目标去搞修？！请不要举乳腺癌等单基因个例来反驳我，我是在全局的角度说事。
看看当初吊足了科学界和大众口味的ENCODE，一个举国（际）体制项目，就是想搞清基
因组测序之后有什么用。最后只能骗骗看热闹的外行，而在业内早已沦为笑柄，甚至都
有科学家出书来埋汰它。
我认为crispr/cas9是一个极其方便的perturbation tool,能够来帮助我们探索
Genotype-phenotype... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 7 想成立一家技术服务+研发的公司，早期以技术服务为主，在有利润充分保障的情况下
，再考虑向 研发倾斜。
就我自己能力而言，我在质料克隆，基因表达细胞株的建立和某些方面的生物信息学方
面有所专长。
在基因的亚克隆方面（就是把一个基因从一个质粒载体转到客户指定的另一个质粒中）
，我有独门技巧，可以节省不少耗材和时间。亚克隆一个<1kb和5kb基因的质粒的平均
周期分别为3天和10天， 试剂耗材成本平均分别为$15和$80左右。 对于<2kb基因的质
粒亚克隆，以我的方法，一般只要挑选3个克隆即可以得到至少一个阳性质粒克隆，所
以我估计每三天我可以完成至少20个基因以上的亚克隆。我的问题是， 基因亚克隆这
方面市场大不大？
现在市面上的克隆服务多是基因的直接克隆，即用PCR方法将获取的基因插入到公司或
客户指定的质粒中。收费都在$250以上（对<1kb基因而言， 5kb基因大概要上千元）。
这方面我并没有特别的技巧，和那些公司比没有竞争优势。而且基因碱基的多态性太
普遍，PCR克隆到的基因蛋白编码序列不一定会是客户所想要的。暂时无意开展这种类
型的克隆服务。
在基因表达细胞株的筛选与建立方面，... 阅读全帖 |
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n********n
发帖数: 8336 | 8 我们是同一对父母的后裔 ——介绍Y染色体亚当、线粒体夏娃学说
对于生命的起源，一直是人类好奇和探索的领域。进化论者虽然提出了生命进化的学说
，但当下进化论已经很少人问津，因为缺乏严谨、科学的理论支撑。
事实上，现代科学中提出了更为权威的信息，得出与进化论截然不同的结论。
1
生命的遗传信息
19世纪中叶，达尔文在小猎犬号的航程中，透过单透镜显微镜进行观察，提出了进化论
。100多年来，经过某些专家、学者的不断“包装”，此假说居然被塑造成了一个被广
为接受的理论。
随着科学技术的进步，人们观察到了细胞中的染色体、线粒体，以及它们包含的DNA编
码序列，知道了生命更深层的秘密。目前科学家已经确认：“人类细胞中的DNA编码，
是存储生命遗传信息唯一的载体。”
大小如一粒PM2.5雾霾的人类精子，居然包含了23条染色体；在这23条染色体中，竟承
载了30亿个DNA编码。这些编码编织出的秘密，就是从父亲来的全部遗传信息。同样，
在卵子之中，也有23条染色体，只是多了线粒体的16569个DNA编码，总共有30亿个DNA
编码，承载着母系的全部遗传信息。
DNA编码很像电脑软件的编码，不同的是，DN... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 9 #注明译者，请随便转载：）
CRISPR英雄谱
埃里克・兰德（Eric Lander）
小鹿／译
三年之前，科学家们宣布，CRISPR技术能够对真核活细胞进行精准与有效的基因组编辑
。自此，这项技术手段已然震撼了科学界，数以千计的实验室正在将其运用于从生物医
药到农业的各个领域。然而，从一种奇特的细菌重复序列现象的发现开始，到确认这种
现象为适应性免疫系统，进而对它的生物功能特性的了解，直至开发为一项基因工程的
技术，这此前二十载相关的研究历程却不为人所知。本文正是着眼于填补这段科学历史
的空白，它讲述的是观念的演化历史和先锋人物的传奇故事，并且从中获得关于支撑科
学发现的优秀科研环境的启迪。
前言
很难想起曾经有哪一次科学革命像CRISPR这般如此迅速地改变生物学界。仅仅三年之前
，科学家宣布，CRISPR系统，即细菌通过纪录和精准攻击入侵病毒的DNA序列而进行自
身防御的适应性免疫系统，可以利用转化为一项简单而有效的技术在哺乳动物和其它生
物体的活体细胞内进行基因组编辑。CRISPR即此被全球数以千计的实验室运用于广泛的
领域，如创建人类遗传疾病和癌症的复杂动物模型；... 阅读全帖 |
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i*****s
发帖数: 15215 | 10 罕见的冻尸：这具在俄罗斯发现的非常罕见的小长毛象冻尸距今已有42 000年，包
含大量有用的信息。不过，想要了解这种动物曾经赖以生存的生物机能的精确细节，只
能依靠DNA。
生物技术的发展使我们能够重新构建灭绝动物的古基因，并进而研究古生物机体活
着的时候如何运转。利用这种方法，科学家揭开了史前巨兽长毛象如何适应冰河时代严
酷环境的谜题。
撰文 凯文•L•坎贝尔(Kevin L. Campbell) 迈克尔•霍夫瑞特(
Michael Hofreiter)翻译 黄修远 李辉
150多年以来，科学家一直主要依靠骨骼和牙齿化石，来重塑史前生物。骨架能够
告诉科学家这些古生物的体型大小和身体形态；骨骼上的肌肉附着点显示了这些生物究
竟有多么强壮，以及它们可能的移动方式；牙齿形状和磨损程度则揭示了它们的食物种
类。总而言之，研究者们必须想方设法从这些坚硬的化石中获取大量的信息。在某些偶
然的情况下，他们会有机会获得保存完好的干尸或者冻尸。这使得研究者们能够得到更
多细节用以重塑，例如毛发的长度、耳朵的形状、动物最后一顿晚餐所吃的东西等等。
尽管科学家已经能够... 阅读全帖 |
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g*********d
发帖数: 233 | 11 目前表观遗传学(Epigenetics)通常被定义为基因表达通过有丝分裂或减数分裂发生了
可遗传的改变, 而DNA 序列不发生改变[1, 2]。表观遗传学的机
制主要包括DNA 甲基化、组蛋白修饰及非编码RNA。DNA 甲基化(DNA methylation)是指
在DNA甲基转移酶(DNA-methyltransferases, DNMTs)的催化下, CpG 二核苷酸中的胞嘧
啶被选择性地添加甲基, 形成5-甲基胞嘧啶[3, 4]。DNA 甲基转移酶有两种, 其中
DNMT1 主要起维持甲基化的作用, 能使半甲基化的DNA 双链分子上与甲基胞嘧啶相对应
的胞嘧啶甲基化, 可参与DNA 复制双链中新合成链的甲基化[5]; 而DNMT3a 和DNMT3b
主要起形成甲基化的作用, 能在未发生甲基化的DNA 双链上进
行甲基化[6]。DNA 甲基化一般与基因的沉默相关,DNA 去甲基化则与基因的活化相关[7
~9]。
组蛋白修饰(Histone modifications) 是指组蛋白的基础氨基末端尾部突出于核小体,
常在转录后发生变化, 包括甲基化、乙酰化、磷酸化和泛素化等翻译后的修饰... 阅读全帖 |
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S*******C
发帖数: 7325 | 12 ☆─────────────────────────────────────☆
