l*****c 发帖数: 17 | 1 是啊,我们研究遗传学,分子生物学包括搞统计的人,不断的创造新的名词来解释以前
不能解释的现象。每个都合理,最后表示都不合理。现在的GWAS研究,根本不能对超出
QTL范畴的生物学有人和解释。
这又回到了50年前的解释了,把所有(大部分)疾病/表型看成是数量性状,用微效多
基因来解释,既然是微效多基因,那当然是有无穷的组合了,比如有40个基因,每个基
因可能有50个突变,然后加上这些突变的组合,大家计算以下这有多少?从应用的角度
,接近无穷吧。最近的一篇NG文章用新方法来处理以前的数据,发现12万个SNP(我望
了具体的数值,反正很大)能解释56%的疾病表型,那是不是需要1百万的SNPs能解释80
%呢?显然还达不到,因为有环境因素在。那在计算这多大上百万SNPs的组合表型呢?
这还是只从SNP出发来解释。大家在建立简单的BLUP模型的时候,能考虑多少互作?
还有大量的CNV, chromosome rearrangement,methylation......,然后还有这些遗传因
素的组合呢?我们在研究这些生物现象的时候,用了太多的determinism的方法,考虑
太少的stocha |
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t****p 发帖数: 1504 | 2 呵呵,这个系统太复杂了,buffering的机制太强大了,KO一个是看不出啥表型的:短
期内可以看到有一些蛋白活性增加,比如聚团到白宫或者ground zero,股市稍有波动
,长期来说没有影响。
要看到较明显的表型,还是要区段删除,或者把整个family干掉,比如搞掉世贸大厦,
或者敲除花街。
要看到lethal的表型的话那就更难了,唯有火星撞地球,或者引爆所有核弹…… |
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I****p 发帖数: 101 | 3 去年8月份PNAS刊登一个撤稿,老板说她从来没见过一个突变体的基因竟然克隆错了,
2005年刊出至今,已被引用几十次,估计是因为很多人不能重复,作者才重新仔细观察
,最后决定撤稿。首先PCR片段测序认为是该基因,如果是的话,用野生型基因应当能
够互补。既然互补对了,从突变体库分离的该基因的突变位点也自然要有相似的表型,
检测结果也符合,很完美。老板说,现在作者认为是首先PCR有错,突变体表型又自动
回复,所以不是真正的互补,那为什么用作对照的突变体在当时又不回复?又说,如果
用更可靠的方法,该基因其它突变位点就不再显示那种表型。
哎,老板总结:每一步或每一个角度的实验都要很严谨,否则总是要用一个似是而非的
结果去解释上一步或其它角度的结果,最后结果是:各个角度都指向某个结论,很完美
,但是早晚要面临撤稿的命运。牛人或牛组可能一点事都没有,但是换成一般的或年轻
的实验室就多少会受到影响。她很不希望我们实验室在她退休前碰到这事。听后,受到
不少启发。 |
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s******y 发帖数: 28562 | 4 我抱着讨论的态度来说一下啊,我怎么觉得他说的那个“super green rice”
貌似不是很靠谱的样子?
首先,大部分植物里面的性状(比方说抗旱),并不是单一基因决定的。
所以要克隆到所谓的“有自己专利的基因资源,为转基因育种服务”这个
目标就有点不是那么现实。
第二,大部分基因的作用并不是一加一等于二的作用,比方说分开研究的时候
貌似基因A决定抗旱,那个基因B决定抗倒伏,但是如果简单的把这A+B同时转到
同一个株里面去,得出来的后代,如果我要猜的话,我会猜十有八九是既不
抗旱也不抗倒伏。虽然我没有直接做过转基因水稻,但是转基因老鼠我是天天
接触,最起码在老鼠里面是这样的,随便把两个基因合在一起转进去并不就是
想当然的就是两个表型合在一起。除非这两个基因完全是independent, 一点儿
互相影响都没有。另外一个考虑因素就是,很多基因的表型,在某些文章上
貌似很突出,换了一个实验室就不突出了,其中一个因素就是这几个实验室
用的不是同一株个体,基因背景不一样。所以除非他们完全的一开始就针对一个
非常特点的株来干活,然后转基因的时候也只转那个株。否则很难预测最后
转出来的结果是什么... 阅读全帖 |
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P****d 发帖数: 564 | 5 An overtly simplified 观点:
基因型决定表型,表型决定适应性。化石拿到的是表型,测序拿到的是基因型。能把两
者连起来就理想了。 |
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b**********8 发帖数: 349 | 6 在大牛们出现之前我先抛个砖
我觉得要完全准确的回答你的问题,必须针对两个不同的shRNA做rescue实验,rescue
实验能说明至少两个问题:
1)两种完全相反的表型中,到底哪一种才是你的目的基因真正负责的表型;
2)在1)的基础上,进一步确定引起另一种无关表型的shRNA是否有脱靶效应。 |
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b**********8 发帖数: 349 | 7 在大牛们出现之前我先抛个砖
我觉得要完全准确的回答你的问题,必须针对两个不同的shRNA做rescue实验,rescue
实验能说明至少两个问题:
1)两种完全相反的表型中,到底哪一种才是你的目的基因真正负责的表型;
2)在1)的基础上,进一步确定引起另一种无关表型的shRNA是否有脱靶效应。 |
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s******a 发帖数: 472 | 8 【 以下文字转载自 Dreamer 讨论区 】
