a********k
发帖数: 2273 | 1 花了一个小时，深深的鄙视一下自己的无聊行径！！
125 蔡亮 男 1980年11月 复旦大学 生命
科学 2007年12月毕业于[美国]北卡大学 [美国]加州大学旧金山分校 博士后
Cai L, Mostov K. Polarity is destiny. Cell. 2009 Nov 13;139(4):660-2. PubMed
PMID: 19914162; PubMed Central PMCID: PMC2900917.
Cai L, Makhov AM, Schafer DA, Bear JE. Coronin 1B antagonizes cortactin and
remodels Arp2/3-containing actin branches in lamellipodia. Cell. 2008 Sep
5;134(5):828-42. PubMed PMID: 18775315; PubMed Central PMCID: PMC2570342.
Cai L, Makhov AM, Bear JE. F-actin... 阅读全帖 |
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n******7
发帖数: 12463 | 2 事情是这样，我们用RT-PCR克隆了一些gene的transcript （CDS only），然后丢给454
测了，然后把其中的一些克隆又拿去做了Y2H。我发现有好几个基因都有个特别的
transcript克隆出来。它们的特点是：
1. 超级短。往往gene有七八个exon，这个transcript就在取了第一个和最后一个exon
的各一部分了事。一共也就200个nt左右
2. READS coverage很低。我们平均的coverage在60X+，这几个小东西也就1-2X，因为
也很短，也就是说，就一两条reads支持。很奇怪，因为我们是用clone测序，所以这个
跟表达量也没关系。后续的Sanger data也确认了这些短序列
3. 不是canonical splicing site。把这些序列align的genome的话，都是覆盖最5'和
最3'端的，之间是一个巨大的gap。如果gap是spliced intron的话，对应的splicing
site不是GU..AG。
4. interaction partner往往很多。比如有个transcript，有15个partner筛出... 阅读全帖 |
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n******7
发帖数: 12463 | 3 情况大概是这样：我们做了很多cDNA clone，测序之后选取了一些进行了下游的实验，
主要是in vitro 的protein实验。我们鉴定了很多新的splicing isoform，其中有不少
有premature stop codon(可以是splicing 造成的，也可以使indel造成的）
现在我们想做一些quality control，去掉一些不靠谱的transcripts，于是出现了分歧
组里的大姐想法是要尽量跟已知的protein一致。把每条isoform对应的protein align
到已有的protein sequence上。如果整条protein基本align上去，即便使truncated
protein, 不管什么原因，都可以作为partial protein 保留。但是如果shifted frame
的amino acid sequence长到一定程度，那就认为这些protein sequence跟已有的
sequence太不一样，要除去
我完全明白大姐为什么那么想，因为我们实际test的是一些protein sequences
但是就我这部分工作，我需要关... 阅读全帖 |
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x********u
发帖数: 430 | 4 TWO POST-DOCTORAL POSITIONS
Self-splicing introns and inteins: Structure, Function, Evolution,
Application
Postdoctoral positions are available in the Marlene Belfort lab to study
both self-splicing introns and inteins. The group investigates both the
dynamics of retrotransposon-like group II introns and their evolutionary
relationship to spliceosomal
introns, and the structure, function, evolution and application of the
protein-splicing inteins.
The successful applicants will use genetic, bioch... 阅读全帖 |
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K**R
发帖数: 193 | 5 谢谢您的回复，
我是为了测试alternative splicing。 我们最近发现一个基因alternative splicing
在发育和成熟组织中似乎存在，想证实是否是western 非特异还是确实是alternative
splicing。
想设计一段包含所有潜在的splicing，就是shared的区域。然后northern 测试是不是
确实有不同大小拼接。
probe应该是cdna 为模板和mRNA杂交
谢谢您
. |
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l**********1
发帖数: 5204 | 6 key words:
5fC; 5 caC; pre-mRNA splicing; Pol II; hetrochromatin or H4K20
cited from
Nat Struct Mol Biol. 19: 1061-4. (2012).