monkeylady (MonkeyQueen) 于 (Fri Feb 12 10:22:39 2010, 美东) 提到:
很多证据，当然我看不懂那些证据了。包括我们东亚人。
☆─────────────────────────────────────☆
phenix0 (super傻蛋) 于 (Fri Feb 12 10:32:44 2010, 美东) 提到:
线粒体DNA
进化树
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monkeylady (MonkeyQueen) 于 (Fri Feb 12 10:39:23 2010, 美东) 提到:
你还懂这个，说说。科普语言，拒绝图标和公式。
☆─────────────────────────────────────☆
phenix0 (super傻蛋) 于 (Fri Feb 12 10:47:11 2010, 美东) 提到:
很久很久以前，非洲有个老太太生了很多小孩。当时的非... 阅读全帖 |
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c*********d
发帖数: 9770 | 13 荒猫牛不耕微信号laoniu003005
功能介绍
好文分享
来源：荒猫之舞
作者：荒猫
中美贸易战告一段落，毫不意外地，咱们又赢了。不过与以往不同的是，这次美国也赢
了，是双赢。据报道，咱们答应了美国减少贸易逆差的要求，所以美国赢了；而因为要
减少贸易逆差，中方将大量增加自美购买商品和服务，这样可以满足咱们不断增长的消
费需求和促进高质量经济发展，所以咱们也赢了。
但让我感觉不可思议的是，这么好的事情，为什么一直不做呢？为什么要在美国政府的
逼迫下去做呢？是因为没有想到？那岂不是说那些人能力低下？是因为想到了而不做，
那岂不是证明了那些人很坏？
而且在美国高调启动贸易战之初，咱们是抱着多大的决心，宁为玉碎不为瓦全，一定要
打赢的，一定要粉碎美国人阻挡咱们大国崛起的阴谋的。当美国提出500亿的清单时，
咱们针锋相对；当美国提出1000亿的清单时，咱们继续应战；而当美国把清单的总价提
高到2000亿的时候，一夜之间，美国就不是阻挡咱们大国崛起，而是有利于咱们大国崛
起了。美国的要求原来是有利于咱们的发展，而不是遏制咱们的发展了。我恍然大悟：
原来以前的针锋相对，是用的激将法，是为了刺激美... 阅读全帖 |
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g*********d
发帖数: 233 | 14 MicroRNA 和病毒
作者：王磊
上海交通大学生命学院研究生
摘要：
microRNA(miRNA)是真核生物体内一组内源性的 21—25nt 长的非编码蛋白质的短序列
RNA，它们能通过碱基配对的方式与生物体中的 mRNA 分子相结合来参与调节基因的表
达。自 2000 年至今，miRNA 的研究发展的速度极快并且影响的范围也非常的广泛，而
且分别在2002年和2003年度中miRNA入选了Science杂志年度十大科技突破。因此，
miRNA是 RNA 研究的又一个突破，被称为 RNA 的第二次革命。目前的研究已发现
miRNA 参与了很多重要的生命活动过程涵盖了发育、凋亡、代谢、人类疾病以及病毒侵
染等方面。在病毒侵染宿主和宿主抵抗病毒的过程中病毒编码的 miRNAs 和宿主编码的
miRNAs 均发挥了重要的作用。这无疑为病毒的侵染以及宿主抵抗病毒的侵染的研究提
供了新的思路和新的领域。因此，本文的主要目的在于阐述 miRNA 的一些基本概况以
及在病毒中主要的研究方向和进展，最后对这个具有跨时代意义的小分子进行展望。
关键词：miRNA vmiRNA 功能 宿主的 miR... 阅读全帖 |
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c***s
发帖数: 70028 | 15 非编码RNA（核糖核酸），被称为生命体中“暗物质”。日前，中国科学技术大学单革教授实验室发现一类新型环状非编码RNA，并揭示了此类非编码RNA的功能和功能机理。成果发表在国际知名杂志《自然·结构和分子生物学》上。
非编码RNA是一大类不编码蛋白质，但在细胞中起着调控作用的RNA分子。正如宇宙间存在着许多既看不到也感觉不到的“暗物质”“暗能量”一样，在生命体这个“小宇宙”中，也存在这样的神秘“暗物质”—非编码RNA。
越来越多的证据表明，一系列重大疾病的发生发展与非编码RNA调控失衡相关。
环形RNA分子最近数年才引起研究人员注意，而此前的研究主要集中于线形RNA分子。单革教授实验室发现的新型环状非编码RNA，被命名为外显子-内含子环形RNA。在论文中，他们还对这类新型环状非编码RNA为何会成为环形而不是线形分子进行了研究，发现成环序列两端经常会有互补的重复序列存在。 |
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r*******g
发帖数: 32828 | 16 本报讯 非编码RNA（核糖核酸），被称为生命体中 “暗物质”。日前，中国科学技术
大学单革教授实验室发现一类新型环状非编码RNA，并揭示了此类非编码RNA的功能和功
能机理。成果发表在国际知名杂志《自然·结构和分子生物学》上。
非编码RNA是一大类不编码蛋白质，但在细胞中起着调控作用的RNA分子。正如宇宙间存
在着许多既看不到也感觉不到的“暗物质”“暗能量”一样，在生命体这个“小宇宙”
中，也存在这样的神秘“暗物质”—非编码RNA。
越来越多的证据表明，一系列重大疾病的发生发展与非编码RNA调控失衡相关。
环形RNA分子最近数年才引起研究人员注意，而此前的研究主要集中于线形RNA分子。单
革教授实验室发现的新型环状非编码RNA，被命名为外显子-内含子环形RNA。在论文中
，他们还对这类新型环状非编码RNA为何会成为环形而不是线形分子进行了研究，发现
成环序列两端经常会有互补的重复序列存在 |
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j**h
发帖数: 126 | 17 中科大发现新型生命“暗物质” 与一系列重大疾病有关
非编码RNA（核糖核酸），被称为生命体中 “暗物质”。日前，中国科学技术大学单革
教授实验室发现一类新型环状非编码RNA，并揭示了此类非编码RNA的功能和功能机理。
成果发表在国际知名杂志《自然·结构和分子生物学》上。
非编码RNA是一大类不编码蛋白质，但在细胞中起着调控作用的RNA分子。正如宇宙间存
在着许多既看不到也感觉不到的“暗物质”“暗能量”一样，在生命体这个“小宇宙”
中，也存在这样的神秘“暗物质”——非编码RNA。
越来越多的证据表明，一系列重大疾病的发生发展与非编码RNA调控失衡相关。
环形RNA分子最近数年才引起研究人员注意，而此前的研究主要集中于线形RNA分子。单
革教授实验室发现的新型环状非编码RNA，被命名为外显子-内含子环形RNA。在论文中
，他们还对这类新型环状非编码RNA为何会成为环形而不是线形分子进行了研究，发现
成环序列两端经常会有互补的重复序列存在 |
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w**********g
发帖数: 1985 | 18 南京大学miRNA理论颠覆转基因安全神话,引世界轰动!