发信人: Dreamer (不要问我从哪里来), 信区: Dreamer
标 题: 发泄下,老板说要fire我(请转生物版)
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Mar 23 20:28:23 2012, 美东)
为了客观,先说下老板的情况:犹太人,助教做果蝇,第五年了,四年内只有一篇
CNS和一篇IF>10的文章。实验室只剩最后一个RO1,养着四个博后,但只有我没有
fellowship。已经连续两年申不到钱,再没有文章就该关门了。
我是国内土博,去年来这个实验室,先做了四个月的筛选,筛到两个基因和表型给
了组内其他人(被他命令的)。八月份的时候发现很重要的一条信号通路在干细胞中有
功能,就开始做这个通路。到上个月为止已经知道了组织中的信号pattern,ligand表
达pattern,有哪些ligand参与其中,知道了ligand为何会表达,还做了从ligand到
receptor到transcriptional factor的突变表型,RNAi表型。基本了解了这条通路的作
用。现在就是不知道downstream... 阅读全帖 |
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T****i 发帖数: 15191 | 9 新技术作为技术储备到花钱不多,但只要用起来,就收不住了,铺开来,有多少钱也能
花光。
另外,不是所有的技术都有必要实现。技术不成熟的时候,完全可以等待未来更成熟的
技术再大规模铺开应用。而现实是,往往一个新技术出来,大规模应用就开始了。比如
,做酵母的同学都知道yeast knockout collections (YKO)。当时做的时候,就没引
入loxP sites,就大规模做了。用YKO strains 做double KO 就不方便。现在用zinc
finger nuclease技术做knockout mice,其实也有很多问题,但也开始大规模铺开了。
希望Sigma没从NIH拿钱做这个。
发生这种有技术马上就大规模上马的原因,主要是个人和小集团利益。有新技术,就有
忽悠钱的机会。而且,大规模做,自己5年的funding就有保障了。而且肯定能产生结果
。至于有没有用,那也肯定有的,作为工具。
还有,对技术应用能解决多少问题,事先的评估是很不够的。基本就听申请人瞎吹。讲
个例子,无论是传统的SNP/haplotype mapping,还是新一些的arrays,还是最新的
Next... 阅读全帖 |
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T****i 发帖数: 15191 | 10 新技术作为技术储备到花钱不多,但只要用起来,就收不住了,铺开来,有多少钱也能
花光。
另外,不是所有的技术都有必要实现。技术不成熟的时候,完全可以等待未来更成熟的
技术再大规模铺开应用。而现实是,往往一个新技术出来,大规模应用就开始了。比如
,做酵母的同学都知道yeast knockout collections (YKO)。当时做的时候,就没引
入loxP sites,就大规模做了。用YKO strains 做double KO 就不方便。现在用zinc
finger nuclease技术做knockout mice,其实也有很多问题,但也开始大规模铺开了。
希望Sigma没从NIH拿钱做这个。
发生这种有技术马上就大规模上马的原因,主要是个人和小集团利益。有新技术,就有
忽悠钱的机会。而且,大规模做,自己5年的funding就有保障了。而且肯定能产生结果
。至于有没有用,那也肯定有的,作为工具。
还有,对技术应用能解决多少问题,事先的评估是很不够的。基本就听申请人瞎吹。讲
个例子,无论是传统的SNP/haplotype mapping,还是新一些的arrays,还是最新的
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C*******h 发帖数: 75 | 11 大约一年半载前,跟我一起奋斗的小兄弟纯属偶然从我们自己建立的EMS突变体库中筛
选出一个有细胞死亡现象的突变体。接下来,我们主要做了以下两个方面的工作:
确立表现型与基因之间的因果关系
(A) 锁定细胞死亡,用传统的位置克隆法克隆到了基因。
(B) 用遗传互补的方式也确证了突变中的点突和包括细胞死亡在内的多种表型之间的
直接因果关系。
其二是涉及蛋白层次
(A) 全多肽链丙氨酸替代扫描,通过转基因手段在突变体 (系KNOCKOUT) 背景上转入
自身启动子驱动的携带某个位点丙氨酸替代的突变基因,考察替代位点和表型之间的关
系。工作量庞大,但所得并不多,虽找到了几个残基位点突变导致蛋白完全没有活性的
突变位点。总的来说,性价比不是太高,人力物力财力消耗都相当的大。但也算是有得
有失吧,比竟这个蛋白目前没有任何人有任何已知的认识。
(B) 用GUS标定,确定了组织和器官水平上该蛋白在活体内的表达模式。
(C) 用GFP标定,完成了该蛋白的亚细胞定位工作;而且也确定了该蛋白中存在一个非
常规或者说不同任何已知核定位信号的核定位信号。
(D) 也用删除多肽链前后的办法搞清楚了真正和... 阅读全帖 |
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O******e 发帖数: 4845 | 12 换个遗传系后表型消失很正常。但纯系的小鼠是最基本的要求,因为这样你的实验结果
的重复性才能保证,别人用同样的老鼠同样的突变才能做出同样的结果。表型纵然重要,
但更重要的是找到表型后面的机制。没有纯系做基础,机制做起来会非常艰难。
does
belong |
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c********b 发帖数: 363 | 13 你这出现表型了来判断不怎么可靠。一般烟草瞬时表达是没有表型的,除了necrosis之
类。而且如果表型是co-suppressor呢?