New functions for DNA modifications by TET-JBP.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23132381
>the ability of 5fC and 5caC to decrease the transcription elongation rate
of Pol >II may facilitate the interaction of Pol II with diverse
transcription elongation factors, chromatin regulators, histone-modifying
enzymes and factors involved in pre-mRNA splicing. Shukla et al.34... 阅读全帖 |
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m******g
发帖数: 467 | 7 Nature 13.11.14
推荐：
1. A high-resolution map of the three-dimensional chromatin interactome in
human cells
3C方法（你知道4C,5C等等吗）determined over one million long-range chromatin
interactions at 5-10kb resolution.
知道有这么个资源就好，好像有不少类似产数据的paper,但是感觉physically close离
function还是有很长的距离要走（特别是本来就是连锁在一起的gene），加油~
稍微了解一下：
1. Dedifferentiation of committed epithelial cells into stem cells in vivo
看一下标题，知道有这件事情就好啦
2. RNA catalyses nuclear pre-mRNA splicing
The spliceosome is shown to catalyse splicing through th... 阅读全帖 |
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m******g
发帖数: 467 | 8 Nature 13.11.14
推荐：
1. A high-resolution map of the three-dimensional chromatin interactome in
human cells
3C方法（你知道4C,5C等等吗）determined over one million long-range chromatin
interactions at 5-10kb resolution.
知道有这么个资源就好，好像有不少类似产数据的paper,但是感觉physically close离
function还是有很长的距离要走（特别是本来就是连锁在一起的gene），加油~
稍微了解一下：
1. Dedifferentiation of committed epithelial cells into stem cells in vivo
看一下标题，知道有这件事情就好啦
2. RNA catalyses nuclear pre-mRNA splicing
The spliceosome is shown to catalyse splicing through th... 阅读全帖 |
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l********e
发帖数: 415 | 9 google "gene trap"
I'm pretty sure that the insert contains a splicing acceptor site followed
by STOP codons. This would promote upstream exon to be spliced into the
insert, instead of the downstream exons. Thus, the mutant transcript would
contain multiple STOP codons that prevent translation of downstream mRNA
sequences.
Leakage happens when normal splicing occurs at low frequency, even in the
presence of the inserted splicing acceptor site.
Hope it helps. |
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O********4
发帖数: 113 | 10 看来你不常做分子生物学。RT的产物不需要nick repair 或ligation啊，就像通常做就
可以了。RT 的产物是linear DNA的，只不过跨过circRNA特有的splice Junction. 比
如你用一个基因里反向的引物做PCR， linear mRNA 就没产物，而circular RNA 才会
有产物， 再一测序发现你的产物上exon 4连到exon 3 的5' end 了，这就证明了是环
状。
<- ->
－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－
还有你可以用外切酶RNase R 处理一下，线性的RNA被降解而环状不降解。
最早发现circRNA 的是通过90年代开始大规模测EST （那时还没有RNA-seq ) ， 发现
许多mRNA 的exon order 反了, 这不是由于trans-splicing 就是由于 back splicing
，结果这两种splicing方式都存在。还有circRNA 是可以被翻译成protein 的，所以也
不能说它纯粹是非编码，呵呵。 |
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p*******g
发帖数: 2976 | 11 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: albertsmwk (.)(.), 信区: Biology
标 题: 第一批“青年千人计划”生物类@publication列表@
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Aug 18 15:04:16 2011, 美东)
花了一个小时，深深的鄙视一下自己的无聊行径！！
125 蔡亮 男 1980年11月 复旦大学 生命
科学 2007年12月毕业于[美国]北卡大学 [美国]加州大学旧金山分校 博士后
Cai L, Mostov K. Polarity is destiny. Cell. 2009 Nov 13;139(4):660-2. PubMed
PMID: 19914162; PubMed Central PMCID: PMC2900917.
