由买买提看人间百态

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全部话题 - 话题: histones
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发帖数: 1
1
转帖:今天一早打开微信发现“转基因自闭症猴”研究报道刷屏了,两大知名科普微信
公众号“赛先生”和“知识分子”都在第一时间推送了相关报道,同时国内外各大媒体
做了较为详尽的报道。这篇研究论文于今日凌晨在Nature在线发表,标题为《Autism-
like behaviours and germline transmission in transgenic monkeys
overexpressing MeCP2》,同时Nature配发了评论文章《Monkeys genetically
modified to show autism symptoms》。
这项研究是由中科院上海神经科学研究所研究院仇子龙课题组和孙强研究组合作
完成的。这项研究是全球首例利用非人类灵长类动物建立的自闭症研究模型,为后续深
入研究自闭症致病机理和探索治疗自闭症的研究方法奠定了基础。在这里小编就不再重
复今日媒体报道的内容了,今天写这篇文章主要是综合了国外媒体的报道,谈谈这项工
作受到某些人质疑的内容或者说是不足吧。小编首先声明不是来黑这项标志性的具有重
要意义的文章的,本人只是从另一个角度聊聊国内媒... 阅读全帖
b********g
发帖数: 46
2
来自主题: Biology版 - DNA体积不到细胞核的1%
听胖头鱼老师的言论挺有意思,受启发了。
之所以发这篇帖子是突然发现自己对分裂间期DNA的结构存在误解。此处省略283字。
从体积而言,细胞完全没有必要compact DNA,细胞核有非常充足的空间容纳DNA;从长
度而言,细胞核短了些,所以,细胞核需要folding DNA. 细胞自然是需要提供这些辅
助DNA folding 的蛋白供我们研究的。folding 过程中一个很重要的过程是DNA 的折叠
(bending etc),一根长长的DNA需要打很多很多的折子(每个折子长约数微米)才能
容纳于细胞核。细胞想了想,打太多折子并维持着,似乎很费力,加点核蛋白 (
histone)吧,虽然增加了体积 (增加体积了也不是什么坏事啊,根据万有引力定律,
信号分子从核孔进来,更容易找到DNA),但是折子的数目就减少很多了。每个折子之间
加些蛋白 (CTCF, SMC, cohesin etc)来固定下,形成了3C热爱研究的DNA looping。
同一侧的折子上的DNA,也许可以相互作用,就是promoter-enhancer 相互作用了。 同
一侧的折子上的某些基因不需要表达了,直接加些H... 阅读全帖
W*********m
发帖数: 17
3
来自主题: Science版 - paper for help
Luger, K., T.J. Rechsteiner, and T.J. Richmond, Expression and purification
of recombinant histones and nucleosome reconstitution. Methods Mol Biol,
1999. 119: p. 1-16.
Luger, K., T.J. Rechsteiner, and T.J. Richmond, Preparation of nucleosome
core particle from recombinant histones. Methods Enzymol, 1999. 304: p. 3-19.
Email me to w*********[email protected]
Thank you very much
S*******1
发帖数: 1860
4
如果生物科技再发达一点,使用现代人的卵子,把其中的染色体提出来,而把尼安德特
人的染色体注入。
这里可能会有问题。可以按照尼安德特人化石的DNA序列,合成出完整的DNA set。可是
DNA
和histone的甲基化水平如何决定呢?化石不可能测出甲基化水平。
即便成功了,这样的实验伦理上非常说不通。
w********9
发帖数: 8613
5
来自主题: Military版 - 惊讶于德国人的英语能力
这是Shorter Oxford American English Dictionary第五版列出的与德语或者日耳曼语
相关的英语词根或词汇。
-at, suffix2. + -dom, suffix. + -ed, suffix1. + -ed, suffix2. + -en, suffix1
+ -en, suffix2 + -en, suffix5 + -en, suffix6 + -er, suffix1. + -er, suffix3
. + -er, suffix5. + -est, suffix1. + -est, suffix2. + -et, suffix2. + -eth,
suffix1. + -hood, suffix. + -ing, suffix1. + -ing, suffix3. + -ish, suffix1.