tag |
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a*****x 发帖数: 901 | 14 是啊,就是突变遗传了以后引起表型的概率。简单的说就是A突变有30%的概率引起表型
,B突变有20%的概率引起表型。 |
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D*a 发帖数: 6830 | 15 那除了表型有无,也还要看表型严重程度才知道?
还是说30%的penetrance是说30%的后代表型完全突变,70%的完全野生型?
这个叫hypomorph?hypomorph的意思不是说100% 的后代有部分的减弱么?
如果是30%透出来的后代突变程度也不一样,那再加上另一个基因我感觉完全没办法分
析啊。。。 |
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D*a 发帖数: 6830 | 16 还有一种情况是某表型,可能同一个通路抑制一点表型改善,再抑制一点表型恶化。 |
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w********e 发帖数: 21 | 17 1.大的那只应该是原来放进去的祖先,所以这个问题的关键是表型为什么会消失
2.没做过遗传筛选,不知道题目中的F1到底是哪一代。推测大的那只虫子的表型可能是
母源调控的(它妈妈赋予的),而虫子自身的基因型可能是纯合野生型,所以当它作为
母亲时,后代没有表型。纯属猜测。 |
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l******g 发帖数: 1145 | 18 我cross了两个转基因的老鼠,发现大约1/3的老鼠从postnatal 3天到2周,出现不同
程度的体型变小,以及预期中其他的一些表型。老鼠就算只有sibling的1/2大小,但
还是生活自理,三周就可以wean了。
问题1,
现在我想quantify老鼠body size的变化,测体重是比较有效的手段吗?
我担心的是,不是所有老鼠都变小,体重平均后,也许会弱化差异。
ps,下周第一批老鼠要拉去做echo,到时麻倒了,肯定会拍比较照片。
问题2,
如果检测体重的话,需要连续测多久?可以只测到6周成年的时候吗?
concern是,现在的老鼠只是第一次cross后的double het,本来是没预期有表型的。按
计划要继续cross将一个基因完全knockout,预期得到更严重的表型。
所以说,所有的female老鼠都要用来breeding,等到怀孕后,体重肯定就不准了。就算
是公老鼠,用来breed后,都会变肥(难怪男人一结婚就发福),可能体重也不准了。
是不是测体重只能到breeding前? |
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s******y 发帖数: 28562 | 19 有很多种假说可以解释,比方说,一个貌似有点道理的是同性恋行为是群居动物中为了
缓解群体中不同个体(尤其是侵略性比较强的雄性个体)之间的矛盾而被迫进化出来的
一种表型,而这种表型有利于整个群体的稳定存在。这个说法貌似对于野生灵长类之间
的很普遍的同性恋行为还是解释得通的。如果就这个角度来看,那么,同性恋表型就有
一定的可能性和动物的个体是否脾气比较温和有关联。而因为在野生动物的驯化过程中
,人类会不停的对动物的脾气进行挑选,不够温和的都给淘汰了,最后有可能挑出来的
那个脾气最温和,最容易能被驯养的种群就有可能同性恋比例比较高(但是不可能整个
群体都是完全同性恋,否则就没有后代了)。
不过麻烦的是,大部分这些假说都停留在理论层次,因为几乎没有资金支持谁去认真检
测这些假说。所以我不能说这个假说到底是对的还是不对的,我只能说是听起来貌似有
道理。不过我记得几年前current biology发过一篇文章,说是前苏联的科学家想要驯
养一种毛色非常漂亮的狐狸,因为这些狐狸脾气非常糟糕导致很难大规模驯养。但是他
们进行几十年驯养后,发现那个毛色和脾气是相关的。脾气好的狐狸毛色都不漂亮,毛
色漂亮的... 阅读全帖 |
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s******y 发帖数: 28562 | 20 我觉得他说的有一定道理啊。他说的意思是家养动物里到底是什么样的个体才有交配权
是主人说了算。假如在这个假设前提下,比方说。某个和脾气温和有关的基因表型同时
也会导致后代有比较高的同性恋比例(比方说是10%)。那么这个基因在野生情况下虽
然不会导致完全绝后,但是多少会因为对后代的生育不利所以会被控制在一个比较低的
比例里(比方说不超过10%,然后总体平均下来,导致群体同性恋比例不超过1%)。但
是在人为控制生殖的情况下,因为这个基因会导致脾气温和,就会成为被筛选的有利表
型,从而就会在家养的群体里迅速成为dominant gene,比方说90%的家养动物都有这个
基因,那么家养动物的后代里9%的同性恋比例.
