发帖数: 1 | 1 《自然-生物技术》社论与韩春雨及同事的撤稿声明
原文以Time for the data to speak为标题
发布在2017年8月2日的《自然-生物技术》社论上
标题：是该数据说话的时候了
doi:10.1038/nbt.3938
一项宣称通过Argonaute酶实现基因编辑的研究被撤回，这显示了论文发表后的同行评
议在全天候媒体时代的重要性。
本期，韩春雨及同事撤回了发表于去年5月的一篇论文。该论文称，短5′磷酸化单链
DNA可引导格氏嗜盐碱杆菌核酸内切酶（NgAgo）产生双链断裂，实现对人类基因组的编
辑。论文一发表，便引起科研人员的极大兴趣和媒体的竞相报道。但是很快，在推特、
博客和其它社交媒体的助燃之下，有关该研究可重复性的质疑开始迅速增多。去年11月
，本刊发表了“编辑部关注”（Editorial Expression of Concern），提醒科研界留
意这些可重复性方面的担忧。为了最终解决这个争议，多个研究小组在数月里生成了更
多的实验数据。如今尘埃落定，这也是世界各地的许多实验室为澄清NgAgo的功能而付
出的大量时间、精力和资金的证明。
韩春雨的这篇论文自去年发... 阅读全帖 |
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c********n
发帖数: 225 | 2 特别记录 2016.10.15
信息来源：
- 凤凰资讯
- 百度贴吧 河北吧
http://news.ifeng.com/a/20161015/50105264_0.shtml
http://tieba.baidu.com/p/4822837762
Key points
- 据报道，韩春雨NBT论文合作者第二作者，也是Ago专利的两个拥有者中的第一拥有者
， 浙江大学沈啸老师，首次公开回应：若有问题不会逃避责任
- 据报道，沈啸老师并未参与韩春雨NBT论文发表时的实验
- 据报道，沈啸老师向韩春雨多次问过数据的真实性，并得到韩春雨很自信的确认
- 据报道，沈啸老师承认Ago专利上没有河北科大，是自己“由于对职务发明认识不足
遗漏了河北科技大学”， “现在浙江大学也正在办理把河北科技大学变更为共申请人
的手续
。”
- 据报道，沈啸老师实验室也在自己的系统中重复验证NgAgo实验
-- “现在我已经发现了比较有趣的现象，有些是论文里没有讲到的，我会继续投入做
下去。我希望通过后续发表论文以及出一个专利这样的方式公开它。”
- 据报道， 沈啸老师声明，“我只知道韩春雨仍在持续地研究和改良... 阅读全帖 |
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c********n
发帖数: 225 | 3 特别记录 2016.10.15
信息来源：
- 凤凰资讯
- 百度贴吧 河北吧
http://news.ifeng.com/a/20161015/50105264_0.shtml
http://tieba.baidu.com/p/4822837762
Key points
- 据报道，韩春雨NBT论文合作者第二作者，也是Ago专利的两个拥有者中的第一拥有者
， 浙江大学沈啸老师，首次公开回应：若有问题不会逃避责任
- 据报道，沈啸老师并未参与韩春雨NBT论文发表时的实验
- 据报道，沈啸老师向韩春雨多次问过数据的真实性，并得到韩春雨很自信的确认
- 据报道，沈啸老师承认Ago专利上没有河北科大，是自己“由于对职务发明认识不足
遗漏了河北科技大学”， “现在浙江大学也正在办理把河北科技大学变更为共申请人
的手续
。”
- 据报道，沈啸老师实验室也在自己的系统中重复验证NgAgo实验
-- “现在我已经发现了比较有趣的现象，有些是论文里没有讲到的，我会继续投入做
下去。我希望通过后续发表论文以及出一个专利这样的方式公开它。”
- 据报道， 沈啸老师声明，“我只知道韩春雨仍在持续地研究和改良... 阅读全帖 |
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c********n
发帖数: 225 | 6 【再贴一次】
对于韩春雨NBT文章无法重复的问题
需要从Figure 1 开始一步步看
作者的contributions
1. C.H. conceived the study and designed the experiments.
文章 “Story” “Idea” 的设计与发起人
2. X.Z.S. provided intellectual advice on the project and experimental
design.
