P****D
发帖数: 11146 | 1 http://www.sciencemag.org/content/336/6086/1248.full
Published Online June 6 2012
Science 8 June 2012:
Vol. 336 no. 6086 pp. 1248-1250
DOI: 10.1126/science.336.6086.1248
News
News
My Microbiome and Me
Mara Hvistendahl
Zhao Liping combines traditional Chinese medicine and studies of gut
microbes to understand and fight obesity.
Introduction
Perspectives
ScienceIs It Time for a Metagenomic Basis of Therapeutics?
ScienceHonor Thy Gut Symbionts Redux
Science Translational Med... 阅读全帖 |
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d******0
发帖数: 1598 | 2 四
罗生门这种倒霉的名字，当然是cc给取的。
cc告诉我，他之所以跑到香槟，是因为太平洋的对面是个高压锅。他说，历史专业是他
妈一悲剧，倘有功夫去研究那满是阴谋与谎言的上下五千年，倒不如去琢磨琢磨那五页
纸的高压锅使用说明书。他还说，政治专业也他妈是一悲剧，美国也没好哪儿去，美国
是他妈一KFC微波炉。
cc在香槟的实验室里，整天把艹字挂在嘴边，就跟他的胡子拉碴一样，反正系里的美国
人韩国人印度人也听不懂。他把自己培养的细胞，标记成艹24h艹48h艹96h，一盘一盘
，歪歪斜斜，大大咧咧摆在37度的培养箱里。那些被标记了的细胞，从病人身上活剥出
来的细胞，千千万万个，密密麻麻，浸泡在绛紫色的培养液里，同呼吸，共命运，不知
道有没有人琢磨着造出一巴别塔来。绛紫色的培养液，看起来很像酒，里面可是加了胎
牛血清的。我高中时候在深圳，看了不少不入流的吸血鬼小说。我每次跟cc培养细胞，
都忍不住多看几眼那绛紫色的培养液，心里还琢磨着，我要是个吸血鬼，就先吸干cc的
血，再喝光实验室所有的细胞培养液。
然而据cc的说法，他在离开香槟之前，最想干的事情却是往实验室的培养液里吐上一口
浓痰。他经常自信... 阅读全帖 |
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O*******d
发帖数: 20343 | 3 美国人一般都不会知道什么是Nitric Oxide Pathway吧？ 更不要说这里边的笑点了。
科普一下。
Sildenafil citrate, popularly known by the trade name Viagra, stimulates
erections primarily by enhancing signaling through the nitric oxide pathway
in the penis.
http://en.wikipedia.org/wiki/Nitric_oxide |
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r*********n
发帖数: 13992 | 4 随手在wiki pathway中找了一个。
Integrated breast cancer pathway |
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G*********s
发帖数: 6786 | 5 1. According to Dr. Xiao, he has "dedicated my live to SCI research since
1976" [1]. The animal studies on cats [2] and clinical trials of 15 patients
[3] are all for SCI.
2. Dr. Xiao's papers on SCI were published "in highly regarded western
journals" in 1999 and 2003, co-authored with Dr. de Groat, "the most
respected name in bladder physiology" [4]. We note that, in his recent
reviews [5, 6] on bladder function recovery after SCI, Dr. de Groat gave no
word to Dr. Xiao's work.
3. From 1999 to ... 阅读全帖 |
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y***v
发帖数: 270 | 6 这个Beaumont医院回答的信比较清楚，你们看看
我写个摘要：
手术有风险，风险是手术一侧神经的变弱或萎缩。原文:The risks of this surgery
are weakness to the lower extremity (the operative side).