核心提示：南京大学张辰宇教授课题组一项非常令人惊奇的发现——植物的微小核糖核
酸（microRNA）可以通过日常食物摄取的方式进入人体血液和组织器官。并且,一旦进
入体内,它们将通过调控人体内靶基因表达的方式影响人体的生理功能,进而发挥生物学
作用.南京大学的miRNA理论发表以后引起世界极大关注，美国老牌权威杂志《大西洋月
刊》不得不发出惊呼：转基因食品确实具有非常真实的危险，会给人类的健康带来麻烦！
这回真的是“麻烦大了”，因为转基因的生物被人类做了手脚后，牵一发会动全身，那
么复杂的一个巨大系统，往里面插几个基因，算是“已知”的改动，会不会因此多了或
者少了几个microRNA？在新知的微小核糖核酸面前，转基因食品的安全性是不可能有保
证的，因为干转基因、测转基因的那一套“严格的”规定，根本就没有考虑微小核糖核
酸。而肆意生产销售的转基因食品饲料对动物的杀伤力，已经被一再地证明了。那个只
能骗骗傻子和官员的“小鼠7天灌胃”实验，无疑已经永远钉在中国科技史的耻辱柱上
了！
转基因毒蛋白进入人体血液的机理，终于被揭开了!
附文一... 阅读全帖 |
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y***i
发帖数: 11639 | 19 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: sunnyday (艳阳天), 信区: Biology
标 题: Re: 再聊进化论：热运动组装第一个基因 (转载)
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Sep 9 15:47:45 2011, 美东)
跟那些宗教狂很难讲到一起的，他们知道的其实就是一些中学生物学的皮毛，
却让人哭笑不得的喜欢乱发挥去推导一些超过他们学识的东西。
这么说吧，我从来没有听说过有什么“热运动组装第一个遗传密码/基因的理论”
就是有，也就是某少数人想出来的假说，没有经过生物学界的人用实验证明过，
所以他（BHistory）拿这个来当靶子攻击就是乱弹琴。
第二，进化上的早期基因，其实应该是RNA 编码基因。因为RNA本身就有酶活性，
有足够完成一个基本生命体所需要的基本活性（代谢和复制）。而RNA 本身就是由编码
组成的。DNA 可以看作是RNA 编码的一个稳定备份，所以就成了所谓的基因（基因的本
质就是生物信息的稳定备份体）。
即使在现在的有蛋白质为主的生命体里面，仍然有很多DNA 序列是纯粹用来记录RNA而
和蛋白质完全无关的。
第三，从RN... 阅读全帖 |
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s******y
发帖数: 28562 | 20 跟那些宗教狂很难讲到一起的，他们知道的其实就是一些中学生物学的皮毛，
却让人哭笑不得的喜欢乱发挥去推导一些超过他们学识的东西。
这么说吧，我从来没有听说过有什么“热运动组装第一个遗传密码/基因的理论”
就是有，也就是某少数人想出来的假说，没有经过生物学界的人用实验证明过，
所以他（BHistory）拿这个来当靶子攻击就是乱弹琴。
第二，进化上的早期基因，其实应该是RNA 编码基因。因为RNA本身就有酶活性，
有足够完成一个基本生命体所需要的基本活性（代谢和复制）。而RNA 本身就是由编码
组成的。DNA 可以看作是RNA 编码的一个稳定备份，所以就成了所谓的基因（基因的本
质就是生物信息的稳定备份体）。
即使在现在的有蛋白质为主的生命体里面，仍然有很多DNA 序列是纯粹用来记录RNA而
和蛋白质完全无关的。
第三，从RNA过渡到蛋白界的时候，并不是三个密码子决定一个氨基酸的，
所以这个BHistory在文章里面论证了那么久，根本就是空对空乱辩论。
生物界里的实验支持的结论是：在我们这些生物的祖先的早期，其实是两个密码子决定
一个氨基酸。
至于为什么基于RNA的生物 要想到去用氨基酸？其... 阅读全帖 |
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l**********r
发帖数: 4612 | 21 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: wayofflyingg (小小熊熊), 信区: Military
标 题: 南京大学miRNA理论颠覆转基因安全神话,引世界轰动! 核心提示：南京大学张辰宇教授课题组一项非常令人惊奇的发现——植物的微小核糖核酸（microRNA）可以通过日常食物摄取的方式进入人体血液和组
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Mar 30 12:05:49 2012, 美东)
南京大学miRNA理论颠覆转基因安全神话,引世界轰动!
核心提示：南京大学张辰宇教授课题组一项非常令人惊奇的发现——植物的微小核糖核
酸（microRNA）可以通过日常食物摄取的方式进入人体血液和组织器官。并且,一旦进
入体内,它们将通过调控人体内靶基因表达的方式影响人体的生理功能,进而发挥生物学
作用.南京大学的miRNA理论发表以后引起世界极大关注，美国老牌权威杂志《大西洋月
刊》不得不发出惊呼：转基因食品确实具有非常真实的危险，会给人类的健康带来麻烦！
这回真的是“麻烦大了”，因为转基因的生物被人类做了手脚后，牵一发会动全身，那
么复杂的一个巨大系统，往... 阅读全帖 |
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m*****u
发帖数: 723 | 22 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: wayofflyingg (小小熊熊), 信区: Military
标 题: 南京大学miRNA理论颠覆转基因安全神话,引世界轰动! 核心提示：南京大学张辰宇教授课题组一项非常令人惊奇的发现——植物的微小核糖核酸（microRNA）可以通过日常食物摄取的方式进入人体血液和组
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Mar 30 12:05:49 2012, 美东)
南京大学miRNA理论颠覆转基因安全神话,引世界轰动!