实验设计， “One guide-faithful” -Figure 2d？
3. C.H. performed mammalian genome editing.
（Figure 4,5）
文章里让科研界最感兴趣的结果，也是无法被重复验证的主要问题
4. F.G. performed the BLAST search and the in vitro cleavage experiments.
（Figure 1, Figure 2？，Figure 3a，supplementary figure 2）
大肠杆菌E coli 表达的蛋白
NgAg... 阅读全帖 |
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c********n
发帖数: 225 | 10 【记录历史】NgAgo'2016 - Milestones draft 第一阶段时间点补充：
（added on 2016年8月28日）
NgAgo 序列，其基因编辑功能信息，以及相关实验流程， 对大众公开的几个时间点的
补充
Date：2016年04月13日（在NBT paper 上线前约2个多星期）
Title：以Argonaute核酸酶为核心的基因编辑技术 （中国专利号CN 105483118 A）
Links:
https://www.google.com/patents/CN105483118A
https://www.google.com/patents/CN105483118A?cl=zh
Key Points：
- 沈啸、韩春雨 （浙江大学）Ago基因编辑专利发表
- 特别注明：
1. 专利filing date：Dec 21, 2015
2. 根据专利描述，不但NgAgo有基因编辑功能，HpAgo、NaAgo和NtAgo “都与NgAgo一
样有很强的编辑哺乳动物细胞内基因表达的能力”；以及MaAgo，NpAgo，NIESAgo，
SchAgo，SPAgo “等Arg... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 11 真的要调查他的话，其实没那么多废话，就是调查组找他要NBT文章的原始数据，如果
不能出示，那就认定造假就完活了。
所谓的第三方监督下重复试验也不能说明问题，就算现在能够重复也不代表着给NBT投
稿的时候没有造假！
但是到现在为止，为毛还是没有调查呢？根本就不必等NBT撤稿，在NBT调查之前搞定调
查才能挽回一点点中国科学界的信誉，事不宜迟啊！否则等NBT撤稿了，还没见你采取
行动，那对于中国科研界信誉的伤害实在是太大了！
所以我认为上面还没有下令调查韩，要不然早就动他了！越往后可能性越小！ |
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发帖数: 1 | 12 本来是不想说什么的，整个事件发展到今天这个地步，大部分真正做生物懂生物都已经
不再怎么关注NgAgo，而且结论已经非常清晰：那就是迄今为止没有一个实名实验室可
以重复出NgAgo的实验结果。没有多少人会愿意再在上面浪费时间。事先声明，实在看
不下去mitbbsrobot 和wang9这两个人（或者是同一个人）在这里搅浑水。此帖欢迎任
何人阅读和讨论，唯独不欢迎mitbbsrobot 和wang9这两个ID，所以请不要阅读或者留
言，我不愿意和你们浪费时间。
我是因为我的两个好朋友做不出来NgAgo才关注这个事情，当时韩老师刚发出NBT paper
时，我也跟着读了，也为韩老师的工作感到开心。大概在6月份，我在国内的一个朋友
告诉我重复不出来，我才在我的圈子和朋友们讨论这个事情，发现我的两个好朋友在试
图重复NgAgo（他们开始都是想发展这个technique，但是发现不work，才开始重复NBT
paper里的实验想去找原因），结果发现paper里报导的也重复不了，而且是重复了多次
。他们都是用CRISPR做对照，每次都是CRISPR works as expected， but no... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 14 仇子龙的声称：
目前总结下我自己实验室对NgAgo的实验结果。
1，NBT Fig3c实验，对共转染的质粒表达的GFP蛋白确实可以看到显著的抑制表达作用
，但是DNA水平的切割并未看到，这个实验里面因为被切割的质粒有可能被降解，检测
不到突变也不能说明对DNA没作用，当然也不能排除，也许，NgAgo并非作用在DNA水平
对基因表达进行了抑制等可能性。
2, 基因组水平的实验重复，
a. 我们用NBT文章中的一模一样的ssDNA与薛天老师带回来的NLS-NgAgo进行实验，在
293细胞中无法重复NBT文章中的dyrk1a等基因的切割与Indel等等。没有在Hela细胞中
进行实验。
b. 我们自己设计了针对人源的kras, p53等基因的ssDNA，分别在293细胞中human kras
, p53基因上看到过测序水平的indel，且是ssDNA靶点区域的deletion，但是频率不高
，低于5%，同批比较的cas9切割效率20%。
c， 我们自己实验室还在重复，优化各种条件，比如筛选等等。
3，这是我们自己实验室的结果，其他的老师的结果我没有发言权，不评论
4，我呼吁一下，目前这些实... 阅读全帖 |
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p*******m
发帖数: 20761 | 15 2015/2016 Map Updates - North America & Europe & More - (CCC/CIC/NBT/
EntryNav)
2015/2016 map updates for North America, Europe and all other regions are
now available for the CCC/CIC/NBT/EntryNav navigation systems.