若是非同侧，或者两侧都出现问题，则应该是疾病本身造成的而不是手术造成的。
问题：那些被报道的，到底是两侧都有问题，还是就手术侧有问题。还有，就用这个做
个retrospective study 去验证一下安全性，很简单吧。
另，有医生表示：
“肖氏术取用的是单侧一段运动神经，这段神经功能丧失后出现的是废用性萎缩而不是
溃疡。病人本来存在的脊髓受压如果严重会导致双下肢周围神经病变，与糖尿病足的致
病因素有相似之处，出现迁延不愈的溃疡最后截肢。这种病变是渐进性的，也可以解释
为什么这个小孩在术后两年才截肢。”
还有人表示：
“栓系综合症。由于脊柱裂，脊髓被栓到骶骨部位，没有回位，没有伸缩空间，所以，
小孩每长高一点，脊髓就绷得更紧，神经损伤平面就更高：丛最早的膀胱直肠神经（骶
5、4、3、2）到管腿的神经（骶1... 阅读全帖 |
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W*****s
发帖数: 684 | 7 Further experimental studies are still required, notably with animals to
confirm the encouraging results of these initial studies, and to better
understand the mechanism before possible routine patient use.
Xiao hammer!
Bladder reinnervation with creation of a "somato-autonomic" reflex pathway
in spinal cord injured or spina bifida, a new way for treatment?
Nouhaud, F.-X.a , Caremel, R.a , Leroi, A.-M.b , Grise, P.a
a Service d'urologie, CHU de Rouen, 1, rue de Germont, 76000 Rouen, France
b... 阅读全帖 |
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W*****s
发帖数: 684 | 8 Further experimental studies are still required, notably with animals to
confirm the encouraging results of these initial studies, and to better
understand the mechanism before possible routine patient use.
Xiao hammer!
Bladder reinnervation with creation of a "somato-autonomic" reflex pathway
in spinal cord injured or spina bifida, a new way for treatment?
Nouhaud, F.-X.a , Caremel, R.a , Leroi, A.-M.b , Grise, P.a
a Service d'urologie, CHU de Rouen, 1, rue de Germont, 76000 Rouen, France
b... 阅读全帖 |
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W*****s
发帖数: 684 | 9 Further experimental studies are still required, notably with animals to
confirm the encouraging results of these initial studies, and to better
understand the mechanism before possible routine patient use.
Xiao hammer!
Bladder reinnervation with creation of a "somato-autonomic" reflex pathway
in spinal cord injured or spina bifida, a new way for treatment?
Nouhaud, F.-X.a , Caremel, R.a , Leroi, A.-M.b , Grise, P.a
a Service d'urologie, CHU de Rouen, 1, rue de Germont, 76000 Rouen, France
b... 阅读全帖 |
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Z**S
发帖数: 1211 | 10 Just searched the Pubmed. Be humble.
Rat experiment:
Paraplegia. 1994 May;32(5):300-7.
A possible new reflex pathway for micturition after spinal cord injury.
Xiao CG, Godec CJ.
Department of Urology, Long Island College Hospital, SUNY Health Science
Center at Brooklyn 11201.
Cat experiment:
J Urol. 1999 Sep;162(3 Pt 1):936-42.
"Skin-CNS-bladder" reflex pathway for micturition after spinal cord injury
and its underlying mechanisms.
Xiao CG, de Groat WC, Godec CJ, Dai C, Xiao Q.
Department of Uro... 阅读全帖 |
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c*******o
发帖数: 8869 | 11 【 以下文字转载自 USANews 讨论区 】
发信人: gemini2012 (双子AB), 信区: USANews
标 题: 以史为鉴，diversity导致chaos
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Aug 25 10:01:40 2016, 美东)
Diversity: History's Pathway to Chaos
Victor Davis Hanson
Posted: Aug 25, 2016 12:01 AM
Emphasizing diversity has been the pitfall, not the strength, of nations
throughout history.
The Roman Empire worked as long as Iberians, Greeks, Jews, Gauls and myriad
other African, Asian and European communities spoke Latin, cherished habeas
corpus and saw being Roman as pre... 阅读全帖 |
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s*******w
发帖数: 2257 | 12 Book Review: Your Best Life Now, by Joel Osteen
Review
03.08.2001
Someone might legitimately raise the question why we are reviewing this book
. After all, the pattern here at 9Marks has been that we review Christian
books.
I suppose we must be branching out now, because Joel Osteen’s Your Best
Life Now is decidedly not one of those. Open the book to any random page,
and you will likely find some mention of God or even a reference to
Scripture. Yet that is just window-dressing.