类似的事情其实并不少。比方说白毛红眼睛的那种老鼠,其实免疫能力非常低下,生殖
能力也不高。如果放在野外,相关基因虽然不会完全被淘汰,但是表型会被控制得非常
严所以野生老鼠会非常少是白的。但是因为人为因素,在实验室里面被人故意培养出来
所以就成了实验室老鼠的dominant表型。 |
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n***y 发帖数: 114 | 21 突变型对病毒有什么影响,就是这个蛋白不能聚集的时候,对病毒的生命周期有什么作
用,或者对宿主有什么影响。因为这些突变型,相当于抑制了prion的表型,如果有什
么表型的变化,用野生型蛋白感染如果能逆转表型就能说明问题了。 |
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X******n 发帖数: 914 | 22 你的基因是个essential gene。 你买的这个是heterzygous deletion,很多时候这种
deletion没有表型。所以你应该先看看有没有你想要的表型,然后才做互补试验。
如果没有表型,你可以参考上面Tianzi的回复所说的方法,也可以去找找有没有ts
mutant。或者去看看Yeast DAmp Library 或者 TR Hughes 的 TetO7-promoter
mutants library有没有你想要的基因。 |
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H****s 发帖数: 301 | 23 往细菌里转了一个基因文库,发现了一个表型改变。似乎这个表型变化是不可逆的,挠
头中。我更感兴趣的是细菌的这个新表型。请问有没有什么办法去掉细菌里转进去的质
粒?这个质粒是基于pUC Ori的,是个高拷贝质粒。如果我在没有抗性的培养液中连续
传代,会不会彻底除去?谢谢。 |
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D*a 发帖数: 6830 | 24 再上个图吧。链接都给你了。。
人的端粒酶缺失会造成表型啊。老鼠的可能是一不小心造长了没用上呗 。。。
再说后来说了G3的时候年轻的时候没表型但是衰老有表型。 |
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L****T 发帖数: 169 | 25 我当时没有检测到表型就没有发文。他们的表型和我当时的hypothesis是一样,用的
mESC分化protocol也都一样(都是follow一个大牛的方法),我当时除了shRNA kd,还
用了chemical inhibitors,其他几个lab用KO的mESC貌似也没有看到这个表型。 |
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L****T 发帖数: 169 | 26 我当时没有检测到表型就没有发文。他们的表型和我当时的hypothesis是一样,用的
mESC分化protocol也都一样(都是follow一个大牛的方法),我当时除了shRNA kd,还
用了chemical inhibitors,其他几个lab用KO的mESC貌似也没有看到这个表型。 |
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f******t 发帖数: 2699 | 27
另一个有 off-target嫌疑的技术?没有证据表明,abp1-c1 是否影响到其它target,
尽管回交了一下;然后,他们也提到可能有紧密连锁的其它突变(off-target所致)无
法清掉,所以就筛了另一个(非Cas)突变abp1-TD1。乖乖,也没有表型,但是同样无
法证明abp1-TD1影响了其它基因。反正,两种可能都有:以前的结果被他们认为是off-
target造成,别人也可以说,你们现在的结果也没法排除这个可能性,那发出来干嘛?
等以后第三方再来“纠正”?就为了数文章数?本来,他们吧 abp1-c1 和abp1-TD1杂
交的F1 表型验证一下,对于排除可能的off-target也稍微更有说服力一些(如果这些
影响是隐性的)。
--验证负结果跟正结果不一样。至少他们证明了基因不表达(我对此存疑),但植物
没有表型。off target导致负负得正的机会有多大呢?他们至少做了abp1-c1跟WT回交
clear background。我赞同你的观点,他们确实应该做几个complement,abp1-c1Xabp1
-TD1是一个,另一是cross最早的那个embry... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 28 做了两年的老鼠,一直在研究某个表型的分子机制,却发现表型越来越不稳定,重新检
查,发现最开始用的老鼠混进了另一个KO,看到的表型其实来自那个基因 ... lol |
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o*****y 发帖数: 699 | 29 11101433 彭君 中南大学 “补丁”马氏过程
及其相关问题的研究 A0110 青年科学基金项目 22
2012-1-1 2014-12-31
2 11101434 徐勇 中南大学 无限时滞随机泛
函微分方程及其在种群动力系统中的应用 A011003 青年科学基金项目
22 2012-1-1 2014-12-31
3 11101435 周岳 中南大学 三类常数项恒等
