a********k
发帖数: 2273 | 1 genetic screen最有效的时候不就是单一表型么，你要screen啥直接有一个荧光marker
的变化可以Flow是最快的了吧？
比如筛mitochonria里面Ca2+的变化，直接搞个genetic的ca sensor+mit定位序列筛就
是啊，作为遗传的筛选marker我看足够了 |
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k******y
发帖数: 236 | 2 亮点在mouse上痛觉phenotype的研究，以及和人的特殊表型的联系
果蝇screening、老鼠KO、人SNP都没意思，白痴都知道怎么做 |
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s******y
发帖数: 28562 | 3 这个你忽略了一个可能性，就是这个gay 形态并不是完全的表型，而是在某一些
情况，包括在一定的发育情况下才能有一定比例才能激发出来的。（也就是
类似隐性基因那样）。这样的话这种基因就完全可以遗传下去。
比方说那个高生育的母亲，生下20个小孩，就算是10个男的和10个女的吧，
其中男的可能只有两个是同性恋，其他8个都是异性恋。而且10个女的也都
是异性恋。这样一来这个基因就搞出了18个异性恋的后代，相比于那些只能生
一两个的（即使生下来的全部是异性恋）还是有进化优势。
而那个聪明基因，我搞笑的举一个和你的理论的反例啊，先千万不要当真啊，
比方说啊，只有聪明到一定程度（比方说IQ 200)才能激发这个gay的副作用。
但是在这个之下就没有事。这样的话，这个基因就可以遗传下去，因为大多数
人都没有那么聪明，顶多就是１６０啦，１７０啦什么的，所以都是异性恋。
只是在如果父亲和母亲都非常聪明，不小心结了婚，然后生下一个特别聪明的
儿子智商超过了２００，才会激发这个副作用。
用, |
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s******y
发帖数: 28562 | 4 那。。。那你这个说特别聪明的人容易成为同性恋的说法不就是支持了同性恋是有物质基础性的理论了么？
另外，果蝇里面的女同性恋基因好像找到了呀。具体文章我忘记怎么回事了，
大概好像是某个关键基因，如果不小心成为某个表型，那么那个女果蝇就成了
同性恋了，一看到男果蝇向她求爱就会愤怒地又踢又打，然后看到其他女果蝇
就会去求爱。 |
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s******y
发帖数: 28562 | 5 这个还是有一点类似吧。
因为这个母果蝇在生理上还是母的，生殖系统什么的也没有什么问题，但如果
她的那个基因出现了男性基因的剪切方式的话就把她变成女同了。
至于她在性别自我认定上到底有没有出问题。。。这个问题在果蝇上
很难界定。。。
就看你怎么认为什么叫做“性别自我认定”了。因为果蝇毕竟是果蝇，你又
不能直接去问她到底她认为是自己是男的还是女的。
另外一个题外话是，这个Fru表型果蝇里的这种现象倒是有点类似女同性恋
里面的男性角色。不知道女果蝇里面有没有类似人类的女同性恋里面的女性
角色？
比方说假如一个女果蝇看到另外一个女果蝇向她求爱，是不是会又踢又打？
还是会欣然而从？
other |
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z****g
发帖数: 3340 | 6 不是做iPS. 是想overexpression一个protein后看表型. 因为primary human
fibroblast难转染,就转了两次. |
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w*e
发帖数: 740 | 7 初步打算先用酶消化，然后测试细胞的功能，目前已经成功
下一步：
想通过RT-PCR来确定我们测试的细胞是不是MUTANT细胞。
因为我们是CRE/LOXP老鼠，不能保证所有细胞都是MUTANT细胞，而且不同的细胞，表型
也不一样
谢谢
cell |
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O******e
发帖数: 4845 | 8 多大变化才是significant，不同的人有不同的定义。但有几点应该明确：
１。实验已经包含了必要的controls;
２。Reproducible;
３。相应的细胞表型。
而且蛋白水平的变化永远是最直接有效没有争议的指标。 |
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O******e
发帖数: 4845 | 9 我想你已经在细胞里面表达过这个mutant protein了，有没有发现任何表型？相关的
活性有没有大的变化？
光你现在有的数据，分量有点小。建议还是把后续功能实验做完了再发吧。 |