Your best life no... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 13 村民老梁：肖传国的申诉信中的笑点
美国ACH医院的Tuite团队发表了一篇否定肖氏手术的论文，肖传国很不服气，给杂志社
写了一篇斗志昂扬的申诉信。在申诉信中，肖传国说道：
我立即强烈反对，并列出2个主要理由：1，肖氏手术已被许多医学中心证明有效，包
括3家著名美国医院（Beaumont医院，纽约大学医学中心，路易桑拿州立大学医院），
并均有高水平专业学术文章发表，所以还将此特大手术在儿童，而且还是脊膜膨出残疾
儿童，进行双盲实验，既不需要，更违反医学伦理；。。。
那么，在ACH的双盲实验开始之前，真的有包括三家美国著名医院的多中心发表了高水
平专业学术文章吗？我们看看肖传国所说的高水平专业文章都是什么。在中文信中，肖
传国没有给出相关的参考文献，但是在英文版中，是有参考文献的。
First, Xiaoprocedure had been proved to be a very effective procedure by
many centers withthousand cases and formal publications [123] including
those in ... 阅读全帖 |
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d*b
发帖数: 21830 | 14 因为USMLE step 1在台湾开考比大陆早点而已。学医的比较trick的是pathway, 你要走
这个规定的pathway才能eligible USMLE, 当然，用不了5年，美国医院里就全是穿白大
褂的四眼大陆妞了 |
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P********l
发帖数: 452 | 15 １．好牛逼．
２．不便宜．
３．很怪异．
不会丢的内存数据库：Auto-Commit Memory
But, what if an application could designate a certain area within its memory
space as persistent, and know that data in this area would maintain its
state across system reboots? This application would no longer have the
burden of following the multi-step block I/O pathway to persist that data.
It would no longer need smaller transactions to be packaged into 4k blocks
for storage. It would just place selected data meant for persistence in this
de... 阅读全帖 |
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O*******a
发帖数: 692 | 16 Pathway 1 or Pathway 2 应该怎么选
我工作了不满1年，但是有超过500个小时的时间，不知道这样算不算满足要求的。谢谢 |
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I**********l
发帖数: 1350 | 17 Are you sure? Where did you read that? I tried to google it, it doesn't say
10 units ethics counrse + 20 more acct units are required...
http://www.calcpa.org/content/licensure/requirements.aspx
Pathway 2 (After Jan. 1, 2014, this will be the ONLY pathway to licensure in
California.)
Requirements:
A bachelor’s degree;
24 semester units in accounting-related subjects;
24 semester units in business-related subjects;
150 semester units (or 225 quarter units) of education;
Passing the Uniform CPA Ex... 阅读全帖 |
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I**********l
发帖数: 1350 | 18 Are you sure? Where did you read that? I tried to google it, it doesn't say
10 units ethics counrse + 20 more acct units are required...
http://www.calcpa.org/content/licensure/requirements.aspx
Pathway 2 (After Jan. 1, 2014, this will be the ONLY pathway to licensure in
California.)
Requirements:
A bachelor’s degree;
24 semester units in accounting-related subjects;
24 semester units in business-related subjects;
150 semester units (or 225 quarter units) of education;
Passing the Uniform CPA Ex... 阅读全帖 |
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i******o
发帖数: 273 | 19 Applicants That Have Passed the CPA Exam Prior to December 31, 2013