+ -kin, suffix. + -le, suffix1 + -le, suffix3 + -less, suffix. + -ling,
suffix1. + -ling, suffix2 + -ly, suffix1. + -ly, s... 阅读全帖
d********m
发帖数: 3662
6
就这么说吧,你能让细菌基因组自然的包上histone就行
x****6
发帖数: 4339
7
e coli里面有histone类似的结构:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC179140/
d********m
发帖数: 3662
8
我的意思当然是各种高级histones了
这样进化搞起来是不是很有意思
d********m
发帖数: 3662
9
适应ecological life style和dna包上高级histone差距完全就是你和Francis Crick之
间的差距
w********2
发帖数: 632
10
来自主题: Military版 - he工作的意义
而且现在cas9很可能是 e coli表达,到人体用的时候,很可能空间结构会有局部的不
匹配,因为人有染色体高级histone。在能教授没用电镜照出cas9的裸体照就敢用受精
卵,能教授情何以堪呐。
w********2
发帖数: 632
11
来自主题: Military版 - he工作的意义
她是在e coli里研究configuration,这在人体细胞内有histone的情况下还会这样吗?
感觉钥匙和锁不完全对孔齿啊。
b*********8
发帖数: 985
12
来自主题: Military版 - he工作的意义
所以能叫兽反对呀

:而且现在cas9很可能是 e coli表达,到人体用的时候,很可能空间结构会有局部的不
:匹配,因为人有染色体高级histone。在能教授没用电镜照出cas9的裸体照就敢用受精
s****u
发帖数: 1433
13
来自主题: Military版 - he工作的意义
这里其实有两个问题:一是基因编辑是否符合伦理。二是此人是不是楼逼。中国人逻辑
性差,总爱把不同问题混在一起讨论。然后吵成一锅粥。


: 所以能叫兽反对呀

: :而且现在cas9很可能是 e coli表达,到人体用的时候,很可能空间结构会有
局部的不

: :匹配,因为人有染色体高级histone。在能教授没用电镜照出cas9的裸体照就
敢用受精

b********s
发帖数: 9
14
Postdoctoral and Technician Positions in the Dinshaw J. Patel lab
in the Department of Biology, SUSTC, Shenzhen.
Dinshaw J. Patel is a member of the United States National Academy of
Sciences. The Patel structural biology lab is set to open on March 1, 2016
in the Department of Biology at the South University of Science and
Technology of China (SUSTC) in Shenzhen. SUSTC, located in picturesque and
environmentally healthy Shenzhen, is a new University that aims to become a
world-leader in Science... 阅读全帖
c*******u
发帖数: 12899
15
☆─────────────────────────────────────☆
jiajia1982 (小样) 于 (Fri Feb 25 23:30:36 2011, 美东) 提到:
刚刚做完neurophychological test,结果是自闭症。
我的儿子3岁4个月,还只会说单音字,而且就说那么几个。和别人交流很困难,不爱看
电视,也不爱跟别的小孩玩。各方面的发展都严重delay。
医生推荐做 (Applied Behavior Analysis)ABA therapy,说这是目前治疗儿童自闭症
的最好的方法。可气的是公司的mental health insurance还不cover 这个ABA
therapy。可这个治疗要长期做,非常昂贵,自己很难负担。该怎么办?
真的要崩溃了。
☆─────────────────────────────────────☆
mitbbser1 (mitbbser) 于 (Fri Feb 25 23:33:14 2011, 美东) 提到:
你可以和学区联系, 学龄前儿童也都有免费的治疗.
☆───────────────... 阅读全帖
w*******i
发帖数: 477
16
妻子10月底J2五年到期过期,现在在工作, 因为俩小孩在上Daycare, 我是生物博后,
为了能养家户口,需要尽快得到I-140 申请EAD,真诚求审稿机会。 现在审稿只有个位
数,希望各位帮忙尽快攒到20+审稿!再次先谢过了。
本人: 主要从事 RNA splicing and fusion genes in Prostate cancer research,
同时做 Histone modification, Epigenetics 方面, RNA seq, Bioinformatics.