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a*********u
发帖数: 96 | 10 google字典翻译成疾病表型，读起来很拗口啊
还有对应的genotype
非医学专业毕业，不知道国内教科书上是不是有个专门的对应翻译？
还请生物或者医学的大侠赐教
谢谢啦 |
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b****r
发帖数: 17995 | 11 也没那么好吧，zhuangbility表型很明显，类似于太阳照常升起
当然在国产片里算是可以的，特别是不知道怎么通过政审的，真是让姜文站着也把钱挣
了 |
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f**u
发帖数: 346 | 13 我只说我了解得比较详细的一个例子。
这个例子是关于遗传性的隐性的小脑症，英文好像叫microcephaly。
这个病人类遗传学已经map到了几个不同的基因，然后有人就做了KO小鼠。
对于其中一个基因的KO，纯合体有类似的小脑症状，分子机理是神经元非正常凋亡。
但有意思的是本来应该是黑毛的小鼠，如果是杂合体肚子上会有一大块白斑，
而且这个白斑phenotype好像很稳定。penetrance大概100%，expressivity也稳定。
我忘了他们有没有去解释为什么会有白斑，不过我猜是因为影响了neural crest。
于是他们就在这个白斑的基础上用ENU去筛选显性的modifiers，
readout就是白斑的大小位置什么的有变化的就统统都拿出来。
忘了他们的通量了，好像不是一千多就是一万多只，我觉得应该是一万多只。
还真筛出了不少个line，有的白斑变大了，有的变小了，还有的从一大块变成了斑点。
然后他们把这些新筛出来的东西分出来继续作characterization，有意思的再mapping。
起码有一个line如果是纯合体的话也会产生小脑症，其他的line我不清楚。
这个scr... 阅读全帖 |
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f**u
发帖数: 346 | 14 我不是说所有的screen都可以达到，但对于很多screen，有人都敢claim 100%。
对于果蝇，通常这些都是F1的screen，而且表型非常容易看，比如眼睛颜色什么的。
这种screen每条染色体筛上个1到2个million是很正常的，目标通常是essential基因。
每条染色体上也就那么一千来个essential基因，有时候一个基因会拿到四五十个line。 |
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S**********e
发帖数: 1789 | 15 这个很难讲。stable clone 如果只有1个，那你看到的有可能是插入了某个重要区域后
的表型。相反的结果也有可能。stable clone 是真的，你的pool里面可能这个稳定的
外源基因占少数，被掩盖了。估计你要多弄几个stable clone, 然后比较一下。
stable |
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f**u
发帖数: 346 | 16 不太了解药物筛选流程的细节，没太看明白你说的这种筛法。
难道不是先要从基础研究里面找到靶点，然后建立动物模型，然后再筛选化合物吗？
怎么会有靶点的问题？
你说得phenotype筛选，也就是用正常的鱼去筛，然后选想要的表型？
我的理解除了睡眠节律什么的，其他好像不好筛吧。
的m |
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n***w
发帖数: 2405 | 17 我不是这个领域的，读过一些AD的文章。我是这么想的：
1.因为用的是人的mutation，抗体用rodent raise，无所谓，用人的mutation就是为了
保证这个研究和临床的correlation。如果用rodent做，虽然表型一样，但是gene在
rodent上能成，但是在人上却不行，成不了大事。
2.我没有觉得主流觉得机制偏向Ca overload，这只是人们用来解释Abeta cascade的一
个思路。你找几个新的review来看看。
3.我觉得A beta产生就是要被cleaved，只是在哪里cleaved的问题。sAPP有paper说是
neurotrophic和neuroprotective作用的。 |
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s******s
发帖数: 13035 | 18 我瞎说两句。比如研究一下到底哪个domain有相互作用。比如A蛋白的S domain
和B蛋白的T domain有相互作用。然后用已知有相互作用的domain比如X和Y替代。