If you passed the CPA Exam on or before December 31, 2013, you have the
option to apply under the prior pathway system listed below. This option
will exist until December 31, 2015. Each pathway has its own educational and
experience requirements. All education must be completed at an accredited
degree-granting educational institution. |
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g*****2
发帖数: 46 | 20 请问CA pathway 2要求的150学分，如果是中国的本科是不是要把成绩单寄去指定的地
方作评估？记得以前是说pathway 2是如果有master degree,就一年的experience,现在
怎么变成本科150学分加一年经验了，真是奇怪。谢谢。 |
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l**k
发帖数: 419 | 22 object cognition是处理spatial info，而dorsal pathway是处理temporal
info的。当然，这个spatial并不是指空间分布，而是指在空间里面的features。
举例而言，比如你能够认出你面前的mm是否是你熟悉的(verntral pathway)，
但是她在你的左边还是右边，是否正在象你走来还是离开，这就是dorsal的
干活(一个不是特别恰当的例子而已)。脑的这两条通路，可以回溯到visual
tract/nerve上的P和M通路上。 |
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g**********t
发帖数: 475 | 23 bioinformatics可以考虑。不过最适合你的方向肯定是上边说的lab automation，个人
也觉得这个方向很有前途。生物学实验很多都是重复性的，如果能够将这些实验自动化
那对生物学研究的贡献可是功德无量啊（决不夸张）。比如我就经常想，现在研究那些
生物patheway的方法效率太差，要是以后都全自动了就爽了。比如直接全基因组水平自
动化的knockout基因，然后自动化的鉴定表型。根据表型用程序建立可能的pathway模
型，然后根据这些备选模型设计下一步的knockout实验。如此往复循环直到确定最终的
pathway模型。
不过生物的方向大多只能混学术界，找工作可比工科差远了。 |
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c*********r
发帖数: 1312 | 24 说道微调，刚看了篇文章说Wnt pathway和cell cycle相关，LRP S1490在G2/M期被
CDK14/Cyclin Y磷酸化导致Beta-catenin富集，还是挺有意思的。wnt和细胞周期、纺
锤体、centrosome、oriented cell division等等等等都能扯上点关系。。。
另外，Wnt的主要components基本上发现的差不多了，但不同的条件下哪些蛋白参与了
，怎么参与了还不清楚。比如海葵海胆早期发育（很早很早）时wnt pathway是激活的
，但似乎不需要Wnt ligand的参与；比如LRP、dishevelled等有那么多磷酸化位点，具
体怎么被磷酸化的，还不是很清楚。。。 |
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a***e
发帖数: 1010 | 25 why not create your own direction, instead of jump in something that has
been studied for such a long time?
Until you are doing some other biological phenomena and come cross wnt
pathway, it is meaningless to focus on this pathway itself. |
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c*********r
发帖数: 1312 | 26 不好意思，刚看到你的帖子。这个问题我没有深究过，只是附和老板和前辈们的结论。
在海胆和海葵中，Wnt pathway被激活的地方，以beta catenin作为marker，是
gastrulation的地方。我们实验室以前的数据显示，Wnt ligand不是localized。但是
Wnt pathway中的dishevelled在卵细胞甚至更早就localize在植物极，而且是必需的。
据说Wnt ligands的knock down都没有明显的表现性缺陷但是老板的文章里Dishevelled
下调后影响胚胎发育。不知道这些信息是否够证明Wnt ligands不参与早期的这些事件
。。。
早期的胚胎发育有些独特，是从一个巨大的单细胞开始的，和之后的多细胞的体系有所
不同吧。
Wnt |
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d***y
发帖数: 195 | 27 你的问题不成问题，
首先一个问题，现在的药物有没有副作用的药物么？
其次，肿瘤细胞和癌细胞有区别，某个pathway也好，某个靶蛋白也好，源自于突变也
好，异常调控也好，假设化合物真的只对肿瘤细胞有特异性，那么正常细胞里的靶蛋白
或pathway哪去了？
如果能解决这个问题，化合物/药物也许就不是很重要了，重要的是肿瘤和正常的区别
，也许是大发现呢。
特异性是指目标小且精确，达到这点已经是一个很好药物候补了，
药物开发为什么会有Phase I II III？ |
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M*******s
发帖数: 108 | 28 signaling pathway 很有用的方法 是 phosphorylation proteomics 还有 就是
标记pathway中的key component 比如 input或者 output signal 可以read receptor 或者