式的数学机械化研究 A0116 青年科学基金项目 22
2012-1-1 2014-12-31
4 11102239 李地元 中南大学 ... 阅读全帖 |
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n*******e 发帖数: 1141 | 30 钱云会案刑事判决书
http://wenku.baidu.com/view/f506336f58fafab069dc021c.html
http://www.fabang.com/a/20110211/237535.html
费良玉交通肇事案刑事判决书
浙江省乐清市人民法院
刑事判决书
(2011)温乐刑初字第152号
公诉机关浙江省乐清市人民检察院。
被告人费良玉,男,1979年8月29日出生于安徽省颍上县,身份证号码XXXX,汉族,个
体运输,初中文化,住安徽省颍上县黄桥镇张庄村东海队xx号。因涉嫌犯交通肇事罪于
2010年12月25日被刑事拘留,于2011年1月4日被逮捕。现羁押于乐清市看守所。
辩护人周光、吴之欧,浙江光正大律师事务所律师。
乐清市人民检察院以乐检刑诉(2011)73号起诉书指控被告人费良玉犯交通肇事罪,于
2011年1月21日向本院提起公诉。本院受理后依法组成合议庭,公开开庭审理了本案。
乐清市人民检察院指派检查员林宏炽、余乐燕出庭支持公诉,被害人父亲的诉讼代理人
斯伟江,被告人费良玉及其辩护人周光、吴之欧,证人黄标到庭参加诉讼。现已审理终
结。
乐清市人民检... 阅读全帖 |
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c***s 发帖数: 70028 | 31 由中科院上海生命科学研究院、北京基因组研究所、中国水稻研究所等单位合作的研究成果《水稻地方品种重要农艺性状相关基因的全基因组关联分析》,日前在线发表在《自然―遗传学》(Nature Genetics)杂志上。
该研究报道了中国水稻地方品种的全基因组的遗传多态性和单倍体型图谱,并对籼稻品种的14个重要农艺性状进行了全基因组关联分析,确定了这些农艺性状相关的候选基因位点,对水稻的遗传学研究和分子育种提供了重要资源。
论文一经发表,便迅速引起了世界同行的关注,许多人称之为作物遗传学研究中里程碑式的工作。
《自然―遗传学》副主编Pamela Colosimo介绍,这篇论文从编辑部到同行专家评议都获得了高度评价,是她在该杂志遇到的发表最为顺利的一篇论文。中科院副院长李家洋也对研究团队的成果表达了高度赞赏。
功不可没的GWAS
全基因组关联研究(Genome-wide Association Study,简称GWAS)是一种用来寻找基因变异与表型之间关系的遗传学方法,最近几年在人类医学遗传学领域中发展迅速。
以常见人类遗传疾病的GWAS为例,研究者首先要选取一个较大的人群样本,考察哪些是患者,然后... 阅读全帖 |
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b****r 发帖数: 17995 | 32 哪怕就是y染色体比线粒体染色体长太多了,不知道你这在说什么
而且y决定性别这么重要的一个表型
线粒体染色体差异会导致正常人之间什么表型差异,你说说? |
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w*********g 发帖数: 30882 | 33 基因武器正在锁定中国汉族血统的人 侠客兴
2位粉丝
核心会员6
1楼
——童增种族基因灭绝战观点并非危言耸听
王胜军
刚刚出版的童增先生所著《最后一道防线——中国人基因流失忧思录》一书给国人提出
许多令人深思的观点。我们同意该书主要观点——基因武器的研制是可行的,或许正在
国外获得某种程度的成功。同时我们还认为国外科研机构以健康普查的手段,采集中国
人的血样,特别是采集安徽贫困地区哮喘病基因的血样,可能是一个阴谋,其中就含有
制备基因武器的因素,由于特定汉族血统人的基因流失严重,基因武器正在锁定汉族血
统的人,这绝不是危言耸听。本文将以科学论据,针对基因武器是否成立的辩论中,回
答一些人的疑问,同时对洪涛院士,杨焕明专家在这一个问题上的认识提出不同意见。
1、国外科研机构采集中国汉族血统人的哮喘病易感基因血样和获取相应资料事件可能
存在阴谋。
如果一关键性等位基因在某一人种或地区频率特别高,则有可能成为某些疾病显示人种
和地区高发性遗传原因。
鼻咽癌好发于华南人和HLA-B46关联,B46在白种人和黑种人中频率几乎为零。本文后述
B46可成为基因武器攻击汉族特定群体血统人的靶点。那么在... 阅读全帖 |
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w*********g 发帖数: 30882 | 34 刚刚出版的童增先生所著《最后一道防线——中国人基因流失忧思录》一书给国人提出
许多令人深思的观点。我们同意该书主要观点——基因武器的研制是可行的,或许正在
国外获得某种程度的成功。同时我们还认为国外科研机构以健康普查的手段,采集中国
人的血样,特别是采集安徽贫困地区哮喘病基因的血样,可能是一个阴谋,其中就含有
制备基因武器的因素,由于特定汉族血统人的基因流失严重,基因武器正在锁定汉族血
统的人,这绝不是危言耸听。本文将以科学论据,针对基因武器是否成立的辩论中,回
答一些人的疑问,同时对洪涛院士,杨焕明专家在这一个问题上的认识提出不同意见。
1、国外科研机构采集中国汉族血统人的哮喘病易感基因血样和获取相应资料事件可能
存在阴谋。
如果一关键性等位基因在某一人种或地区频率特别高,则有可能成为某些疾病显示人种