理想化的结果就是A(S)+B(T)正常，A(S)+B(Y)或者A(X)+B(T）不正常，但是双突变
A(X)+B(Y）能够rescue表型。不过这个估计比较看运气 |
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s******s
发帖数: 13035 | 19 我不是说了么，单突变有问题，双突变换domain能够rescue表型。 |
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o**4
发帖数: 35028 | 20 但是突变基因，它如果有表型，也有可能是别的原因，不是因为破坏interaction啊？ |
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k****a
发帖数: 7077 | 21 发现以前实验室老板发的文章，主要的克隆，细胞里表达，和主要表型都是我做出来的
，合作者做了些后续工作。走的时候也和他特意谈起过将来发文章的事。
现在倒好，我的名字居然没在文章，换上了另一个几乎可以肯定没做什么的家伙。
这种情况怎么办？ |
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s******y
发帖数: 28562 | 22 话题再回到我的面试的过程。
面试之前，我还问了我们系另外一个新的发考题，他就带我去查了那个系的人
在NIH和 NSF 的funding 情况，以及他们都做什么什么等等。然后他简单看了看
那些人的信息后，就告诉我：这个这个和这个很可能就是你的recruit committee
的人，你要小心对待他们。后来的事实证明，他说对了。
他们系里的网页，老师们不太更新。里面很多信息都很老了。反而是funding 情况
提供的信息更有用。这个后来让我在和他们聊天的时候用上了很多。
面试的时候分两天，第一天做讲座。这个我是轻松拿下。
第二天chalk talk, 一个半小时，一开始就被他们问问题，一直问到结束。
他们问了很多奇奇怪怪的问题，包括逼问我为什么认为某某氨基酸的侧链很重要，
基本上是一个文章里会被reviewer 问的问题他们都会问到。但是这种技术性的问题
也基本上难不倒我，因为我毕竟是一个千老。他们后来又开始问一些原则性问题，
包括那个类似我们系那个新发考题所说的关于科学意义的问题也问了。我都一一
对付过去了。
后来，一个看起来脸色不善的女发考题就问了我一个很麻烦的问题，就是说
我们用的那... 阅读全帖 |
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i**********5
发帖数: 261 | 23
去年发了那片CNS之后，觉得自己老了，渐渐在实验走向上也开始和老板有不同的
意见了。
老板的结论是：你翅膀硬了，该飞了。加上她明年不一定能够拿到资金，所以她
鼓励我去试一试水。
于是我就懵懵懂懂的下水了。
因为不知道自己的市场定位在哪里，所以我回国了一趟。
回国和科大，上海生化所和北京生物物理所的人都约见了。
那个时候我的文章已经出来了，他们也都读了，都表现出了很强的兴趣。
生化所的朱学良（负责细胞一块的），本来和我没有appointment 的，
我到了上海联系他后第二天就和我见面了，一谈就是两个多小时。
然后到了科大，也是谈的非常愉快。虽然没有真正的和他们面试，但是给了我
一个印象就是如果我回去的话他们应该会收我。
所以我回到美国之后，就告诉老板说：我大概只会找美国前５０名的学校，
否则我不如回中国算了。她对此表示支持，并说：假如我第一年找不到，那就
再呆一年，再找。
有老板的话放在那里，我真的就只申请了前５０名的学校。
我们实验室其实是生化的。但是因为现在这个时候纯粹的生化根本没办法发好文章，
所以我们什么都做，分子通道，细胞结构，癌症，发育，心血管，神经，免疫，
统统一网捞过... 阅读全帖 |
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i**********5
发帖数: 261 | 24 应作者要求修改过顺序
我的那个文章发得很不容易，因为我们是小实验室。 我们老板算是一个raising star
吧（在我们手里升起来的：）
我们发文章经常被人刁难得死去活来的，但从另外一个角度来讲，就让我们做
实验的时候很小心，往往主动的先作一大堆control再说。
所以，我也不认为单纯是因为文章发在CNS上, 而更多的是读者们觉得我们那片
文章写得好。 因为和我一起面试的人，有CNS的多得很，但并不是每一个都能
走到最后
去年发了那片CNS之后，觉得自己老了，渐渐在实验走向上也开始和老板有不同的
意见了。
老板的结论是：你翅膀硬了，该飞了。加上她明年不一定能够拿到资金，所以她
鼓励我去试一试水。
于是我就懵懵懂懂的下水了。
因为不知道自己的市场定位在哪里，所以我回国了一趟。
回国和科大，上海生化所和北京生物物理所的人都约见了。
那个时候我的文章已经出来了，他们也都读了，都表现出了很强的兴趣。