I can provide FSC codes for all regions and all map types. Send me an email
at [email protected]/* */
I give a 60 day (for purchases made October 1st 2015 and later) guarantee to
anyone who purchases an FSC code from me and a newer version of the maps is
made available within ... 阅读全帖 |
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p*******m
发帖数: 20761 | 16 http://x3.xbimmers.com/forums/showthread.php?t=1007952
2015/2016 Map Updates - North America & Europe & More - (CCC/CIC/NBT/
EntryNav)
2015/2016 map updates for North America, Europe and all other regions are
now available for the CCC/CIC/NBT/EntryNav navigation systems.
I can provide FSC codes for all regions and all map types. Send me an email
at [email protected]/* */
I give a 60 day (for purchases made October 1st 2015 and later) guarantee to
anyone who purchases an FSC code from me an... 阅读全帖 |
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g*r
发帖数: 2116 | 17 又一次证明反对转基因的人根本不读文献啊
这一篇根本不是research article。NBT的editor主要目的是想说 媒体不要随便报道未
经严密论证的所谓科学发现
起因是这个俄国科学家Irina V. Ermakova (IE) 从2005年开始 多次在会议和媒体前面
宣布她的研究结果：转基因大豆导致大鼠后代大量死亡，但是这个结果从未正式发表在
有同行评议的杂志上。
于是NBT得editor主动把这些data要过来然后找了几个相关领域的科学家实名评审这些
结果并把IE得结果和同行评议的意见发在了同一篇文章之中。注意这并不是一篇研究论
文。请来得几个人把IE得data批驳的体无完肤。IE就写了一封信回复后来也发在NBT上
，试图狡辩，不过这些狡辩的内容又被驳的一塌糊涂（http://www.nature.com.ezproxyhost.library.tmc.edu/nbt/journal/v25/n12/full/nbt1207-1356b.html）。
值得一提的是，此事过去了5年，这个研究结果仍然没有出现在任何学术杂志上，也没
有任何的后续研究支持这个结果。转这件事情来反对转... 阅读全帖 |
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c********n
发帖数: 225 | 20 实例记录 - 首例 第三类信息
第三类“重复” 验证实验信息：实名，科研杂志发布
− 在科研杂志上实名发表的关于重复、验证NgAgo基因组编辑功能的文
章
− 需有具体实验设计流程描述，实验材料来源信息，实验数据及分析
− 需有citation link
- 需包含发布时间
- 需注明是否应用2016年8月8日韩春雨组在Addgene更新的Protocol的相关条件
信息简述：
- 发布方：Jialing Qi et al
- 发布时间：2016年11月11日
- 发布平台：Cell Research
- 发布方国家：中国
- 发布方城市：江苏南通
- 发布方研究机构：Co-innovation Center of Neuroregeneration, Jiangsu Key
Laboratory of Neuroregeneration, Nantong University
- 实验室PI：Dong Liu
- NgAgo的来源：Synthetic codon opti... 阅读全帖 |
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c********n
发帖数: 225 | 21 实例记录 - 第三类信息， 第二例
第三类“重复” 验证实验信息：实名，科研杂志发布
− 在科研杂志上实名发表的关于重复、验证NgAgo基因组编辑功能的文
章
− 需有具体实验设计流程描述，实验材料来源信息，实验数据及分析
− 需有citation link
- 需包含发布时间
- 需注明是否应用2016年8月8日韩春雨组在Addgene更新的Protocol的相关条件
信息简述：
- 发布方：Burgess， Cheng， et al
- 发布时间：2016年11月15日
- 发布平台：Protein & Cell
- 发布方国家：二十家中外实验室， 18所科研院校
- 发布方城市：美国及中国
- 发布方研究机构：
1.National Human Genome Research Institute, NIHBethesdaUSA
2.Division of Hematology in Department of MedicineJohns Hopkins University
S... 阅读全帖 |
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c********n
发帖数: 225 | 22 特别记录
信息来源：
- Nature Biotech