Cai L, Makhov AM, Schafer DA, Bear JE. Coronin 1B antagonizes cortactin and
remodels Arp2/3-containing actin branche... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 12
Download pdf published by SfN (Chapter from 'The History of Neuroscience in
Autobiography, Volume 8' edited by Larry R. Squire)
Yuh-Nung Jan's CV
Lily Jan's CV
Yuh-Nung Jan and Lily Jan
Birth
Family History and Growing Up
National Taiwan University
The Hiking Trip to Shitou in the Spring of 1967
Graduate School Application
Graduate Study at Caltech (1968锟974)
Seymour Benzer Lab (1974锟977)
Steve Kuffler锟絪 Lab at H... 阅读全帖 |
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a***e
发帖数: 413 | 13 多谢各位大牛回复。
lanti真牛，我就是卡在这里。尤其不清楚get里面下面这句怎么算是把当前访问的节点
移到链表头部。糊涂得很。。。。。。cacheMap[key]是一个list::
iterator，我理解相当于或者类似pointer。打算在VS里面debug看看。这还是第一次用
splice，以前都不知道有这么个东东。
cacheList.splice(cacheList.begin(), cacheList, cacheMap[key]);
private:
struct CacheNode{
int key;
int value;
CacheNode(int k, int v) :key(k),value(v){}
};
list cacheList;
unordered_map::iterator> cacheMap;
int capacity;
public:
LRUCache(int capa... 阅读全帖 |
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t*****s
发帖数: 3478 | 14 大钓，谢谢了。
我splice过braid to braid，以及braid to mono， 我都是用胶水粘的，splice以后。
现在我明白了，只要splice一个foot长度，就可以了，而且不要胶水。 |
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p***r
发帖数: 20570 | 15 大善人Bill Gates在非洲另外一个大笔投资是什么来着？转基因作物。
http://blog.sina.com.cn/s/blog_4134ba9001017wqm.html
转帖：纠正方舟子的错误
(2011-02-08 20:37:02)
转载
标签：
转基因
方舟子
食品
美国
中国
文化
分类： 转帖
题记：曹明华是我多年老朋友，目前在美国工作。不久前方舟子批评了曹明华，内
容主要针对曹明华两年前在国内出版的一本书《生命科学手记》，但批评涉及面超出了
这本书本身。最近，曹明华写了一篇回应文章，原标题为《回答方舟子》。原文较长，
我略作了些删改，转帖在这里。现标题是我改的，目的是醒目些。以下是曹明华的文字：
到目前为止，我总共发表过两篇反对转基因食物的文章和一篇以温和的口吻谈论“
中医之争”的文章，却因此招致方舟子先生对我的攻击：“学过分子生物学而崇拜中医
、攻击转基因技术的很罕见，现发现了一个……”，“她那书应该改名叫《生命伪科学
手记》，在《文汇报》的专栏也应该相应改名。这种人学生物学，是一场误会……”。
并且，方舟子先生不惜对我使用了“痛恨（！）... 阅读全帖 |
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n******7
发帖数: 12463 | 16 最近处理一些数据，鉴定到了几百个unique的transcripts，对应一百来个基因。这样
很多
transcripts其实是一个gene的不同isoform。现在因为要annotate这些isoform而有些头
疼。
1. 哪里有高质量又比较全的isoform数据呢？
我希望用已知的isoform的一个集合做reference，来确定我们鉴定的isoform，哪些是
之前已
经被发现的，哪些是我们新近鉴定出来的。
我个人喜欢用RefSeq数据，但是挑了几个基因，发现RefSeq记录的isoform数量还是挺
少的。
UCSC Known gene没有经过human curation，很多记录仅仅基于genbank数据。我担心会有
很多artificial的序列
GenCode/ENSEMBLE 数据，一直没太搞明白，Gendoce的level 1+2的数据似乎质量还可
以，
但是也不知道他们具体的annotation的流程
CCDS似乎就是ENSEMBLE和RefSeq的交集，coverage估计是个问题
Alternative Splicing的数据我不太熟悉，看过一些数据库，很... 阅读全帖 |
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j*p
发帖数: 411 | 17 本人在wet lab里面做纯数据分析，for NGS data analysis, 简单介绍一些自己接触过
，并且觉得挺有用的工具，说的有点杂，权作抛砖引玉，还请不吝赐教。
Next-Gen sequencing(NGS)和现在正在发展的3rd-gen sequencing将会在生物学研究中
被越来越广泛应用。不管你信不信，反正我信了。一是基于实验成本的降低（$1k