生化所的朱学良（负责细胞一块的），本来和我没有appointment 的，
我到了上海联系他后第二天就和我见面了，一谈就是两个多小时。
然后到了科大，也是谈的非常愉快。虽然没有真正的和他们面... 阅读全帖 |
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l******t
发帖数: 2243 | 25 mark
发信人: interfile485 (lele), 信区: Biology
标 题: 我来整理艳阳天的帖子
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Mar 11 15:27:20 2011, 美东)
应作者要求修改过顺序
我的那个文章发得很不容易，因为我们是小实验室。 我们老板算是一个raising star
吧（在我们手里升起来的：）
我们发文章经常被人刁难得死去活来的，但从另外一个角度来讲，就让我们做
实验的时候很小心，往往主动的先作一大堆control再说。
所以，我也不认为单纯是因为文章发在CNS上, 而更多的是读者们觉得我们那片
文章写得好。 因为和我一起面试的人，有CNS的多得很，但并不是每一个都能
走到最后
去年发了那片CNS之后，觉得自己老了，渐渐在实验走向上也开始和老板有不同的
意见了。
老板的结论是：你翅膀硬了，该飞了。加上她明年不一定能够拿到资金，所以她
鼓励我去试一试水。
于是我就懵懵懂懂的下水了。
因为不知道自己的市场定位在哪里，所以我回国了一趟。
回国和科大，上海生化所和北京生物物理所的人都约见了。
那个时候我的文章已经出来了，他们也都读了，都... 阅读全帖 |
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i**********5
发帖数: 261 | 26 应作者要求修改过顺序
我的那个文章发得很不容易，因为我们是小实验室。 我们老板算是一个raising star
吧（在我们手里升起来的：）
我们发文章经常被人刁难得死去活来的，但从另外一个角度来讲，就让我们做
实验的时候很小心，往往主动的先作一大堆control再说。
所以，我也不认为单纯是因为文章发在CNS上, 而更多的是读者们觉得我们那片
文章写得好。 因为和我一起面试的人，有CNS的多得很，但并不是每一个都能
走到最后
去年发了那片CNS之后，觉得自己老了，渐渐在实验走向上也开始和老板有不同的
意见了。
老板的结论是：你翅膀硬了，该飞了。加上她明年不一定能够拿到资金，所以她
鼓励我去试一试水。
于是我就懵懵懂懂的下水了。
因为不知道自己的市场定位在哪里，所以我回国了一趟。
回国和科大，上海生化所和北京生物物理所的人都约见了。
那个时候我的文章已经出来了，他们也都读了，都表现出了很强的兴趣。
生化所的朱学良（负责细胞一块的），本来和我没有appointment 的，
我到了上海联系他后第二天就和我见面了，一谈就是两个多小时。
然后到了科大，也是谈的非常愉快。虽然没有真正的和他们面... 阅读全帖 |
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l******t
发帖数: 2243 | 27 mark
发信人: interfile485 (lele), 信区: Biology
标 题: 我来整理艳阳天的帖子
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Mar 11 15:27:20 2011, 美东)
应作者要求修改过顺序
我的那个文章发得很不容易，因为我们是小实验室。 我们老板算是一个raising star
吧（在我们手里升起来的：）
我们发文章经常被人刁难得死去活来的，但从另外一个角度来讲，就让我们做
实验的时候很小心，往往主动的先作一大堆control再说。
所以，我也不认为单纯是因为文章发在CNS上, 而更多的是读者们觉得我们那片
文章写得好。 因为和我一起面试的人，有CNS的多得很，但并不是每一个都能
走到最后
去年发了那片CNS之后，觉得自己老了，渐渐在实验走向上也开始和老板有不同的
意见了。
老板的结论是：你翅膀硬了，该飞了。加上她明年不一定能够拿到资金，所以她
鼓励我去试一试水。
于是我就懵懵懂懂的下水了。
因为不知道自己的市场定位在哪里，所以我回国了一趟。
回国和科大，上海生化所和北京生物物理所的人都约见了。
那个时候我的文章已经出来了，他们也都读了，都... 阅读全帖 |
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j*****d
发帖数: 787 | 28 其实我刚想起他做的那个蛋白突变后在Arabidopsis里面有一个很有意思的表型
搁到动物里，大的方向还是非常棒的，他老板的webpage已经很清楚地讲明了
——你不能只盯着那个蛋白想问题。
另，我相信他做的也能用到免疫，因为太基础了，所以"打击面"很大
赫赫 |