- editorial expression of concern
- 2016.11.28
link：
http://www.nature.com/nbt/journal/v34/n7/full/nbt.3547.html#correction1
Key points
- 引用了Nature Biotech 和 Protein&Cell 两篇 NgAgo 基因编辑无法重复的质疑文章
， 特别是关键的 Fig4 按原文实验设计也无法重复
- 已通知原文作者，原文作者正在找无法重复原因， Nature Biotech在调查中，调查
结束后会给community update
- 原文作者对于 editorial expression of concern 的态度：
While the investigations are ongoing, Chunyu Han and Xiao Z. Shen agree with
this editorial expression of concern. Feng Gao, Feng Jiang ... 阅读全帖 |
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c********n
发帖数: 225 | 23 实例记录 - 首例 第三类信息
第三类“重复” 验证实验信息：实名，科研杂志发布
− 在科研杂志上实名发表的关于重复、验证NgAgo基因组编辑功能的文
章
− 需有具体实验设计流程描述，实验材料来源信息，实验数据及分析
− 需有citation link
- 需包含发布时间
- 需注明是否应用2016年8月8日韩春雨组在Addgene更新的Protocol的相关条件
信息简述：
- 发布方：Jialing Qi et al
- 发布时间：2016年11月11日
- 发布平台：Cell Research
- 发布方国家：中国
- 发布方城市：江苏南通
- 发布方研究机构：Co-innovation Center of Neuroregeneration, Jiangsu Key
Laboratory of Neuroregeneration, Nantong University
- 实验室PI：Dong Liu
- NgAgo的来源：Synthetic codon opti... 阅读全帖 |
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c********n
发帖数: 225 | 24 实例记录 - 第三类信息， 第二例
第三类“重复” 验证实验信息：实名，科研杂志发布
− 在科研杂志上实名发表的关于重复、验证NgAgo基因组编辑功能的文
章
− 需有具体实验设计流程描述，实验材料来源信息，实验数据及分析
− 需有citation link
- 需包含发布时间
- 需注明是否应用2016年8月8日韩春雨组在Addgene更新的Protocol的相关条件
信息简述：
- 发布方：Burgess， Cheng， et al
- 发布时间：2016年11月15日
- 发布平台：Protein & Cell
- 发布方国家：二十家中外实验室， 18所科研院校
- 发布方城市：美国及中国
- 发布方研究机构：
1.National Human Genome Research Institute, NIHBethesdaUSA
2.Division of Hematology in Department of MedicineJohns Hopkins University
S... 阅读全帖 |
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c********n
发帖数: 225 | 25 特别记录
信息来源：
- Nature Biotech
- editorial expression of concern
- 2016.11.28
link：
http://www.nature.com/nbt/journal/v34/n7/full/nbt.3547.html#correction1
Key points
- 引用了Nature Biotech 和 Protein&Cell 两篇 NgAgo 基因编辑无法重复的质疑文章
， 特别是关键的 Fig4 按原文实验设计也无法重复
- 已通知原文作者，原文作者正在找无法重复原因， Nature Biotech在调查中，调查
结束后会给community update
- 原文作者对于 editorial expression of concern 的态度：
While the investigations are ongoing, Chunyu Han and Xiao Z. Shen agree with
this editorial expression of concern. Feng Gao, Feng Jiang ... 阅读全帖 |
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w*p
发帖数: 16484 | 26 任你们怎么评论，就是不出头，只等NBT撤稿的那一天了。估计到了NBT撤稿的时候，好
多好处他已经占上了没法退了，而且NBT撤稿也只会说他的东西没法重复，不可能直接
说他造假。所以，NBT的撤稿通知也不会把韩春雨扳倒。 |
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c********n
发帖数: 225 | 28 对于韩春雨NBT文章无法重复的问题
需要从Figure 1 开始一步步看
作者的contributions
1. C.H. conceived the study and designed the experiments.
文章 “Story” “Idea” 的设计与发起人
2. X.Z.S. provided intellectual advice on the project and experimental
design.