核心提示：南京大学张辰宇教授课题组一项非常令人惊奇的发现——植物的微小核糖核
酸（microRNA）可以通过日常食物摄取的方式进入人体血液和组织器官。并且,一旦进
入体内,它们将通过调控人体内靶基因表达的方式影响人体的生理功能,进而发挥生物学
作用.南京大学的miRNA理论发表以后引起世界极大关注，美国老牌权威杂志《大西洋月
刊》不得不发出惊呼：转基因食品确实具有非常真实的危险，会给人类的健康带来麻烦！
这回真的是“麻烦大了”，因为转基因的生物被人类做了手脚后，牵一发会动全身，那
么复杂的一个巨大系统，往... 阅读全帖 |
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x******g
发帖数: 33885 | 23 波士顿海归张辰宇揭穿转基因食品安全神话
【波士顿华人双语网李强报道】近日来，随着美国俄勒冈州一家农场发现转基因小麦出
现在非转基因小麦农田中，后来得到美国部测试证实，而引起世界性关注。虽然美国农
业部强调转基因小麦不会对人体健康产生危害，也没有进入商业流通渠道，欧洲已经要
求测试从美国进口的小麦，日本已经停止进口美国西北部地区的一些品种的小麦，而中
国和菲律宾等多国表示，密切关注事态发展。
这一事件的国际关注度体现了公众对于转基因食品潜在危害的认知，而这一认知过程的
关键人物是一位从波士顿海归的中国生命科学家张辰宇。
张辰宇教授从1995年到2003年在哈佛医学院工作多年，是一位杰出的生命科学家。
从2008年开始，张辰宇教授和他领导的南京大学学生命科学院团队在国际知名学术刊物
上就微小核糖核酸（microRNA）的研究发表了一系列重要论文，让人类对转基因食物的
潜在危害第一次有了以科学实验为依据的认识。
在去年的11月份的第二届健桥医学峰会上，记者同南大生命科学院院长张辰宇教授做了
简短的访谈。作为近年来取得了世界瞩目研究成果的海归学者，张辰宇显得非常平易近
人。他向... 阅读全帖 |
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W*********n
发帖数: 775 | 24 大家好：
现在已克隆出基因编码区的全长cDNA, 想设计Mophilino片断，就得知道此基因mRNA起
始编码区上游25bp的序列。现在有基因组序列， 可否认为基因组序列中起始编码区上
游的25bp也出现在转录后的mRNA序列中？
5’UTR会不会有Intron?
谢谢！ |
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i**i
发帖数: 2042 | 25 2013年度生物制药领域的重大头条可谓"四大"：大手笔、大数据、大裁员、大争议。同
时，NIH和FDA因政治口水战而陷入关门16天。本文将盘点过去12个月内生物制药领域发
生的"四大"事件始末。
理想丰满、现实骨感：FDA勒令23andMe停止售卖基因检测装置
23andMe公司于2007年开始提供解译基因组服务。该公司由Google联合创始人
SergeyBrin前妻AnneWojcicki创立。该公司试图帮助世界各地的人获取自己的基因数据
，并利用这些数据改善生活。23andMe目前已拿到1.61亿投资，其中Google、Milner、
NEA等都是其投资方。
23andMe在提供个人基因检测服务的公司中颇有名气，主要得益于亲民的价格及便利性
。用户只需花费99美元，将2.5毫升唾液放入试管寄到23andMe公司，即可进行DNA测试
。数周后，客户便可在线查看检测结果。通过该项测试，客户可以了解自己的家族起源
、遗传性疾病和过敏药物等。
科技带来进步，也带来问题，如果恰跟食品或医疗有关的话，FDA定会闲不住。FDA已勒
令初创公司23andMe停止售卖其基因检测装置，甚至还附上一封... 阅读全帖 |
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b**u
发帖数: 2761 | 26 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: iwii (猫猫), 信区: Biology
标 题: 2013年度生物制药领域"四大"头条
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Dec 30 14:11:58 2013, 美东)
2013年度生物制药领域的重大头条可谓"四大"：大手笔、大数据、大裁员、大争议。同
时，NIH和FDA因政治口水战而陷入关门16天。本文将盘点过去12个月内生物制药领域发
生的"四大"事件始末。
理想丰满、现实骨感：FDA勒令23andMe停止售卖基因检测装置
23andMe公司于2007年开始提供解译基因组服务。该公司由Google联合创始人
SergeyBrin前妻AnneWojcicki创立。该公司试图帮助世界各地的人获取自己的基因数据
，并利用这些数据改善生活。23andMe目前已拿到1.61亿投资，其中Google、Milner、
NEA等都是其投资方。
23andMe在提供个人基因检测服务的公司中颇有名气，主要得益于亲民的价格及便利性
。用户只需花费99美元，将2.5毫升唾液放入试管寄到23andMe公司，即可进行DNA测试
。数周... 阅读全帖 |
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s*****e
发帖数: 970 | 27 由上海血液学研究所所长陈赛娟院士等人领衔的上海血液学研究所/医学基因组学国家
重点实验室在白血病研究领域又有重大发现。该研究团队利用第二代测序技术在国际上首
次对急性髓细胞白血病M5亚型（AML-M5）——急性单核细胞白血病进行了全外显子组测
序，解读了基因组中基因编码区域的信息。他们发现表观遗传学调控中的一个重要基因——
DNA甲基转移酶（DNMT3A）基因在AML-M5中存在高频突变，该基因的突变与患者的不
良预后密切相关；对其编码蛋白质的功能研究表明DNMT3A突变很可能在单核细胞系受累的
急性白血病的发病机理中发挥重要作用，他们的结果为该类白血病的预后预测提供了新的分
子标志，也为其治疗提供了新的思路。2011年3月13日，《自然遗传学（Nature Genetics
）》杂志以长文形式（article）系统报道了这项研究结果，表明中国科学家在肿瘤基因组学
的研究领域已经跻身于世界一流行列。
急性单核细胞白血病是一种特殊类型的急性髓细胞白血病，表现为骨髓和外周血原始和
幼稚单核细胞增多，其临床进程凶险，患者易发生髓外浸润，3年平均无病生存率仅有25%，
且复发率高。因而寻找特异... 阅读全帖 |
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f***y
发帖数: 4447 | 28 http://scitech.people.com.cn/n1/2017/0310/c1007-29135176.html
人工合成4条酵母染色体 我国科学家开启“再造生命”新纪元
人民网北京3月10日电（记者赵永新）大姑娘出嫁——头一回！3月10日出版的国际顶级
学术期刊《科学》，以封面的形式同时刊发了中国科学家的4篇研究长文！
由天津大学、清华大学和华大基因分别完成的这4篇长文，介绍了真核生物基因组设计
与化学合成方面的系列重大突破：完成了4条真核生物酿酒酵母染色体的从头设计与化
学合成——要知道，酿酒酵母总共有16条染色体，此前国际同行奋斗多年才发现了一条。