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b***j
发帖数: 240 | 29 中国科学院生物物理研究所陈畅课题组诚聘研究人员
中国科学院生物物理所计算与系统生物学研究中心陈畅研究员课题组主要研究蛋白质巯
基的翻译后修饰和细胞氧
化还原调控作用机制以及天然产物和中医药的作用机制及应用。当前主要在以下三个方
面开展研究：1.蛋白的亚
硝基化修饰以及相关功能研究；2，氧化应激/氮应激与疾病的相关性；3，PI4K和GSNOR
相关功能与分子机制的
研究。因科研需要现公开招聘博士后/助研/副研，具体要求如下：
1） 具有(或将具有)生物化学与分子生物学或细胞生物学等相关专业博士学位；
2） 热爱科研事业，具备科研进取精神；富有团队协作精神、善于沟通；有责任
心和独立工作能力； 具有英语阅
读、写作和交流能力；
3） 以第一作者发表过优秀科研论文者优先；有转基因动物表型鉴定功能研究基
础者优先
2. 备注说明
A. 具体级别根据
个人资历面议
B. ... 阅读全帖 |
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A*******e
发帖数: 284 | 30 我已经confirm过了，融合蛋白work的非常好，GFP很强，也得到了漂亮的表型。 请问
你说得随机片断array那里能买到，有推荐马？ 或者给我paper看看好吗，多谢了 |
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t******y
发帖数: 716 | 31 他的报告是基于发表在nature上的文章。
http://www.nature.com/nature/journal/v465/n7301/full/nature0914
他认为细胞内，假基因RNA和mRNA竞争microRNA，导致mRNA的作用不仅仅在于表达蛋白
还具有调控功能，因为microRNA通常针对多个基因，如果一个mRNA下降，会导致更多
microRNA结合到其他基因的mRNA上，导致其它mRNA下降。这点对基因敲除特别有影响，
因为基因敲除不仅仅是一个蛋白数量下降，同时也是mRNA的敲除，这会导致microRNA调
控的其他mRNA降解。这可以解释为什么基因敲除经常得不到理想中的表型。 |
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D*a
发帖数: 6830 | 32 一种可能是KO的phenotype对后代有影响。很多phenotype都是互相联系的，你不知道ko
怎么就影响了后代表型了。
一种可能是这个基因在129和b6上的penetrance不一样。这个无数ref证明无数的gene都
有这个现象。
BACKCROSS无所谓het或者ko吧，反正f1之后就全是het了，要不怎么叫BACKCROSS？
最好的方案是het x het，这样你测的才是littermates的数据。如果图省事用ko x ko
，现在做老鼠的reviewer肯定会要解释。一般都是说因为het x het不可行，因为小老
鼠不吃奶啊，或者double or triple KO，做het x het工作量大的没边儿了，什么的，
才不得已用ko x ko |
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s*******e
发帖数: 1389 | 33 Cell Editorial Board
Tian Xu已经待了十多年了，Xiaowei Zhuang刚加进来。这算一个体现吧。
另外，我只知道晓东做细胞凋亡发现了细胞色素C以及一系列与凋亡有关的工作。但并
没觉得对我“science”的满足心理增添多少。况且我自己在研究中所有涉及凋亡通路
的体内试验都展现了复杂的表型，总是不喜欢做生化的人所声称的结论。
许田在遗传，细胞领域中的贡献极大，果蝇中的FRT系统不知解决了多少发育中实实在
在的问题。 |
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s*******e
发帖数: 1389 | 34 Cell Editorial Board
这算一个体现吧。
另外，我只知道晓东做细胞凋亡发现了细胞色素C以及一系列与凋亡有关的工作。但并
没觉得对我“science”的满足心理增添多少。况且我自己在研究中所有涉及凋亡通路
的体内试验都展现了复杂的表型，总是不喜欢做生化的人所声称的结论。
许田在遗传，细胞领域中的贡献极大，果蝇中的FRT系统不知解决了多少发育中实实在
在的问题。 |
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j****x
发帖数: 1704 | 35 其实我在最早的帖子里就已经举出了几个我认为的具有奠基性意义的工作，能不能媲美
量子力学及相对论在上世纪初带来的冲击，这个转念一想，我说了可能不算，呵呵等后
人去评判吧。