和地区高发性遗传原因。
鼻咽癌好发于华南人和HLA-B46关联,B46在白种人和黑种人中频率几乎为零。本文后述
B46可成为基因武器攻击汉族特定群体血统人的靶点。那么在基因武器事件中争议极大
的带有哮喘病易感基因的汉族特定群体血统人,其易感基因频率和表型频率占中国汉族
血统总人口多少?... 阅读全帖 |
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t******y 发帖数: 716 | 35 目前的转基因技术太粗糙,不应该推广。我认为理想中值得推广的转基因技术是能够提
供作物产量(光转化比)或天然抗逆性,而不是目前这种转入莫名其妙非作物本身基因
的转基因。理由很简单,对于生物体我们了解太少。尤其转基因这种影响全人类的技术
,我们尤其要谨慎。因为很简单,目前的转基因对人类的贡献有限,危害却无限(因为
我们不了解)。没有必要因为它是科学的结晶就要推广。尤其是在没有做长期动物实验
之前。
很多人做生物以为自己了解很多,其实未必。很多时候做细胞生化的不懂做动物模型的
。做植物的对动物免疫更加无知。前段时间参加一个会议,与会的学者做了一个转基因
动物,敲除了端粒合成体系里的一个基因,老鼠在这个基因敲除后,端粒长度没有变化
,没有其他任何表型。直到突变体回交6代后,老鼠端粒长度突然短,并且早死。没人
知道这是什么原因,敲除一个基因要等到6代后才出现表型。举这个例子只是要说明生
物体的复杂性。
很多人对转基因想得太简单。不要说在宏观生态上当下的转Bt和除草剂的作物危害巨大
,而且证据很多。即使在微观上,这些转基因对个人的影响也需要长期验证才能谨慎应
用。
当下实在没有必要推广这种转基因技... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 36 首先还是基于表型判断吧
比如你看见两个一模一样的猴子,你一想表型判断不准,我得测序,那是不是得把世界
上所有生物个体测序一遍啊? |
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x****6 发帖数: 4339 | 37 1.你说话可不可以不那么刻薄?我敬你是同行,不想伤和气
2.对于he的工作,如果你有看我主贴的内容 and/or我其他关于这件事的帖子,你就知
道我坚决的反对态度。我是菌斑和生物版第一个发贴明确condemn的,我还因为这个跟
生物版的尼罗河杠上了,结果被关了小黑屋。
3. 我上面支持 定制婴儿的前提是技术成熟,并且是对于需要雪中送炭的人。这个技术
成熟的时候,脱靶风险降到最低,并且对目标基因的表型摸得很透彻,那么这个技术将
和现在的IVF差不多,属于常规技术。
4. 至于你说人类可能永远也无法透彻的认识30亿碱基对背后的表型机制。你也许是对
的,但我偏向never say never. |
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x********e 发帖数: 35261 | 38 你觉得我刻薄,其实也是源于你的无知而不自知。真的,你跟贺都是意识不到自己思维
局限性,又觉得自己认定的事多么伟光正。只有认识到自己认识的不足,了解行为对应
的责任,才能做个合格的千老。你大概和贺一样是半路出家搞生物,缺乏基础生物学知
识,把生物当工程搞。
: 1.你说话可不可以不那么刻薄?我敬你是同行,不想伤和气
: 2.对于he的工作,如果你有看我主贴的内容 and/or我其他关于这件事的帖子,
你就知
: 道我坚决的反对态度。我是菌斑和生物版第一个发贴明确condemn的,我还因为
这个跟
: 生物版的尼罗河杠上了,结果被关了小黑屋。
: 3. 我上面支持 定制婴儿的前提是技术成熟,并且是对于需要雪中送炭的人。这
个技术
: 成熟的时候,脱靶风险降到最低,并且对目标基因的表型摸得很透彻,那么这个
技术将
: 和现在的IVF差不多,属于常规技术。
: 4. 至于你说人类可能永远也无法透彻的认识30亿碱基对背后的表型机制。你也
许是对
: 的,但我偏向never say never.
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s******y 发帖数: 28562 | 39 我建议我们就不要再就这个话题辩论下去了,否则就会变成完全空对空的辩论,因为相
关的研究刚刚才做到了一点点皮毛,根本没有足够证据让我们支持或者否定那些可能性。
比方说虽然有人在果蝇上找到了会出现lesbian 或者gay 表型的基因组合,但是那些研
究是在果蝇上做的,是否能适用哺乳动物根本就无从得知。
至于你问的问题说gay基因如果真的存在的话是否在进化上一定是劣势,我的回答是
现在无法回答这个问题,因为在理论上有好多种可能性可以让这些基因的存在自圆
其说。具体要看那些个表型到底是什么基因组合产生的。 |
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a******c 发帖数: 597 | 40 情况是这样的,癌症方面的,5个大图,每个大图3-4个小图,动物表型只有xenograft
in nude mice,其余为细胞生物学实验。分子机制方面一个大图共5个小图,和表型方
面的联系不是特别strong。老板不太care这个文章,所以不太可能愿意付很贵的page
charge。但我个人比较喜欢这篇manuscript,因为图里面的结果效应都比较strong,虽
然不是什么大发现。
本来打算投neoplasia的,但page charge实在太贵$1800. 各位能推荐个便宜点的杂志
么?
