由买买提看人间百态

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全部话题 - 话题: cas9
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n*****2
发帖数: 1432
1
来自主题: Hardware版 - 预备 BF 攒机的清单中。。。
多谢提醒,^_^
现在已经下单和已经到手的自己觉得还行吧:
Seagate 7200.12 1TB (瞄着SSD的deal呢)
XFX GT 240 1G DDR5 (非游戏用户)
Seasonic 650W 80 Plus Gold
Kingston 4*2G DDR3 1600Mhz 1.65v CAS9
华硕那个蓝光光驱是因为基本上我也不用来看碟,顶多装个系统之类的,要好的也没用。
机箱主板CPU都还没下手呢,看来要等到BF了。
s*****o
发帖数: 1565
2
老金,到底买CAS9的还是11的?
我看manual上好像说是11
但是是11-11-11-28还是11-11-11-32?
s*****o
发帖数: 1565
3
来自主题: Hardware版 - 内存混用
两条是2x4GB, 1.35V
609MHz CAS8
685 9
761 10
800 11
另外两条是2x4GB,1.5V
533 7
609 8
666 9
800(XMP) 9
主板不支持XMP
CPU-Z显示是
665MHz CAS9
这么混用靠谱么...?
n********n
发帖数: 529
4
来自主题: Hardware版 - $85的16G DDR3 cas9
需要内存的可以买了。
http://slickdeals.net/f/7152512-corsair-vengeance-16-gb-desktop
s****m
发帖数: 5244
5
来自主题: Hardware版 - $85的16G DDR3 cas9
进了,希望没给cancel lol
i******r
发帖数: 1415
6
来自主题: Hardware版 - $85的16G DDR3 cas9
还好吧,要是2x8这价格还不错
b*****c
发帖数: 165
7
来自主题: Hardware版 - $85的16G DDR3 cas9
为什么还要运费?怎么才能搞到free shipping?
h******l
发帖数: 793
8
来自主题: Hardware版 - $85的16G DDR3 cas9
89 - amex 15 = 74刀16g,这年头ram好贵,哈哈
t*****z
发帖数: 1598
9
来自主题: Hardware版 - $85的16G DDR3 cas9
我前两天遇到$52包邮的4x4GB DDR3-1333 ECC RDIMM。犹豫了下,觉得买来也没用,就
放过去了。
q**********r
发帖数: 465
10
来自主题: Hardware版 - $85的16G DDR3 cas9
放过去是对的。
ECC 的好象不值钱。
a*****8
发帖数: 26
11
来自主题: Hardware版 - $85的16G DDR3 cas9
Order Summary
Sales Order Number: 149897615
Sales Order Date: 11/22/2012 7:51:25 AM
Shipping Method: Super Eggsaver (4-7 Days)
2 x ($44.99) G.SKILL 16GB (2 x 8G) 204-Pin DDR3 SO-DIMM DDR3 1333 (PC3 10600
) Laptop Memory Model F3-10600CL9D-16GBSQ $89.98
Subtotal: $89.98
Tax: $0.00
Shipping and Handling: $0.00
Total Amount: $89.98
Ordered from NewEgg 2 years ago, 4x8G = 32G, only spent $89.98. One pair
used in my Mac Pro, one pair in Thinkpad W520.
w****u
发帖数: 3147
12
来自主题: Hardware版 - $85的16G DDR3 cas9
以前内存便宜硬盘贵,现在都不便宜!
就是费钱