1.遗传信息的编/解码。
基因组信息，结合表观遗传，如何与环境互作，最终决定表型。人们这10年来一直探寻
的，首先是仅仅这不到3万个基因，是如何构成这么复杂的系统的，这是不能不说是个
伟大的迷吧。其次基因组中接近90%的非编码区域，仍然是一个黑盒子，以什么方式参
与调控，虽然有众多新发现，但基本还是没有头绪。基因-环境互作是与此关联、更深
一层的问题。目前生物学对此种种还处于描述问题的初级阶段，基本概念和理论框架都
有待创新和完善，离完整还差得远呢。遗传信息编码的另一个层面，在蛋白质水平，序
列如何决定结构并决定功能。如何通过序列直接推导结构直接推衍功能，乃至反过来，
预设功能反推结构设计序列。所谓“理论指导实验”，这也是现代生物学翘首已久的了
吧。无论理论价值还是现实意义，说划时代应该不过分吧？系统生物学/合成生物学也
是在此大背景下诞生的，不否认目前有不少泡沫和忽悠的成分，但这是必由之路毋庸置
疑。
2.意识和认知... 阅读全帖 |
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b****n
发帖数: 311 | 36 我觉得未来生物学最激动人心的是bioengineering.我的bioengineering指的是广义的
生物学原理的应用。现在比较流行的复杂化合物的生物合成之类的只能算很简单的。复
杂的如组织器官再生。
对这些很庞大，目前看起来很遥远的目标来说，我们目前最大的障碍来自对机体发育和
工作的基本原理还很不够。举个具体的例子，肢体（手或腿）的再生。泛泛一看，我们
对肢体发育知到很多，从Hox gene决定位置，到不同类型的stem cell及其关键转录因
子，还有神经和肌肉的发育和各种各样细胞联系的形成。哪个人都能举出无数的具体知
识，但哪个人都无法了解全部。即使这样，面对再造肢体这样一个问题的时候，我们仍
然无从下手。我们需要多少种起始细胞？数量？如何启动各自的发育程序？如何协调他
们？如何终止？更进一步，我们能不能做出具有更强大神经和肌肉的肢体？
来看个具体的人物的研究，UC Berkeley的 Mike Levine和他lab出来的一些postdoc做
果蝇早期发育的转录研究，他们从简单的研究某些有明显表型的关键基因发展到全基因
组的转录研究。放本版绝大多数的人要嘲笑浪费钱去研究fl... 阅读全帖 |
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s******y
发帖数: 28562 | 37 这个，虽然我并不是专业做这个autism的，但是我也必须指出说，
临床数据里面的关于基因和疾病的关系一般不能作为直接证据的，顶多只能说是
有关联。在老鼠里面作敲除或者其他处理才是比较直接的证据之一。
这篇文章的意义(我认为是相当重要的意义）就是给领域里面的人往下追踪
这个蛋白提供了一个非常重要的支持证据
另外，虽然人类autism 疾病里面直接含有这个shank3突变的人其实很少，
但是考虑到其他的一些突变可能是通过这个途径的来起作用的，还有很多
非基因型的因素（比方说heat shock, chemical stress etc) 可以在不依赖于
突变的情况下影响到基因的表型，其实在真实意义上这个shank3 所包含的case
的比例可能远远大于这个1%。
如果我是这个领域里面的话，下一步更重要的做法就是把这个shank3 进行
inducible KO, or stage-specific KO, 看看这个蛋白是否真的在幼年时候
大脑发育的时候起作用。因为大部分autism 病人出现症状的时期都是幼年期，
在青春期之前。 |
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s******y
发帖数: 28562 | 38 呵呵，我就不去趟这种浑水了。
我就是查文献的时候看到有的实验室已经在做PTEN在autism里面的功能，
觉得挺纳闷的。
就像你说的那样，大部分功能特别重要的基因（那些很多都是oncogene)，
在neuron 里面都肯定有功能的。
比方说我要是发个神经在纹状区把tubulin KO了，几乎也肯定能够产生
autism 症状吧？可是这么做有意义么？
SHANK3, 和Neuroligin 的意义在于他们是非常组织特异性的蛋白，
在基因上搞乱这两个蛋白后产生的形状主要集中在神经和行为上，
这个和autism 病人的特点一致。因为autism 病人主要是行为异常，
其他发育大致都还正常。
而PTEN这种蛋白，在自然情况下不管是以什么方式被搞乱（比方说基因
突变，或者mis-regulation)，其表型不太可能集中在脑部，所以不太可能是
autism 的致病原因。
在这个意义上来说，我觉得对SHANK3, Neurologin等几个post-synaptic
scaffold protein 的调控，才是最有可能的autism 的致病原因。 |
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c******y