TF的 time course fluorescence signals
gene regulatory network 最常 用 的 就是 microarray 了
目前可以 做 cell-type specific time series 应该暂时够用了 但是microarray
的弊端也不容忽视
目前比较高效精确的技术手段 还 不是很成熟
不过荧光作为read out signal将来必然会成为有力的技术手段。 |
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g*****n
发帖数: 241 | 29 我研究两个基因（a和b），各自的null mutant都有共同的表型X,但是penetrance很低
（小于10%）。Null mutation的双突变致死（synthetic lethal），但是a和b的各自的
weak allele的组合不致死，但是导致的表型X的penetrance达到了70%。请问该怎么解
释啊？
PS: a和b都是membrane receptor，有各自不同的ligand和signaling pathway，但有研
究表明它们可能可以形成co-receptor，但是ligand和signaling pathway未知。
谢谢 |
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s*******e
发帖数: 740 | 30 年轻人讨论很激烈，我老同志也插句嘴（大家看了别拍，我老了受不起了）
要我说大家应该思考一下如果你是决策者，具体采取什么措施，而不是停留在概念的争
论上。很多事情道理简单，就是没法实施。
要我说啊，如果我作决定，我就大致实行一刀切（不一刀切在中国执行肯定变样）。具
体是：支持生物新技术，新方法的研究；不支持用已有技术collect data的研究。
举例说明：
我会大力支持新一代DNA测序技术的研究，决不会fund给牡蛎genomic dna测序的研究
我会支持新质谱或其他物理谱在生物方面应用的研究，绝不会花6亿去测肝脏蛋白组，
虽然这些data确实有一定意义，但信价比太低
我会支持新的测量蛋白-蛋白之间相互作用技术的研究，而不会fund用antibody技术去
研究某一条signaling pathway的project,即使这条signalling pathway很重要
我基本的观点是：目前生物学实在还算不上是一门严格意义上的科学，就是个经验积累
行业
。要命的是，由于现有技术太差，我们积累（至少是发表出来)的data高度不精确，甚
至根本错误。所以目前迫切需要解决的问题实在是如何更 |
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y******8
发帖数: 1764 | 31 One sample from google. Good luck!
Dear PLoS Biology editor:
I would like to submit a presubmission inquiry regarding suitability of our
manuscript, "Subversion of cellular autophagy pathway by RNA viruses" by
William T. Jackson, Thomas H. Giddings Jr., Sara Mulinyawe, Ron Kopito and
Karla Kirkegaard for publication in PLoS Biology. Cellular autophagy is a
field that is just entering a period of rapid discovery, because the
mammalian homologs for the many yeast genes that affect autophagy have v... 阅读全帖 |
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p*****m
发帖数: 7030 | 32 not necessarily.
Geneticists (esp. the old school ones) once tend to design simple and
qualitative (black and white) assays for screens. One major reason was
that they had to score the mutant phenotype manually-and human eye is
not good at identifying subtle quantitative changes. But simplicity also
came at the expense of being indirect. For example, fly people used eye
development to screen for RTK pathway genes, or used bristle numbers to
screen for notch/delta pathway genes, and they risked t... 阅读全帖 |
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a*****y
发帖数: 269 | 33 【 以下文字转载自 SanDiego 讨论区 】
发信人: alvinpy (生命就是一场歪打正着), 信区: SanDiego
标 题: Post-Doc Positions at Pfizer
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Nov 16 20:10:46 2010, 美东)
Please send in cover letter and CV to Nathan Lee: n**********[email protected]
Postdoctoral Positions in Pfizer Oncology, La Jolla CA
The post doctoral positions will be responsible for elucidating the
mechanism of action of existing Pfizer