whole-genome sequencing is coming），越来越多的实验室可以操作；二是可以提供
相对low throughput experiment多的多的数据和信息，可以看到很多从前看不到的东
西；三是sequencer本身对测序的准确性正在逐渐提高，所以实验固有错误率降低；四
是各种算法的成熟应用，这使得很多由于实验产生的误差在出数据后通过对数据的分析
得以过滤。按照library preparation来分，NGS主要有DNA-seq和RNA-seq
DNA-seq is usually used as ChIP-seq to study transcription factor(TF)-DNA
bi... 阅读全帖 |
|
j*p
发帖数: 411 | 18 我也不是很理解,你可以作功能方面的研究,你也可以说,由于这个病人有这个mutation,
改变了他很多gene splicing,从而使的这个病人患上这种疾病.我不觉得这样的story和
统计有什么关系.但是,人家会问,如果这个mutation是造成这种疾病的原因,那么在其他
患相同疾病的患者身上有没有这个mutation?又有多少其他的患者携带这个或者类似紊
乱splicing regulator 的mutation?这就和统计有关了,并且这两个问题显然不能通过
一个病例得到回答.RNA-seq只能帮助你确定gene splicing,并不能帮助你回答这两个问
题. |
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j*p
发帖数: 411 | 19 本人在wet lab里面做纯数据分析，for NGS data analysis, 简单介绍一些自己接触过
，并且觉得挺有用的工具，说的有点杂，权作抛砖引玉，还请不吝赐教。
Next-Gen sequencing(NGS)和现在正在发展的3rd-gen sequencing将会在生物学研究中
被越来越广泛应用。不管你信不信，反正我信了。一是基于实验成本的降低（$1k
whole-genome sequencing is coming），越来越多的实验室可以操作；二是可以提供
相对low throughput experiment多的多的数据和信息，可以看到很多从前看不到的东
西；三是sequencer本身对测序的准确性正在逐渐提高，所以实验固有错误率降低；四
是各种算法的成熟应用，这使得很多由于实验产生的误差在出数据后通过对数据的分析
得以过滤。按照library preparation来分，NGS主要有DNA-seq和RNA-seq
DNA-seq is usually used as ChIP-seq to study transcription factor(TF)-DNA
bi... 阅读全帖 |
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j*p
发帖数: 411 | 20 我也不是很理解,你可以作功能方面的研究,你也可以说,由于这个病人有这个mutation,
改变了他很多gene splicing,从而使的这个病人患上这种疾病.我不觉得这样的story和
统计有什么关系.但是,人家会问,如果这个mutation是造成这种疾病的原因,那么在其他
患相同疾病的患者身上有没有这个mutation?又有多少其他的患者携带这个或者类似紊
乱splicing regulator 的mutation?这就和统计有关了,并且这两个问题显然不能通过
一个病例得到回答.RNA-seq只能帮助你确定gene splicing,并不能帮助你回答这两个问
题. |
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l**********1
发帖数: 5204 | 21 RE LZ
Did you note that some organism, anti-sense RNA likes RNAi can assist target
protein trans-splicing.
if not , pls go to one
2011 PhD dissertation of Université de Montréal
by Yan YF
pdf web link:
HTTPS double dot //papyrus.bib.umontreal.ca/xmlui/bitstream/handle/1866/5423
/Yan_Yifei_2011_memoire.pdf?sequence=5
its pp24:
>Does anti-sense mRNA assist trans-splicing?
A mechanism was recently identified in the ciliate Oxytricha trifallax
where larger RNA molecules are used as templates to dir... 阅读全帖 |
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n******e
发帖数: 110 | 22 在做肿瘤RNA测序相关的研究，最近才开始注意到反转录酶的出错率，看了一些文献报
道，觉得这是个大的问题，尤其是在做一些de novo sequence 研究的时候。比如trans
-splicing 和alternative splicing，大多数开始的实验是通过cDNA来作研究的。对于
一两个的transcript到是可以用传统的方法来验证通过cDNA sequence 的结果，可是对
于高通量的测序结果，好像没有人去一个个都验证吧。下面是两篇由反转录酶引起假阳
性的例子。
有没有同学对这方面熟悉的，比如反转录酶的错误率，怎么控制RNA sequence的准确，
希望可以讨论讨论。
1. Houseley, J. and D. Tollervey, Apparent non-canonical trans-splicing is
generated by reverse transcriptase in vitro. PLoS One. 5(8): p. e12271.