实验设计， “One guide-faithful” -Figure 2d？
3. C.H. performed mammalian genome editing.
（Figure 4,5）
文章里让科研界最感兴趣的结果，也是无法被重复验证的主要问题
4. F.G. performed the BLAST search and the in vitro cleavage experiments.
（Figure 1, supplementary figure 2）
大肠杆菌E coli 表达的蛋白
NgAgo 基因编辑功能的初步 in vitro 数据支持
注... 阅读全帖 |
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c********n
发帖数: 225 | 29 【记录历史】谁重复验证了NgAgo？
http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/32034437.html
实例记录 - 第三类信息， 第二例
第三类“重复” 验证实验信息：实名，科研杂志发布
− 在科研杂志上实名发表的关于重复、验证NgAgo基因组编辑功能的文
章
− 需有具体实验设计流程描述，实验材料来源信息，实验数据及分析
− 需有citation link
- 需包含发布时间
- 需注明是否应用2016年8月8日韩春雨组在Addgene更新的Protocol的相关条件
信息简述：
- 发布方：Burgess， Cheng， et al
- 发布时间：2016年11月15日
- 发布平台：Protein & Cell
- 发布方国家：二十家中外实验室， 18所科研院校
- 发布方城市：美国及中国
- 发布方研究机构：
1.National Human Genome Research Institute, NIHBethesdaUSA
2.D... 阅读全帖 |
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c********n
发帖数: 225 | 30 【记录历史】谁重复验证了NgAgo？
实例记录 - 第三类信息， 第二例
第三类“重复” 验证实验信息：实名，科研杂志发布
− 在科研杂志上实名发表的关于重复、验证NgAgo基因组编辑功能的文
章
− 需有具体实验设计流程描述，实验材料来源信息，实验数据及分析
− 需有citation link
- 需包含发布时间
- 需注明是否应用2016年8月8日韩春雨组在Addgene更新的Protocol的相关条件
信息简述：
- 发布方：Burgess， Cheng， et al
- 发布时间：2016年11月15日
- 发布平台：Protein & Cell
- 发布方国家：二十家中外实验室， 18所科研院校
- 发布方城市：美国及中国
- 发布方研究机构：
1.National Human Genome Research Institute, NIHBethesdaUSA
2.Division of Hematology in Department of MedicineJohns H... 阅读全帖 |
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U**R
发帖数: 34 | 31 尘埃落定韩春雨? Nature Biotechnology 撤稿 NgAgo!
原创2017-08-03 知社 知社学术圈
海归学者发起的公益学术平台
分享信息，整合资源
交流学术，偶尔风月
北京时间8月3日，在经历过长达一年多的纷争和等待之后，Nature Biotechnology应韩
春雨等作者的要求，撤稿其发表于2016年5月的NgAgo论文。
从一鸣惊人到一波三折再到一声叹息，这一年多，中国学术界和韩春雨走过来了什么样
的历程？“身心疲惫”？NgAgo的争议，是否又就此尘埃落定？ 请看知社对这一里程碑
事件的回顾，和业内人士特约独家点评。
首先，我们来回顾一下NgAgo事件的主要发展过程与关键时间节点。
2014年2月，荷兰科学家John van der Oost在Nature杂志发表论文，报道TtAgo可以在
高温条件下体外切割DNA。韩春雨受到启发，开始利用Argonaut进行基因编辑，并在
2014年5月中旬取得关键突破。
2015年6月3日，韩春雨向Nature Biotechnology投稿。12月21日，浙江大学沈啸和韩春
雨提交“以Argonaute核酸酶为核心... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 32 NBT的社论里已经介绍了，韩去年年末补充数据后的经过。
NBT认定他们补充的数据不够强驳倒大量反对意见。
并且给了足够的时间让韩等人继续补充数据，依旧没有进展。
如果韩不主动撤稿，除了NBT主动撤稿，想不出NBT还有什么可以给的机会了。
你觉得不是么？ |
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发帖数: 1 | 33 首先，我们来回顾一下NgAgo事件的主要发展过程与关键时间节点。
2014年2月，荷兰科学家John van der Oost在Nature杂志发表论文，报道TtAgo可以在
高温条件下体外切割DNA。韩春雨受到启发，开始利用Argonaut进行基因编辑，并在
2014年5月中旬取得关键突破。
2015年6月3日，韩春雨向Nature Biotechnology投稿。12月21日，浙江大学沈啸和韩春
雨提交“以Argonaute核酸酶为核心的基因编辑技术”的专利保护申请。2016年3月21日
，Nature Biotechnology接收韩春雨的投稿，并在5月2日在线发表其题为DNA-guided
genome editing using the Natronobacterium gregoryi Argonaute论文。
2016年5月8日，多家知名微信公众号以一鸣惊人为题，先后报道韩春雨在极端艰苦与简
陋的条件下，做出世界级的科技成果，韩春雨首次进入大众视野，引发热议，并受到许
多媒体热捧。对于许多处于中国学术体制边缘地带的本土青年学者，韩春雨的成功具有
极大的励志效应，让很多人看... 阅读全帖 |
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U**R
发帖数: 34 | 34 尘埃落定韩春雨? Nature Biotechnology 撤稿 NgAgo!