portfolio compounds, ensuring that we have the appropriate patient selection
strategies for such
mechanisms, aligning ... 阅读全帖 |
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w***a
发帖数: 4361 | 34 问题是做了这么多年，很多疾病相关的signaling pathway已经逐渐明了。target就在那
里，问题是不drugable。
RNAi的好处太多了，不是单个基因控制的diease，你就多弄几条siRNA target多个基因
，甚至整条pathway。这个用small molecular是不可想象的。要说off target effect，
small molecular就更没法控制了。至于RNAi的作用是short term而非long term，这点
跟small molecualr也一样，而且实际上你也不希望吃点药就permanently knock out你的
某个基因吧？
对于RNAi therapy，其实就是个delivery的问题。 |
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P******n
发帖数: 78 | 35 那你说哪个pathway搞清楚了？Wnt pathway? cell cycle 还是metabolic？不要跟我说
你说的是bacterial里面的。为啥现在RNAi screen那么火？
懒得和你磨嘴皮子，你如果enjoy做试验的乐趣，觉得自己的方法是主导，那就抱着，
一遍遍做，挺好的。我觉得不停倒腾新数据，发现pattern，预测结果挺有趣，那咱么
各玩各得好了。千万不要觉得自己吃了很多苦就一定是主导。好的科学家懂得尊重每一
个科学工作者。
PI
cell |
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P******n
发帖数: 78 | 36 那你说哪个pathway搞清楚了？Wnt pathway? cell cycle 还是metabolic？不要跟我说
你说的是bacterial里面的。为啥现在RNAi screen那么火？
懒得和你磨嘴皮子，你如果enjoy做试验的乐趣，觉得自己的方法是主导，那就抱着，
一遍遍做，挺好的。我觉得不停倒腾新数据，发现pattern，预测结果挺有趣，那咱么
各玩各得好了。千万不要觉得自己吃了很多苦就一定是主导。好的科学家懂得尊重每一
个科学工作者。
PI
cell |
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o********r
发帖数: 775 | 37 GO, pathway之类的说实话没太大实际意义，因为无论GO或者pathway数据库中都有不少
的错误和遗漏。NGS倒是可以直接发现一些direct AA change以及一些fusion protein
，可能更有直接意义，不过这个需要deep coverage。
list |
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f*****i
发帖数: 10 | 38 结构
天然。最多也就两三个蛋白在一起搅。
信号
傲娇。很多蛋白，今天和这个pathway搅，明天好像又跟另外一个pathway搅，你永远不
知道它的官配是哪一个。
bioinformatics
鬼畜。需要解释么？ |
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p*****m
发帖数: 7030 | 39 这个我不太同意。如果按照果蝇/线虫遗传学的思路 就是拿鲍和筛选来彻底搞清一个
pathway 这个老鼠肯定不行，事实上在老鼠里做modifier screen的好像就没有什么人
。但是你完全可以换个思路，screen出来一个hit，只要有意思，大可以接着用biochem
,用genomics的方法把它的上下游找出来接着做。这个时候forward screen找出的那个
hit是最重要的，别的方法替代不了的。
还是原来举的例子。当年Joe Takahashi作mouse screen其实就做了一丁点，就找到了
clock mutant,然后从clock gene出发能找出整套circadian rhythm的mechanism，后面
这部分就不需要genetic screen了，看看啥东西和clock binding,啥东西受clock调控
，blabla,也可以做得很好。但是这个clock gene如果没有forward screen就不知道什
么时候能找出来（当然现在往回看的话，如果mouse people相信fly的结果，完全可以
从fly circadian rhythm gen... 阅读全帖 |
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f**u
发帖数: 346 | 40 你说得我都同意，我不是说老鼠不能做遗传，
但我始终觉得老鼠本身不是个合适的做遗传的物种。
之所以这么多人还在做，其实就是没办法，老鼠很重要，
而且也像你们说的，有些问题你必须用老鼠去做，
所以怎么整的都有，用什么方法作的都有。
如果老鼠遗传大多数时候都是只能找出一个hit，然后再顺藤摸瓜，
这就已经说明了老鼠遗传不是那么强大。
我不是说老鼠遗传没用，第一个hit很重要，有了就能牵出一片，
但是和线虫酵母一下就揪出一条甚至几条相关的pathway，还是有上下之别的。
也许老鼠就永远不可能把一个pathway一下揪出来，
所以就只能有什么方法都试着，看能不能揪出一两个hits出来。
另外你说老鼠里筛modifier的不多，挺巧的是我知道得那么一两个都是这么搞的。
现在老鼠里作forward screen大都怎么做的？直接晒显性？
biochem |
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g***j
发帖数: 40861 | 41 Tough Lessons From Golden Rice
Martin Enserink
It was supposed to prevent blindness and death from vitamin A deficiency
in millions of children. But almost a decade after its invention, golden