2. Zeng, X.C. and S.X. Wang, Evidence that BmTXK beta-B... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 23 "知道哪些问题重要哪些问题不重要，再这些重要的问题里，哪些问题是可以通过deep
learning解决的"
“bioinfo大量的精力其实浪费在寻找有效的feature上了”
我觉得这像一个哲学问题。
input: 血压数据 ------output：病人是否高血压
input: 血糖数据 ------output：病人是否糖尿病
input: 图像pixel ------output: 人脸识别这个是谁？
input: 遗传SNP ------output: 这个人会不会得帕金森？
对于任何新的问题/data，是不是我们都先blind的在training data上尝试各种
modeling？线性的非线性的；如果input和output真的有逻辑关系，那么至少会有一种
technique在test data上展现出很好的performance。
（当然参数的调试，甚至一开始选择哪种machine learning/deep learning手段这是另
外一个问题，可以另开个帖子）
如果尝试过很多，还是没能找到表现优异的model，
1. 是不是我们就认为input和output没... 阅读全帖 |
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m****g
发帖数: 530 | 24 近日，中科院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康科学研究所孔祥银课题组
张振国等人发现基因重复后基因剪
接信号演化特点，以及这些变化对基因新结构形成的影响，该成果在线发表在《基因生
物学》(Genome Biology)杂志
上。
在物种进化过程中，基因重复是经常发生的。那么基因重复后，基因结构是如何演化的
？张振国等人发现基因重复后，
早期阶段外显子剪接增强子（Exon splicing enhancers）和外显子剪接沉默子（
Exon splicing silencers）快速变
化，然后逐渐饱和。基因重复后，外显子剪接增强子严重丢失，这些改变主要与同义突
变相关；剪接信号的改变同时导
致基因新的剪接形式的发生。这一发现有助于理解新基因结构是如何演化的。
早年毕业于中国医学科学院的孔祥银博士是今年中科院院士增选初选入选者，他获得了
许多分子遗传学方面的成果，曾
成功克隆了遗传性牙本质发育不全I型基因(DSPP)，进入2009年，他所在的分子遗传学
研究领域又接连获得了许多新成
果。
第一篇“Divergence of exonic splicing ele |
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c********g
发帖数: 15629 | 25 转帖 - 曹明华：转基因食物在美国的争议 16 1
转基因食物在美国的争议
作者：曹明华
本人注：曹明华1985年毕业于上海交通大学生物医学工程系，1987年毕业于上海交通大
学社会科学及工程系。上个世纪90年代初赴美留学，获美国南加州大学神经老化分子学
硕士学位。目前在美国加州居住、工作。此文7月6日发表于《文汇报》，但《文汇报》
对原文有删改，而且没能附上注释。本人对曹明华的原文略作润色，以飨读者。以下是
曹明华的文章。
曾登上《时代》周刊封面的著名生物学家Barry Commoner说：目前的转基因食物产业和
种业所基于的“科学”，是已经过时的生物学理论。为什么他会这么说？
Barry Commoner指的是：转基因食物的研究和制造产业，最初发展时所基于的对于“基
因”的认识和研究理论、以及相关的“分子生物学”模型，在分子生物学日新月异的发
展进程中，特别是到了今天这个阶段，已一再被证明是“错了”。由于已经失去可靠的
生物学原理的指导和依据，目前的转基因食物行业，已成为一门充满风险的、带有赌博
性质的“实验科学”。Commoner博士还说：“公众所惧怕的，并不是这门实验科学本身
... 阅读全帖 |
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S*******l
发帖数: 4637 | 27 目前认为是因为alternative splicing.高等生物有这个机制使用有限lego pieces组合
实现功能。可以拼接coding area表达不同基因，实现不同功能。
高等生物有这个机制形成多种功能。
大米小麦没有这个机制，只能一个功能蛋白对应一个基因。所以genome大。
可以理解为人类genome是zip过的，有解压缩功能。
大米小麦没有，没有压缩过，也没有解压缩机制。
大米表达4万个蛋白。
人类虽然genoem 小，但是因为alternative splicing, 总蛋白质数量反而高。可能接
近10万。 |
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q*a
发帖数: 2330 | 28 ☆─────────────────────────────────────☆
jianglai (Veni, Vidi, Vici.) 于 (Thu Aug 2 02:54:30 2012, 美东) 提到:
http://www.nature.com/news/why-great-olympic-feats-raise-suspic
英帝堕落到什么地步了。。。
★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.3.1
☆─────────────────────────────────────☆
daye520 (哈哈) 于 (Thu Aug 2 02:56:00 2012, 美东) 提到:
罗切特每次都被拿出来做背景。
☆─────────────────────────────────────☆
michaelxiaga (南京中山陵) 于 (Thu Aug 2 02:58:53 2012, 美东) 提到:
回复里面有一个哥们写的不错
其实咱们在这里说有啥用, 就得用英文反驳white trash
☆─────────────────... 阅读全帖 |
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t*******y
发帖数: 21396 | 29 DETROIT -- Ford Motor Co. has issued its 11th recall on the 2013 Escape
crossover, this time because a wiring problem could cause the engine to
hesitate or stall.