在合成染色体的过程中，他们还突破了生物合成方面的多项关键核心技术，比如：突破
合成型基因组导致细胞失活的难题，设计构建染色体成环疾病模型，开发长染色体分级
组装策略，证明人工设计合成的基因组具有可增加、可删减的灵活性，等等。这些技术
将帮助在全世界的生命科学研究和相关实际应用中大显身手，其价值不可估量。
国内外同行指出，这是继合成原核生物染色体之后的又一里程碑式突破，开启人类“设
计生命、再造生命和重塑生命”的新纪元。
参与... 阅读全帖 |
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p***r
发帖数: 20570 | 29 大善人Bill Gates在非洲另外一个大笔投资是什么来着？转基因作物。
http://blog.sina.com.cn/s/blog_4134ba9001017wqm.html
转帖：纠正方舟子的错误
(2011-02-08 20:37:02)
转载
标签：
转基因
方舟子
食品
美国
中国
文化
分类： 转帖
题记：曹明华是我多年老朋友，目前在美国工作。不久前方舟子批评了曹明华，内
容主要针对曹明华两年前在国内出版的一本书《生命科学手记》，但批评涉及面超出了
这本书本身。最近，曹明华写了一篇回应文章，原标题为《回答方舟子》。原文较长，
我略作了些删改，转帖在这里。现标题是我改的，目的是醒目些。以下是曹明华的文字：
到目前为止，我总共发表过两篇反对转基因食物的文章和一篇以温和的口吻谈论“
中医之争”的文章，却因此招致方舟子先生对我的攻击：“学过分子生物学而崇拜中医
、攻击转基因技术的很罕见，现发现了一个……”，“她那书应该改名叫《生命伪科学
手记》，在《文汇报》的专栏也应该相应改名。这种人学生物学，是一场误会……”。
并且，方舟子先生不惜对我使用了“痛恨（！）... 阅读全帖 |
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w*********g
发帖数: 30882 | 30 英国《自然》杂志首次公布人类蛋白质组草图
字号:小中大2014-05-30 17:19:37
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37
关键字 >> 蛋白质蛋白质组《自然》杂志英国科学技术技术突破草图生物技术科技前沿
28日出版的英国新一期《自然》杂志，公布了人类蛋白质组草图绘制工作的里程碑成果
：两个小组发表了对人体组织、体液和细胞所做的质谱分析，标绘了人类蛋白质组草图。
如果说基因是描述生命奥秘的图纸，蛋白质就是构成生命的具体建筑材料。在人类基因
组草图完成后，科学家尚不能借此完全解释生命现象，因为有些基因信息不会真的表达
为蛋白质，而人类的生、老、病、死也只有在蛋白质这个更直接的层面上才能得到解释
。因此如果想要阐释人类生命活动及其病理机制的实质，必须绘制人类蛋白组。
上世纪90年代，人类基因组计划开始成形时，有科学家提出了破译人类蛋白质组的想法
。其目标是将人体所有蛋白质归类并描绘出它们的特性、在细胞中所处的位置以及蛋白
质之间的相互作用。中国科学家在这个工程中，主要负责人类肝脏蛋白组计划。但人类
蛋白质组的规模和复杂性使此类研究困难重重。
蛋白质
编码一个蛋白质氨基酸序列的基因的DNA序列
《自然》发表人... 阅读全帖 |
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c*******d
发帖数: 192 | 31 这几天看了toptip的高通量DNA测序技术在生物学研究中的应用,,受益匪浅.. 俺们实验
室的研究也focus这种应用..所以平时也作了很多数据分析.. 这里比较一下两种测序的
平台(solid和solexa),,相关的软件,,也讨论一下他们的应用.. 本人经验有限,,本文权
当抛砖引玉,,希望各位大侠多多指教:
1. raw sequence 编码
SOLiD: Solid采用color-coded序列输出. 所以输出的序列除了首位以外,,都是数字(0-
3). 没两位编码一个nucleotide.. T0132123. 然后根据一个编码表,,可以转换成
nucleotide序列.
Solexa: 输出采用nucleotide编码, 不需要任何转换..
2. yield
两种测序技术每个单位的yield都在15M左右 (最近一次solexa平均yield约20M per
Lane).. 好像solid是spot,, solexa叫lane..solid每次可以测8个spot,, solexa每次
可以测序8个lane.. 所以从raw输出的数量来说,,两个没有大的差别..
3. S |
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l********n
发帖数: 260 | 32 两年一次的中科院院士增选总是你那么令人瞩目，鉴于2011年和2013年产生的系列“事
件”，本次科学院院士增选选择了直接公布了第二轮名单。何以见得？2011年初步候选
名单77人，进入第二轮30人，最终当选9人（朱玉贤、张学敏、张明杰、李林、赵玉沛
、康乐、黄路生、舒红兵、葛均波）；2013年初步候选名单88人，第二轮没有公布，最
终当选9人（金力、赵继宗、施一公、桂建芳、高福、韩家淮、韩斌、程和平、郝杰）
。从名单上看纯临床医学背景1-2个，作物遗传昆虫~2个，纯生命科学和医学基础5-6个
；2015年实际上是直接进入第二轮名单，候选人30个。
虽然2015年生命学部院士候选人没有首轮名单，但是根据几个一级专业学会（遗传
、生化分子、细胞）推荐的名单约略可以知道部分候选人信息，这部分详见博文2015年
院士增选生命科学领域部分公示名单，不过很遗憾细胞生物学会推荐的董晨教授没能进
入第二轮，国内免疫领域董晨教授的学术水平国内应在Top3（个人觉是No.1^_^），此
次没能进入第二轮可能主要是因为回国时间短。一下是摘录清华官网对董教授的介绍：
董晨教授是世界上著名的免疫学家... 阅读全帖 |
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a****o
发帖数: 1786 | 33 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: cnDiehard (半杯), 信区: Biology
标 题: 也谈next-generation sequencing technology
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Nov 29 14:41:44 2009, 美东)
这几天看了toptip的高通量DNA测序技术在生物学研究中的应用,,受益匪浅.. 俺们实验
室的研究也focus这种应用..所以平时也作了很多数据分析.. 这里比较一下两种测序的
平台(solid和solexa),,相关的软件,,也讨论一下他们的应用.. 本人经验有限,,本文权
当抛砖引玉,,希望各位大侠多多指教:
1. raw sequence 编码
SOLiD: Solid采用color-coded序列输出. 所以输出的序列除了首位以外,,都是数字(0-
3). 没两位编码一个nucleotide.. T0132123. 然后根据一个编码表,,可以转换成
nucleotide序列.
Solexa: 输出采用nucleotide编码, 不需要任何转换..