10600
i******r
发帖数: 1415
13
来自主题: Hardware版 - $85的16G DDR3 cas9
现在硬盘挺便宜的吧
h**v
发帖数: 2010
14
来自主题: Hardware版 - low profile内存?
现在的内存的是DDR3 1.5v,准备全部换掉。newegg有mushkin台式机CAS9 DDR3L 1.35v
的内存,这种直接可以用吧?
n******e
发帖数: 163
15
Crispr/Cas9 Genome Editing 已经很成熟,现在只差搞清楚哪里需要编辑。
d*p
发帖数: 534
16
I am talking about general cell therapy. Oncogenic is only one part of the
safety issue. For example, one major concern of T cell therapy is over-
activated T cell might cause autoimmune disease, which is a very common
problem in stem cell and organ transplant, including cancer immunotherapy.
Rosenberg, a big name in cancer immune therapy, killed one patient due to
the infused Her2/neu targeting T cell were activated in lung.
Stem cell therapy actually only account for a small part of cell thera... 阅读全帖
l*********1
发帖数: 351
17
来自主题: Biology版 - Human Genome Engineering Techniques
外行小白请教下:
RNA-programmed genome editing in human cells
RNA-Guided Human Genome Engineering via Cas9
Multiplex Genome Engineering Using CRISPR/Cas Systems
“It’s too early to declare total victory” over TALENs and zinc-fingers,
Church said, “but it looks promising.”
是不是说TALEN engineering的坑就不用跳了啊?多谢指教。
d*******3
发帖数: 15
18
我觉得没什么意义,TALEN出来了完全没ZFN啥事了,本来ZFN的特异性就有很大问题,
而且不是每个基因都能有合适的靶点。并且CAS9更快了。。。去看看Keith Joung的
publication就知道了。
h******y
发帖数: 351
19
Jaenisch lab最新发表的利用CRISPR同时敲除5个基因的文章。CRISPR前途无限啊。再搞
出几个inducible的CRISPR就更厉害了。
One-Step Generation of Mice Carrying Mutations in Multiple Genes by CRISPR/C
as-Mediated Genome Engineering
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23643243
Cell. 2013 May 1. pii: S0092-8674(13)00467-4. doi: 10.1016/j.cell.2013.04.02
5.
One-Step Generation of Mice Carrying Mutations in Multiple Genes by CRISPR/C
as-Mediated Genome Engineering.
Wang H, Yang H, Shivalila CS, Dawlaty MM, Cheng AW, Zhang F, Jaenisch R.
Source
W... 阅读全帖
m**********r
发帖数: 26
20
来自主题: Biology版 - 求paper
Generation of gene-modified mice via Cas9/RNA-mediated gene targeting. Shen
B, Zhang J, Wu H, Wang J, Ma K, Li Z, Zhang X, Zhang P, Huang X. Cell Res.
2013 Apr 2. doi: 10.1038/cr.2013.46
请发至:j*****[email protected]
不胜感谢
a*q
发帖数: 2109
21
来自主题: Biology版 - CRISPR-Cas9 应用到in vivo 了吗?
想做Gene Therapy?
y*********o
发帖数: 37
22
来自主题: Biology版 - CRISPR-Cas9 应用到in vivo 了吗?
线虫的好几篇genetics
m******g
发帖数: 467
23
最近被导师说了,觉得我被distracted了,我自己也这么觉得,不过可能真的心智不够
成熟吧,感觉与自己以及导师的预期差了不少。我会努力的!
新年快乐!
Nature 14.01.09
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原文两篇见science
1. Genome-Scale CRISPR-Cas9 Knockout Screening in Human Cells
评论: CRISPR screen identifies genes
A library of 64,751 guide RNA sequences
Target 18,080 genes in human cells
Genes that are required by cancer and stem cells to survive
稍微了解一下:
1. The effects of genetic variation on gene expression dynamics during
development
2. Diversity of ageing across the tree of life
小知识:
1. Serial Fem... 阅读全帖
m******g
发帖数: 467
24
最近被导师说了,觉得我被distracted了,我自己也这么觉得,不过可能真的心智不够
成熟吧,感觉与自己以及导师的预期差了不少。我会努力的!
新年快乐!
Nature 14.01.09
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m******g
发帖数: 467
25
Nature 14.03.06
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2. DNA interrogation by the CRISPR RNA-guided endonuclease Cas9
a short trinucleotide protospacer adjacent motif (PAM)
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m******g
发帖数: 467
26
Science 14.05.16
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稍微了解一下:
1. Cas9 Targeting and the CRISPR Revolution
2. Border Control - A Membrane-Linked Interactome of Arabidopsis
3. Stick Insect Genomes Reveal Natural Selection's Role in Parallel
speciation
m******g
发帖数: 467
27
Nature 14.05.22
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Genome-defence small RNAs exapted for epigenetic mating-type inheritance
l**********1
发帖数: 5204
l*********y
发帖数: 12
29
据我所知广州的那家公司的质量和可靠性都非常好,老鼠运回美国的话海关也没有问题
。不过基因打靶KO小鼠八九万可能下不来,十万出头吧,也已经很便宜了。他们也用新
的技术TALEN及Cas9做KO小鼠,几万就行。
b********e
发帖数: 50
30