The recall covers 159,395 Escapes and Focus ST hatchbacks from the 2013 and
2014 model years with turbocharged 2.0-liter engines in North America. Ford
said the engine wiring harnesses may have “splices that were insufficiently
compressed during the supplier manufacturing process,” which can affect
engine performance by sending incorre... 阅读全帖 |
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l**********i
发帖数: 11748 | 30 Disclaimer：我不懂他在说什么
我只是复制粘贴
Hacking the Progressive Snapshot OBDII device for perpetual 30% discount on
insurance (self.hacking)
submitted 8 months ago * by meccanexus
Background:
The Progressive Snapshot is a device offered by automotive insurance company
Progressive. It talks to your OBDII computer built into your car via the
OBDII port, usually located under your steering wheel / above the drivers
feet. It recieves information on vehicle speed and VIN and sends it back to
Progressive via a ce... 阅读全帖 |
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v**********m
发帖数: 5516 | 31 该文中四处提出诺贝尔奖字眼跟施论文的科学内容没有任何关系，作者那么牵强的把施
的工作和诺贝尔奖扯在一起是为什么？
当然如果你读不出清华吹捧它为诺贝尔奖级别的意思，当我没说，我向虎肉教授个人道
歉。
http://news.tsinghua.edu.cn/publish/news/4205/2015/201508230948
施一公教授研究组在《科学》发表两篇论文
报道剪接体的三维结构并阐述RNA剪接的分子结构基础
清华新闻网8月23日电8月21日，清华大学生命科学学院施一公教授研究组在《科学
》（ScienceStructure of a Yeast Spliceosome at 3.6 Angstrom
ResolutionStructural Basis of Pre-mRNA Splicing）。第一篇文章报道了通过单颗
粒冷冻电子显微技术（冷冻电镜）解析的酵母剪接体近原子分辨率的三维结构，第二篇
文章在此结构的基础上进行了详细分析，阐述了剪接体对前体信使RNA执行剪接的基本
工作机理。这在世界上首次捕获了真核细胞剪接体复合物的高分辨率空间三维结构，阐
述了剪接体对前体信使RNA... 阅读全帖 |
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f****i
发帖数: 20252 | 32 我车子空调坏了，加了制冷剂能制冷，但是顶不了两天。
跑去小店，师傅说，看，皮带上有油，你的压缩机爆了。你自己瞎灌制冷剂，压力太高
，所以爆了。
新压缩机要好几百，我就去junk yard买了个旧的，100刀，花180刀换上，结果只能用
两天。
再查，师傅说，嗯，你的high side valve上有个洞，要换。这次60刀。
结果几天一过，又不制冷了。再查，师傅说，啊，你这管子上有个洞，要换AC
Manifold，要500刀，我靠，我不修了。
你说这三玩意儿会一起坏吗？那皮带上的油应该是我放制冷剂时喷出来的。
Dealor更厉害，直接说，AC坏了，要全换，2000刀。
上youtube自学，有人说，管子上有洞可以买个splice kit，管子割断了中间加个
splice就行。省老鼻子钱了。现在正在进行中。
我的结论是，除非师傅做了检查，或者指给我看哪里漏了，我才信。张口就说压缩机漏
了，当我白痴啊。 |
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t*****s
发帖数: 3478 | 33 呵呵。大钓者，我刚刚好也有事想请教你呢。
当初你老大给我讲的，海钓刺激些，但是更烧钱和辛苦，现在我是有体会了。尤其我去
海边路比较远。另外，我按照你的推荐，买了Hollow Core braided line的鱼线，我买
了600yard。我拿到后才去看看应该怎么用，然后我看了别人一个video啥的，这个可能
用起来也是麻烦呢。（因为我手指头很粗壮的呀，绑线的活，不是太灵光的。呵呵。）
但是，我既然买了，就留下。我猜呀，我就是简单用用好了，如果braid的线断了，我
就splice一下，是braid线和braid线之间才用splice，用一根针，是吧？其它的比如，
和leader线连接什么的，就直接打结，当普通线用好了。大钓者请confirm一下好不？
谢谢。
关于这个trailer的事情，哈，我刚刚开始，也是花了好多时间研究。以为一般拖我的
10尺8的小船，trailer都买不到啊，所以，刚刚好在网上看到amazon上有卖，反复看人
的review啥的，了解到，我的船可以用。（可能是10到14尺的船都可以，调正一下就行
）。
package是这个
http://www.amazon.... 阅读全帖 |
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g*********r
发帖数: 1443 | 34 如果你是第一次splice hollow core，JB 40lb会比较困难。JB 60lb容易得多。 你如