发帖数: 148 | 39 写论文写到无聊，下班又太早，翻看下了腾讯本拉登专题，索性把除掉拉登和生物学比
较下。
PI来了又走了，从克林顿，布什到奥巴马，3代PI，十几年过去了，定位拉登基因一直
是个难题。用尽了各种高科技手段，牺牲了众多大兵phd的青春或者生命，还是巴马的
团队几乎在最后时刻撞了大运，靠跟踪partner信使搞定了拉登的位置，然后把拉登彻
底地knock out了。
于是乎，奥巴马的CNS发表了，他也可以光荣的宣布: 我是第一个knock out本拉登的，
意义重大，二次诺奖。。嘿嘿
运气，绝对的运气，生物学里头，如果没有运气，绝对的灰头土脸。
拉登基因被knockout好几天了，世界表型似乎没有什么变化，除了拉登homolog们要扬
言复仇。只见transcript增加，没见到蛋白变化。没意义。
一个拉登没了，旁路途径的拉登活性可能就要增加了。如此解释，这分明就是在
discussion里面耍赖么。
耍赖没关系，这也是idea啊，可以继续骗funding啊，继续寻找拉登homolog么，招一堆
大兵继续敲，不然大兵们闲着也容易闹事啊，还不如锻炼升级。
终于敲完了，世界太平了吗？
显然没有，于是... 阅读全帖 |
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S*****s
发帖数: 242 | 41 嗯，看来本拉登的确不是一个essential基因，也不是lethal。也不大影响发育。这种
基因不少啊，平时也没有多少人关注。关键是有人捧臭脚，变成一个fashion的基因。
你看，knockout刚做出来，表型鉴定还是非常的preliminary，这个senior author奥巴
马今天就要在柳腰Golden Conference上做keynote speech了。 |
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s******y
发帖数: 28562 | 42 磷酸化和降解可以有间接关系，和很多蛋白的结合也可能有关系，还是和
非常非常多的通路都可能有关系， 所以很难直接推测。
一般是把磷酸化的氨基酸突变了，看看会引起什么表型，然后再推测。
可以突变成不能磷酸化的集团，或者把serine, thronine变glutamate 来
模拟磷酸化后的结果 |
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t****p
发帖数: 1504 | 43 我还觉得癌症比例明显升高。我们村那疙瘩，一查一个准，癌症，五千人的村庄，每年
都有几个中招，而且越来越年轻化。
这个用诊断标准很难解释得通，我也觉得跟环境食品啥的有关。
第二个就是随着儿科妇科医学的发展，人类的淘汰率大大降低，也就是原来不具备生存
能力的孩子也能长大成人，这些人的患病率可能会比较高。
还有一个就是人类现在结婚生子的年龄也越来越大，所有人都知道妇女随着年龄的增长
，孩子唐氏以及其它疾病的几率大幅升高。孩子没有检测到这些疾病，长大了也跟其它
个体表型也差不多，但是没有理由不相信中老年出生的孩子，不会在其它一些隐性的基
因上有更多的突变。
我一直想找一个资料，就是统计最极端的两级，年轻生子，老年得子，连续几代下去，
他们的患病率等等会不会跟平均水平的人有明显差别。 |
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d*p
发帖数: 534 | 44 鉴于有癌症专业人士认为这两个是不同的概念，特开此贴听听大家意见！
肿瘤发生，环境和遗传都在起作用，谁强谁弱，没有一个方法来确定，也是case by
case，因此姑且说其为各半。
肿瘤的遗传因素，可分为两中，一种是可沿家系遗传的，主要为质量性状，表现为携带
该性状的后代群体具有发生同一肿瘤的高风险。 而另一种为不能沿家系追踪的，主要
为数量形状，表现在人群中的易感人群。这两种性状对肿瘤发生的贡献只存在效果上的
差异，我不赞同前者是肿瘤基因而后者不是的观点。
肿瘤发生是一个复杂的过程，仅从遗传这一方面来看，单个基因的效果不能导致群体完
全致病。即使是可沿家系遗传的质量性状，在后代身上有同样的基因表型，也有致病和
不致病的，这就存在环境和其总的遗传背景是否为易感相关。以前面其他网友提到的吸
烟对肺癌的影响为例，个人的遗传背景决定了有一不部分人对于吸烟导致的突变有高抗
性，而有一部分人则具有敏感性，其结果就是一部分人即使有长期的过度吸烟史也不会
致病，而有一部分人即使短期吸烟史也会容易致病。有个俄罗斯的老头，活到106岁了
，媒体问他的长寿秘诀是什么，他的回答是：cigarette, liq... 阅读全帖 |
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c****l
发帖数: 1086 | 45 看你愿意讨论学术问题，会你一个。
二者概念也许不同，使用的语境也许不同，但本质没有区别，