癌症生物学,分子生物学,细胞生物学,生物化学,免疫学等方面的都熟悉。
我的EMAIL: [email protected]
/* */
or [email protected]
/* */
万分感激!
Fujun
F******k
发帖数: 7375
17
来自主题: Immigration版 - Review opportunity
Several review opportunities.
I don't have time to review but would like to recommend somebody who are
looking for such opportunities.
1.
Journal: Hematology
Key words: Arsenic trioxide; Acute promyelocytic leukemia; Nuclear factor
kappa β; Pin1; PinX1
2.
Journal: Experimental Hematology
Key words: JAK2 V617F; GATA-1; FOG-1; DNA methylation; Histone acetylation;
HP1a;
3.
Journal: Molecular and Cellular Biochemistry
Key words: cell-conditioned medium, cord blood stem cell, paracrine
mechanism,
se... 阅读全帖
c**k
发帖数: 1228
18
来自主题: Immigration版 - (gone) bioloyg-review opportunity
titile:
Depletion of histone demethylase KDM2A inhibited cell proliferation of stem
cells from apical papilla by de-repressed p15INK4B and p27Kip1
please PM me your name, publication list and email.
a*********0
发帖数: 213
19
来自主题: Immigration版 - 求review opportunity
本人生物化学和分子生物学 postdoc, 希望能够review一些manuscripts, 为申请绿卡
做准备。我的review 次数太少了,恳请大家帮忙。
本人研究方向:cancer biology and signal transduction, protein modification,
DNA methylation, histone deacetylases, gene regulation, cancer drug
resistance etc.
谢谢!
m*******9
发帖数: 868
20
[gone]第一篇:英文,关键词:Proteomics, obesity,histone deacetylase 4 (
HDAC4)
第二篇:中文文章,有关微生物基因组的
请站内联系
j****9
发帖数: 456
21
来自主题: Immigration版 - (gone) 审稿机会 chem comm
chem comm, IF 约6-7.
title: Label-Free Fluorimetric Detection of Histone Using Quaternized Carbon
Dot-DNA Nanobiohybrid
请发名字,official email, 简单的相关背景和文章到站内.
我会帮忙转,希望你能拿到
x********e
发帖数: 2275
22
Journal: Development Growth and Differentiation.
Key words: Histone deacetylase, stem cells, differentiation
有兴趣的请发邮件到站内:
1,名字
2,email
3,简短简历(最多1页)
我会推荐最先联系我的背景合适的ID,但是不保证编辑一定会采纳。
l******t
发帖数: 12659
23
nice & bless~
b********2
发帖数: 125
24
I sent you my CV in the mailbox. Thank you!
b********2
发帖数: 125
25
BTW, bless you 485!
w*******i
发帖数: 477
26
Biomedical Research, Cancer Biology, Molecular Biology, Cell Biology,
Molecular Genetics, Genomics and Epigenetics. RNA-seq, ChIP-seq 等
bioinformatics。
本人Ph.D 曾经是植物分子生活学, 后来Postdoc到现在一直做前列腺癌症研究,基本
背景10多年一直没变。主要做Epigenetics(histone mofication), RNA splicing. 所
以植物 动物 医学相关的都可以。
站内我。
非常感谢!
l****f
发帖数: 650
27
来自主题: Immigration版 - 招guest editor
大家好,现在需要为一个小杂志(Genetics & Epigenetics, 无影响因子)招4-6名
guest editor, 已招到2位,guest editor需要约稿数篇(无硬性数量要求),主题是
DNA Methylation and Histone Modification,约稿周期是18个月。如果感兴趣请站内
联系(姓名和单位邮箱,请考虑清楚哦,可能会比较费时间),然后杂志方面会发正式
邀请。
谢谢!
l****f
发帖数: 650
28
来自主题: Immigration版 - 招guest editor
大家好,现在需要为一个小杂志(Genetics & Epigenetics, 无影响因子)招4-6名
guest editor, 已招到2位,guest editor需要约稿数篇(无硬性数量要求),主题是
DNA Methylation and Histone Modification,约稿周期是18个月。如果感兴趣请站内
联系(姓名和单位邮箱,请考虑清楚哦,可能会比较费时间),然后杂志方面会发正式
邀请。
谢谢!