果还没打开，就换成60lb的，以后你splice得熟练了，再换用 JB 40lb。我现在为了节
省cost，用JB 60lb。 |
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t*****s
发帖数: 3478 | 37 splice线时，你是用胶水粘吗？ 还要用其它细线绕个结啥的吗？
leader不用很长吧？7尺？leader连编织线是直接打结还是splice？
我看马里兰那个party boat，mate绑rig时，把我留的leader都不要了，直接编织线上
绑钓组rig了。
speed
动。 |
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t*****s
发帖数: 3478 | 38 braid to braid不须胶水, 你是说，就splice后，其它什么都不用了？我还没有试过，
这样也行啊？那么splice进去多长线呢？
新手俺都不知道wind-on leader是干啥需要。。 |
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n**e
发帖数: 2026 | 39 今年初，美国科学促进会（AAAS）和皮尤研究中心（Pew Research Center）联合公布
的一项调查显示，88％的科学家认为转基因食品可安全食用，持这一看法的公众只有37
％。报告认为差距如此之大的一个可能原因是，三分之二的公众认为科学家对转基因食
品的健康后果没有清晰认识。这就是真正的原因吗？
根据报告全文，皮尤中心给19，984名科学家发出了调查问卷，3748人（18.8%）完成了
问卷调查。其中生物医学学科背景的科学家占50%。报告没有说明50%的生物医学背景是
否能够代表科学家总体的学科构成。更大问题是在这50%的科学家人群中，有多少人的
工作是与转基因作物的研究有关，以什么样的方式相关。报告没有提供任何信息。
由于这些关键信息缺失，88%的科学家相信转基因安全的说法毫无意义。在一个没有代
表性并且无法排除偏向性的样本中调查，科学家相信转基因安全从1%到99%与88%没有任
何不同。好消息是超过半数的美国民众认为转基因不安全。
2012年10月，美国科学发展协会以官方名义（Board of Directors ）抛出了一个反对
转基因标识声明（附录1）。目的就是诱导民... 阅读全帖 |
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r*******g
发帖数: 32828 | 40 【 以下文字转载自 Dreamer 讨论区 】
发信人: Dreamer (不要问我从哪里来), 信区: Dreamer
标 题: [bssd]未名现在怎么这么low
发信站: BBS 未名空间站 (Wed May 24 16:09:22 2017, 美东)
都是什么人在上？前两天看了首页上提到的一个电影， splice, 看了后我恶心的三天
没吃下饭。这都是什么人说那些电影。
想减肥看splice. |
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n*******e
发帖数: 27 | 41 my understanding, for the 1st one, alternative splicing of a specific mRNA
will result in a totally different polypeptide. meanwhile, selection of
start codon will lead to differnt translated protein of a spliced mRNA.
it could be developmental-specific or tissue-specific. i guess it makes
the cell not overburdened with too much information. and it helps to explain
why there are quite less genes than we have expected, yet the network
produces such a complex organism in the world. the second ques |
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M****e
发帖数: 70 | 42 if you are look at splicing events and you definitely would
like to use northern blot, though technically it might be
difficult. RTPCR is more sensitive for quantitation of total
messages, or you can actually design primers for alternative
splicing products to specifically measure them in a total
population of mRNAs. i like RTPCR since it is quick to roughly
estimate changes for steady level of RNA. and sometimes i do
semiquantitative RTPCR, which means that i stop the RXN before
it reaches the |
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Z*****N
发帖数: 112 | 43 Thank everyone. It sounds like the mutated genomic DNA should be test for
splicing before puttng into mice.