2. yield
两种测序技术每个单 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 34 单分子RNA-seq 测序仪器的错误率从15%减少到了不到0.1%。
pls refer :
美研究人员成功解码“学习能力”相关基因
translation from article:
Hybrid error correction and de novo assembly of single-molecule sequencing
reads
by
Koren S. et al. Nat Biotech (2012)
2012-07-18
据外媒报道，有US科学家称，他们组合了一条更完整的基因链条，这个基因链条可
以控制鹦鹉模仿主人和其他声音的能力。
研究者用一种新技术分解了鹦鹉的基因组中的某个区域，进行了单分子测序，并用
来自较早的DNA解码设备的数据对其进行了纠错。研究者还解码了来自玉米和细菌的难
以测序的基因物质，以此来证明他们新的排序方法。
单分子测序“在去年获得了大量宣传”，因为它产生了测序长读取，“使组装基因
组中的复杂部分变得更容易，”研究参与者之一，Duke大学的神经生物学家Erich
Jarvis说。
Jarvis对那些控制鹦鹉模仿能力的序列很感兴趣，因为它们能... 阅读全帖 |
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p*******m
发帖数: 20761 | 35
当前用来保护互联网数据所采用的技术主要为代码加密。但是由于量子计算机强大的计
算能力，使其可能在未来的某一天可以找到破解这些加密技术的算法，随之这些加密算
法便变得不再安全。华盛顿州立大学数学学习中心的导师Nathan Hamlin，就正在为这
种未来的可能的不安全做着准备。
Nathan Hamlin 最近将他的一片新的文章发表在了《离散数学开放杂志》（Open
Journal of Discrete Mathematics）上。在这篇文章中，他解释了一段他为博士论文
所写的名为“通用背包编码”（Generalized Knapsack Code）的代码，如何阻止下一
代拥有量子计算机的黑客们的攻击。
这篇文章澄清了对公共秘匙编码这个复杂领域的误解，并且为那些在量子计算时代
终将承担起设计新的互联网安全系统重任的科学家们，提供了一个共同的基本的认知起
点。
Hamil 说“设计安全系统以保护数据，这项工作会涉及来自许多不同领域的专家，
他们的工作方式也会有很多的不同点。所以在某一时刻的工作中可能会包括纯粹的数学
家、应用数学家、计算机程序员和工程师多方的参与。为了实现在现实工作中的... 阅读全帖 |
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H********g
发帖数: 43926 | 36 如果光比蛋白质基因的有无和差别，那人和猩猩的蛋白质序列的确就差1%，这不令人吃
惊。蛋白质就像是低级的函数，把这些蛋白质堆积起来是堆不出细胞的。真正的程序是
怎么用这些蛋白质。我觉得对这个问题，到目前为止我们的理解都相当少，比如说一个
人蛋白质基因，通常非编码区可以占到整个序列的90%以上，这些地方到底说了些什么
，我们的理解很少吧。如果在一大段乱码区，藏着小段小段的控制字符，那就是说序列
和序列的权重是不同的。如果1%的差别大多在权重高的地方，实际的效果也许是50%以
上的差别。
说星星和人96%都一样的这个文章是2005年左右的。似乎主要的对比都是在比蛋白质序
列。对非编码区的理解至今都比较浅，估计比了也白比：不知道哪里是重要的，哪里是
不重要的。
http://genome.wellcome.ac.uk/doc_WTD020730.html
The consortium found that the chimp and human genomes are very similar and
encode very similar proteins. The DNA sequence... 阅读全帖 |
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g*********d
发帖数: 233 | 37 RNA干扰及其在动物繁殖中的应用
2009-12-28
RNA 干扰(RNA interference, RNAi)是生物进化过程中遗留下来的一种在转录后通
过 RNA 调控基因表达的机制, 它是指在真核细胞中引入双链 RNA分子从而导致具有序
列同源性的基因产生特异性基因沉默 (gene silencing)的现象 。由于 RNA干扰可以阻
断特定的基因表达, 具有超越疫苗和抗病毒药物的诸多优点, 因此在阐述基因功能以及
蛋白质相互作用等方面, 表现出诱人的前景。近年来随着分子生物学的发展, RNAi 的
机制也不断被阐明, 同时国内外研究也证实 RNAi 技术可以为动物繁殖过程中所涉及的
基因功能提供一条新的思路, 这在科研和生产实践上都具有重要的意义。
1 RNAi的发现
Matzke 等于 1989 年报道了启动子介导的序列同源性基因共转染烟草可引起转
基因表达发生沉默。 1990 年, Napoli 和 Van der Krol 等为了让矮牵牛花的颜色更
加鲜艳, 把与紫色相关的查尔酮(chalcone)基因转染到牵牛花内, 结果意外发现, 植物
体的颜色... 阅读全帖 |
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V**3
发帖数: 12756 | 38 关于 新冠病毒来源 的专业分析
新冠病毒神秘来源
Original 刘永 大卫深观察 2 days ago
随着新冠肺炎对全球的威胁与日俱增，越来越多的各国专家也对新冠病毒（2019-nCoV
或SARS-CoV-2）的来源投下更多关注的目光。本文从流行病学调查、病毒基因比对、跨
物种感染研究以及关键的“中间宿主”等领域，对新冠病毒来源进行了全景式梳理与深
度挖掘，为读者提供一个深刻而全新的视角。
一、华南海鲜市场：备受争议的“疫源地”
二、病毒学证据：武汉新冠病毒2019-nCoV的基因异样之处
三、石正丽：疑云笼罩的冠状病毒跨物种感染研究
四、穿山甲之谜：突如其来的“中间宿主”
自从武汉爆发新冠肺炎迄今，已经过去了两个月，但科学界对这个神秘的新冠状病毒“
2019-nCoV”（也叫SARS-CoV-2，本文简称新冠病毒）的认识依然十分有限。此次疫情
爆发的源头是华南海鲜市场吗？当局称新冠病毒来自原始宿主蝙蝠，华南农业大学几位
学者甚至声称他们找到了中间宿主穿山甲。但科学界对病毒基因序列的研究以及大量科
学文献的比对查证，均显示这个病毒的来源并非如此简单。
一、华南海鲜市场：备受... 阅读全帖 |
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d*******g
发帖数: 8992 | 39 武汉病毒所是疫情源头?石正丽:阴谋论者不相信科学
2020-02-06 19:24:55 来源: 澎湃新闻
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（原标题：武汉病毒所是疫情源头？无事实依据，学者呼吁不要凭空假设）
中国唯一的P4生物安全实验室所在地中科院武汉病毒研究所，近日卷入了“新冠病毒源