w*******i
发帖数: 477
29
Biomedical Research, Cancer Biology, Molecular Biology, Cell Biology,
Molecular Genetics, Genomics and Epigenetics. RNA-seq, ChIP-seq 等
bioinformatics。
本人Ph.D 曾经是植物分子生活学, 后来Postdoc到现在一直做前列腺癌症研究,基本
背景10多年一直没变。主要做Epigenetics(histone mofication), RNA splicing. 所
以植物 动物 医学相关的都可以。
[email protected]
/* */
非常感谢!
j*********o
发帖数: 237
30
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: justdengtao (老男孩), 信区: Biology
标 题: 求推荐epigenetic或stem cell方面的review
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Aug 7 11:40:00 2015, 美东)
先多谢了!!
Tao Deng,Ph.D
Email: [email protected]
/* */
Research Fellow
National Cancer Institute
National Institutes of Health
Summary of Research Experience:
Deep understanding of epigenetic regulations, including DNA methylation,
histone modifications and chromatin dynamics
Rich experience on mouse embryonic stem cell manipulation
Full hands-on exp... 阅读全帖
a*********0
发帖数: 268
31
来自主题: Immigration版 - 审稿转让
以前在版上求助审稿。得到了大家的热心帮助。现在审稿差不多了。回馈班上。有一篇
life science的稿子,关于Alterations in Histone Deacetylase 8 Lead to Cell
Migration and Poor Prognosis in Breast Cancer。有兴趣的的同学,发给我几句
background介绍,和email。可以代为推荐。这个杂志的推荐成功率很高。我之前就是
班上的同学帮我推荐的。大家节日快乐。

发帖数: 1
32
来自主题: Immigration版 - 审稿转让
你好,我正好在找审稿机会。自己是做histone相关epigenetics的,在JHU博后,邮箱
是[email protected]
/* */,谢谢帮忙推荐,祝新年快乐。

发帖数: 1
33
不知道你是什么领域的。生物的话,
CNS级别的别想了。
其他级别先在网站上注册,然后填关键词的时候填一些跨学科,小众的词。比如在
hepatology的杂志上填histone modification。这样editor在搜reviewer的时候有更高
几率搜到你。
j*********o
发帖数: 237
34
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: justdengtao (老男孩), 信区: Biology
标 题: 求推荐epigenetic或stem cell方面的review
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Aug 7 11:40:00 2015, 美东)
先多谢了!!
Tao Deng,Ph.D
Email: [email protected]
/* */
Research Fellow
National Cancer Institute
National Institutes of Health
Summary of Research Experience:
Deep understanding of epigenetic regulations, including DNA methylation,
histone modifications and chromatin dynamics
Rich experience on mouse embryonic stem cell manipulation
Full hands-on exp... 阅读全帖
h*********e
发帖数: 18
35
来自主题: Connecticut版 - Re: 249
but science and arts can never be broken apart.
really scientists have a heart for arts
true artists have a mind for science.
it is like serum and vescles, it is like DNA and histones
it is like Yale and New Haven, it is like bbs and me
m******g
发帖数: 3667
36
来自主题: WaterWorld版 - 居然发了篇cns
你叫ning zheng?
Structural Basis for Assembly and Activation of the Heterotetrameric SAGA
Histone H2B Deubiquitinase Module
Alwin Köhler, Erik Zimmerman, Maren Schneider, Ed Hurt, and Ning
Zheng
S*******1
发帖数: 1860
37
【 以下文字转载自 History 讨论区 】
发信人: Smurf2011 (Smurf), 信区: History
标 题: 理论上可以制造一个尼安德特人吗
发信站: BBS 未名空间站 (Fri May 22 21:52:38 2015, 美东)
如果生物科技再发达一点,使用现代人的卵子,把其中的染色体提出来,而把尼安德特
人的染色体注入。
这里可能会有问题。可以按照尼安德特人化石的DNA序列,合成出完整的DNA set。可是
DNA
和histone的甲基化水平如何决定呢?化石不可能测出甲基化水平。
即便成功了,这样的实验伦理上非常说不通。
H********g
发帖数: 43926
38
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: freewang (Tom), 信区: Biology
标 题: 爸爸早年受点苦,孩子会得福
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Nov 19 07:50:57 2014, 美东)
Early life stress in fathers improves behavioural flexibility in their
offspring
Nature Comm.