只是penetrance不同罢了。我之前也没有说二者不同，如果
我的回帖给你这种错误的印象，那是我的错。
我之前讨论的是germline的mutation和somatic
mutation的区别，前者可以遗传，后者是后天环境导致，是
肿瘤mutation的绝大部分，所以在个体上谈不上是否有选
择。
听大家意见！
法来确定，也是case by
要为质量性状，表现为携带
为不能沿家系追踪的，主要
发生的贡献只存在效果上的
基因的效果不能导致群体完
样的基因表型，也有致病和
关。以前面其他网友提到的吸 |
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g*********d
发帖数: 233 | 46 MicroRNA 和病毒
作者：王磊
上海交通大学生命学院研究生
摘要：
microRNA(miRNA)是真核生物体内一组内源性的 21—25nt 长的非编码蛋白质的短序列
RNA，它们能通过碱基配对的方式与生物体中的 mRNA 分子相结合来参与调节基因的表
达。自 2000 年至今，miRNA 的研究发展的速度极快并且影响的范围也非常的广泛，而
且分别在2002年和2003年度中miRNA入选了Science杂志年度十大科技突破。因此，
miRNA是 RNA 研究的又一个突破，被称为 RNA 的第二次革命。目前的研究已发现
miRNA 参与了很多重要的生命活动过程涵盖了发育、凋亡、代谢、人类疾病以及病毒侵
染等方面。在病毒侵染宿主和宿主抵抗病毒的过程中病毒编码的 miRNAs 和宿主编码的
miRNAs 均发挥了重要的作用。这无疑为病毒的侵染以及宿主抵抗病毒的侵染的研究提
供了新的思路和新的领域。因此，本文的主要目的在于阐述 miRNA 的一些基本概况以
及在病毒中主要的研究方向和进展，最后对这个具有跨时代意义的小分子进行展望。
关键词：miRNA vmiRNA 功能 宿主的 miR... 阅读全帖 |
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g*********d
发帖数: 233 | 47 RNA干扰及其在动物繁殖中的应用
2009-12-28
RNA 干扰(RNA interference, RNAi)是生物进化过程中遗留下来的一种在转录后通
过 RNA 调控基因表达的机制, 它是指在真核细胞中引入双链 RNA分子从而导致具有序
列同源性的基因产生特异性基因沉默 (gene silencing)的现象 。由于 RNA干扰可以阻
断特定的基因表达, 具有超越疫苗和抗病毒药物的诸多优点, 因此在阐述基因功能以及
蛋白质相互作用等方面, 表现出诱人的前景。近年来随着分子生物学的发展, RNAi 的
机制也不断被阐明, 同时国内外研究也证实 RNAi 技术可以为动物繁殖过程中所涉及的
基因功能提供一条新的思路, 这在科研和生产实践上都具有重要的意义。
1 RNAi的发现
Matzke 等于 1989 年报道了启动子介导的序列同源性基因共转染烟草可引起转
基因表达发生沉默。 1990 年, Napoli 和 Van der Krol 等为了让矮牵牛花的颜色更
加鲜艳, 把与紫色相关的查尔酮(chalcone)基因转染到牵牛花内, 结果意外发现, 植物
体的颜色... 阅读全帖 |
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n**********s
发帖数: 228 | 48 研究的基因是一个酶，很简单的knock in模型，就是将GFP-Neo同源重组到基因的第一
个exon前面，这样homozygous的老鼠该酶实际上是knock out的。
理论上GFP表达细胞是受该基因调控的，现在的结果是，在已知正常情况下该基因表达
的器官，homozygous的老鼠GFP细胞数大概是heterozygous的2倍多，比较的是相似位置
的切片，做过统计，基本上是这个结果。
请教这种现象准确原因是什么？Allelic Imbalance造成的吗？好像没什么理论基础支
持这个？另外，该基因也不存在明显的imprinting，应该不是这个原因吧。请高人指教
！ |
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s******s
发帖数: 13035 | 49 不是imprinting, x-inactivation一类的？我就不知道了 |
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l**********k
发帖数: 189 | 50 这是Allelic exclusion， 很正常。好多基因都有这种情况。至于一个细胞里面表达哪个
染色体上的等位基因，是随机的。在你的小鼠里面，heterozygous小鼠里某类细胞
的GFP＋比例是homozygous小鼠的30％－70％都是正常的。 |
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