头”风波。
该研究所的石正丽研究员率领的团队是蝙蝠病毒研究领域的权威，也是中国SARS（严重
急性呼吸道综合征）病毒的源头攻克团队。然而，随着疫情的进展，“实验室病毒泄漏
”、“人为制造新病毒”等流言开始笼罩在武汉病毒研究所及石正丽等人身上。
2月2日下午，石正丽在朋友圈回应：“2019新型冠状病毒是大自然给人类不文明生活习
惯的惩罚，我石正丽用我的生命担保，和实验室没有关系。”石正丽曾经的合作伙伴、
美国非营利组织生态健康联盟（EcoHealth Alliance）疾病生态学家Peter Daszak在接
受《科学》杂志（Science）采访时也表示，每当新疾病、新病毒出现时，都会产生诸
如实验室泄漏或者生物工程制造一类的“阴谋论”，“这令人... 阅读全帖 |
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d*******g
发帖数: 8992 | 40 要是看不懂报道的内容，那还是别传播病毒是人工编辑并从实验室泄露的谣言啦。
当然，对于独轮运，造谣是天赋人权！
----------------------
https://news.163.com/20/0206/19/F4NOA6MQ0001899N.html
武汉病毒所是疫情源头?石正丽:阴谋论者不相信科学
2020-02-06 19:24:55 来源: 澎湃新闻
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（原标题：武汉病毒所是疫情源头？无事实依据，学者呼吁不要凭空假设）
中国唯一的P4生物安全实验室所在地中科院武汉病毒研究所，近日卷入了“新冠病毒源
头”风波。
该研究所的石正丽研究员率领的团队是蝙蝠病毒研究领域的权威，也是中国SARS（严重
急性呼吸道综合征）病毒的源头攻克团队。然而，随着疫情的进展，“实验室病毒泄漏
”、“人为制造新病毒”等流言开始笼罩在武汉病毒研究所及石正丽等人身上。
2月2日下午，石正丽在朋友圈回应：“2019新型冠状病毒是大自然给人类不文明生活习
惯的惩罚，我石正丽用我的生命担保，和实验室没有关系。”石正丽... 阅读全帖 |
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l**n
发帖数: 7272 | 41 虽然这里的码工比较少，但是能appreciate coding和programming的朋友也可以看看。
我觉得挺有意思的。
http://blog.sina.com.cn/s/blog_5d90e82f01014k5j.html
我想通过这篇文章解释一下我对 Unix 哲学本质的理解。我虽然指出 Unix 的一个设计
问题，但目的并不是打击人们对 Unix 的兴趣。虽然 Unix 在基础概念上有一个挺严重
的问题，但是经过多年的发展之后，这个问题恐怕已经被各种别的因素所弥补（比如大
量的人力）。但是如果开始正视这个问题，我们也许就可以缓慢的改善系统的结构，从
而使得它用起来更加高效，方便和安全，那又未尝不可。同时也希望这里对 Unix 命令
本质的阐述能帮助人迅速的掌握 Unix，灵活的应用它的潜力，避免它的缺点。
通常所说的“Unix哲学”包括以下三条原则[Mcllroy]：
一个程序只做一件事情，并且把它做好。
程序之间能够协同工作。
程序处理文本流，因为它是一个通用的接口。
这三条原则当中，前两条其实早于 Unix 就已经存在，它们描述的其实是程序设计最... 阅读全帖 |
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o***s
发帖数: 42149 | 42 9月9日下午，有“中国版诺贝尔奖”之称的第二届“未来科学大奖”在北京揭晓。
据澎湃新闻报道，清华大学教授、结构生物学家施一公，中国科学技术大学教授、量子通信卫星“墨子号”首席科学家潘建伟，北京大学国际数学研究中心教授许晨阳分别获得“生命科学奖”、“物质科学奖”和“数学与计算机科学奖”，奖金各为100万美元。
施一公、潘建伟、许晨阳
未来科学大奖：中国版“诺贝尔奖”
2016年，未来科学大奖正式设立，成为中国大陆第一个由科学家、企业家群体共同发起的民间科学奖项。一年一届，未来科学大奖的颁奖对象不限国籍，但需要是在大中华地区（包含中国大陆地区、香港、澳门及台湾）完成研究的科学家，且研究要具备原创性、长期重要性和巨大的国际影响。
从奖金金额上看，这也将成为中国金额最高的科学奖项，高于国家最高科学技术奖的500万人民币。
之所以称为民间科学奖项，是因为和国家最高科学技术奖等政府设置的奖项不同，未来科学大奖是一次科学界和商业圈联袂设立的奖项。此外，未来科学大奖和民间一些家族或个人设立的奖项不同，在奖金来源上，创投公司和上市公司的大鳄们为共同捐赠人。其中，丁健、李彦宏、沈南鹏、张磊捐赠“生命科学奖... 阅读全帖 |
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d****n
发帖数: 10034 | 43 今天很多人都被一则“一对名为露露和娜娜的基因编辑婴儿于11月在中国诞生”的消息
震撼了。旋即掀起了一阵舆论热潮。
事情大致是这样的，深圳一位科学家使用名为CRISPR-Cas9的基因编辑技术修改了一对
人体胚胎的基因，来达到预防HIV病毒的目的。
提到CRISPR-Cas9，正如它的主要发明者之一，加州大学伯克利分校的生物化学家詹妮
弗·杜德娜（Jennifer Doudna）所说的，这项技术的灵感来源于细菌。它可以驾驭细
菌的免疫系统、截断甚至破坏单个基因，然后在它们的相应位点上插入新的基因。它是
当前最强大的、实用化的基因修改工具。
这么说吧，科学家用它创造出不长角的牛已经根本不是难事。一切的限制，只在于伦理
道德和监管政策。
2017年，美国国家科学院就发布过一份题为《人类基因编辑：科学、伦理和治理》的研
究报告，是迄今该领域最全面的相关研究报告之一。非常非常令人意外，报告认为在条
件高度受限的情况下，应该允许科学家从事编辑人类活胚胎的研究。这一结论引起了巨
大的争议。
关于中国基因编辑婴儿这一事件，曾光临造就做过专题演讲的中科院生物化学与细胞生
物学研究所研究员、博士生导师吴立... 阅读全帖 |
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d****n
发帖数: 10034 | 44 南方科技大学副教授贺建奎，在第二届人类基因组编辑峰会召开前一天（11月26日）宣
布：一对名为露露和娜娜的基因编辑婴儿于11月在中国健康诞生。
报道还表示，露露和娜娜在胚胎形成时经过基因剪刀CRISPR/Cas9对其生殖细胞核中一
个基因（CCR5）进行了编辑修改，这使得她们出生后即能天然抵抗艾滋病（世界首例）
，也意味着中国在基因编辑技术用于疾病预防领域实现历史性突破。
消息发出后，全网立马引发了“基因编辑婴儿”的热议。
基因编辑，究竟是怎样一门科学技术
基因编辑神器CRISPR
我们知道人类的遗传信息都是存储在DNA中，而DNA是由ATCG四种核苷酸来编码遗传信息
。人类的基因组里一共有30亿个碱基，30亿个核苷酸，可以编码两万五千个基因，而每
一个基因都编码一种蛋白质。
蛋白质是我们生命活动的执行者，它不仅组成了我们的身体，也决定了我们如何运动和