Is there any way to test the splicing in vitro or in vivo? |
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c******r
发帖数: 3778 | 44 什么不同？是几个base pairs的不同？还是完全不同？总是几个不同？还是每次都不同
？ls说了，要细节。
可能的原因：
1. PCR不够specific，压根就不是你要的东西。解决方法：从新design primers。
2. ls说的，有不同的splicing form。解决方法：从新design splicing specific的
primers。
3. 还有可能你这个测试的sample有污染，比如说如果你测肿瘤细胞，由于genomic
instability，可能会有几个不同的改变，并且混有正常细胞，造成测序不准。
这是个技术问题，根遗传关系不大。 |
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A******y
发帖数: 2041 | 45 How do you know is post-translation? Did you see different bands with
different molecular weight with your antibody? Are you sure your antibody
is binding to the right protein? There are translational control and
control of mRNA splicing. Some proteins can bind to your mRNA in cell A and
stop translation. Your primers for RT-PCR just amplifying a small fragment
, maybe you are missing alternative splicing. There are so many
possibilities.
Not everything go though proteasome either but good... 阅读全帖 |
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Z**********g
发帖数: 222 | 47 可能是该基因通过alternatice splice产生至少两种mRAN,一种mRNA包含exon4,其编码
蛋白不是发育必需;另一种mRNA包含exon5,其编码蛋白为胚胎发育必需.所以确认一下该
基因可能的alternatice splice. |
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y******8
发帖数: 1764 | 48 才开张的新所吧。在北大，所是和学院平行的单位，据我所知，北大给新的所都会给一个5年一个亿的启
动支持。
夫妻店开的好才是好，学校也不用担心培养的人才什么时候为了家庭原因就飞走了。另
外，这个所的人才引进不错啊。这一位在千青中也是翘楚。
132 汪阳明 男 1979年12月 北京大学 生命
科学 2006年02月毕业于[美国]伊利诺伊大学厄巴纳－尚佩恩分校 [美国]加州大
学旧金山分校 博士后
1: Wang Y, Blelloch R. Cell cycle regulation by microRNAs in stem cells.
Results
Probl Cell Differ. 2011;53:459-72. PubMed PMID: 21630156.
2: Wang Y, Blelloch R. Cell cycle regulation by MicroRNAs in embryonic stem
cells. Cancer Res. 2009 May 15;69(10):4093-6. Epub 2009 May 12.... 阅读全帖 |
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l*h
发帖数: 4124 | 49 柯贝：对转基因的无知与偏见
发布时间:2011-07-24 09:52 作者:柯贝 字号：大 中 小 点击:1249次
相比于完全不懂生物学、用简单的“人文关怀”来反对转基因的人，一些戴着生
物学“帽徽”的所谓专家，他们的欺骗性更大。
近年来，中国比较关注转基因技术和食品，与此同时，也出现一股反对转基因的势
力。看看一些反转基因人物的所作所为，或许能够帮助人们免受误导。
美国对食品安全的要求远远高于中国。但是反转基因在中国造成的后果是：美国已
经多年种植可以食用的转基因植物，而中国迄今却不能。美国人食用转基因食物也已有
多年，有些人则是直接食用。因为美国饲养的动物普遍食用转基因作物，因此更多的美
国人间接地食用了转基因食物。美国科学院明确指出转基因食物没有对人的健康产生不
良影响，美国政府明确规定食物不能标示是否转基因，这使得民众能够同等地对待转基
因和非转基因的食物。
中国对于食品的安全要求低于美国，为什么在转基因方面的要求却大大高于美国呢
？是中国在转基因方面比美国高明？显然不是。
一个重要原因是：反转基因的势力在网络和一些传统媒体上误导了国内舆论，阻碍
了中国转基因技术的发展和应... 阅读全帖 |
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