谢谢!!! |
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t**h 发帖数: 82 | 41 我们与另一个研究组做了同一个基因的knockout,他们于2009年发了表型,但无确切的
机制。我们2011发了表型加机制。他们又于2012发了机制(与我们的结论一样)。近年
,同领域数篇大牛的review只引用他们的文章,没有引用我们的工作。 我们用了NCBI
推荐的offical 基因名称作了主题词,而没有附上通用的缩写名称。如果用"通用的缩
写名称",在PubMed和Google里找不出我们的文章。想做faculty,很想让领域的同行能
知道我们的工作。 请教有没有补救的办法?先谢了。 |
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m****s 发帖数: 18160 | 42 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: runstill (昵称), 信区: Biology
标 题: 助研-博士后招聘-上海交通大学
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Apr 15 20:29:25 2014, 美东)
帮朋友发帖。
上海交通大学系统生物医学研究院即上海系统生物医学研究中心是依托上海交通大学成
立的生物医学研究机构,为隶属校本部的研究院。该院是集生物、医学、理化、工程、
数学、信息等多学科交叉于一体的新型科研机构。
韩泽广教授系上海交通大学特聘教授、教育部长江学者奖励计划特聘教授、国家杰出青
年基金获得者、“新世纪百千万人才工程”国家级人选、国家科技部“973”项目首席
科学家。主要研究方向为肿瘤(肝癌)分子遗传学、基因组学和系统生物学应用,重点
阐明肿瘤发生发展过程中的遗传学和表观遗传学变异以及导致的分子相互作用网络紊乱
;探讨基于分子机制基础上的肿瘤预防、诊断和靶向治疗方法。近年来,在Nature、
Nature Genetics、JCI、Hepatology、Cancer Research等发表多篇有影响力论文。
现因科研需要,拟招聘以... 阅读全帖 |
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m****s 发帖数: 18160 | 43 【 以下文字转载自 Returnee 讨论区 】
发信人: runstill (昵称), 信区: Returnee
标 题: 助研-博士后招聘-上海交通大学
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Apr 15 21:04:27 2014, 美东)
帮朋友发帖。
上海交通大学系统生物医学研究院即上海系统生物医学研究中心是依托上海交通大学成
立的生物医学研究机构,为隶属校本部的研究院。该院是集生物、医学、理化、工程、
数学、信息等多学科交叉于一体的新型科研机构。
韩泽广教授系上海交通大学特聘教授、教育部长江学者奖励计划特聘教授、国家杰出青
年基金获得者、“新世纪百千万人才工程”国家级人选、国家科技部“973”项目首席
科学家。主要研究方向为肿瘤(肝癌)分子遗传学、基因组学和系统生物学应用,重点
阐明肿瘤发生发展过程中的遗传学和表观遗传学变异以及导致的分子相互作用网络紊乱
;探讨基于分子机制基础上的肿瘤预防、诊断和靶向治疗方法。近年来,在Nature、
Nature Genetics、JCI、Hepatology、Cancer Research等发表多篇有影响力论文。
现因科研需要,拟招... 阅读全帖 |
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d******d 发帖数: 1 | 44 剑桥—苏大基因组研究中心是由苏州大学与英国剑桥大学Sanger研究所合作建立,依托
Sanger研究所提供的资源,建立起干细胞资源中心,以此成为一个提供干细胞、疾病模
型以及基因功能解析技术的生物技术平台。
Cam_Su GRC因发展需要,面向海内外诚聘中级以上职称人员5-6名。有关招聘事宜
具体公告如下。
一、招聘岗位:
讲师(助理研究员)、副教授(副研究员)、教授(研究员)
二、工作内容:
主要从事干细胞研究、小鼠制备以及表型分析与数据库的相关工作。
三、招聘基本要求:
1、具备从事科学研究的道德素养、良好的思想政治素养、团队合作精神和奉献精
神;
2、爱岗敬业、勤奋踏实、有强烈的事业心和责任感;
3、应聘者须具有国内外高校或科研院所博士学历、学位;
4、身心健康。
四、岗位具体要求:
1、在干细胞、小鼠制备、小鼠表型分析、转化医学与产业化方面有相关背景
2、具有良好的文字运用和口头表达能力,有较强的英语运用能力,具备良好的思
维能力
五、应聘材料:
1. 个人简... 阅读全帖 |
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c********1 发帖数: 1839 | 45 易位:当两条非同源染色体同时发生断裂时,断落片段由一条染色体移至另一条染色体
的断端上,形成易位染色体。易位可以是平衡性的,也可以是不平衡性的。在易位发生
过程中,可造成染色体的点缺失,基因断裂损伤或位置效应,由此产生表型异常,此种
称为不平衡易位(unbalanced translocation)。没有遗传物质的得失者,表型正常,称
为平衡性易位(balanced translocation)。这两种易位很难从常规染色体检查中区分。
BIG BIG BIG BLESS |
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c*******u 发帖数: 12899 | 46 ☆─────────────────────────────────────☆
MyDora (家有懒猫-迷恋咖啡香味) 于 (Thu Jan 20 23:32:03 2011, 美东) 提到:
这个要看你们俩的染色体有没有问题吧,如果父母染色体都正常的话,那 不太好说,
如果是从父母一方继承的话,应该没大问题。
☆─────────────────────────────────────☆
northbeach (Oops) 于 (Thu Jan 20 23:53:24 2011, 美东) 提到:
你应该马上找医生问,有专门遗传方面的医生啊。
translocation,
can
and
☆─────────────────────────────────────☆
qingq (asura) 于 (Thu Jan 20 23:58:02 2011, 美东) 提到:
结果出来后医生没有详细的解释?