者。
这里都是做科研的人。做广告没有什么,但不能靠忽悠。以下是你的信息:
上站次数:5次,
发文数:4次。
下面是你的4次发文。是赛业的人也没有关系,告诉大家一些实在的东西比较好吧。
发信人: lovebiology (lovebiology), 信区: Biology
标 题: Re: 一两百万启动经费在小地方做老鼠模型是不是不可行?
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Oct 26 19:28:28 2013, 美东)
赛业在转基因,基因敲除模式动物方面做的相当出色,其主要技术骨干均是留学归国人
员,他们帮Stanford, UCSF等科研机构制备了大量的转基因,基因敲除小鼠。
发信人: lovebiology (lovebiology), 信区: Biology
标 题: Re: 海归博士养鼠一对售价18万 销遍近百家实验室(图) (转载)
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Dec 6 11:34:05 2013, 美东)
据我所知广州的那家公司的质量和可靠性都非常好,老鼠运回美国的话海关也没有问题
。不过基因打靶KO小鼠八九万可能下不来,十万出头吧,也已经很便... 阅读全帖
l******3
发帖数: 25
31
来自主题: Biology版 - 请教一个CRISPR-CAS9的问题
从合作者那里拿来了一个某个基因KO的细胞系,他们是用CRISPR系统建的细胞系。如果
我现在要在此基础上过表达该基因的一个突变体,需要先做mutation吗?
a*****n
发帖数: 2835
32
来自主题: Biology版 - 请教一个CRISPR-CAS9的问题
应该不用吧,理论上来说CRISPR系统是瞬时表达的
你可以跟合作者沟通一下
l********e
发帖数: 415
33
来自主题: Biology版 - 请教一个CRISPR-CAS9的问题
当然要做,否则你拿什么表达 ...
T****u
发帖数: 424
34
远还没有到。
Zhang Feng确实很牛。
但Crisp这一系列的paper,除了第一批和Church back to back的那篇science,后面
的double nick,whole genome都是可以想见的,很多人都在做,只是mit资源(人,物
较其他地方多)。
即使Crisp的第一批次的paper,credit很多程度也属于2012年的Science paper,这篇
基本上确定了大的框架,并指出了可以用于genome editing.
http://www.sciencemag.org/content/337/6096/816.full.html
A Programmable Dual-RNA–Guided DNA Endonuclease in Adaptive
Bacterial Immunity
Martin Jinek,1,2* Krzysztof Chylinski,3,4* Ines Fonfara,4 Michael Hauer,2&#
8224;
Jennifer A. Doudna,1,2,5,6‡ Emmanuelle Charpen... 阅读全帖
i**i
发帖数: 2042
35
2013年度生物制药领域的重大头条可谓"四大":大手笔、大数据、大裁员、大争议。同
时,NIH和FDA因政治口水战而陷入关门16天。本文将盘点过去12个月内生物制药领域发
生的"四大"事件始末。
理想丰满、现实骨感:FDA勒令23andMe停止售卖基因检测装置
23andMe公司于2007年开始提供解译基因组服务。该公司由Google联合创始人
SergeyBrin前妻AnneWojcicki创立。该公司试图帮助世界各地的人获取自己的基因数据
,并利用这些数据改善生活。23andMe目前已拿到1.61亿投资,其中Google、Milner、
NEA等都是其投资方。
23andMe在提供个人基因检测服务的公司中颇有名气,主要得益于亲民的价格及便利性
。用户只需花费99美元,将2.5毫升唾液放入试管寄到23andMe公司,即可进行DNA测试
。数周后,客户便可在线查看检测结果。通过该项测试,客户可以了解自己的家族起源
、遗传性疾病和过敏药物等。
科技带来进步,也带来问题,如果恰跟食品或医疗有关的话,FDA定会闲不住。FDA已勒
令初创公司23andMe停止售卖其基因检测装置,甚至还附上一封... 阅读全帖
d*****r
发帖数: 2583
36
这个版是时候需要一些正面榜样了..
北大生物本科, 奥赛金牌, 她以前也是生物PhD,现在也是生物千老,即使手里大公司
牛公司offers一把,全都不去;几个大风投追着跑,却还是坚持做生物千老,这才是生
物千老应该有的样子。坚持做生物的同志里面,她和Zhang Feng走的道路不同,代表了
未来的方向。
http://www.forbes.com/pictures/mkg45mjhl/luhan-yang-28/
http://www.forbes.com/sites/matthewherper/2014/01/06/30-under-3
http://www.linkedin.com/pub/luhan-yang/12/b63/359
Luhan Yang, 28
Cofounder, Egenesis
Yang is trying to engineer personalized organs for drug screening and
transplantation. Her company is using genome engineering technology base... 阅读全帖
d*****r
发帖数: 2583
37
这个版是时候需要一些正面榜样了..
北大生物本科, 奥赛金牌, 她以前也是生物PhD,现在也是生物千老,即使手里大公司
牛公司offers一把,全都不去;几个大风投追着跑,却还是坚持做生物千老,这才是生
物千老应该有的样子。坚持做生物的同志里面,她和Zhang Feng走的道路不同,代表了
未来的方向。
http://www.forbes.com/pictures/mkg45mjhl/luhan-yang-28/
http://www.forbes.com/sites/matthewherper/2014/01/06/30-under-3
http://www.linkedin.com/pub/luhan-yang/12/b63/359
Luhan Yang, 28
Cofounder, Egenesis
Yang is trying to engineer personalized organs for drug screening and
transplantation. Her company is using genome engineering technology base... 阅读全帖
x******g
发帖数: 289
38
1.