尘埃落定韩春雨? Nature Biotechnology 撤稿 NgAgo!
原创2017-08-03 知社 知社学术圈
海归学者发起的公益学术平台
分享信息，整合资源
交流学术，偶尔风月
北京时间8月3日，在经历过长达一年多的纷争和等待之后，Nature Biotechnology应韩
春雨等作者的要求，撤稿其发表于2016年5月的NgAgo论文。
从一鸣惊人到一波三折再到一声叹息，这一年多，中国学术界和韩春雨走过来了什么样
的历程？“身心疲惫”？NgAgo的争议，是否又就此尘埃落定？ 请看知社对这一里程碑
事件的回顾，和业内人士特约独家点评。
首先，我们来回顾一下NgAgo事件的主要发展过程与关键时间节点。
2014年2月，荷兰科学家John van der Oost在Nature杂志发表论文，报道TtAgo可以在
高温条件下体外切割DNA。韩春雨受到启发，开始利用Argonaut进行基因编辑，并在
2014年5月中旬取得关键突破。
2015年6月3日，韩春雨向Nature Biotechnology... 阅读全帖 |
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t***h
发帖数: 5601 | 35 Nature Biotechnology | Editorial | doi:10.1038/nbt.3938
Time for the data to speak
Published online, 2 August 2017
http://www.nature.com/nbt/journal/vaop/ncurrent/full/nbt.3938.html
在社论中，一项宣称通过Argonaute酶实现基因编辑的研究被撤回，这显示了论文
发表后的同行评议在全天候媒体时代的重要性。
韩春雨的这篇论文自去年发表后所产生的影响力，再怎么夸张地说也不为过，尤其
是在论文的来源地中国。中国媒体纷纷进行报道，以大标题宣告一项全新基因编辑系统
的发现。这无疑是一篇中国去年被报道最多的论文；媒体监测公司融文（Meltwater）
的数据显示，仅在论文发表后的最初两个月，就有将近4000篇相关的中文新闻报道。
NgAgo的轰动之处集中在它有可能补充，甚至取代CRISPR/Cas9基因编辑系统之一点
上。NgAgo有望以一个目标序列进行基因编辑（Cas9不仅需要目标序列，还需要另外一
个附近... 阅读全帖 |
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l****z
发帖数: 29846 | 36 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: Chamgrape (香槟葡萄), 信区: Biology
标 题: 这期Nature Biotechnology上关于转基因的文章
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Sep 10 14:15:59 2013, 美东)
http://www.nature.com/nbt/journal/v31/n9/full/nbt.2700.html?WT.
真正想了解而不是想吵架的同学可以看看
还可以给身边对这个有疑问的朋友看看
也提到了去年法国的那个老鼠实验
还有黄金大米
Contrary to popular belief
Nature Biotechnology 31, 767 (2013) doi:10.1038/nbt.2700
Published online 10 September 2013
Three decades after transgenes were first introduced into plants, why do so
many consumers remain so negative abou... 阅读全帖 |
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l****z
发帖数: 29846 | 37 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: Chamgrape (香槟葡萄), 信区: Biology
标 题: 这期Nature Biotechnology上关于转基因的文章
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Sep 10 14:15:59 2013, 美东)
http://www.nature.com/nbt/journal/v31/n9/full/nbt.2700.html?WT.
真正想了解而不是想吵架的同学可以看看
还可以给身边对这个有疑问的朋友看看
也提到了去年法国的那个老鼠实验
还有黄金大米
Contrary to popular belief
Nature Biotechnology 31, 767 (2013) doi:10.1038/nbt.2700
Published online 10 September 2013
Three decades after transgenes were first introduced into plants, why do so
many consumers remain so negative abou... 阅读全帖 |
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h*****2
发帖数: 991 | 38 这是5年加减乘除的Common Core的标准，就是个很通行的标准，我看不出来有什么问题
。 要求理解多种解法。好正常。
Perform operations with multi-digit whole numbers and with decimals to
hundredths.