Traumatic experiences in childhood can alter behavioural responses and
increase the risk for psychopathologies across life, not only in the exposed
individuals but also in their progeny. In some conditions, such experiences
can however be beneficial and facilitate the appraisal of a... 阅读全帖
y*********u
发帖数: 14561
39
☆─────────────────────────────────────☆
faithjing (蛋,blue的妈咪) 于 (Fri Jan 7 12:43:43 2011, 美东) 提到:
今天blue送去KC了,刚才上线看到昨天四猫家的孩子也去了,恢复的挺快,真希望blue
也能那样坚
强。
另外就是我的命运,明天也许会是人生一个转折点,具体事情等明天回来再说,先埋个
伏笔。
希望大家能祝福我和blue。大家都说pets版是净土,我也来求一份祝福。
明天晚上回来报道。如果成功,发伪币1800。
更新——————————————————————————————————————————————
回来了,一切顺利。
blue昨天回来,我把他放出来,蛋蛋发现blue身上有异味,跟着blue闻屁股,被blue给
揍一顿,看着他们满屋跑的样子,怀疑blue根本没做手术,于是小心翼翼解开blue的尾
巴,发现两只毛茸茸的蛋蛋没了,才确认blue的确做手术了。这两天玩的很好,一点都
没有变,看来公猫就是皮实。
我呢,今天下午去模特中介报名,中介老板说我身材长相都不错,有潜力。以后打... 阅读全帖
s**********x
发帖数: 4593
40
十四、化学化工学院
题目:有机金属碳硼烷化学以及在烯烃聚合催化反应中的应用
报告人:金国新
时间:5月14日上午10:00
地点:化学楼图书馆二楼学术报告厅
题目:有机靶分子修饰的量子点在生物显影中的应用
报告人:张艳
时间:5月15日上午9:00
地点:化学楼三楼报告厅
题目:新型人工蛋白质
报告人:芦昌盛
时间:5月15日上午10:00
地点:化学楼三楼报告厅
题目:纳米薄膜制备及其电化学传感研究
报告人:徐静娟
时间:5月15日上午11:00
地点:化学楼三楼报告厅
题目:纳米约束体系的催化特性
报告人:包信和
时间:5月17日上午9:00
地点:知行楼二楼报告厅
题目:嵌段共聚物的自组装
报告人:史安昌
时间:5月17日上午9:30
地点:化学楼三楼报告厅
题目:结晶和相分离的interplay—以高分子溶液为例
报告人:胡文兵
时间:5月17日上午10:30
地点:化学楼三楼报告厅
题目:新型手性催化剂研究
报告人:周其林
时间:5月17日下午2:30
地点:化学楼三楼报告厅
题目:Computer Simulation of Histone Modifying Enzyme
M**a
发帖数: 4816
41
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: freewang (Tom), 信区: Biology
标 题: 爸爸早年受点苦,孩子会得福
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Nov 19 07:50:57 2014, 美东)
Early life stress in fathers improves behavioural flexibility in their
offspring
Nature Comm.
Traumatic experiences in childhood can alter behavioural responses and
increase the risk for psychopathologies across life, not only in the exposed
individuals but also in their progeny. In some conditions, such experiences
can however be beneficial and facilitate the appraisal of a... 阅读全帖
r***o
发帖数: 162
42
you can not simply say whether the result of an experiment right or
not,
I have read papers of both sides for the origin of that lovely
protein virus(virus?), I even have asked my professor, he dare not
judge
either, by the way, he is a really excellent virologist, and editor of
RNA magazine, :)
one thing, I think we need to add to the answer of the question is
that
some DNA viruses can enter nucleus, with histones, forming a structure
just like mini-chromosome, for transcription and replication
s***e
发帖数: 911
43

DNA弹性是很关键的.150 bp以下的DNA很难弯曲. 所以要形成一个核小体, core
histone protein需要作许多功来弯曲DNA. 不过现在这几个新实验表明, 弯曲150bp以
下的DNA比从前认为的要容易许多.