Title: A polymer tandem solar cell with 10.6% power conversion efficiency
Author(s): You, Jingbi; Dou, Letian; Yoshimura, Ken; et al.
Source: NATURE COMMUNICATIONS Volume: 4 Article Number: 1446 DOI: 10.
1038/ncomms2411 Published: FEB 2013
Times Cited: 133 (from Web of Science)
Context Sensitive Links
[ View the abstractView abstract ]
2.

Title: Efficient genome editing in zebrafish using a CRISPR-Cas system
Author(s): Hwang, Woong Y.; Fu, Yanfang; Reyon, Deepak; et al.
Sourc... 阅读全帖
b********e
发帖数: 50
39
来自主题: Biology版 - 基因打靶新进展?
这是本版名ID微博上的一段话。这几年Talen和Cas9很火,想知道这个技术现在到什么
地步了? 会不会最终完全取代胚胎干细胞方法呢? 有没有牛人评一下?
“这两天真是太兴奋了。基于EGE系统的大片段基因敲进成功了,使基因敲进和条件性
基因敲除动物制备过程缩短到两三个月,成本也大大降低,使得模式动物能够走入几乎
所有实验室。同时,我们实现了在两个不同基因位点实现同时敲进,使得在动物体内研
究基因相互作用变得更容易。而且,可做物种更多了”。
y***i
发帖数: 11639
40
来自主题: Biology版 - 基因打靶新进展?
去他的微博看了一下,好像是他们公司自己发展出来的技术
“我们用Extreme Genome Editing (EGE)系统通过基因敲进的方式,分别跟ACTB(细胞
骨架)和LMNB1(核蛋白)加上GFP标签。可以看到其效率比CRISPR/Cas9高很多倍。而
且,通过各种检测,发现90%以上是同源重组,随机插入很少。现在我们正在做多基因
敲进,这对于研究细胞内蛋白相互作用非常有帮助。”
“这是在两个不同基因上分别敲进了DsRed和DTR-EGFP,并做成融合蛋白。这次敲进不
是用ODN, 而是比较大的DNA片段敲进。看来我们的EGE系统真的非常好用。是不是应该
发一篇文章。”
v********e
发帖数: 1597
41
来自主题: Biology版 - 基因打靶新进展?
你这么说起来,我想你们没必要申请专利,也不要发表文章,除非你觉得技术被拿走泄
密的可能性很大;而且申请专利未必能保护的了你们,你想啊,别人要是也用你的技术
做敲除,你找出证据说别人侵权的难度很大;而且,你的专利并不是单独的,你需要用
别人的专利去覆盖,不管是talen,还是cas9,现在肯定已经不少专利的,你们要花很多
钱和精力去处理专利的问题,不划算
r***z
发帖数: 19
42
来自主题: Biology版 - 基因打靶新进展?
我猜是donor片段两端设计成带有ngg序列的,利用改造过的不会发生切割的cas9指引
donor到要替换的位点,提高效率
T****u
发帖数: 424
43
来自主题: Biology版 - 求建议. 构建转基因细胞系
Then that's knockin cell line to a specific position.
Cas9 and TALEN will help.
f*********9
发帖数: 258
44
用crispr/cas9
给这个蛋白的chr上加个tag然后做RNA IP
或者用biotin label 的oligo pulldown RNA 核protein 做protein seq
l********e
发帖数: 415
45
来自主题: Biology版 - 9kb gene rescue experiment
crispr/cas9 mediated knockin repair

penetrated
c**********n
发帖数: 177
46
做结构的大部分实验室也不可能随便就发很大文章吧。大牛实验室是年年都有CNS,小
牛实验室估计是几年有个CNS,剩余的实验室(大多数)其实就是发PNAS,structure,
JBC,JMB,biochem。所以说其实所有分支都差不多吧,没有谁好发文章或者谁不好发。
施一公,颜宁这次确实是手慢了。Anyway,总不能啥结构都被他俩抢走吧。。。

science
j******i
发帖数: 939
47
我是说思路。结构领域纯体力活嘛。当然说的好听一点就是技术活。开个玩笑,哈哈。
做生物的大家都不容易。

发。
j******i
发帖数: 939
48
果然!你可以帮我看看那篇文章的结构吗?我看不懂啊。。
E******g
发帖数: 170
49
哪里不懂?
j******i
发帖数: 939
50
你做结构吗?跟我在做的一个project有关。你可以帮我看看吗?我消息你。
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