rice is still stuck in the lab
It's easy to recognize Ingo Potrykus at the train station in Basel,
Switzerland. Quietly waiting while hurried travelers zip by, he is holding,
as he promised, the framed and slightly yellowed cover of the 31 July 2000
issue of Time magazine. It features Potrykus's bearde... 阅读全帖 |
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b*****l
发帖数: 9499 | 42 稳定性可以改进么，概念上问题还是不大的。
IPA 的算法，说来 ft：先给个 pathway，数出里面 protein 的个数（比如说 n），然
后看 DEGs 里面出现了多少个(比如说 m)，那么 m/n 就是这个 pathway 的 index。。
。这还不如 GSEA 的算法靠谱呢。
后来据说他们也要开始考虑每个 protein 的 fold change 了。。。 |
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h**********r
发帖数: 671 | 43 Keasling主要是在yeast中玩的，再说了K先生组在e. coli中偏好arabionose
inducible的Pbad,早期Keasling在这个promoter上花了不少功夫包括模型和实验。
最近WHO已经发现青蒿素的耐药性出现了。这个比较搞，synthetic biology还没有搞好
，人家那边耐药性已经出现了。其实这工作也就这种大组有稳定的funding能玩玩儿。
不过说不定有些enzyme能对前体物修饰，一定程度上对抗这种耐药机制。
以前有篇报道，说这种pathway组装，需要大量的人力来完成（千老的作用显现出来了
），说Keasling的工作（从基因到产量）需要多少个postdoc 50年完成（数字不记得了
）。现在也有人在想发明更高效的pathway assembling的过程。keasling的工作有点像
是“炮轰”式，遇到问题了一堆人来做mutant克服inhibition啊尝试不同的表达量啊。
不喜欢思考形而上学的东东。这么些年来，其实让人印象深刻的东西不太多(scaffold
上蛋白的表达synthetic operon等)。去年发的那篇nature关于... 阅读全帖 |
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h**********r
发帖数: 671 | 44 Keasling主要是在yeast中玩的，再说了K先生组在e. coli中偏好arabionose
inducible的Pbad,早期Keasling在这个promoter上花了不少功夫包括模型和实验。
最近WHO已经发现青蒿素的耐药性出现了。这个比较搞，synthetic biology还没有搞好
，人家那边耐药性已经出现了。其实这工作也就这种大组有稳定的funding能玩玩儿。
不过说不定有些enzyme能对前体物修饰，一定程度上对抗这种耐药机制。
以前有篇报道，说这种pathway组装，需要大量的人力来完成（千老的作用显现出来了
），说Keasling的工作（从基因到产量）需要多少个postdoc 50年完成（数字不记得了
）。现在也有人在想发明更高效的pathway assembling的过程。keasling的工作有点像
是“炮轰”式，遇到问题了一堆人来做mutant克服inhibition啊尝试不同的表达量啊。
不喜欢思考形而上学的东东。这么些年来，其实让人印象深刻的东西不太多(scaffold
上蛋白的表达synthetic operon等)。去年发的那篇nature关于... 阅读全帖 |
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O******e
发帖数: 4845 | 45 20-30%已经够厉害了－－我怀疑不会影响这么大。
CR pathway?就是metabolism吧，怎么会有CR specific pathway? |
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m**********2
发帖数: 57 | 46 我的意思是Active JAK/STAT pathway出现某种phenotype，
而这种phenotype出现表明是激活JAK/STAT pathway 导致的。
Active JAK/STAT能够导致某种function assay or phenotype.
我现在是想加入某种drug出现某种function assay or phenotype.
说明drug是active JAK/STAT,
当然WB观察phosphorylation stat也是一种方法，但是只是从protein level。
我现在是想从功能level观察。想问问是不是有实践证明的Active JAK/STAT 导致的某
种function。
比如说某种细胞的分化，这样我加入drug，细胞出现分化，说明可能是active JAK/
STAT。 然后我再测量phosphorylation stat level increase，这样就比较完整了 |
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t****p
发帖数: 1504 | 47 要说Pan也是根正苗红，北大，CUSBEA，Johns Hopkins教授，HHMI；控制器官大小
Hippo Pathway的奠基人。
我个人认为他的工作很有原创性，Hippo Pathway的重要性不亚于晓东同学的线粒体凋
亡通路。 |
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g*********3
发帖数: 177 | 48 有一批microarray的数据（affy）,找到了差异表达基因后，怎样把他们mapping到
signal pathway和metabolism pathway上去。
请大家推荐几个数据库或者软件。
谢谢。 |
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