缺陷的意思是, DNA局部因为某种结构变化, 比B-DNA更软. Melting是指几个被破坏的
bae pairs. 破坏h-bond需要能量. 所以这是一种激发缺陷.
量>
.
现实DNA的弹性在200 bp以下不能用传统的弹性模型描述. 具体表现上是变得"更软".
DNA更容易被弯曲, 所以looping需要的能量更小.
g*******r
发帖数: 95
44
我再和老同志们说几句做纯生物
在北美,目前做faculty的这些CHINESE PI 们,人品90% 以上都很差,都有相当程
度的心理扭曲。建议大家避开这些人,也避开INDIA 东欧这些PI,不要去鸟他什么
哈佛的教授之类的,不值钱。我是吃尽了苦头,也仔细考察过,绝非虚言。当然,
你如果是那种中国传统说的‘小人’,你不妨可以到里面去倾轧。不妨去那种肮脏
的CHINATOWN。当然,biofan那种傻B 显然是进这些地方的料子,那些chinese PI
正发愁找不到biofan这样的炮灰。
想发CNS,第一是要赶时髦,比如说,看见DNA damage,histone methylation,RNAi,
RNAi library screen热,就赶紧上。但是要千万注意了,这个领域如果热了两年,
在CNS上高频出现了两年,你就不要去赶了。别的实验室已经有2-4年的累积,等你
玩出来,基本上淘汰货,偶尔能捡个漏,CNS上面发一发。
其次是要搞好和几个大LAB的关系。某个领域,一般是那么几个实验室霸占了。长期
在发的,一般就是那么个小圈子里面的人,或者是他们实验室里面的薄厚,出来的
PI 。
y******y
发帖数: 107
45
来自主题: Biology版 - 求一片paper 谢谢
Functional proteomics in histone research and epigenetics.
Expert Review of Proteomics
August 2007, Vol. 4, No. 4, Pages 491-503 , DOI 10.1586/14789450.4.4.491
(doi:10.1586/14789450.4.4.491)
谢谢
c*********r
发帖数: 1312
46
"In our experience, a typical histone modification ChIP performed on 500,000
cells yields ~1 ng of DNA. Thus, ChIP-seq analysis of 50,000 cells would
require the interrogation of ~100 pg of DNA."
Alon Goren et al. Chromatin profiling by directly sequencing small
quantities of immunoprecipitated DNA. Nature Methods. 2009.
t*x
发帖数: 1065
47
来自主题: Biology版 - 请推荐做Epigenetics方面的大牛
偶老板想请人在一个会议上作为keynote speaker,说是epigenetics方面的,histone
modifications, DNA methylation什么的,让我查一查。大家有推荐么??
谢谢,千恩万谢~~
s******r
发帖数: 2876
48
Histon H1 行不行?

所在的实验室是一个烧钱的实验室,做几十个转录因子,实验套路大致就是qPCR和
western结合检测不同基因在不同human cell line中的表达,然后挑出表达合适的细胞
系去做siRNA和Chip-seq,目的呢,找出这些转录因子的binding site以及pathway什么
的。
我其实只是一国内小硕在这里做一小技术员,可是目前实验室没有post-doc,所以这些
实验基本上就着落在我和另一技术员身上,她负责做siRNA,其它的实验都我做。
照着protocol做实验当然没问题啊,遇到不懂的没人问就难办了。可是我成天闷头赶实
验,哪里有空看文献呢,所以就只好跟science脱节了。
做qPCR还好说(其实也有困难,另行发帖请教),我用的是GAPDH作为internal
control来计算相对表达量。可是做western时,我一开始选的是GAPDH做内对照,买的
是Sigma的抗体,做的还挺好的,因为这个GAPDH检测大小是36kd,正好跟我的目的蛋白
50-75kd能分开,我转一张膜,然后剪开就可以同时检测两个抗体。可是老板在我上周
汇报结
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