思考。因此，基因上的差别会造成我们每个人的差异。而一旦这些基因发生突变，就会
导致一些遗传疾病。
但如果我们能想办法将突变的那个碱基纠正的话，就意味着可以治疗这种疾病。所以，
科学家一直对基因编辑技术非常着迷，只是苦于长时间无法突破。
... 阅读全帖 |
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d****e
发帖数: 10 | 45 ［文献俱乐部 2007－2－7］
SNP可能位于基因编码区内，也可能出现在非编码区。位于编码区内的SNP(称为cSNP)较
少。但它在遗传性疾病研究中却具有重要意义，尤其是非同义cSNP(non-synonymous
cSNP),单个核苷酸的改变使得其指令翻译的蛋白质序列发生改变，从而可能直接影响蛋
白质的功能。
同义cSNP(synonymous cSNP),不影响蛋白质的氨基酸序列，所以一般认为突变碱基与未
突变碱基的含义相同。
今天，我向大家推荐一篇研究文章，讲述了一个很罕见的故事：同义cSNP改变了蛋白质
结构。
摘要请阅 http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/315/5811/525
明天文献俱乐部后再向大家汇报大牛们是如何评价的。欢迎问题和点评。 |
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p*****n
发帖数: 981 | 46 ☆─────────────────────────────────────☆
danube (Astro Boy ~~ 木桶阿碧铁) 于 (Wed Feb 7 20:01:14 2007) 提到:
［文献俱乐部 2007－2－7］
SNP可能位于基因编码区内，也可能出现在非编码区。位于编码区内的SNP(称为cSNP)较
少。但它在遗传性疾病研究中却具有重要意义，尤其是非同义cSNP(non-synonymous
cSNP),单个核苷酸的改变使得其指令翻译的蛋白质序列发生改变，从而可能直接影响蛋
白质的功能。
同义cSNP(synonymous cSNP),不影响蛋白质的氨基酸序列，所以一般认为突变碱基与未
突变碱基的含义相同。
今天，我向大家推荐一篇研究文章，讲述了一个很罕见的故事：同义cSNP改变了蛋白质
结构。
摘要请阅 http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/315/5811/525
明天文献俱乐部后再向大家汇报大牛们是如何评价的。欢迎问题和点评。
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t***u
发帖数: 368 | 47 特斯拉（一）
Velimir Abramovich
江立军[译]
“事物总是创造于天才的头脑，而非自然。即天才总是在事物真实存在之前就已在
头脑中形成关于它们清晰图象。”
— Augustine Blessed
“我将不再为眼前工作，而是为将来。”在七十年前的纽约特斯拉这样对记者说。
“未来将是我的！”—交流电，多相电机，可逆磁场，无线通信，遥控自动学……的发
明者。特斯拉是个发明家，他的专利奠定了二十世纪力能学的基础，他独自奋斗数十载
研究宇宙形成过程，他还希望就如在他的实际发明中完成对物质和精神的结合那样在理
论上完成这一课题。
现在提起尼古拉·特斯拉的名字，人们肯定会把他和所谓的特斯拉线圈，感应电机
，还有衡量磁场力的国际单位符号联系起来，而遗忘了他的许多生活逸事和非凡的创造
天赋。
特斯拉最多产的创造时期是在美国度过的。他在不同的国家有超过300项的专利发
明。其中很大一部分直到今天仍无法重复。例如：辐射能量接收器。除了知道这是一个
关于宇宙线能量的转换器外我们对它的工作原理一无所知。1899到1900年间，在科罗拉
多泉的特殊实验室里他全身心地投入到低频电磁振动的研究中。两年... 阅读全帖 |
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c**c
发帖数: 2593 | 48 嗯，很对，人类在灭亡之前怎样有意识地留下文明的证据，向宇宙声明自己存在过，让
后世别的文明（如果有的话）凭吊，确实是一个问题。在地球表面建大型纪念碑，就算
能长久挺得住风雨天气变化，也不见得能经得住亿万年地壳运动、地质变迁的考验，说
不定什么时候就给埋到地壳深处，或者融到地幔里去了。
在没有大气风化，也没有地壳运动的月球上建纪念碑可能是个选择。
要让完全另一种文明了解我们的语言文字系统，首先也需要设计一套编码体系，而且编
码方式要能自明。首先如果用数字来编码，首先数字的表示方式是什么，要让别人能认
得出来。别的文明肯定是不会明白我们习惯的阿拉伯数字的。所以要用别的自明的方式
，比如用每个小方格里刻的三角形的个数来表示数字，就要安排一个很有规律但又不可
能是自然界自然出现的序列，比如2,3,5,7,11,13,17，质数序列，第一个方格里刻2个
三角，第二个方格里刻3个三角，依此类推。另一种文明发现这些方格，如果去数开头
一系列方格里的三角形个数，发现它们对应的是质数序列，他们就知道这是先前一种智
慧文明留下来的人工信息里的字母表，三角形个数表示数字。
突然想起以前网上看过的一个幼儿园入... 阅读全帖 |
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c**c
发帖数: 2593 | 49 【 以下文字转载自 LeisureTime 讨论区 】
发信人: calc (calc), 信区: LeisureTime
标 题: Re: 有幽默感的女生一例
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Apr 11 01:02:26 2013, 美东)
嗯，很对，人类在灭亡之前怎样有意识地留下文明的证据，向宇宙声明自己存在过，让
后世别的文明（如果有的话）凭吊，确实是一个问题。在地球表面建大型纪念碑，就算
能长久挺得住风雨天气变化，也不见得能经得住亿万年地壳运动、地质变迁的考验，说
不定什么时候就给埋到地壳深处，或者融到地幔里去了。
在没有大气风化，也没有地壳运动的月球上建纪念碑可能是个选择。
要让完全另一种文明了解我们的语言文字系统，首先也需要设计一套编码体系，而且编
码方式要能自明。首先如果用数字来编码，首先数字的表示方式是什么，要让别人能认
得出来。别的文明肯定是不会明白我们习惯的阿拉伯数字的。所以要用别的自明的方式
，比如用每个小方格里刻的三角形的个数来表示数字，就要安排一个很有规律但又不可
能是自然界自然出现的序列，比如2,3,5,7,11,13,17，质数序列，第一个方格... 阅读全帖 |
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l***7
发帖数: 50 | 50 某基因克隆到某载体后，做试验时，请问大家用一般都用什么做negative control？
我以前是用空载体做负对照，但刚到一个新的实验室，他们要求用含有这个基因的反向
序列的载体做负对照。 不知这个反向序列会不会编码其他基因？我同时在做几个基因
，有些基因的反向序列能预测到编码区（ORF）. 谢谢！ |
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