CCSS.MATH.CONTENT.5.NBT.B.5
Fluently multiply multi-digit whole numbers using the standard algorithm.
CCSS.MATH.CONTENT.5.NBT.B.6
Find whole-number quotients of whole numbers with up to four-digit dividends
and two-digit divisors, using strategies based on place value, the
properties of operations, and/or the relationship between multiplication and
divis... 阅读全帖 |
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q*****d
发帖数: 445 | 39 这篇文章的方法我怎么看不明白呢？如果我看明白了，就是它有明显的错误，但我相信
NBT是不可能有错误的，尤其是这位大神实验室经常出一些Nature, Science的，所以说
还是我没有看明白。现在还是直奔主题吧！问题幼稚，还望大神们多多指教！
文章链接在这里：http://www.nature.com/nbt/journal/v27/n3/full/nbt.1526.html
我们是想用它的方法进行细胞转座子分析，看看细胞内的转座子都跑哪里去了。因此我
想follow他们的LM-PCR方法。
原文272页的Pyrosequencing说到：把转座子的左边用BfaI切，右边用NlaIII切，然后
与合成的linker连接：引物的设计如下：
To make the BfaI linker, the following oligonucleotide sequences were
annealed together using standard protocols, top strand 5’-
GTAATACGACTCACTATAGGGCTCCGCTTAAGGGAC-3’ and bott... 阅读全帖 |
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C*******e
发帖数: 4348 | 40 http://www.nature.com/nbt/journal/v31/n9/full/nbt.2700.html?WT.
真正想了解而不是想吵架的同学可以看看
还可以给身边对这个有疑问的朋友看看
也提到了去年法国的那个老鼠实验
还有黄金大米
Contrary to popular belief
Nature Biotechnology 31, 767 (2013) doi:10.1038/nbt.2700
Published online 10 September 2013
Three decades after transgenes were first introduced into plants, why do so
many consumers remain so negative about genetically modified (GM) food?
GM food has an uncanny ability to spook consumers. It does not matter that
many of us have been consuming GM ... 阅读全帖 |
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i***9
发帖数: 106 | 41 这个是整体的大环境的问题，所有人的诚信都基本为零。
小宝当初也是自己人监督的，没有人说什么。因为大家相信这个机构背后的credit。
现在的情况是，就算国内某个人做出来了，问题是你信么？
其实澳大利亚的实验室，或者西班牙的实验室确实不算顶级，多说也就是中游水平。但
是因为是独立实验室，也因为是洋人的实验室，所以很多人相信。
尼玛，橘生淮南则为橘，生淮北则为枳。如果就中国的实验室能重复，很难让人相信这
是科学。
NBT潜在的意思已经很明确，如果韩故意隐匿了某些关键步骤的话，同样面临撤稿的命
运。所以，如果韩真能拿出来，smart版，而且证明work的话，NBT同样会以诚信的理由
撤稿。如果不这样，NBT就不用搞了，所有人都写个垃圾protocol糊弄过去，即便结论
可靠，对整个科研环境会造成重大伤害。 |
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发帖数: 1 | 42 NBT调查是人民日报从NBT处直接得到的消息，难道人民日报造谣传谣陷害韩春雨？
应该是NBT内部已经确定要调查此事，但尚未正式开始调查 |
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c********n
发帖数: 225 | 43 第四类“重复” 验证实验信息：实名, 网络、论坛发布
- 重复、拓展验证实验不能支持NgAgo基因组编辑功能
- 包含有具体实验信息（eg实验材料，步骤，etc）以及发布方具体信
息的发布报告
共计13则
细节请参见
Date：2016年10月10日
Title：13位科学家实名呼吁对韩春雨启动调查：为了中国学界的名声
Link：
http://www.thepaper.cn/newsDetail_forward_1541143_1