☆─────────────────────────────────────☆
lifelove (为什么我炒鸡蛋都糊?) 于 (Thu Jan 2... 阅读全帖 |
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a******c 发帖数: 597 | 47 情况是这样的,癌症方面的,5个大图,每个大图3-4个小图,动物表型只有xenograft
in nude mice,其余为细胞生物学实验。分子机制方面一个大图共5个小图,和表型方
面的联系不是特别strong。老板不太care这个文章,所以不太可能愿意付很贵的page
charge。但我个人比较喜欢这篇manuscript,因为图里面的结果效应都比较strong,虽
然不是什么大发现。
本来打算投neoplasia的,但page charge实在太贵$1800. 各位能推荐个便宜点的杂志
么?
谢谢!!! |
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G****a 发帖数: 10208 | 48 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: Clonetech (Clonetech), 信区: Biology
标 题: 故事人生______我的博后生涯
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Nov 18 15:39:43 2010, 美东)
按版主的要求,将零散的段落连在一起重发一次, 不好意思。
***********************************************************************
在我以往的科研生涯最困难的时候,曾在此版得到好心网友的指点。 怀着感恩的心写
下自己的一点切身经历,或许能给版上的兄弟姐妹点滴启迪。
(一 )
2007年 4月我完成博士论文答辩,7月1号高高兴兴地正式进入博后老板的实验室。 高
兴的原因有三: 1) 老板是领域大牛;2) 课题新颖前沿;3) 面试的经历让我觉得老板
能给我提供一个施展才华的平台。
我所承担的课题,老板原来的一个博后(法国人/代称 A)已经启动,分离了有特定遗传
性状的大量突变体,而且构建好了用来克隆基因的群体。所以老板给我交待工作的时候
还得意地... 阅读全帖 |
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G****a 发帖数: 10208 | 49 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: toptip (土翁), 信区: Biology
标 题: 从骨科医生到诺贝尔奖-山中伸弥的研究历程
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Oct 17 00:04:30 2012, 美东)
引言
山中伸弥(Shinya Yamanaka)获得诺奖已经有几天了,虽然两年前在听完他的讲座后
我兴致很高地写了两篇文章,这些天我却没有多少动力再写一篇完整的文章来介绍他的
工作。
我一直对中国现在还盛行的规划性科研,应用导向型科研耿耿于怀。这些所谓的重大项
目在立项的当初对目标/前景写得宏大无比,之后却通常草草收场。如果那些重大项目
真的能实现立项当初的用意,那诺贝尔奖早就在中国遍地开花了。广大科研人员都觉得
这种运行模式是一个笑话,饶毅、施一公等大牛也重炮轰击,但是分钱游戏还在进行着
。而公众,包括相当一部分科研人员也并不了解科研的自身规律,总是一再地问做基础
研究有什么用。
Shinya Yamanaka的成功是典型的小实验室自由探索的成功。他的成功再一次提示,有
相当多的科学突破是不可预测的。如果中国有大批优质的小实验室得到稳... 阅读全帖 |
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c*********7 发帖数: 32 | 50 老爸在美国, 一直想在钓鱼的高科技上胜人家一畴,找到也这个声波fish finder. 价格
大概都是
$100左右. 可国内钓鱼还只是坐在岸边,不象人家美国人开船去. 所以一直不知道这种
fish finder
对于坐岸边钓鱼的人的实用性.
我们现在看的主要是两种型号,一种是手表型的, 这种主要是给岸边钓鱼的人用的,但不
好的地方是屏幕
小, 而且型号有些旧. 另外一种看上去屏幕大, 而且好象是主流产品, 但据说这种型号
是给开船钓鱼的
人用的,不知道这种fishfinder对于岸边钓鱼的人有用吗? 有用过的人谈谈使用体会吗?
local 的dicks' 没有手表型的,所以也没有办法买来试用一下.
我现在看的是以下的型号:
Humminbird Smartcast RF15, RF35型号, 还有就是garmin fishfinder 140 型号.
非常谢谢.如果有型号推荐,那就更好了. |
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