增加实验细节请参见：
Date：2016年10月11日
Title：【赛先生】13个课题组实名声明：无法重复韩春雨实验
Link:
http://chuansong.me/n/943170546756
其中， 根据一些实验室数据推论，“NgAgo或许不具备双链DNA切割活性”
“北京大学生物动态光学成像中心研究员孙育杰的实验室专长荧光成像。。。。孙育杰
进一步解释：端粒有一个特点，它有数千个重复片段，如果用CRISPR或者TALEN这样的
技术去target（靶向）端粒的重复片段的话，由于它有上千次重复，数百、上千个
CRISPR或TALE会富... 阅读全帖 |
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c********n
发帖数: 225 | 45 第四类“重复” 验证实验信息：实名, 网络、论坛发布
- 重复、拓展验证实验不能支持NgAgo基因组编辑功能
- 包含有具体实验信息（eg实验材料，步骤，etc）以及发布方具体信
息的发布报告
共计13则
细节请参见
Date：2016年10月10日
Title：13位科学家实名呼吁对韩春雨启动调查：为了中国学界的名声
Link：
http://www.thepaper.cn/newsDetail_forward_1541143_1
增加实验细节请参见：
Date：2016年10月11日
Title：【赛先生】13个课题组实名声明：无法重复韩春雨实验
Link:
http://chuansong.me/n/943170546756
其中， 根据一些实验室数据推论，“NgAgo或许不具备双链DNA切割活性”
“北京大学生物动态光学成像中心研究员孙育杰的实验室专长荧光成像。。。。孙育杰
进一步解释：端粒有一个特点，它有数千个重复片段，如果用CRISPR或者TALEN这样的
技术去target（靶向）端粒的重复片段的话，由于它有上千次重复，数百、上千个
CRISPR或TALE会富... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 47 你太天真了。退一万步讲，以前如果真是碰运气“偶尔”work一下，他NBT文章里汇报
的”完美“数据是哪里来的？他言必称优化什么的，其实就是承认了他已经报道的数据
是假的。所以，不管他的系统work不work，他编造了数据，就是撤稿的基础。他敢对记
者耍赖说不会出示原始数据。但是NBT必然会管他要数据，他对NBT刷赖就是公然对抗杂
志，必然导致撤稿。 |
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c********n
发帖数: 225 | 48 【记录历史】NgAgo’2016 第二阶段 Milestones
编者注：前面发布了第一个阶段总结：
http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/32041815.html
简单回顾一下 第一阶段：缘起NgAgo，真假难辨
2016/04/13 to 2016/07/15
从NgAgo 专利发布到“火锅哥”宣布按照韩春雨给的实验建议（NBT paper里没有
提）重复出NgAgo基因编辑的实验结果
第一个阶段还处于“科学的事情要由科学来解决”
这个阶段有三个小起伏：
1. NBT文章发表后带来的对于NgAgo基因编辑功能的期待
2. 无法重复验证NgAgo基因编辑功能而带来的困惑
3. 韩春雨NBT论文造假嫌疑的讨论开始了
第二阶段：搅起一池浑水，正邪混战
2016/07/15 to 2016/08/31
从“火锅哥”一闪即隐，到河北省批给河北科大2.24亿人民币为韩春雨建造基因编
辑中心，其中近两千万用于购买仪器。
这个阶段，基于“无法重复”基础上的大量“科学证伪”数据继续不断出现，韩春雨
实验室也未能及时发布任何重复NgAgo基... 阅读全帖 |
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c********n
发帖数: 225 | 50 Date：2016年07月20日（NBT paper 上线两个半月以后）
Title：仇子龙的声明
Link:
http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/32030017.html
Key Points：
- 从声明的内容来看，仇子龙实验室没有能够重复出韩春雨NBT文章中的结果；
- 但是试了自己组的几个基因，他们发现NgAgo可能有很低的效率（只给了个估值，<5%
），用测序检测出来的； 相对应的CRISPR/Cas9对照，有20%的效率。缺少具体实验设
计，实验材料来源，实验方法等信息。
- 呼吁韩春雨发布效率更高的NgAgo的版本
- 声明会继续重复验证实验
编者注：
1.韩春雨NBT原文中，NgAgo和CRISPR/Cas9的效率很接近
2.截止到2016年9月2日，在这个发布信息一个多月以后，仇子龙组仍然没有发布任何相
关的追加实验结果信息
3.仇子龙组如果有后续试验结果，建议他们向“澳洲哥”学习
- “澳洲哥”虽然一开始给大家带来了一些不完全的，比较让人困惑的信息，后面认真
追加实验，并详细分析，公布实验细节，“open science... 阅读全帖 |
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